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In vitro Rekonstitution der bakteriellen Zellteilung

In vitro reconstitution of bacterial cell division

Martin Loose (ORCID: 0000-0001-7309-9724)
  • Grant-DOI 10.55776/P34607
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2021
  • Projektende 31.08.2024
  • Bewilligungssumme 388.818 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    In vitro reconstitution, Bacterial Cell Division

Abstract Endbericht

Bakterielle Zellen haben einen genau definierten inneren Aufbau. Ihre Komponenten bilden am richtigen Ort und zur richtigen Zeit komplexe Strukturen, die für Wachstum und Teilung der Zelle verantwortlich sind. Da Bakterien allerdings sehr klein sind, ist es nur sehr schwer möglich, diese Strukturen in der lebenden Zelle zu untersuchen. Wir wissen somit momentan sehr wenig über die genaue Anordnung der einzelnen Bausteine in der Zelle, wie sie zusammenkommen und wie sie ihre jeweilige Funktion erfüllen. Beispielsweise wird die Teilung der bakteriellen Zelle von einer komplizierten, aus mehreren zusammenarbeitenden Teilen bestehenden Maschinerie durchgeführt. Diese Maschine ist von außerordentlicher Bedeutung für das Überleben der Zelle. Viele Antibiotika wurden entwickelt, die Funktion dieser Struktur zu unterbinden und damit Krankheitserreger zu töten. Doch trotz der wichtigen Rolle der Zellteilungsmaschinerie wissen wir immer noch sehr wenig darüber, wie aufgebaut ist und wie sie funktioniert. In diesem Forschungsprojekt werden wir die Zellteilungsmaschinerie aus ihren einzelnen Komponenten neu zusammenbauen, anstatt sie in der lebenden Stelle zu untersuchen. Wir werden die einzelnen Bausteine isolieren und mit Hilfe von hoch-auflösender Mikroskopie untersuchen, wie sie wieder zu einer intakten Struktur zusammenfinden. Mit unserem experimentellen Ansatz können wir nicht nur die Reaktionsbedingungen genau kontrollieren, wir erhalten auch die Möglichkeit die Eigenschaften und das Verhalten der Komponenten im Detail zu charakterisieren und damit Informationen, die mit anderen Methoden nicht zugänglich sind. Wir somit in der Lage sein besser zu verstehen, wie sich diese komplizierte Maschine aufbaut und wie sie es schafft die Zelle zu teilen.

Bakterien verfügen, ähnlich wie menschliche Zellen, über eine komplexe innere Struktur. Ihre winzige Größe macht es jedoch besonders schwierig herauszufinden, wie die inneren Bausteine zusammenarbeiten. Dies ist besonders wichtig um zu verstehen, wie Bakterien sich teilen - ein Prozess, der auch wichtiges Ziel für Antibiotika darstellt. In unserem Projekt haben wir uns dieser Herausforderung gestellt, indem wir Teile der bakteriellen Zellteilungsmaschinerie außerhalb lebender Zellen nachgebaut haben. Mithilfe isolierter Komponenten konnten wir so das Verhalten einiger wichtiger Proteine rekonstruieren, die an diesem Prozess beteiligt sind: FtsZ, ein Tubulin-ähnliches Protein; FtsA, ein Aktin-verwandtes Protein; und einen Teil von FtsN, einem Protein, das für die Aktivierung der Teilungsmaschinerie essenziell ist. Gemeinsam bilden diese Proteine dynamische Filamente auf der Zellmembran, die sich zu einer Struktur namens Z-Ring organisieren. Dieser Ring ist entscheidend für die bakterielle Zellteilung, da er die Aktivität der Proteine koordiniert, die die Zellwand der Bakterien bei ihrer Teilung umbauen. Um zu verstehen, wie sich diese Proteine selbst organisieren, haben wir neue experimentelle Methoden verwendet und wichtige Erkenntnisse gewinnen können: 1. Das Verhalten von FtsA auf Membranen: Wir haben untersucht, wie FtsA an Membranen bindet, wie lange es dort verbleibt und wie es mit sich selbst interagiert, um größere Komplexe, sogenannte Oligomere, zu bilden. Besonders wichtig ist, dass wir herausgefunden haben, dass FtsN eine zentrale Rolle bei der Förderung dieser Oligomerisierung spielt. 2. Das Verhalten von FtsZ-Filamenten: Mithilfe neuer Mikroskopietechniken konnten wir das dynamische Verhalten von FtsZ-Filamenten mit einer bisher unerreichten räumlichen und zeitlichen Auflösung beobachten. Unsere Experimente zeigen, dass FtsZ-Filamente keine stabilen Bündel bilden, sondern nur kurzzeitig miteinander interagieren. Zudem entdeckten wir, dass die Flexibilität und Dichte dieser Filamente beeinflussen, wie sie sich gegenseitig organisieren. 3. Ein selbstorganisierender Z-Ring: Unsere experimentellen Daten stützen ein theoretisches Modell, das vorhersagte, dass FtsZ-Filamente ein sogenanntes "Treadmilling" durchlaufen - ein Prozess, bei dem ein Ende des Filaments wächst, während das andere schrumpft. Dieses Treadmilling sorgt dafür, dass falsch ausgerichtete Filamente verschwinden, was letztendlich zur Bildung des Z-Rings im Zentrum der teilenden Zelle führt. Wir konnten so neue wichtige Informationen über die bakterielle Zellteilung gewinnen, was auch zur Entwicklung neuartiger Antibiotika beitragen kann, die diesen Prozess gezielt stören. Darüber hinaus stellt unsere Arbeit einen wichtigen Schritt in Richtung einer vollständigen Rekonstruktion der bakteriellen Zellteilung im Reagenzglas dar - ein Meilenstein, der die Erforschung der bakteriellen Physiologie revolutionieren könnte.

Forschungsstätte(n)
  • Institute of Science and Technology Austria - ISTA - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Jan-Michael Peters, Institut für Molekulare Pathologie - IMP , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Edouard Hannezo, Institute of Science and Technology Austria - ISTA , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Johann Georg Danzl, Institute of Science and Technology Austria - ISTA , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Gülsün Elif Karagöz, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in

Research Output

  • 136 Zitationen
  • 13 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
  • 2 Datasets & Models
  • 1 Disseminationen
  • 7 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2023
    Titel Spatiotemporal signaling during assembly of the bacterial divisome
    DOI 10.15479/at:ista:14280
    Typ Other
    Autor Radler P
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Proteins containing photosynthetic reaction centre domains modulate FtsZ-based archaeal cell division
    DOI 10.1038/s41564-024-01600-5
    Typ Journal Article
    Autor Nußbaum P
    Journal Nature Microbiology
    Seiten 698-711
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Chiral and nematic phases of flexible active filaments
    DOI 10.1101/2022.12.15.520425
    Typ Preprint
    Autor Dunajova Z
    Seiten 2022.12.15.520425
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Self-organization of mortal filaments and its role in bacterial division ring formation
    DOI 10.1038/s41567-024-02597-8
    Typ Journal Article
    Autor Vanhille-Campos C
    Journal Nature Physics
    Seiten 1670-1678
    Link Publikation
  • 2021
    Titel In vitro reconstitution of divisome activation
    DOI 10.1101/2021.11.08.467681
    Typ Preprint
    Autor Radler P
    Seiten 2021.11.08.467681
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Author Correction: In vitro reconstitution of Escherichia coli divisome activation
    DOI 10.1038/s41467-022-34485-1
    Typ Journal Article
    Autor Radler P
    Journal Nature Communications
    Seiten 6741
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Self-organisation of mortal filaments: the role of FtsZ treadmilling in bacterial division ring formation
    DOI 10.1101/2023.05.08.539808
    Typ Preprint
    Autor Vanhille-Campos C
    Seiten 2023.05.08.539808
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The membrane surface as a platform that organizes cellular and biochemical processes
    DOI 10.1016/j.devcel.2023.06.001
    Typ Journal Article
    Autor Leonard T
    Journal Developmental Cell
    Seiten 1315-1332
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Spatiotemporal signaling during assembly of the bacterial divisome
    Typ PhD Thesis
    Autor Philipp Radler
  • 2023
    Titel A dynamic duo: Understanding the roles of FtsZ and FtsA for Escherichia coli cell division through in vitro approaches
    DOI 10.1016/j.ejcb.2023.151380
    Typ Journal Article
    Autor Radler P
    Journal European Journal of Cell Biology
    Seiten 151380
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Chiral and nematic phases of flexible active filaments
    DOI 10.1038/s41567-023-02218-w
    Typ Journal Article
    Autor Dunajova Z
    Journal Nature Physics
    Seiten 1916-1926
    Link Publikation
  • 2023
    Titel PRC domain-containing proteins modulate FtsZ-based archaeal cell division
    DOI 10.1101/2023.03.28.534543
    Typ Preprint
    Autor Nußbaum P
    Seiten 2023.03.28.534543
    Link Publikation
  • 2022
    Titel In vitro reconstitution of Escherichia coli divisome activation
    DOI 10.1038/s41467-022-30301-y
    Typ Journal Article
    Autor Radler P
    Journal Nature Communications
    Seiten 2635
    Link Publikation
Methoden & Materialien
  • 2022
    Titel FRET-based approach to study FtsA self-interaction
    DOI 10.1038/s41467-022-30301-y
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich
Datasets & Models
  • 2023 Link
    Titel Chiral and nematic phases of flexible active filaments
    DOI 10.15479/at:ista:13116
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2022
    Titel Quantification of FtsA self-interaction using FRET
    DOI 10.15479/at:ista:10934
    Typ Data analysis technique
    Öffentlich zugänglich
Disseminationen
  • 2024
    Titel Seminar given for the Absolventenverein der Lebensmittel- und Biotechnologen (VÖLB, Boku-Absolventen)
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2024
    Titel Speaker at EMBO Workshop Archaeal and bacterial cell division: Beyond the Z-ring
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Invitation to give a keynote lecture at the 4th Bacterial Cell Biology Conference in Cancun, Mexico
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel JSM3 Congress
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Speaker at the Building the Cell 2023 subgroup at ASCB meeting 2023
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Invited speaker at VAAM meeting in Berlin 2022
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Invited speaker to the Biological Metamaterials 16-20 May 2022, Leiden, NL
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel EMBO Workshop on Bacterial cell biophysics: DNA replication, growth, division, size and shape
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2023
    Titel IST-BRIDGE: International Postdoctoral Program
    Typ Fellowship
    Förderbeginn 2023

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