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Epigenetische Kontrolle des angeborenen Immunsystems

Epigenetic control of the innate immune system

Christian Seiser (ORCID: 0000-0002-7046-9352)
  • Grant-DOI 10.55776/P34998
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2021
  • Projektende 30.06.2025
  • Bewilligungssumme 360.851 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Epigenetics, DNA methylation, Innate Immune System, Epidermis, Mouse Genetics

Abstract Endbericht

Das angeborene Immunsystem muss in unserem Körper Krankheitserreger wie Viren und Bakterien erkennen und unschädlich machen. Eines der Merkmale, an denen das Immunsystem die Krankheitserreger erkennt, ist deren genetisches Material, die DNA oder bei manchen Viren die RNA. DNA-Methylierung ist ein essentieller epigenetischer Mechanismus, der mobile Elemente, sogenannte Transposons, in unseren Zellen in Schach hält und für die Stabilität unseres Genoms wichtig ist. Wir haben kürzlich entdeckt, dass in Mäusen, bei denen die DNA- Methylierung in der äußeren Schicht der Haut, der Epidermis, genetisch reduziert ist, massive Entzündungen kommt. Diese Immunreaktion führt zu starken strukturellen Änderungen in der Haut dieser Tiere. Das angeborene Immunsystem greift dabei in einem Vorgang, den man Autoinflammation nennt, die körpereigenen Zellen an. Wir haben Hinweise, dass durch die beeinträchtigte DNA-Methylierung in der Epidermis das Genom destabilisiert wird und DNA, die normalerweise hauptsächlich im Zellkern lokalisiert ist, plötzlich im Zytosol zu finden ist. Dort wird sie vom angeborenen Immunsystem für die DNA von Krankheitserregern gehalten. Des Weiteren führt die Reduktion der DNA-Methylierung zu einer Aktivierung der Transposons und deren RNA wird vom angeborenen Immunsystem als Zeichen einer viralen Infektion genommen. Beide Phänomene führen zu lebensbedrohenden Entzündungsreaktionen in der Haut. Diese Daten weisen darauf hin, dass DNA-Methylierung in der Epidermis einen wesentlichen Mechanismus für die Vermeidung der unerwünschten Aktivierung des angeborenen Immunsystems darstellt. In diesem Projekt werden wir die Mechanismen, die unter diesen Bedingungen fälschlicherweise körpereigene DNA und RNA als fremd erkennen, im Detail untersuchen. Dazu werden wir eine Kombination von genetischen, immunologischen und zellbiologischen Methoden verwenden. Diese Studie wird dazu beitragen, den Einfluss von epigenetischen Mechanismen in der Entstehung von autoinflammatorischen Erkrankungen besser zu verstehen. Letztlich erwarten wir uns auch neue Erkenntnisse für die Krebsforschung, da dort neuerdings Kombinationen aus epigenetischen und immuntherapeutischen Medikamenten als vielversprechende Ansätze getestet werden.

DNA-Methylierung ist ein wichtiger Mechanismus in der epigenetischen Kontrolle des angeborenen Immunsystems Das angeborene Immunsystem des Menschen ist in der Lage, Krankheitserreger wie Viren, Bakterien oder Parasiten zu erkennen und unschädlich zu machen. Es erkennt diese Erreger unter anderem anhand ihrer RNA oder DNA. Diese Nukleinsäuren existieren aber auch in den menschlichen Zellen. Daher muss das Immunsystem in der Lage sein, körpereigene Substanzen von körperfremden zu unterscheiden, um Autoinflammation oder Autoimmunerkrankungen zu vermeiden, Diesen Vorgang nennt man Self/Non-Self-Diskriminierung. Die Methylierung der DNA ist ein wichtiger epigenetischer Mechanismus in unseren Zellen. Sie kontrolliert die zellspezifische Expression von Genen. Außerdem verhindert dieser Mechanismus die Aktivierung von zelleigenen Viren, den sogenannten Transposons, die ihre Position im Genom verändern können. In diesem Projekt wurde gezeigt zeigen, dass es zu Autoinflammation und pathologischen Veränderungen in der Haut kommt, wenn es zu einer Reduktion der DNA-Methylierung durch Inaktivierung des epigenetischen Schlüsselenzyms DNA-Methyltransferase kommt. Eine derart reduzierte DNA-Methylierung verursacht aber nicht nur die Aktivierung von Transposons, sondern auch eine gewisse genomische Instabilität, die zum Auftreten von DNA außerhalb des Zellkerns als Mikronuklei führt. Diese Mikronuklei erkennt ein Hauptregulator des angeborenen Immunsystems (cGAS) fälschlicherweise als fremd bzw. "non-self" und aktiviert das Immunsystem. Die Resultate dieses Projekts sind einerseits für weitere Untersuchungen der Ursache von Autoinflammationserkrankungen relevant und könnten andererseits auch positive Effekte auf die Wirksamkeit der Immuntherapie gegen Krebs durch epigenetische Medikamente zeigen.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Christoph Bock, CeMM – Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Michael Mildner, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Iris Karina Gratz, Universität Salzburg , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Simone Tangermann, Veterinärmedizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Andrea Ablasser, École polytechnique fédérale de Lausanne - Schweiz

Research Output

  • 63 Zitationen
  • 12 Publikationen
  • 3 Datasets & Models
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2025
    Titel HDAC1 acts as a tumor suppressor in ALK-positive anaplastic large cell lymphoma: implications for HDAC inhibitor therapy
    DOI 10.1038/s41375-025-02584-9
    Typ Journal Article
    Autor Zrimšek M
    Journal Leukemia
    Seiten 1412-1424
    Link Publikation
  • 2025
    Titel The domesticated transposon protein L1TD1 associates with its ancestor L1 ORF1p to promote LINE-1 retrotransposition
    DOI 10.7554/elife.96850.4
    Typ Journal Article
    Autor Kavaklioglu G
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2025
    Titel The domesticated transposon protein L1TD1 associates with its ancestor L1 ORF1p to promote LINE-1 retrotransposition
    DOI 10.7554/elife.96850
    Typ Journal Article
    Autor Kavaklioglu G
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2025
    Titel The domesticated transposon protein L1TD1 associates with its ancestor L1 ORF1p to promote LINE-1 retrotransposition
    Typ PhD Thesis
    Autor Gülnihal Kavaklioglu
  • 2023
    Titel Targeting the catalytic activity of HDAC1 in T cells protects against experimental autoimmune encephalomyelitis
    DOI 10.1101/2023.04.14.536700
    Typ Preprint
    Autor Zhu C
    Seiten 2023.04.14.536700
    Link Publikation
  • 2023
    Titel GSE1 links HDAC1/CoREST co-repressor complex to DNA damage
    Typ PhD Thesis
    Autor Terezia Vcelkova
  • 2023
    Titel GSE1 links the HDAC1/CoREST co-repressor complex to DNA damage
    DOI 10.1093/nar/gkad911
    Typ Journal Article
    Autor Vcelkova T
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 11748-11769
    Link Publikation
  • 2024
    Titel The domesticated transposon protein L1TD1 associates with its ancestor L1 ORF1p to promote LINE-1 retrotransposition
    DOI 10.1101/2024.02.01.577722
    Typ Preprint
    Autor Kavaklioglu G
    Seiten 2024.02.01.577722
    Link Publikation
  • 2021
    Titel DNA hypomethylation leads to cGAS-induced autoinflammation in the epidermis
    DOI 10.15252/embj.2021108234
    Typ Journal Article
    Autor Beck M
    Journal The EMBO Journal
    Link Publikation
  • 2023
    Titel GSE1 links the HDAC1/CoREST co-repressor complex to DNA damage
    DOI 10.1101/2023.03.13.532402
    Typ Preprint
    Autor Vcelkova T
    Seiten 2023.03.13.532402
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Mimicking isoform-specific histone deacetylase inhibition in vitro and in vivo
    Typ PhD Thesis
    Autor Lena Hess
  • 2022
    Titel A toolbox for class I HDACs reveals isoform specific roles in gene regulation and protein acetylation
    DOI 10.1371/journal.pgen.1010376
    Typ Journal Article
    Autor Hess L
    Journal PLoS Genetics
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2022 Link
    Titel A toolbox for class I HDACs reveals isoform specific roles in gene regulation and protein acetylation
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2022 Link
    Titel DNA hypomethylation leads to cGAS-induced autoinflammation in the epidermis
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2025 Link
    Titel The domesticated transposon protein L1TD1 associates with its ancestor L1 ORF1p to promote LINE-1 retrotransposition
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Weitere Förderungen
  • 2025
    Titel Epigenetic Control of Keratinocyte Innate Immunity
    Typ Research grant (including intramural programme)
    DOI 10.55776/pat6887024
    Förderbeginn 2025
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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