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SPM Studien von zellulären Wechselwirkungen mit Biofilm

SPM studies on single cellular interactions with biofilm

Yoo Jin Oh (ORCID: 0000-0002-9636-3329)
  • Grant-DOI 10.55776/V584
  • Förderprogramm Elise Richter
  • Status beendet
  • Projektbeginn 15.08.2018
  • Projektende 14.02.2023
  • Bewilligungssumme 361.578 €
  • Projekt-Website

Matching Funds - Oberösterreich

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (50%); Nanotechnologie (10%); Physik, Astronomie (40%)

Keywords

    Scanning Probe Microscopy, Force Spectroscopy, Atomic Force Microscopy, E. coli, Biofilm, Curli

Abstract Endbericht

Viele Infektionskrankheiten beim Menschen werden durch virulente Biofilme verursacht, die von komplexen Wechselwirkungen zwischen spezifischen Mikroorganismen und deren extrazellulärer Umgebung resultieren. Beteiligt an der Biofilmbildung sind verschiedene Arten von filamenten Strukturen, die auch immunogene Komplexe mit der DNA bilden. Es ist bekannt, dass bakterielle Infektionen zur Pathogenese beitragen, indem sie Zelltod und Entzündungen induzieren. Die genauen Mechanismen und die daran beteiligten Moleküle, die zur Pathogenese der Zellen führen, sind jedoch bis heute weitgehend unklar. Dieses Projekt zielt darauf ab, die einzigartigen physikalischen, biochemischen und elektrostatischen Eigenschaften von lebenden Bakterienzellen und Biofilmen zu erforschen. Mit einem Portfolio von Rastersondenmikroskopie-basierten Methoden mit Nanometer räumlicher Auflösung und Einzelmolekül-Detektionsempfindlichkeit werden wir die Moleküle studieren, welche an der Bindung von Bakterien an Oberflächen und der Entwicklung von Biofilmen beteiligt sind. Chemische, elektrostatische und mechanische Eigenschaften von Biofilmen werden während der Reifung beobachtet werden. Unter den durch pathogene Bakterien verursachten Infektionen ist die breite Palette von Autoimmunerkrankungen, bei denen das Immunsystem eine gestörte Reaktion gegen die eigenen Zellen, Gewebe oder Organe produziert. Wir werden daher die molekularen Wechselwirkungen von Biofilmen mit Zellen des Immunsystems studieren und die Immunantwort, die durch die Bindung der Immunzellen an Biofilme ausgelöst wird, detektieren. Ziel des Projektes ist es, unser Verständnis der Biofilmbildung grundlegend zu erweitern und genau zu verstehen, warum Biofilme Krankheiten, wie die Autoimmunerkrankungen, hervorrufen können. PR_abstract_deu

Das übergeordnete Ziel dieses Projekts bestand darin, die detaillierten molekularen Mechanismen zu verstehen, die der bakteriellen Biofilmbildung und der Entwicklung der Pathogenität zugrunde liegen. Zu diesem Zweck haben wir das Verständnis der mikrobiellen Struktur auf der Nanoskala erweitert, idealerweise auf der Ebene einzelner Moleküle, und zwar über alle Phasen hinweg, von der anfänglichen Anheftung über die Biofilmbildung bis hin zur Immunstimulation. Außerdem konnten wir unseren Ansatz auf ein breiteres Spektrum von Krankheitserregern ausdehnen, und zwar nicht nur auf bakterielle, sondern auch auf virale Pathogenität, wie es bei der letzten Pandemie der Fall war. Die neu gewonnenen Erkenntnisse sind wichtig für die Entwicklung von antibakteriellen Medikamenten gegen erregerbedingte Krankheiten und für den hochempfindlichen Nachweis der Pathogenität. Viele Fragen zu Krankheitserregern und ihrer molekularen Rolle bei Krankheiten müssen noch beantwortet werden. In diesem Projekt haben wir molekulare Mothoden entwickelt, welche die Einschränkungen anderer Methoden in Bezug auf Empfindlichkeit und Auflösung überwinden. Wir haben wichtige strukturelle Informationen über Krankheitserreger und molekulare Details von Biomolekülen erhalten, die an pathogenbedingten Krankheitsmechanismen beteiligt sind.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Linz - 100%

Research Output

  • 342 Zitationen
  • 11 Publikationen
Publikationen
  • 2021
    Titel Identification of lectin receptors for conserved SARS-CoV-2 glycosylation sites
    DOI 10.15252/embj.2021108375
    Typ Journal Article
    Autor Hoffmann D
    Journal The EMBO Journal
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Force spectroscopy of single cells using atomic force microscopy
    DOI 10.1038/s43586-021-00062-x
    Typ Journal Article
    Autor Viljoen A
    Journal Nature Reviews Methods Primers
    Seiten 63
  • 2024
    Titel Plant-Derived Anti-Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 Antibody Suppresses Trastuzumab-Resistant Breast Cancer with Enhanced Nanoscale Binding
    DOI 10.1021/acsnano.4c00360
    Typ Journal Article
    Autor Park C
    Journal ACS Nano
    Seiten 16126-16140
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Nanoscale Characteristics and Antimicrobial Properties of (SI-ATRP)-Seeded Polymer Brush Surfaces
    DOI 10.1021/acsami.9b09885
    Typ Journal Article
    Autor Oh Y
    Journal ACS Applied Materials & Interfaces
    Seiten 29312-29319
  • 2022
    Titel Force-tuned avidity of spike variant-ACE2 interactions viewed on the single-molecule level
    DOI 10.1038/s41467-022-35641-3
    Typ Journal Article
    Autor Zhu R
    Journal Nature Communications
    Seiten 7926
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Molecular Recognition in Confined Space Elucidated with DNA Nanopores and Single-Molecule Force Microscopy
    DOI 10.1021/acs.nanolett.3c00743
    Typ Journal Article
    Autor Suh S
    Journal Nano Letters
    Seiten 4439-4447
    Link Publikation
  • 2021
    Titel A molecularly engineered, broad-spectrum anti-coronavirus lectin inhibits SARS-CoV-2 and MERS-CoV infection in vivo
    DOI 10.21203/rs.3.rs-516695/v1
    Typ Preprint
    Autor Markovitz D
  • 2021
    Titel Nanomechanical mechanisms of Lyme disease spirochete motility enhancement in extracellular matrix
    DOI 10.1038/s42003-021-01783-1
    Typ Journal Article
    Autor Strnad M
    Journal Communications Biology
    Seiten 268
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A molecularly engineered, broad-spectrum anti-coronavirus lectin inhibits SARS-CoV-2 and MERS-CoV infection in vivo
    DOI 10.1016/j.xcrm.2022.100774
    Typ Journal Article
    Autor Chan J
    Journal Cell Reports Medicine
    Seiten 100774
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Assessment of Efficacy of a Novel Crosslinking Protocol with Intracameral Oxygen (Bubble-CXL) in Increasing the Corneal Stiffness Using Atomic Force Microscopy
    DOI 10.3390/nano12183185
    Typ Journal Article
    Autor Alkhalde A
    Journal Nanomaterials
    Seiten 3185
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Ultra-Sensitive and Label-Free Probing of Binding Affinity Using Recognition Imaging
    DOI 10.1021/acs.nanolett.8b04883
    Typ Journal Article
    Autor Oh Y
    Journal Nano Letters
    Seiten 612-617

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