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Unterstützung für Entwicklung und Transformation von CGPs

Support for Authoring and Transformation of CGPs

Katharina Kaiser (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/TRP71
  • Förderprogramm Translational-Research-Programm
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.11.2010
  • Projektende 31.10.2015
  • Bewilligungssumme 338.168 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (40%); Informatik (60%)

Keywords

    Clinical Practice Guidelines, Information Estraction, Knowledge Modelling

Abstract Endbericht

Klinische Therapierichtlinien und Protokolle (CGPs) sind ein vielversprechendes Mittel zur Qualitätssicherung in der Medizin. Die Unterstützung ihrer Ausführung durch intelligente Systeme erhöht die Akzeptanz bei gleichzeitiger Reduktion der Arbeitsbelastung. Eine Voraussetzung dafür ist, daß CGPs in eine automatisch verarbeitbare Form übersetzt werden. Der dafür notwendige, beträchtliche Aufwand kann durch Methoden der Informationsextraktion reduziert werden, bleibt aber ein aktives Forschungsgebiet mit vielen offenen Fragen. Zugleich liegt bereits umfangreiche Erfahrung aus Projekten vor, die derzeit noch nicht auf die Erstellung neuer CGP in ihrer allgemein verwendeten Form (natürlichsprachlicher Text mit Diagrammen) umgesetzt werden. In Vorgängerprojekten sammelten wir Erfahrung auf dem Gebiet der Therapierichtlinienmodellierung, mit und ohne Einsatz von Informationsextraktion, sowie der Richtlinienvalidierung, -verifikation, und -ausführung. Durch die Kombination von verfügbaren Open Source Modulen planen wir die Entwicklung einer umfassenden Lösung für die Erstellung von CGPs in formaler Notation und in natürlicher Sprache. Zur Erreichung dieses Ziels dienen die folgenden Aufgaben. Evaluierung vorhandener Teillösung für die Erstellung von hochstrukturierten, umfangreichen Dokumenten durch ein heterogenes Team, dessen Mitglieder örtlich getrennt arbeiten. Integration einer passenden Auswahl von Open Source Modulen, die durch maßgeschneiderte Lösungen für die besonderen Erfordernisse des Anwendungsgebiets zu einem Prototyp ergänzt werden. Weiterentwicklung der Informationsextraktionsmethoden zur Unterstützung der Umformung von CGPs in natürlicher Sprache in formale Modelle. Erstellung von beispielhaften Anwendungsfällen und Evaluierung des Prototyps mit Experten des Anwendungsgebiets. Erstellung von Schulungsmaterial und Abhalten eines Workshops sowie mehrerer Treffen mit Fachleuten und potentiellen Nutzern um die Verbreitung unserer Lösungen sicherzustellen. Das Ergebnis des Projekts wird aus den Beispielmodellen und neu entwickelten Methoden bestehen, die die Erstellung von natürlichsprachlichen CGPs und ihren formalen Modellen der praktischen Anwendung einen entscheidenden Schritt weiterbringen. Dadurch wird nicht nur die Erstellung formaler Modelle vereinfacht, sondern auch die Erstellung neuer CGPs in natürlicher Sprache durch ein verteilt agierendes Team.

Ein wichtiger Teil des Gesundheitswesens ist die praktische Umsetzung evidenzbasierter Medizin. Um die Behandlung mithilfe von Therapierichtlinien in der Praxis zu unterstützen versucht man, diese Richtlinien in das Krankenhausinformationssystem zu integrieren. Dazu müssen sie in einer dem Computer verständlichen Form gespeichert werden, d.h., nicht als reiner Text in einer natürlichen Sprache. In unserem Projekt haben wir uns mit der Übersetzung von Therapierichtlinien, die ursprünglich in natürlicher Sprache vorliegen, in für den Computer verständliche Formate sowie der Wartung der Übersetzungen bei kleineren Änderungen des Originals beschäftigt. Dazu haben wir zuerst eine halbformale Darstellung entwickelt, die es auch Benutzern mit geringem technischen Wissen ermöglicht, den Inhalt von Richtlinien für die weiteren Modellierungsschritte aufzubereiten. Daneben haben wir auch die Anforderung an Software für diesen Zweck erhoben. Da die Modellierung von Therapierichtlinien arbeitsaufwändig und komplex ist, untersuchten wir Möglichkeiten zur teilweisen Automatisierung mithilfe von Informationsextraktion. Wir verwendeten lexikalische und linguistische Merkmale, sowie semantische Beziehungen zwischen ihnen, und haben heuristische und regelbasierte Methoden entwickelt, sowie Methoden, die auf maschinellem Lernen beruhen. Daneben analysierten wir die Dimension Zeit im Kontext des richtliniengestützten Behandlungsprozesses. Wir zeigten auf, wie zeitbezogene Information im Richtlinientext zur Erkennung von Aktivitäten und zu ihrer Anordnung innerhalb des Behandlungsablaufs verwendet werden können. Außerdem entwickelten wir Methoden zur Übersetzung von verschiedenen Arten vom Computer lesbarer Modelle von Therapierichtlinien in einander. Das ist für die Wiederverwendung von Modellteilen wichtig in Situationen, in denen Modelle von Richtlinien in anderen Formaten vorliegen, als jener, die im jeweiligen Krankenhausinformationssystem verwendet wird. Somit können diese Modelle automatisch in das notwendige Format übersetzt werden.

Forschungsstätte(n)
  • FH St. Pölten - 100%

Research Output

  • 48 Zitationen
  • 14 Publikationen
Publikationen
  • 2014
    Titel Using TimeML to Support the Modeling of Computerized Clinical Guidelines
    DOI 10.3233/978-1-61499-432-9-8
    Typ Book Chapter
    Autor Wenzina Reinhardt
    Verlag IOS Press
  • 2013
    Titel Identifying Condition-Action Sentences Using a Heuristic-Based Information Extraction Method
    DOI 10.1007/978-3-319-03916-9_3
    Typ Book Chapter
    Autor Wenzina R
    Verlag Springer Nature
    Seiten 26-38
  • 2011
    Titel Identifying Treatment Activities for Modelling Computer-Interpretable Clinical Practice Guidelines
    DOI 10.1007/978-3-642-18050-7_9
    Typ Book Chapter
    Autor Kaiser K
    Verlag Springer Nature
    Seiten 114-125
  • 2014
    Titel Towards the Application of TimeML in Clinical Pathways.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Kaiser K
    Konferenz Heß, Schlieter (Eds) Modellierung im Gesundheitswesen (ICB Research Reports).
  • 2014
    Titel Using TimeML to support the modeling of computerized clinical guidelines.
    Typ Journal Article
    Autor Kaiser K
    Journal Studies in health technology and informatics
    Seiten 8-12
  • 2015
    Titel GOALS - Modeling Clinical Guidelines Based on TimeML Concepts.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Kaiser K
    Konferenz Proceedings of the 5th International Conference on Digital Health.
  • 2015
    Titel GOALS
    DOI 10.1145/2750511.2750520
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Wenzina R
    Seiten 121-128
  • 2015
    Titel Leveraging workflow control patterns in the domain of clinical practice guidelines
    DOI 10.1186/s12911-016-0253-z
    Typ Journal Article
    Autor Kaiser K
    Journal BMC Medical Informatics and Decision Making
    Seiten 20
    Link Publikation
  • 0
    Titel Modelling declarative knowledge from a clinical Guideline on gestational diabetes (GDM) with temporal abstraction knowledge concepts (TAK): A graph theoretical & statistical analysis of manually & automatically generated models.
    Typ Other
    Autor Kaiser K
  • 0
    Titel BAT - The Brigid Authoring Tool: Asgaard-TR-2013-1.
    Typ Other
    Autor Seyfang A
  • 0
    Titel MHB-F Specification: Asgaard-TR-2011-1.
    Typ Other
    Autor Kaiser K
  • 2011
    Titel Supporting Knowledge Modelling by Multi-modal Learning: Defining the Requirements.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Kaiser K
    Konferenz Proc of the Workshop on Knowledge Representation for Healthcare (KR4HC) in conjunction with the Conference on Artificial Intelligence.
  • 2013
    Titel Visualizing Complex Process Hierarchies during the Modeling Process
    DOI 10.1007/978-3-642-36285-9_77
    Typ Book Chapter
    Autor Seyfang A
    Verlag Springer Nature
    Seiten 768-779
  • 2013
    Titel Supporting Computer-interpretable Guidelines’ Modeling by Automatically Classifying Clinical Actions
    DOI 10.1007/978-3-319-03916-9_4
    Typ Book Chapter
    Autor Minard A
    Verlag Springer Nature
    Seiten 39-52

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