Ewing-Sarkom - eine Enhancer-gesteuerte Krankheit?
Ewing sarcoma – an enhancer disease?
Wissenschaftsdisziplinen
Informatik (20%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (80%)
Keywords
-
Epigenomics,
Cancer Epigenetics,
Ewing sarcoma,
Enhancers
Krebs ist eine der häufigsten Todesursachen für Kinder in Österreich. Fortschritte in der Forschung und Therapie haben die Überlebensrate von krebskranken Kindern zwar auf 80% und mehr erhöht. Allerdings gibt es eine Reihe von seltenen Krebsarten, die sehr aggressiv sind und für die es keine vielversprechenden Therapien gibt. Die Entdeckung von epigenetischen Defekten in einigen dieser Krebsarten das sind Veränderungen in der Art, wie die DNA in einer Zelle verpackt ist bietet interessante neue Ansatzpunkte für die Krebsforschung. Denn epigenetische Defekte können mit geeigneten epigenetischen Medikamenten zumindest theoretisch rückgängig gemacht werden. In unserer Forschung konnten wir zeigen, dass Krebszellen des Ewing-Sarkoms viele epigenetische Defekte haben und insbesondere die sogenannten Enhancer betroffen sind, welche die Aktivität von Genen steuern. In diesem Projekt werden wir daher überprüfen, ob das Ewing-Sarkom eine Enhancer- Krankheit ist. Diese Forschungen tragen zu unserem Verständnis von Krebs bei und können mittelfristig die Entwicklung epigenetischer Therapien für schwer zu behandelnde Krebsarten bei Kindern voranbringen. Das Forschungsprojekt Ewing-Sarkom - eine Enhancer-gesteuerte Krankheit? wird in der Arbeitsgruppe von Professor Heinrich Kovar im CCRI Forschungsinstitut (St. Anna Kinderkrebsforschung) in Wien durchgeführt werden. Das CCRI ist das führende Zentrum für die Kinderkrebsforschung in Österreich und mit der Medizinischen Universität Wien assoziiert. Die geplanten Forschungsarbeiten umfassen Kooperationen mit führenden Krebsforschern in Österreich, Frankreich und Großbritannien.
Krebs ist eine der häufigsten Todesursachen für Kinder in Österreich. Fortschritte in der Forschung und Therapie haben die Überlebensrate von krebskranken Kindern zwar auf 80% und mehr erhöht. Allerdings gibt es eine Reihe von seltenen Krebsarten, die sehr aggressiv sind und für die es keine vielversprechenden Therapien gibt. Die Entdeckung von epigenetischen Defekten in einigen dieser Krebsarten (als "epigenetisch" bezeichnen wir Veränderungen in der Art, wie die DNA in einer Zelle verpackt ist) bietet interessante neue Ansatzpunkte für die Krebsforschung. Denn epigenetische Defekte können mit geeigneten epigenetischen Medikamenten zumindest theoretisch rückgängig gemacht werden. In unserer Forschung konnten wir zeigen, dass Krebszellen des Ewing-Sarkoms viele epigenetische Defekte haben und insbesondere die sogenannten Enhancer betroffen sind - das sind genomische Regionen, die die Aktivität von Genen steuern. In diesem Projekt haben wir daher untersucht, ob das Ewing-Sarkom als eine Krankheit falsch regulierter Enhancer betrachtet werden sollte. Diese Forschungen tragen zu unserem Verständnis von Krebs bei und können mittelfristig die Entwicklung epigenetischer Therapien für schwer zu behandelnde Krebsarten bei Kindern voranbringen. Das Forschungsprojekt "Ewing-Sarkom - eine Enhancer-gesteuerte Krankheit?" wurde in der Arbeitsgruppe von Eleni Tomazou im CCRI Forschungsinstitut (St. Anna Kinderkrebsforschung) in Wien durchgeführt. Das CCRI ist das führende Zentrum für die Kinderkrebsforschung in Österreich und mit der Medizinischen Universität Wien assoziiert. Die Forschungsarbeiten umfassten Kooperationen mit führenden Krebsforschern in Österreich, Frankreich, Deutschland und Großbritannien.
- Olivier Delattre, Institut Curie - Frankreich
- Stephan Beck, University College London - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 1450 Zitationen
- 13 Publikationen
- 1 Künstlerischer Output
- 1 Datasets & Models
- 1 Disseminationen
- 3 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 8 Weitere Förderungen
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2021
Titel Seeking commonalities in fusion proteins of NUP98. DOI 10.1038/s41594-021-00558-w Typ Journal Article Autor Slape Ci Journal Nature structural & molecular biology Seiten 123-124 -
2021
Titel Multimodal analysis of cell-free DNA whole-genome sequencing for pediatric cancers with low mutational burden DOI 10.5167/uzh-212397 Typ Other Autor Peneder Link Publikation -
2021
Titel Multimodal analysis of cell-free DNA whole-genome sequencing for pediatric cancers with low mutational burden DOI 10.1038/s41467-021-23445-w Typ Journal Article Autor Peneder P Journal Nature Communications Seiten 3230 Link Publikation -
2021
Titel Biomolecular condensation of NUP98 fusion proteins drives leukemogenic gene expression DOI 10.1038/s41594-020-00550-w Typ Journal Article Autor Terlecki-Zaniewicz S Journal Nature Structural & Molecular Biology Seiten 190-201 Link Publikation -
2022
Titel Chapter 31 Epigenetic heterogeneity in primary bone cancers DOI 10.1016/b978-0-12-821666-8.00039-6 Typ Book Chapter Autor Peneder P Verlag Elsevier Seiten 431-445 -
2022
Titel High-content drug screening in zebrafish xenografts reveals high efficacy of dual MCL-1/BCL-XL inhibition against Ewing sarcoma DOI 10.1016/j.canlet.2022.216028 Typ Journal Article Autor Grissenberger S Journal Cancer Letters Seiten 216028 Link Publikation -
2019
Titel EWS–FLI1 modulated alternative splicing of ARID1A reveals novel oncogenic function through the BAF complex DOI 10.1093/nar/gkz699 Typ Journal Article Autor Selvanathan S Journal Nucleic Acids Research Seiten 9619-9636 Link Publikation -
2016
Titel High-throughput RNAi screen in Ewing sarcoma cells identifies leucine rich repeats and WD repeat domain containing 1 (LRWD1) as a regulator of EWS-FLI1 driven cell viability DOI 10.1016/j.gene.2016.10.021 Typ Journal Article Autor He T Journal Gene Seiten 137-146 -
2018
Titel Ewing sarcoma DOI 10.1038/s41572-018-0003-x Typ Journal Article Autor Grünewald T Journal Nature Reviews Disease Primers Seiten 5 -
2018
Titel MIRA: an R package for DNA methylation-based inference of regulatory activity DOI 10.1093/bioinformatics/bty083 Typ Journal Article Autor Lawson J Journal Bioinformatics Seiten 2649-2650 Link Publikation -
2020
Titel Sarcoma treatment in the era of molecular medicine DOI 10.15252/emmm.201911131 Typ Journal Article Autor Grünewald T Journal EMBO Molecular Medicine Link Publikation -
2017
Titel DNA methylation heterogeneity defines a disease spectrum in Ewing sarcoma DOI 10.1038/nm.4273 Typ Journal Article Autor Sheffield N Journal Nature Medicine Seiten 386-395 Link Publikation -
2017
Titel EWS-FLI1 perturbs MRTFB/YAP-1/TEAD target gene regulation inhibiting cytoskeletal autoregulatory feedback in Ewing sarcoma DOI 10.1038/onc.2017.202 Typ Journal Article Autor Katschnig A Journal Oncogene Seiten 5995-6005 Link Publikation
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2018
Titel Sohn Conference: Accelerating Translation of Pediatric Cancer Research Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel Research award for best publication Typ Research prize Bekanntheitsgrad National (any country) -
2017
Titel German Sarcoma Conference Prize for best paper in the field of sarcoma tumors Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International
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2024
Titel HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF EngineeringSARCOMAs Typ Fellowship Förderbeginn 2024 -
2023
Titel ERC-2022-CoG SARCOMAkids Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2023 -
2018
Titel Austrian National Bank (OeNB) Jubilaeumsfonds Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2018 -
2019
Titel WWTF Life Sciences 2018 Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2019 -
2021
Titel WWTF Life Sciences 2020 Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2021 -
2021
Titel FWF Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2021 -
2021
Titel FWF Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2021 -
2022
Titel Cracking the ribosome code of drug resistance in sarcomas Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2022