Neue Aufgaben für kleine uORF-kodierte Peptide

Messenger RNA Moleküle (mRNAs) werden von der DNA abgeschrieben und kodieren Proteine, die an Ribosomen translatiert werden. Sie bestehen aus dem Bereich, der das entsprechende Protein kodiert und aus nicht-kodierenden Regionen, die nicht translatiert werden. In diesen nicht-kodierenden Regionen befinden sich Elemente, die die Synthese des Proteins post-transkriptionell steuern können. Ein interessantes Element, welches sich in der 5-nicht-kodierenden Region einiger mRNAs befindet, ist eine kurze kodi erende Region, die als uORF (upstream open reading frame) bezeichnet wird. Da Proteine klassisch als Polypeptide mit über 100 Aminosäuren Länge definiert wurden, die eine definierte Sekundär- und Tertiärstruktur einnehmen können, wird allgemein angenommen, dass die kurzen uORFs zur Kontrolle der Proteinsynthese dienen. Den kodierten kurzen Peptiden schreibt man im Allgemeinen keine weitere physiologische Funktion zu. Auffallend ist allerdings, dass einige dieser durch uORFs kodierten Peptide in ihrer Aminos äuresequenz evolutionär besonders hoch konserviert sind. Dies könnte darauf hin deuten, dass sie zusätzlich zu ihrer regulatorischen Funktion der Translation des von der mRNA kodierten Proteins eine weitere biologische Funktion wahrnehmen. Wir möchten dahe r mit diesem Projekt untersuchen, ob uORF-kodierte Peptide spezielle physiologische Funktionen wahrnehmen können. Wir werden dazu ein in seiner Sequenz hoch konserviertes Peptid analysieren, das sich in der 5-nicht kodierenden Region des Transkripts befindet, welches den CDK Inhibitor p27 kodiert. Da dieses Peptid einen hydrophoben Charakter besitzt, werden wir dazu Techniken entwickeln, die zur funktionellen Analyse solcher kurzen hydrophoben Peptide geeignet sind. Mit diesem Projekt könnten wir eine neue Klasse bioaktiver Peptide entdecken.