Unsterbliche Titanen: Besitzt die Titanenwurz eine Keimbahn?
Immortal titans: Does a germline exist in the titan arum?
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (80%); Informatik (20%)
Keywords
-
Germline,
Comparative Genomics,
Amorphophallus titanum
Bei der Fortpflanzung übertragen Organismen genetisches Material an ihre Nachkommen. Das betrifft auch Mutationen, die jeder Organismus mit der Zeit anreichert. Handelt es sich dabei um schädliche Mutationen, kann dies schwerwiegende Konsequenzen für das Überleben der Nachkommen haben. In den meisten Tierarten hat sich daher eine Keimbahn, eine Zelllinie mit reduzierter Mutationsrate, entwickelt, die die Anzahl an Mutationen, die an die Nachkommen übertragen werden, reduziert. Lange galt es als erwiesen, dass Pflanzen hingegen keine Keimbahn besitzen und ihre Geschlechtszellen einen Großteil der Mutationen, die im vegetativen Gewebe auftreten, enthalten und diese dann auch an die Nachkommen weitergeben. Neueste Studien an kurzlebigen Pflanzenarten, wie z.B. der Ackerschmalwand oder Tomaten, widersprechen dieser Ansicht. Es ist allerdings noch unklar, ob die vermeintliche Keimbahn in allen und besonders auch in langlebigen Pflanzenarten zu finden ist. Der Grund dafür liegt darin, dass Mutationsraten allgemein gering sind und man mehrere Generationen abwarten müsste, um signifikante Unterschiede zwischen verschiedenen Zelllinien zu erkennen. Bei langlebigen Pflanzen, die in der Regel auch lange Generationszeiten haben, wäre dies schwer machbar. In unserem Projekt möchten wir zur Auflösung dieser Kontroverse beitragen und untersuchen, ob eine Keimbahn in langlebigen Pflanzen existiert. Unser Modellsystem, Amorphophallus titanum Becc., die Titanenwurz, bringt den größten unverzweigten Blütenstand im Pflanzenreich hervor. Die Titanenwurz ist in den Urwäldern der indonesischen Insel Sumatra beheimatet und wird seit 1878 in Botanischen Gärten weltweit kultiviert. Während der Blüte wächst der Blütenstand in sehr kurzer Zeit zu seiner vollen Größe, bis zu drei Metern, aus. Nach einer Wachstumsphase von nur 25-46 Tagen ist diese Größe erreicht und die Pflanze blüht für zwei Tage. Während der Blüte verströmt sie einen extremen Aasgeruch, der Bestäuber anlockt. Die Blüte der Titanenwurz ist spektakulär, da die Kultivierung der Pflanze anspruchsvoll ist und Blühereignisse selten und schwer vorhersagbar sind. Wir werden das beschleunigte Wachstum während der Entwicklung des Blütenstands nutzen, um die Mutationsraten in Zelllinien mit vegetativen bzw. reproduktiven Funktionen zu bestimmen. Dazu wollen wir das Genom verschiedener Gewebearten von einzelnen Pflanzen während der Blüte vergleichen. Wir erwarten, dass die Anzahl an Zellteilungen im Blütenstand nach der extremen Wachstumsphase vergleichbar ist mit der Zahl an Zellteilungen nach mehreren Generationen und verwenden A. titanum daher als natürliches Modellsystem für eine erhöhte Mutationsrate. Unsere Vergleiche werden einen direkten Hinweis auf die Existenz einer Keimbahn in A. titanum liefern. Zudem wird das erste Genom dieser faszinierenden Pflanzenart entschlüsselt, welches dann als Grundlage für weitere Forschungsfragen dienen kann, unter anderem zur Entschlüsselung des Gigantismus bei Pflanzen.
Bei der Fortpflanzung übertragen Organismen genetisches Material an ihre Nachkommen. Das betrifft auch Mutationen, die jeder Organismus mit der Zeit anreichert. Handelt es sich dabei um schädliche Mutationen, kann dies schwerwiegende Konsequenzen für das Überleben der Nachkommen haben. In den meisten Tierarten hat sich daher eine Keimbahn, eine Zelllinie mit reduzierter Mutationsrate, entwickelt, die die Anzahl an Mutationen, die an die Nachkommen übertragen werden, reduziert. Lange galt es als erwiesen, dass Pflanzen hingegen keine Keimbahn besitzen und ihre Geschlechtszellen einen Großteil der Mutationen, die im vegetativen Gewebe auftreten, enthalten und diese dann auch an die Nachkommen weitergeben. Neueste Studien an kurzlebigen Pflanzenarten, wie z.B. der Ackerschmalwand oder Tomaten, widersprechen dieser Ansicht. Es ist allerdings noch unklar, ob die vermeintliche Keimbahn in allen und besonders auch in langlebigen Pflanzenarten zu finden ist. Der Grund dafür liegt darin, dass Mutationsraten allgemein gering sind und man mehrere Generationen abwarten müsste, um signifikante Unterschiede zwischen verschiedenen Zelllinien zu erkennen. Bei langlebigen Pflanzen, die in der Regel auch lange Generationszeiten haben, wäre dies schwer machbar. Unser Projekt zielte darauf ab, zur Auflösung dieser Kontroverse beizutragen und zu untersuchen, ob eine Keimbahn in langlebigen Pflanzen existiert. Unser Modellsystem, Amorphophallus titanum Becc., die Titanenwurz, bringt den größten unverzweigten Blütenstand im Pflanzenreich hervor. Die Titanenwurz ist in den Urwäldern der indonesischen Insel Sumatra beheimatet und wird seit 1878 in Botanischen Gärten weltweit kultiviert. Während der Blüte wächst der Blütenstand in sehr kurzer Zeit zu seiner vollen Größe, bis zu drei Metern, aus. Nach einer Wachstumsphase von nur 25-46 Tagen ist diese Größe erreicht und die Pflanze blüht für zwei Tage. Während der Blüte verströmt sie einen extremen Aasgeruch, der Bestäuber anlockt. Genau dieses beschleunigte Wachstum während der Entwicklung des Blütenstands haben wir genutzt, um die Mutationsraten in Zelllinien mit vegetativen bzw. reproduktiven Funktionen durch einen Vergleich des Genoms verschiedener Gewebearten einzelner blühender Pflanzen zu bestimmen. Unter der Annahme, dass die Anzahl an Zellteilungen im Blütenstand nach der extremen Wachstumsphase vergleichbar ist mit der Zahl an Zellteilungen nach mehreren Generationen haben wir A. titanum daher als natürliches Modellsystem für eine erhöhte Mutationsrate verwendet. Wir haben einen umfangreichen Genom- und Transkriptomdatensatz der Titanenwurz produziert und das erste Referenzgenom dieser faszinierenden Pflanzenart generiert. Mit Hilfe dieser einzigartigen Daten können wir nun Unterschiede zwischen gewebespezifischen Mutationsraten identifizieren und untersuchen, ob eine Keimbahn in A. titanum existiert.
- Universität Salzburg - 100%
Research Output
- 45 Zitationen
- 5 Publikationen
- 1 Methoden & Materialien
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2022
Titel Simultaneous Inference of Past Demography and Selection from the Ancestral Recombination Graph under the Beta Coalescent DOI 10.1101/2022.09.28.508873 Typ Preprint Autor Korfmann K Seiten 2022.09.28.508873 Link Publikation -
2024
Titel Simultaneous Inference of Past Demography and Selection from the Ancestral Recombination Graph under the Beta Coalescent DOI 10.24072/pcjournal.397 Typ Journal Article Autor Korfmann K Journal Peer Community Journal Link Publikation -
2024
Titel Improved inference of population histories by integrating genomic and epigenomic data DOI 10.7554/elife.89470 Typ Journal Article Autor Sellinger T Journal eLife Link Publikation -
2023
Titel Determinants of rapid adaptation in species with large variance in offspring production DOI 10.1111/mec.16982 Typ Journal Article Autor Korfmann K Journal Molecular Ecology Link Publikation -
2023
Titel Improved inference of population histories by integrating genomic and epigenomic data DOI 10.1101/2023.04.02.535252 Typ Preprint Autor Sellinger T Seiten 2023.04.02.535252 Link Publikation
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2022
Titel Novel HMW-DNA-extraction protocol Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich