DIGI-SKIN: Open-access sc-RNA-seq-Maushaut-Atlas
DIGI-SKIN: Open-access sc-RNA-seq mouse skin atlas
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (35%); Informatik (30%); Klinische Medizin (35%)
Keywords
-
Cellular Senescence,
Skin,
Dermatology,
Wounds
Als größtes Organ des Körpers spielt die Haut eine entscheidende Rolle beim Schutz vor verschiedenen Gefahren wie Infektionen, Giftstoffen und UV-Strahlung. Die Haut steht daher oft im Mittelpunkt der wissenschaftlichen Forschung, und ist häufig mit Tierversuchen verbunden. Unser Projekt DIGI-SKIN zielt darauf ab, diesen Ansatz zu verändern, indem wir den größten öffentlich zugänglichen Einzelzell-Transkriptom-Atlas von Mäuse-Hautzellen erstellen und damit möglicherweise den Bedarf an Tierversuchen verringern. In diesem Projekt planen wir, den umfangreichsten Online-Atlas von Einzelzell-RNA- Sequenzierungsdaten der Mäusehaut zu erstellen, indem wir zuvor veröffentlichte Einzelzell- RNA-Sequenzierungsdaten aus Entwicklungsstadien, Alterung und Wundheilung der Haut zusammenführen. Die Einzelzell-RNA-Sequenzierung ist eine entscheidende Technologie, die die Quantifizierung und den Vergleich des gesamten Transkriptoms mit einer Einzelzellauflösung ermöglicht. Diese Methode steht im direkten Gegensatz zu Techniken wie der RT-PCR, die nur eine begrenzte Anzahl von Genen erfassen kann und keine Einzelzellauflösung bietet. Mit dem Online-Hautatlas für Mäuse können Forscher Veränderungen in der Expression von Genen, die sie interessieren, unter verschiedenen Bedingungen und in unterschiedlichen Zelltypen untersuchen. Diese Informationen können dazu führen, fundierte Entscheidungen zu treffen und die Notwendigkeit von Tierversuchen zu beurteilen, bevor sie beginnen.
- Florian Gruber, Medizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Nicole Borth, Universität für Bodenkultur Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Research Output
- 15 Zitationen
- 5 Publikationen
- 3 Disseminationen
- 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2024
Titel Profiling microRNA expression during senescence and aging: mining for a diagnostic tool of senescent-cell burden DOI 10.1101/2024.04.10.588794 Typ Preprint Autor Weigl M Seiten 2024.04.10.588794 Link Publikation -
2024
Titel In the land of not-unhappiness: On the state-of-the-art of targeting aging and age-related diseases by biomedical research DOI 10.1016/j.mad.2024.111929 Typ Journal Article Autor Klinaki E Journal Mechanisms of Ageing and Development Seiten 111929 -
2025
Titel Platform for Drug Testing and Studying Rapid-Onset Signaling and Induction of Cellular Phenotypes Ex Vivo DOI 10.1016/j.jid.2025.05.033 Typ Journal Article Autor Dworak H Journal Journal of Investigative Dermatology -
2025
Titel Aging: the wound that never starts healing DOI 10.1038/s41467-025-64462-3 Typ Journal Article Autor Ogrodnik M Journal Nature Communications Seiten 8732 Link Publikation -
2025
Titel Cells of all trades – on the importance of spatial positioning of senescent cells in development, healing and aging DOI 10.1002/1873-3468.70037 Typ Journal Article Autor Dworak H Journal FEBS Letters Seiten 2087-2106 Link Publikation
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2024
Titel MO's attendance to FEBS Congress 2024 Typ A formal working group, expert panel or dialogue -
2024
Titel MO's attendance to ICSA 2024 Typ A formal working group, expert panel or dialogue -
2024
Titel TR attending ARDD conference 2024 Typ A formal working group, expert panel or dialogue
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2024
Titel EK received Science Art Award from YSA MedUni Wien Typ Research prize Bekanntheitsgrad National (any country) -
2024
Titel KV received Kyrle Travel Fund (ÖGDV) Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International