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Anregung der Produktion bioaktiver Metabolite in Pilzen

Triggering bioactive metabolite production in fungi

Pamela Vrabl (ORCID: 0000-0002-8104-8684)
  • Grant-DOI 10.55776/T862
  • Förderprogramm Hertha Firnberg
  • Status beendet
  • Projektbeginn 16.01.2017
  • Projektende 15.07.2022
  • Bewilligungssumme 228.720 €

Matching Funds - Tirol

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (50%); Gesundheitswissenschaften (10%); Industrielle Biotechnologie (30%); Land- und Forstwirtschaft, Fischerei (10%)

Keywords

    Bioreactor, Nutrient Limitations, Co-Cultivation, Destruxins And Xanthoepocin, Epigenetic Modifier, Metabolite Profile

Abstract Endbericht

In den letzten Jahrzehnten nahm die Anzahl resistenter Mikroorganismen in der Medizin und in der Landwirtschaft weltweit stetig zu. Verschärft wurde dieser höchstproblematische Umstand noch durch das gleichzeitige langsame Versiegen des Nachschubes an neuen wirksamen Substanzen wie Antibiotika. Pilze stellen eine Gruppe von Lebewesen dar, die bereits erfolgreich zur Produktion solcher Substanzen, wie zum Beispiel dem Antibiotikum Penicillin, genutzt wurden und werden. Forschungen der letzten Jahre zeigten aber, dass die bisherigen Kultivierungsbedingungen das Potenzial dieser Organismen bei weitem nicht ausschöpften, da viele Stoffwechselwege bislang unter Laborbedingungen nicht aktiviert werden konnten. Um diese nicht genutzt Möglichkeiten zur Produktion neuer wirksamer Substanzen für die Medizin und landwirtschaftliche Produktion zu eröffnen bedarf es aber eines wichtigen Rüstzeuges: dem besseren Verständnis der genauen Abläufe im Stoffwechsel dieser Organismen. Eine der großen Herausforderungen ist es diese inaktiven Stoffwechselwege zu triggern. Mit dieser Arbeit sollen zwei biotechnologisch interessante Organismen genau dahingehend stimuliert werden. Zum einen ein filamentöser Pilz namens Metarhizium brunneum, der bereits zur kommerziellen Produktion von Wirkstoffen gegen Schadinsekten in der Landwirtschaft genutzt wird und der auch für die Krebstherapie interessante Substanzen (Destruxine) ausscheidet. Zum anderen ein Schimmelpilz namens Penicillium ochrochloron, der neben seiner Anwendung zur Laugung von Metallen auch eine Substanz namens Xanthoepocin produziert, welche ein möglicher Anwärter für ein neues Antibiotikum darstellt. Für diese Studie werden erstmalig hochstandardisierte Fermentationstechniken und gleich mehrere Möglichkeiten zur Anregung des Stoffwechsels neue Substanzen zu produzieren mit hochmoderner Analytik kombiniert. Unter anderem werden die gemeinsame Fermentation verschiedener Organismen und die Aktivierung neuer Stoffwechselwege auf epigenetischer Ebene dafür genutzt um die Produktion neuer bioaktiver Wirkstoffe anzuregen. Ein Vergleich unterschiedlicher Wachstumsbedingungen und die daraus gewonnenen Erkenntnisse sollen die Effizienz der Ausbeute an neuen Substanzen erhöhen. Die dabei gewonnenen Proben und Substanzen - im Speziellen Xanthoepocin und verschiedenen Destruxine - werden dann bezüglich ihrer Anwendbarkeit gegen Schadinsekten im Ackerbau, gegen multiresistente Bakterien und Pilze sowie als mögliche Kandidaten für eine medikamentöse Krebstherapie getestet. Die Ergebnisse dieser Studie sind daher für eine Reihe von verschiedenen Wissenschaftsdisziplinen von Interesse und werden zudem neue einzigartige Einblicke in den Stoffwechsel von Pilzen geben.

Pilze sind eine unerschöpfliche Quelle für bioaktive Naturstoffe, was in Zeiten zunehmender Multiresistenzen gegen Antibiotika von besonderer Bedeutung ist. Eine von vielen Strategien zur Gewinnung neuer Sekundärmetabolite, aber auch zur Erforschung grundlegender physiologischer Aspekte, ist die gezielte Veränderung der Umweltbedingungen, unter denen Pilze wachsen. Dieses Projekt, das auf einem physiologischen Ansatz unter Verwendung von standardisierten Bioreaktorbatchkulturen basierte, machte sich diese Strategie zunutze und versuchte, neuartige, bioaktive Naturstoffe in Verbindung mit einem tieferen Verständnis der Pilzbiologie zu gewinnen. Diese Studie verfolgte zwei Hauptziele: (1) Erstens die Vorauswahl von Probenfraktionen mit potenziell neuen bioaktiven Verbindungen, die von im Bioreaktor gezüchteteten Kulturen von Penicillium ochrochloron und Metarhizium brunneum produziert wurden. Die Stämme wurden verschiedenen Kulturbedingungen ausgesetzt, u.a.Nährstoffbeschränkungen, verschiedene Belichtungen oder Co-Kultivierung. (2) Zweitens sollte untersucht werden, wie die oben genannten Stimuli die biotechnologisch und medizinisch interessanten Metabolite Xanthoepocin (P. ochrochloron) und Destruxine (M. brunneum) beeinflussen. Im Rahmen dieser Studie wurden einige Triggerfaktoren des medizinisch interessanten Sekundärmetaboliten Xanthoepocin identifiziert. So konnte beispielsweise unter Stickstofflimitierung und im Dunkeln die höchste Ausbeute erzielt werden. Weiters konnten wir nachweisen, dass Xanthoepocin gegen wesentlich mehr multiresistente Bakterienspezies effektiv ist als bislang angenommen. Wird das lichtsensitive Molekül zudem vor sichtbarem Licht geschützt, so wurde seine Wirksamkeit sogar erhöht. Auch bei den agrikulturell und medizinisch relevanten Destruxinen konnten wir eine unerwartete lichtabhängige Produktion bei M. brunneum beobachten. Durch die gleichzeitige Kultivierung (Co-Kultivierung) von P. ochrochloron und M. brunneum erreichten wir eine zusätzliche signifikante Erhöhung der Destruxinausbeute. Ettliche Rohextrakte getesteter Pilze zeigten zudem vielversprechende Bioaktivität und werden Gegenstand zukünftiger Forschungsarbeiten sein. Aufgrund des physiologischen Ansatzes konnten wir eine Fülle von Daten und Erkenntnissen über grundlegende physiologische Prozesse wie Wachstum, Produktion von Sekundärmetaboliten oder Ausscheidung organischer Säuren erhalten. Generell zeigte sich der Stimulus Licht als ein äußerst effektiver Triggerfaktor zur Manipulation des pilzlichen Stoffwechsels, wobei wir teils gravierende Veränderungen auf physiologischer Ebene nachweisen konnten. So konnten wir neben Xanthoepocin und den Destruxinen für eine Reihe bereits bekannter anderer Sekundärmetabolite erstmals eine Lichtabhängigkeit ihrer Produktion nachweisen. Überraschend war, dass sich auch der Primärstoffwechsel (z.B. organische Säureausscheidung) als teils sehr lichtsensitiv erwies, wobei wir mehrfach eine nährstoffabhängigige Lichtsensitivität nachweisen konnten. Die Ergebnisse dieses Projektes bieten einzigartige Einblicke in den (Licht-)Stoffwechsel von Pilzen und bilden die Basis für zukünftige Forschungsarbeiten, welche sich sowohl mit dem Primär- als auch dem Sekundärstoffwechsel von Einzel- und Co-Kulturen biotechnologisch relevanter Pilze auseinandersetzen werden. Neben zahlreichen grundlegenden Erkenntnissen hinsichtlich ausgewählter medizinisch relevanter Sekundärmetabolite, dürfte vor allem die lichtabhängige Produktion organischer Säuren in Pilzen von hoher biotechnologischer Relevanz sein.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Cornelia Lass-Flörl, Medizinische Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Hermann Strasser, Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in
  • Hermann Stuppner, Universität Innsbruck , nationale:r Kooperationspartner:in

Research Output

  • 134 Zitationen
  • 35 Publikationen
  • 2 Disseminationen
  • 3 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2022
    Titel Additional file 1 of Xanthoepocin, a photolabile antibiotic of Penicillium ochrochloron CBS 123823 with high activity against multiresistant gram-positive bacteria
    DOI 10.6084/m9.figshare.17870310.v1
    Typ Other
    Autor Siewert B
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Additional file 1 of Xanthoepocin, a photolabile antibiotic of Penicillium ochrochloron CBS 123823 with high activity against multiresistant gram-positive bacteria
    DOI 10.6084/m9.figshare.17870310
    Typ Other
    Autor Siewert B
    Link Publikation
  • 2021
    Titel A new High-Throughput-Screening-assay for Photoantimicrobials Based on EUCAST Revealed Photoantimicrobials in Cortinariaceae
    DOI 10.1101/2021.04.02.438202
    Typ Preprint
    Autor Fiala J
    Seiten 2021.04.02.438202
    Link Publikation
  • 2021
    Titel A New High-Throughput-Screening-Assay for Photoantimicrobials Based on EUCAST Revealed Unknown Photoantimicrobials in Cortinariaceae
    DOI 10.3389/fmicb.2021.703544
    Typ Journal Article
    Autor Fiala J
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 703544
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Light in the box - photobiological examination chamber with light trap ventilation system for studying fungal surface cultures illustrated with Metarhizium brunneum and Beauveria brongniartii
    DOI 10.21203/rs.3.rs-2572234/v1
    Typ Preprint
    Autor Vrabl P
  • 2023
    Titel Light in the box—photobiological examination chamber with light trap ventilation system for studying fungal surface cultures illustrated with Metarhizium brunneum and Beauveria brongniartii
    DOI 10.1186/s40694-023-00159-w
    Typ Journal Article
    Autor Vrabl P
    Journal Fungal Biology and Biotechnology
    Seiten 11
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Growth, morphology, and formation of cinnabarin in Pycnoporus cinnabarinus in relation to different irradiation spectra
    DOI 10.1007/s43630-023-00493-3
    Typ Journal Article
    Autor Schinagl C
    Journal Photochemical & Photobiological Sciences
    Seiten 2861-2875
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Einfluss von Licht auf Wachstum und Physiologie von phosphatlimitierten Bioreaktorbatchkulturen von Penicillium ochrochloron
    Typ Other
    Autor Silvia Thurner
  • 2020
    Titel Wachstum und Physiologie ammoniumlimitierter Bioreaktorbatchkulturen von Penicillium ochrochloron CBS 123.823 in Abhängigkeit von den Belichtungsbedingungen
    Typ Other
    Autor Julia Metzlaff
  • 2020
    Titel Growth and physiology of carbon limited Penicillium ochrochloron cultures in dependence of the illumination conditions
    Typ Other
    Autor Flora Burgstaller
  • 2020
    Titel Microbiology-to-go: Schulungsprogramm für Primär- und Sekundarlehrpersonen zur Umsetzung grundlegender mikrobiologischer Techniken in Schulen ohne Laborausstattung
    Typ Other
    Autor Daria Elisabeth Walch
  • 2020
    Titel Boxing Pochl: Planung, Gehäusebau und Testung von Belichtungsboxen zur Minimierung der phänotypischen Plastizität von Pilzen im mikrobiologischen Alltag und der Wissenschaftskommunikation
    Typ Other
    Autor Kim Meling Linda Oun
  • 2020
    Titel Das Glove Box Modulsystem: Basis für Petrischalenversuche im Schul- und Wissenschaftskommunikationsbereich
    Typ Other
    Autor Lisa-Marie Pohl
  • 2020
    Titel Xanthoepocinproduction in Penicillium ochrochloron and its physiological requirments
    Typ Other
    Autor Jacqueline Winkler
  • 2021
    Titel Etablierung erster Co-Kultivierungen von Penicillium ochrochloron, Metarhizium brunneum und Escherichia coli in Bioreaktoren unter ausgewählten Nährstoffbedingungen
    Typ Other
    Autor Benjamin Ahorn
  • 2021
    Titel Cinnabarin production in Pycnoporus cinnabarinus in dependence of medium composition, temperature and light conditions
    Typ Other
    Autor Gaja Spes
  • 2021
    Titel SchülerInnenvorstellungen zu Antibiotika und Antibiotikaresistenzen - Eine Fallstudie
    Typ Other
    Autor Elisa Rabanser
  • 2021
    Titel Out of the Dark: Influence of visible light on growth, spore production and virulence of Metarhizium brunneum
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Larcher M.
    Konferenz ALVA-Jahrestagung
    Seiten 378 - 380
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Challenging the charge balance hypothesis: reconsidering buffer effect and reuptake of previously excreted organic acids by Penicillium ochrochloron
    DOI 10.1093/femsle/fnaa039
    Typ Journal Article
    Autor Artmann D
    Journal FEMS Microbiology Letters
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Die Pigmentproduktion von Talaromyces flavus und Talaromyces minioluteus unter ausgewählten Kultivierungsbedingungen und die fachdidaktische Aufarbeitung des Themas Pilze in der Heilkunst
    Typ Other
    Autor Hedieh Herzog
  • 2022
    Titel Auswirkungen verschiedener Belichtungsbedingungen auf das Wachstum und die Physiologie phosphatlimitierter Monokulturen und Co-Kulturen von Penicillium ochrochloron und Metarhizium brunneum mit besonderer Berücksichtigung der Destruxinausscheidung durch Metarhizium brunneum
    Typ Other
    Autor Michaela Riedelsperger
  • 2022
    Titel Influence of light on growth, physiology, and destruxin formation of Saboraud-4%-glucose grown bioreactor batch cultures of Metarhizium brunneum
    Typ Other
    Autor Jan Schobert
  • 2022
    Titel Influence of light on growth, physiology, and destruxin production of ammonium limited bioreactor batch cultures of Metarhizium brunneum
    Typ Other
    Autor Sophie Ann Erckert
  • 2022
    Titel Establishment, evaluation, and application of an ImageJ based biomass estimation method for microbroth dilution susceptibility testing of fungal crude extracts
    Typ Other
    Autor Janine Kraussler
  • 2023
    Titel Fungal Anthraquinone Photoantimicrobials Challenge the Dogma of Cationic Photosensitizers
    DOI 10.1021/acs.jnatprod.2c01157
    Typ Journal Article
    Autor Hammerle F
    Journal Journal of Natural Products
    Seiten 2247-2257
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Qualitative und quantitative Untersuchungen zum Einfluss von Licht auf das Sekundärmetabolitenprofil von Talaromyces wortmannii
    Typ Other
    Autor Christina Schober
  • 2022
    Titel Xanthoepocin, a photolabile antibiotic of Penicillium ochrochloron CBS 123823 with high activity against multiresistant gram-positive bacteria
    DOI 10.1186/s12934-021-01718-9
    Typ Journal Article
    Autor Vrabl P
    Journal Microbial Cell Factories
    Seiten 1
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Argumentieren im Biologieunterricht: Eine Analyse von Argumentationsstrukturen zum Thema Antibiotika
    Typ Other
    Autor Thaler Julia
  • 2019
    Titel A convenient workflow to spot photosensitizers revealed photo-activity in basidiomycetes
    DOI 10.1039/c8ra10181g
    Typ Journal Article
    Autor Siewert B
    Journal RSC Advances
    Seiten 4545-4552
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Einfluss der Pufferung auf Wachstum, Ausscheidung von Zitronensäure und antibakterielle Wirkung von Penicillium ochrochloron
    Typ Other
    Autor Rebekka Gianordoli
  • 2019
    Titel FOCUS POCHL: Konzipierung und Realisierung von Lichtsystemen für Versuche zur Wirkung von Licht auf Penicillium ochrochloron und anderen Pilzen für Labor und Wissenschaftskommunikation
    Typ Other
    Autor Lisa Marie Kaufmann
  • 2019
    Titel : Kampf gegen Multiresistenzen
    Typ Other
    Autor Schinagl C.W.
    Konferenz wissenswert - Magazin der Leopold-Franzens-Universität Innsbruck
    Link Publikation
  • 2019
    Titel On the trail of fungal defense strategies – Employing a special workflow to spot photoactivity
    DOI 10.1055/s-0039-3400069
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Hammerle F
    Seiten 1541-1542
  • 2019
    Titel Critical evaluation of a putative glucosamine excretion by Aspergillus niger CBS120.49 and Penicillium ochrochloron CBS123.824 under citric acid producing conditions
    DOI 10.1038/s41598-019-43976-z
    Typ Journal Article
    Autor Artmann D
    Journal Scientific Reports
    Seiten 7496
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Fungal Growth in Batch Culture – What We Could Benefit If We Start Looking Closer
    DOI 10.3389/fmicb.2019.02391
    Typ Journal Article
    Autor Vrabl P
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 2391
    Link Publikation
Disseminationen
  • 2019 Link
    Titel Junge Menschen zur kritischen Auseinandersetzung mit Multiresistenzen anregen
    Typ A magazine, newsletter or online publication
    Link Link
  • 2019 Link
    Titel Kampf gegen Multiresistenzen (wissenswert - Magazin der Leopold-Franzens-Universität Innsbruck)
    Typ A magazine, newsletter or online publication
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2022
    Titel Biotechnology meets Fungal Photophysiology: the underestimated crosstalk between leight and fungal primary and secondary metabolism. XVI. Biotechnet Summer School on Advanced Biotechnology, Innsbruck, 15.09.2022
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Fungal Photophysiology - Exploring the crosstalk between light and fungal Metabolism. 2nd Mycology Tyrol Mini-Symposium
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2017
    Titel Triggering bioactive metabolite production in fungi, 1st Mycology Tyrol Mini Symposium
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
Weitere Förderungen
  • 2018
    Titel Promotional Grant for young scientists [aim: to establish the illumination equipment and methods for the FWF project T862]
    Typ Capital/infrastructure (including equipment)
    Förderbeginn 2018
  • 2018
    Titel Race against superbugs - when antibiotics stop working
    Typ Other
    Förderbeginn 2018

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