Persistente Homologie fuer mehrere Parameter
Multi-parameter Persistent Homology
Wissenschaftsdisziplinen
Informatik (45%); Mathematik (55%)
Keywords
-
Persistent Homology,
Topological Data Analysis,
Representation Theory,
Algorithm engineering,
Computational Topology
Eine große Herausforderung der heutigen Zeit ist die Untersuchung von komplexen Daten, deren Inhalt oftmals im Verborgenen liegt. Stellen Sie sich zum Beispiel vor, Sie haben eine Gruppe von Corona-Infizierten und wissen, ob und wie lange je zwei Infizierte Kontakt zueinander hatten. Zur Nachverfolgung der Infektionen wollen Sie nun Cluster von Infizierten bilden. Dafür könnten Sie z.B. sagen, dass zwei Personen im gleichen Cluster sind, falls sie mindestens 10 Minuten Kontakt hatten. Allerdings könnte sich das Ergebnis deutlich unterscheiden, wenn Sie statt 10 Minuten 20 oder auch nur 5 Minuten als Mindestkontaktzeit nehmen. Die Kontaktzeit ist ein Beispiel für einen Parameter: ein Wert, welcher das Gesamtergebnis beeinflusst und welchen wir frei wählen können. Es ist sinnvoll, alle möglichen Parameterwerte in Betracht zu ziehen und zu untersuchen, wie sich die Cluster verändern, wenn man den Parameter ändert. Anstatt Cluster zu bilden, können wir auch andere Eigenschaften untersuchen, zum Beispiel das Vorkommen von "Löchern" in den Daten. Die persistente Homologie ist eine mathematische Theorie, die untersucht, wie sich topologische Eigenschaften (z.B. Cluster oder Löcher) ändern, wenn sich der Parameter ändert. Bei der Untersuchung von Daten ist man jedoch nicht auf einen einzelnen Parameter beschänkt. Um im Beispiel zu bleiben, kann man vielleicht weitere Rückschlüsse aus den Daten herauslesen, wenn man nur symptomatische oder schwer erkrankte Personen in Betracht zieht. Wir haben nun also zwei Parameter: Schwere der Erkrankung und Dauer des Kontaktes, und bekommen für jede Wahl andere Cluster. Auch hier stellt sich die Frage, wie sich diese Cluster entwickeln, wenn wir die Parameter ändern. Diese Erweiterung nennt sich persistente Homologie mit mehreren Parametern. Beim Übergang von einem auf mehrere Parameter entsteht ein Problem: Die mathematische Beschreibung des Analyseobjektes (im Beispiel oben: die Gesamtheit aller Cluster über alle Wahlen von Kontaktzeiten und Schwere der Erkrankung) erlaubt keine einfache Darstellung, was die Interpretation erschwert. Dennoch wurden in den letzten Jahren einige Durchbrüche erzielt, die eine Untersuchung von Daten mit mehreren Parametern in Aussicht stellen. Oftmals beschränken sich diese Arbeiten jedoch auf eine rein mathematische Sichtweise und vernachlässigen den Aspekt der praktischen Durchführbarkeit auf einem Computer. Das Ziel dieses Projektes ist die Entwicklung von Werkzeugen (d.h. Computerprogrammen), um diese Multiparameteruntersuchung auf großen Datensätzen durchführen zu können. Dafür wird neben der Erstellung und Implementierung schneller Algorithmen auch die mathematische Struktur der untersuchten Objekte eine Rolle spielen. Wir erwarten, dass die Ergebnisse des Projektes Verwendung in der anwendungsorientierten Forschung finden werden.
- Technische Universität Graz - 100%
- Herbert Edelsbrunner, Institute of Science and Technology Austria - ISTA , nationale:r Kooperationspartner:in
- Peter Grabner, Technische Universität Graz , nationale:r Kooperationspartner:in
- Robert Tichy, Technische Universität Graz , nationale:r Kooperationspartner:in
- Jean-Daniel Boissonnat, INRIA Sophia Antipolis - Frankreich
- Siddharth Pritam, Inria - Frankreich
- Claudia Landi, Universita di Modena e Reggio Emilia - Italien
- Emerson Escolar, RIKEN Center for Advanced Intelligence Project - Japan
- Tamal Dey, Purdue University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Michael Lesnick, SUNY Albany - Vereinigte Staaten von Amerika
- Matthew Wright, University of Minnesota - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 45 Zitationen
- 13 Publikationen
-
2025
Titel Expected Complexity of Barcode Reduction DOI 10.1007/s41468-025-00218-8 Typ Journal Article Autor Giunti B Journal Journal of Applied and Computational Topology Seiten 29 Link Publikation -
2022
Titel A Unified View on the Functorial Nerve Theorem and its Variations DOI 10.48550/arxiv.2203.03571 Typ Preprint Autor Bauer U -
2021
Titel Tight quasi-universality of Reeb graph distances DOI 10.48550/arxiv.2112.00720 Typ Preprint Autor Bauer U -
2022
Titel Keeping it sparse: Computing Persistent Homology revisited DOI 10.48550/arxiv.2211.09075 Typ Preprint Autor Bauer U -
2021
Titel Compression for 2-Parameter Persistent Homology DOI 10.48550/arxiv.2107.10924 Typ Preprint Autor Fugacci U -
2022
Titel On interval decomposability of 2D persistence modules DOI 10.1016/j.comgeo.2022.101879 Typ Journal Article Autor Asashiba H Journal Computational Geometry Seiten 101879 Link Publikation -
2023
Titel Topological Data Analysis in smart manufacturing: State of the art and futuredirections DOI 10.48550/arxiv.2310.09319 Typ Preprint Autor Uray M -
2023
Titel A unified view on the functorial nerve theorem and its variations DOI 10.1016/j.exmath.2023.04.005 Typ Journal Article Autor Bauer U Journal Expositiones Mathematicae Seiten 125503 -
2023
Titel Compression for 2-parameter persistent homology DOI 10.1016/j.comgeo.2022.101940 Typ Journal Article Autor Fugacci U Journal Computational Geometry Seiten 101940 Link Publikation -
2023
Titel Decomposing filtered chain complexes: Geometry behind barcoding algorithms DOI 10.1016/j.comgeo.2022.101938 Typ Journal Article Autor Chachólski W Journal Computational Geometry Seiten 101938 Link Publikation -
2023
Titel Abelian and model structures on tame functors DOI 10.48550/arxiv.2301.04079 Typ Preprint Autor Chachólski W -
2023
Titel Sparse Higher Order Cech Filtrations DOI 10.48550/arxiv.2303.06666 Typ Preprint Autor Buchet M -
2023
Titel The Localized Union-of-Balls Bifiltration DOI 10.48550/arxiv.2303.07002 Typ Preprint Autor Kerber M