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Oxidoreductase PYROXD1: myopathies, Turin und Metallom

Oxidoreductase PYROXD1: myopathies, taurine and metallome

Javier Martinez Fernandez (ORCID: 0000-0001-9152-7323)
  • Grant-DOI 10.55776/P34895
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2021
  • Projektende 31.08.2025
  • Bewilligungssumme 602.750 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (70%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (30%)

Keywords

    PYROXD1, Myopathies, Taurine, Metal Ions, Trna-Ligase Complex, Unfolded Protein Response

Abstract

DNA-Moleküle enthalten genetische Informationen, die über Generationen hinweg weitergeben werden. DNA enthält viele Anweisungseinheiten, genannt Gene, und um diese zu "entschlüsseln" verwenden Zellen sogenannte Transfer-RNA (tRNA) Moleküle. tRNAs werden zunächst als unreife Moleküle hergestellt, und damit diese funktionsfähig werden, gibt es viele Enzyme (Proteine, die biologische Reaktionen beschleunigen), welche tRNA-Moleküle chemisch verändern oder schneiden, und dann deren Teile wieder zusammenfügen. Unser Labor ist unter anderem für die Entdeckung eines Schlüsselenzyms in diesem Prozess bekannt, dem tRNA-Ligase-Komplex (tRNA-LC). Der tRNA-LC generiert ein reifes tRNA-Molekül, indem er zwei seiner Teile zusammenklebt. Interessanterweise ist der tRNA-LC ein sehr "altes" Enzym, das bereits in sehr frühen Lebensformen auf der Erde vorhanden war, als es noch keinen Sauerstoff in der Atmosphäre gab. Interessanterweise ist Sauerstoff für viele Enzyme hochgiftig, vor allem für diejenigen, die Metalle zur Erfüllung ihrer Aufgaben benötigen, so wie der tRNA-LC. Wir haben uns daher gefragt: Wie kann der tRNA-LC in der jetzigen, sauerstoffreichen Atmosphäre "überleben"? Wir fanden heraus, dass sich der tRNA-LC zum Schutz vor Sauerstoff zusammen mit einem "privaten Wächter" entwickelt hat: einem kaum untersuchten Protein namens PYROXD1. PYROXD1 ist für den Schutz des tRNA-LC absolut unerlässlich; darüber hinaus führen Variationen in dem Gen, das für PYROXD1 "kodiert", beim Menschen zu schweren Muskelerkrankungen (Myopathien). Wir haben kürzlich einen unerwarteten molekularen Mechanismus aufgedeckt, mit dem PYROXD1 den tRNA-LC schützt. Wir haben jedoch weiters auch Hinweise darauf, dass PYROXD1 noch andere Funktionen in unseren Zellen hat. PYROXD1 kann die zelluläre Menge von Taurin regulieren, einem Molekül, das unter anderem für die chemische Modifikation bestimmter tRNAs verantwortlich ist. In diesem Projekt werden wir diesen Zusammenhang untersuchen und prüfen, ob die Regulierung des Taurinspiegels mit Myopathien zusammenhängt. Wir haben außerdem herausgefunden, dass das Fehlen von PYROXD1 in Zellen ein großes Ungleichgewicht von Metallionen verursacht. Metallionen stehen im Zentrum fast aller biologischen Prozesse, sodass die Rolle von PYROXD1 bei deren Regulierung sehr weitreichende Auswirkungen hat. Schließlich werden wir mithilfe der Strukturbiologie auch die rätselhafte Fähigkeit von PYROXD1-Molekülen untersuchen, sich aneinander zu binden - ein Phänomen, das als Oligomerisierung bezeichnet wird und für viele menschliche Krankheiten kennzeichnend ist. Wir werden untersuchen, warum, wann und wo PYROXD1 solche Oligomere bildet und welche Bedeutung dieser Prozess für unsere Zellen hat. Ausgehend von Forschung an Transfer-RNAs, hat uns die Evolution zu PYROXD1 geführt, und wir sind schon sehr gespannt, dieses bisher sehr rätselhafte, aber wichtige menschliche Protein zu entmystifizieren und seine Rolle bei Gesundheit und Krankheit aufzudecken.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Francisco Balzarotti, Institut für Molekulare Pathologie - IMP , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Sebastian Falk, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Tsutomu Suzuki, The University of Tokyo - Japan

Research Output

  • 1 Zitationen
  • 3 Publikationen
Publikationen
  • 2025
    Titel Mechanistic basis for PYROXD1-mediated protection of the human tRNA ligase complex against oxidative inactivation
    DOI 10.1038/s41594-025-01516-6
    Typ Journal Article
    Autor Loeff L
    Journal Nature Structural & Molecular Biology
    Seiten 1205-1212
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Thioredoxin regulates the redox state and the activity of the human tRNA ligase complex
    DOI 10.1101/2023.05.26.542437
    Typ Preprint
    Autor Jaksch D
    Seiten 2023.05.26.542437
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Thioredoxin regulates the redox state and the activity of the human tRNA ligase complex
    DOI 10.1261/rna.079732.123
    Typ Journal Article
    Autor Jaksch D
    Journal RNA
    Seiten 1856-1869
    Link Publikation

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