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End-to-End Susceptibilitätsbildgebung

End-to-End Quantitative Susceptibility Mapping

Christian Langkammer (ORCID: 0000-0002-7097-9707)
  • Grant-DOI 10.55776/P35887
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.07.2022
  • Projektende 30.06.2026
  • Bewilligungssumme 370.304 €
  • E-Mail

Wissenschaftsdisziplinen

Informatik (50%); Klinische Medizin (25%); Medizintechnik (25%)

Keywords

    QSM, Magnetic Susceptibility, MRI, Deep Learning

Abstract

Erhöhte Eisenablagerungen in der grauen Substanz des Gehirns sind ein häufiger Befund bei neurologischen Erkrankungen wie Alzheimer, Parkinson oder Multipler Sklerose. Aufgrund seiner paramagnetischen Eigenschaften verändert Eisen die magnetische Suszeptibilität des Hirngewebes. Validierungsstudien haben gezeigt, dass Eisen im Gehirn mit Suszeptibilitätsbildgebung (Quantitative Susceptibility Mapping, QSM), einer neuartigen Magnetresonanztomographie-Technik, präzise und vor allem in lebenden Personen gemessen werden kann und damit auch longitudinale Untersuchungen von Erkrankungen ermöglicht. In dieser Arbeit wird maschinelles Lernen eingesetzt, um das zu Grunde liegende mathematische Problem der Berechnung von QSM aus einer Reihe von Bildern eines MRT-Scanners zu lösen. Im Gegensatz zu herkömmlichen Methodiken werden beim maschinellen Lernen künstliche neuronale Netze verwendet, welche auf spezieller Hardware trainiert werden. QSM ist ein mehrstufiger Ansatz, bei dem jeder Schritt die MRT-Bilder des Scanners in einer bestimmten Weise modifiziert, wobei numerische Fehler in jedem Schritt vergrößert werden. In diesem Projekt werden unter anderem diese Einzelschritte in einem einzigen künstlichen neuronalen Netz zusammengefasst, damit die MRT-Bilderdirekt vomScannerverwendet werden können.Dadurchwirdder Gesamtberechnungsfehler minimiert und des Weiteren sind keine Parameter für den Algorithmus notwendig, was eine Vergleichbarkeit sowie die Implementierung auf einem klinischen MRI-Scanner ermöglicht.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Graz - 100%

Research Output

  • 113 Zitationen
  • 5 Publikationen
Publikationen
  • 2024
    Titel Neuroimaging of Parkinson's disease by quantitative susceptibility mapping
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2024.120547
    Typ Journal Article
    Autor Guan X
    Journal NeuroImage
    Seiten 120547
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Biophysical contrast sources for magnetic susceptibility and R2* mapping: A combined 7 Tesla, mass spectrometry and electron paramagnetic resonance study
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2024.120892
    Typ Journal Article
    Autor Otsuka F
    Journal NeuroImage
    Seiten 120892
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Explainable Concept Mappings of MRI: Revealing the Mechanisms Underlying Deep Learning-Based Brain Disease Classification
    DOI 10.1007/978-3-031-63797-1_11
    Typ Book Chapter
    Autor Tinauer C
    Verlag Springer Nature
    Seiten 202-216
  • 2024
    Titel Recommended implementation of quantitative susceptibility mapping for clinical research in the brain: A consensus of the ISMRM electro-magnetic tissue properties study group
    DOI 10.1002/mrm.30006
    Typ Journal Article
    Autor Committee Q
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 1834-1862
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Multimodal analytical tools for the molecular and elemental characterisation of lesions in brain tissue of multiple sclerosis patients
    DOI 10.1016/j.talanta.2023.125518
    Typ Journal Article
    Autor Niehaus P
    Journal Talanta
    Seiten 125518
    Link Publikation

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