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Erforschung der Bioaktivität von Polyoxometallaten

Exploring bio-activity of polyoxometalates

Nadiia Gumerova (ORCID: 0000-0003-4375-0103)
  • Grant-DOI 10.55776/P33927
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2021
  • Projektende 30.06.2025
  • Bewilligungssumme 397.215 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (40%); Chemie (60%)

Keywords

    Polyoxometalate, Protein Crystallization, Organic Functionalization, Solution Speciation, Spectroscopy, X-ray diffraction

Abstract Endbericht

Applikantin: Nadiia Gumerova, PhD (Lise-Meitner-Stipendiatin, Institut für Biophysikalische Chemie, Universität Wien, Österreich) Nationaler Kooperationspartnerin: Prof. Annette Rompel (Vorständin des Instituts für Biophysikalische Chemie, Universität Wien, Österreich) Polyoxometallate (POMs), eigenständige polynukleare Metall-Oxoanionen mit einer faszinieren-den Strukturvielfalt sowie einzigartigen physikochemischen Eigenschaften. Ihr volles Potential kann durch die Er-höhung ihrer Biokompatibilität über organische Funktionalisierung mit bioaktiven Struktureinhei-ten optimiert werden. In den letzten Jahren haben sich POMs als vielversprechende Additive in der Proteinkristallisation herausgestellt. Diese Methode ist die am weitesten verbreitete zur molekularen Strukturaufklärung von Proteinen und Protein-Ligand- Komplexen auf atomarer Ebene. Auf der Maßgeblichkeit der Proteinstruktur für Funktionen und Eigenschaften gründet die immense Bedeutung der Kristallographie für alle biochemischen Forschungsgebiete. Allgemeines Ziel des Projektvorhabens ist die Synthese und Charakterisierung polynuklearer anorganischer und organisch-anorganischer Hybridstrukturen von Metall- Oxoanionen zur Unter-suchung ihrer Anwendung in der Proteinkristallographie und als antibakterielle Wirkstoffe sowie zur mechanistischen Aufklärung ihrer Wechselwirkung mit Biopolymeren. Die Innovationskraft und Einzigartigkeit dieses Projekts liegt im zielgerichteten Design neuartiger Hybrid-POMs mit erhöhter Stabilität und biologischer Aktivität zum Einsatz in verschiedenen biologischen Systemen. Die Kombination aus organi-schen Funktionen mit teilweise variablen Konformationen und anorganischen Polyanionen mit relativ starren käfigartigen Strukturen sollte die Wechselwirkung zwischen Makromolekülen sta-bilisieren, was meist der Ausgangspunkt für eine erfolgreiche Kristallbildung ist.

Polyoxometallate (POM) - molekulare Metall-Oxid-Koordinationsverbindungen aus W, Mo, V und Hauptgruppenelementen - bieten eine außergewöhnlich gut programmierbare Plattform an der Schnittstelle von Chemie, Biologie und Materialwissenschaft. Dieses FWF-Projekt hat die POM-Forschung vom empirischen Finden hin zu Regeln, Karten und frei zugänglichen Datenressourcen geführt, die Verhalten vorhersagbar und gestaltbar machen. Wir kombinierten Lösungsspeziations-Screenings, Strukturchemie und Bio-Interfaces mit offenen Datensätzen und datengetriebenen Perspektiven, um breit nutzbare Einsichten und Werkzeuge bereitzustellen. Zentral ist der "Speciation-first"-Ansatz: Systematische Experimente und Kooperationen zeigen, wie Säuregrad, Konzentration, Ionenstärke und Pufferidentität bestimmen, welche POM-Spezies im Wasser tatsächlich vorliegt - und damit welche Funktion möglich ist. Höhepunkte sind der Speciation Atlas of polyoxometalates in aqueous solutions (Science Advances, 2023) sowie mechanistische Fallstudien zu Puffer- und Kokokristallisationseffekten, darunter TRIS-stabilisierte Minimal-Polyoxotungstate und die Kokokristallisation von Übergangsmetall-substituierten Keggin-Silicotungstaten mit Proteinase K (Inorg. Chem., 2021). Anschlussarbeiten kartierten das Zusammenspiel von Konzentration, Ionenstärke und Pufferzusammensetzung (Frontiers in Chemical Biology, 2024); zugängliche kristallographische Berichte schufen verlässliche Strukturanker (Acta Cryst. C/E, 2021-2022). Diese Grundlagen wurden in Funktion übersetzt. Biologisch zeigten wir, wie definierte POM-Spezies Membranen und Proteine adressieren: Hemmung von SERCA/PMCA-Ca-ATPasen und Übersichtsarbeiten zu Polyoxidovanadat-Protein-Wechselwirkungen (J. Inorg. Biochem.; Coord. Chem. Rev., 2021-2022), agonistische Effekte Preyssler-Typ-POTs an purinergen P2-Rezeptoren (J. Inorg. Biochem., 2024), Tyrosinase-Inhibition durch Wells-Dawson-Phosphotungstate mittels speciation-bewusster Gestaltung (Scientific Reports, 2021) sowie Anti-Quorum-Sensing-, Antibiofilm- und antivirale Aktivitäten (Biology, 2022). Zudem fungieren rein anorganische POMs als superchaotrope Membran-Carrier und passieren Lipidbarrieren ohne organische Anhängsel (Advanced Materials, 2023). In Material- und Energiekontexten immobilisierten wir Co-haltige POMs für die photokatalytische O-Entwicklung (ACS Materials Au, 2022) und entwickelten Ni-substituierte, aminosäure-funktionalisierte Sandwich-Tungstobismuthate mit antibakterieller Aktivität (Inorg. Chem., 2023). Für Reproduzierbarkeit und Entdeckung stellten wir den Curated Polyoxometalate Formula Dataset bereit (Data, 2024) und formulierten in Data-Driven Polyoxometalate Chemistry (Chem. Eur. J., 2025) einen zukunftsgerichteten Rahmen: Community-Datensätze + Speziationskarten + mechanistisch geleitete Gestaltung. Begleitende Reviews (Inorg. Chem.; ACS Org/Inorg Au; Coord. Chem. Rev.) konsolidierten Best Practices und Terminologie. Das Ergebnis sind praktische Designregeln - zuerst Lösung/Medium wählen, die operative Spezies verifizieren, dann Struktur zur Aufgabe matchen - sowie offene Ressourcen, die den Einstieg senken. Das Projekt hinterlässt Karten, Methoden und Daten, die Forschende in Katalyse, Medizin und Materialien unmittelbar nutzen können, um sicherere und wirksamere POM-Lösungen zu entwickeln.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Annette Rompel, Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • C. André Ohlin, Umea University - Schweden

Research Output

  • 552 Zitationen
  • 26 Publikationen
  • 5 Datasets & Models
Publikationen
  • 2022
    Titel Crystal structure of hexa­sodium tetra­serinolium paratungstate B deca­hydrate, [Na6{(CH2OH)2CHNH3}4][W12O40(OH)2]·10H2O
    DOI 10.1107/s2056989022000457
    Typ Journal Article
    Autor Sifaki K
    Journal Acta Crystallographica Section E
    Seiten 207-210
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Curated Polyoxometalate Formula Dataset
    DOI 10.20944/preprints202408.2238.v1
    Typ Preprint
    Autor Kondinski A
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Exploring polyoxometalate speciation: the interplay of concentration, ionic strength, and buffer composition
    DOI 10.3389/fchbi.2024.1444359
    Typ Journal Article
    Autor Ždrnja M
    Journal Frontiers in Chemical Biology
    Seiten 1444359
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Polyoxovanadates: Catalysis, Pharmacology, Antibacterial and Anticancer Activities
    DOI 10.1142/9789811283208_0006
    Typ Book Chapter
    Autor Aureliano M
    Verlag World Scientific Publishing
    Seiten 175-202
  • 2025
    Titel Data-Driven Polyoxometalate Chemistry
    DOI 10.1002/chem.202501528
    Typ Journal Article
    Autor Kondinski A
    Journal Chemistry – A European Journal
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Speciation and structural transformation of a V V –malate complex in the absence and in the presence of a protein: from a dinuclear species to decavanadate
    DOI 10.1039/d5qi01384d
    Typ Journal Article
    Autor Paolillo M
    Journal Inorganic Chemistry Frontiers
    Seiten 6503-6518
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Curated Polyoxometalate Formula Dataset
    DOI 10.3390/data9110124
    Typ Journal Article
    Autor Kondinski A
    Journal Data
    Seiten 124
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Molecular interactions at the interface: polyoxometalates of the Anderson-Evans type and lipid membranes
    DOI 10.3389/fchbi.2024.1454558
    Typ Journal Article
    Autor Pashkovskaya A
    Journal Frontiers in Chemical Biology
    Seiten 1454558
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Unveiling the agonistic properties of Preyssler-type Polyoxotungstates on purinergic P2 receptors
    DOI 10.1016/j.jinorgbio.2024.112640
    Typ Journal Article
    Autor Poejo J
    Journal Journal of Inorganic Biochemistry
    Seiten 112640
  • 2023
    Titel All-Inorganic Polyoxometalates Act as Superchaotropic Membrane Carriers
    DOI 10.1002/adma.202309219
    Typ Journal Article
    Autor Barba-Bon A
    Journal Advanced Materials
    Seiten 2309219
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Speciation atlas of polyoxometalates in aqueous solutions
    DOI 10.1126/sciadv.adi0814
    Typ Journal Article
    Autor Gumerova N
    Journal Science Advances
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The Biological Applications of Metals and Metal Complexes
    DOI 10.3390/met13061041
    Typ Journal Article
    Autor Aureliano M
    Journal Metals
    Seiten 1041
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Synthesis, Characterization, and Antibacterial Activity of Ni-Substituted Krebs-type Sandwich-Tungstobismuthates Functionalized with Amino Acids
    DOI 10.1021/acs.inorgchem.3c00747
    Typ Journal Article
    Autor Rafieeshad M
    Journal Inorganic Chemistry
    Seiten 9484-9490
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Speciation atlas of polyoxometalates in aqueous solution (Part II): Molybdenum browns
    DOI 10.1126/sciadv.aea1910
    Typ Journal Article
    Autor Gregorovic I
    Journal Science Advances
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Polyoxidovanadates' interactions with proteins: An overview
    DOI 10.1016/j.ccr.2021.214344
    Typ Journal Article
    Autor Aureliano M
    Journal Coordination Chemistry Reviews
    Seiten 214344
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Immobilization of a [CoIIICoII(H2O)W11O39]7– Polyoxoanion for the Photocatalytic Oxygen Evolution Reaction
    DOI 10.1021/acsmaterialsau.2c00025
    Typ Journal Article
    Autor Nandan S
    Journal ACS Materials Au
    Seiten 505-515
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The Preyssler-Type Polyoxotungstate Exhibits Anti-Quorum Sensing, Antibiofilm, and Antiviral Activities
    DOI 10.3390/biology11070994
    Typ Journal Article
    Autor Faleiro L
    Journal Biology
    Seiten 994
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Oxo-Replaced Polyoxometalates: There Is More than Oxygen
    DOI 10.1021/acsorginorgau.2c00014
    Typ Journal Article
    Autor Breibeck J
    Journal ACS Organic & Inorganic Au
    Seiten 477-495
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The Smallest Polyoxotungstate Retained by TRIS-Stabilization
    DOI 10.1021/acs.inorgchem.1c01188
    Typ Journal Article
    Autor Gumerova N
    Journal Inorganic Chemistry
    Seiten 12671-12675
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Synthesis and characterization of the Anderson–Evans tungsto­anti­monate [Na5(H2O)18{(HOCH2)2CHNH3}2][SbW6O24]
    DOI 10.1107/s2053229621006239
    Typ Journal Article
    Autor Sifaki K
    Journal Acta Crystallographica Section C
    Seiten 420-425
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Polyoxovanadates with emerging biomedical activities
    DOI 10.1016/j.ccr.2021.214143
    Typ Journal Article
    Autor Aureliano M
    Journal Coordination Chemistry Reviews
    Seiten 214143
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Wells–Dawson phosphotungstates as mushroom tyrosinase inhibitors: a speciation study
    DOI 10.1038/s41598-021-96491-5
    Typ Journal Article
    Autor Lampl R
    Journal Scientific Reports
    Seiten 19354
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Speciation of Transition-Metal-Substituted Keggin-Type Silicotungstates Affected by the Co-crystallization Conditions with Proteinase K
    DOI 10.1021/acs.inorgchem.1c02005
    Typ Journal Article
    Autor Breibeck J
    Journal Inorganic Chemistry
    Seiten 15096-15100
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Inhibition of SERCA and PMCA Ca2+-ATPase activities by polyoxotungstates
    DOI 10.1016/j.jinorgbio.2022.111952
    Typ Journal Article
    Autor Aureliano M
    Journal Journal of Inorganic Biochemistry
    Seiten 111952
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Defect {(WVIO7)WVI 4} and Full {(WVIO7)WVI 5} Pentagonal Units as Synthons for the Generation of Nanosized Main Group V Heteropolyoxotungstates
    DOI 10.1021/acs.inorgchem.1c00810
    Typ Journal Article
    Autor Tanuhadi E
    Journal Inorganic Chemistry
    Seiten 8917-8923
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Interweaving Disciplines to Advance Chemistry: Applying Polyoxometalates in Biology
    DOI 10.1021/acs.inorgchem.1c00125
    Typ Journal Article
    Autor Gumerova N
    Journal Inorganic Chemistry
    Seiten 6109-6114
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2025 Link
    Titel Speciation atlas of polyoxometalates in aqueous solution (Part II): Molybdenum Browns
    DOI 10.25365/phaidra.694
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2023 Link
    Titel Speciation atlas of polyoxometalates in aqueous solutions
    DOI 10.25365/phaidra.398
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2023 Link
    Titel CCDC 2246056: Experimental Crystal Structure Determination
    DOI 10.5517/ccdc.csd.cc2fd6fh
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel CCDC 2079597: Experimental Crystal Structure Determination
    DOI 10.5517/ccdc.csd.cc27szst
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel CCDC 2078090: Experimental Crystal Structure Determination
    DOI 10.5517/ccdc.csd.cc27rf5m
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link

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