Immunologie unter dem Nanoskop
Immunology at a Nanoscopic View: A Single-Molecule Approach
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (50%)
Keywords
-
Single Molecule Microscopy,
Lipid Rafts,
Immunological Synapse,
T cell activation,
Resolution,
Protein-Protein Interaction
Gegenwärtig zielt wissenschaftliche Forschung in so gut wie allen Gebieten der Naturwissenschaften auf eine Erforschung des Nanokosmos - des Kollektivs von Strukturen mit Abmessungen zwischen 1 und 100nm - ab. Es existiert gegenwärtig ein großer Bedarf an Technologien, die den Zugang zu diesen Dimensionen ermöglichen, um im Nanokosmos strukturieren, manipulieren, oder mit hoher Auflösung messen zu können. In den Lebenswissenschaften weckt die Mannigfaltigkeit dieses Nanokosmos bei immer mehr WissenschafterInnen - aber auch bei Investoren mit langen Planungshorizonten - das Interesse am aufstrebenden Bereich der Nanobiotechnologie, also der Biotechnologie auf oder für die nanoskopische Dimension. Der erfolgreiche Projektantrag zielt darauf ab, Einzelmolekül-Mikroskopie als ein neues Werkzeug für das Studium von Nanostrukturen und molekularen Dynamiken in lebenden biologischen Zellen zu etablieren. Die Methode ist allgemein, auf eine Vielzahl von biologischen Systemen, anwendbar. Für das vorliegende Projekt fiel die Themenwahl auf einen brandaktuellen Bereich in der Immunologie, der Formierung der immunologischen Synapse zur T Zell Aktivierung. Die korrekte Formierung dieser stabilen Kontaktzone zwischen antigen-präsentierender Zelle und T Zelle stellt einen wichtigen Schritt in der Aktivierung unseres Immunsystems dar. Die Aktivierung von T Zellen hängt in kritischer Weise von der anhaltenden und aufeinander abgestimmten Interaktion von Liganden (i.e. die einen Partner einer molekularen Wechselwirkung) und Rezeptoren (i.e. die zweiten Partner dieser Wechselwirkung) auf den beiden gegenüberliegenden Zellen ab. Gegenwärtig müssen sich ForscherInnen allerdings auf kinetische Parameter verlassen, die in hochgradig artifiziellen Experimenten an aufgereinigten Substanzen (das sind Substanzen, die nicht im zellulären Milieu, sondern in hochreiner Form gelöst vorliegen) gewonnen wurden. In diesem Projekt werden neue Techniken der Einzelmolekül-Mikroskopie verwendet, um Interaktionen zwischen zwei verschiedenen Proteinen direkt im zellulären Kontext zu bestimmen. Darüber hinaus werden Substrukturen in der sich entwickelnden Synapse auf einer Größenskala von wenigen zehn Nanometern untersucht, wobei die hervorragende Positionsgenauigkeit der Methode ausgenutzt wird. Auf diesem Weg soll es gelingen, endlich die Rolle von Lipid-Domänen in der Aktivierung von T Zellen aufklären zu können. Bis jetzt gibt es viele Hinweise darauf, dass solche nanoskopischen Lipid-Plattformen für die korrekte T Zell-Aktivierung relevant sind. Wegen ihrer geringen Größe von wenigen Nanometern entzogen sie sich jedoch bislang einer direkten Beobachtung. Es ist faszinierend zu erkennen, dass bereits einige wenige Antigen-Moleküle die Ausbildung einer immunologischen Synapse bewirken können. Die extreme Empfindlichkeit der T Zell-Aktivierung lässt ultrasensitive Mikroskopie als die geeignete Methode erscheinen, um die dabei ablaufenden molekularen Re-Arrangements zu beobachten.
Hinter dem Titel meines Projektes Immunologie unter dem Nanoskop stand ein Wortspiel: Ich wollte klassische Mikroskopie welche aufgrund physikalischer Limitierungen nur für die Anwendungen auf einer Mikrometer-Skala oder darüber geeignet ist durch ein Verfahren ersetzen, welches durch die Beobachtung einzelner Moleküle auch in der Lage ist, auf der Nanometer-Skala Informationen zu gewinnen. Mittlerweile ist der englische Ausdruck Nanoscopy absolut üblich geworden, und die optische Abbildung auf einer Nanometer-Skala Stand der Forschung, zu der wir im Rahmen des Projektes auch maßgeblich beigetragen haben. In diesem Projekte ging es uns neben der Entwicklung der entsprechenden Mikroskopie-Methoden vor allem um deren Anwendung auf Fragen der Immunologie, speziell der antigen-spezifischen Aktivierung von CD4-positiven T-Zellen. Dazu bindet der T-Zell-Rezeptor das über MHCII präsentierte Antigen auf einer kontaktierten Antigen-präsentierenden Zelle (APZ). Uns gelang es gemeinsam mit unseren Partnern, diesen Zell-Zell Kontakt durch ein künstliches System nachzubauen, wobei die APZ durch eine künstliche Lipidmembran ersetzt wurde, welche mit den notwendigen aktivierenden Proteinen insbesondere antigen-beladenem MHCII ausgestattet wurde. Farbstoffmoleküle an den Proteinen ermöglichten es uns, gezielt den T-Zell-Rezeptor bei der Erkennung des Antigens zu beobachten. Dabei stellten wir fest, dass die Interaktionszeit drastisch verkürzt ist gegenüber bisherigen Annahmen; es zeigte sich, dass die Zelle an der Bindung zieht und somit die Zeitdauer des gebundenen Zustands verkürzt.Neben diesem zentralen Resultat des Projektes konnten noch zahlreiche weitere Erkenntnisse gewonnen werden. Vor allem beschäftigten wir uns mit der Untersuchung von Zellmembranstrukturen auf der Nanometerskala. Es gab Hinweise, dass sich Proteine und Lipide nicht frei in der Membran bewegen können, weil sie vom darunterliegenden Membranskelett behindert werden. Diese biophysikalisch höchst interessante Frage konnten wir durch eine spezielle Form der Mikroskopie mit extrem hoher Auflösung sowohl in der Zeit als auch im Ort klären: Beobachtungen einzelner lipidverankerter Proteine wiesen klar darauf hin, dass nur eine unwesentliche Beeinflussung von deren Beweglichkeit vorhanden sein kann. Spätere Messungen anderer Arbeitsgruppen bestätigten unsere Resultate.Darüber hinaus waren wir interessiert, ob lipid-mediierte Interaktionen von Proteinen in der Zellmembran existieren. Solche Effekte wurden im Rahmen der sogenannten Raft-Theorie aufgrund biochemischer Daten postuliert, jedoch konnten diese Strukturen nie beobachtet werden. Es wurde vermutet, dass sie entweder zu klein seien, zu kurzlebig, oder nicht vorhanden. Wir entwickelten eine Mikroskopiemethode basierend auf Einzelmolekülbeobachtungen, die speziell zur Lösung solcher Fragestellungen geeignet ist. Damit konnten wir nachweisen, dass Lipid-Plattformen in der Zellmembran existieren, welche allerdings sehr klein sind (<~20nm). Die Methode wurde in weiterer Folge für die Quantifizierung von lokalen Stöchiometrien in Proteinkomplexen verwendet.Zusammengefasst hat es das Start-Projekt ermöglicht, eine Vielzahl an maßgeschneiderten Einzelmolekül- Methoden zu entwickeln und auf das Studium von zentralen Membranprozessen anzuwenden.
- Technische Universität Wien - 100%
- Motomu Tanaka, Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg - Deutschland
- Mark M. Davis, Stanford University School of Medicine - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 2212 Zitationen
- 47 Publikationen
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2017
Titel HDL particles incorporate into lipid bilayers – a combined AFM and single molecule fluorescence microscopy study DOI 10.1038/s41598-017-15949-7 Typ Journal Article Autor Plochberger B Journal Scientific Reports Seiten 15886 Link Publikation -
2013
Titel Improved Ligand Discrimination by Force-Induced Unbinding of the T Cell Receptor from Peptide-MHC DOI 10.1016/j.bpj.2013.03.023 Typ Journal Article Autor Klotzsch E Journal Biophysical Journal Seiten 1670-1675 Link Publikation -
2013
Titel Single Molecule Measurements in Membranes. Typ Book Autor Brameshuber M -
2009
Titel Cell-to-cell variability in the diffusion constants of the plasma membrane proteins CD59 and CD147 DOI 10.1039/b902266j Typ Journal Article Autor Wieser S Journal Soft Matter Seiten 3287-3294 -
2009
Titel Genetically Encoded Förster Resonance Energy Transfer Sensors for the Conformation of the Src Family Kinase Lck DOI 10.4049/jimmunol.0802639 Typ Journal Article Autor Paster W Journal The Journal of Immunology Seiten 2160-2167 Link Publikation -
2009
Titel Reply to “Uncoupling diffusion and binding in FRAP experiments” DOI 10.1038/nmeth0309-183b Typ Journal Article Autor Brameshuber M Journal Nature Methods Seiten 183-184 -
2009
Titel Direct Observation and Quantitative Analysis of Lck Exchange between Plasma Membrane and Cytosol in Living T Cells* DOI 10.1074/jbc.m109.025981 Typ Journal Article Autor Zimmermann L Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 6063-6070 Link Publikation -
2008
Titel How the sum of its parts gets greater than the whole DOI 10.1038/nmeth0208-133 Typ Journal Article Autor Brameshuber M Journal Nature Methods Seiten 133-134 -
2008
Titel Different Types of Cell-to-Cell Connections Mediated by Nanotubular Structures DOI 10.1529/biophysj.108.131375 Typ Journal Article Autor Veranic P Journal Biophysical Journal Seiten 4416-4425 Link Publikation -
2008
Titel High throughput FRET screening of the plasma membrane based on TIRFM DOI 10.1002/cyto.a.20551 Typ Journal Article Autor Paar C Journal Cytometry Part A Seiten 442-450 -
2008
Titel Versatile Analysis of Single-Molecule Tracking Data by Comprehensive Testing against Monte Carlo Simulations DOI 10.1529/biophysj.108.141655 Typ Journal Article Autor Wieser S Journal Biophysical Journal Seiten 5988-6001 Link Publikation -
2008
Titel Micropatterning for quantitative analysis of protein-protein interactions in living cells DOI 10.1038/nmeth.1268 Typ Journal Article Autor Schwarzenbacher M Journal Nature Methods Seiten 1053-1060 -
2008
Titel Plasma Membrane Fluidity Affects Transient Immobilization of Oxidized Phospholipids in Endocytotic Sites for Subsequent Uptake* DOI 10.1074/jbc.m807591200 Typ Journal Article Autor Rhode S Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 2258-2265 Link Publikation -
2008
Titel Single Molecule Microarray Analysis. Typ Book Chapter Autor Hesse J -
2008
Titel Tracking single molecules in the live cell plasma membrane—Do’s and Don’t’s DOI 10.1016/j.ymeth.2008.06.010 Typ Journal Article Autor Wieser S Journal Methods Seiten 131-140 -
2008
Titel Implementation of alternating excitation schemes in a biochip-reader for quasi-simultaneous multi-color single-molecule detection DOI 10.1016/j.bios.2008.02.019 Typ Journal Article Autor Hesch C Journal Biosensors and Bioelectronics Seiten 1891-1895 -
2007
Titel Single-molecule microscopy reveals heterogeneous dynamics of lipid raft components upon TCR engagement DOI 10.1093/intimm/dxm032 Typ Journal Article Autor Drbal K Journal International Immunology Seiten 675-684 Link Publikation -
2007
Titel Single molecule diffusion analysis on cellular nanotubules: Implications on plasma membrane structure below the diffraction limit DOI 10.1063/1.2822890 Typ Journal Article Autor Wieser S Journal Applied Physics Letters Seiten 233901 Link Publikation -
2007
Titel Lateral diffusion of receptor-ligand bonds in membrane adhesion zones: Effect of thermal membrane roughness DOI 10.1209/0295-5075/78/38003 Typ Journal Article Autor Krobath H Journal EPL (Europhysics Letters) Seiten 38003 Link Publikation -
2007
Titel Single molecule fluorescence microscopy for ultra-sensitive RNA expression profiling DOI 10.1117/12.700244 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Hesse J -
2007
Titel (Un)Confined Diffusion of CD59 in the Plasma Membrane Determined by High-Resolution Single Molecule Microscopy DOI 10.1529/biophysj.106.095398 Typ Journal Article Autor Wieser S Journal Biophysical Journal Seiten 3719-3728 Link Publikation -
2007
Titel Single Molecule Bioanalysis DOI 10.2174/157341207781369358 Typ Journal Article Autor Jan Hesse Journal Current Pharmaceutical Analysis Seiten 186-194 -
2006
Titel RNA expression profiling at the single molecule level DOI 10.1101/gr.4999906 Typ Journal Article Autor Hesse J Journal Genome Research Seiten 1041-1045 Link Publikation -
2005
Titel Thinning out clusters while conserving stoichiometry of labeling DOI 10.1063/1.2158031 Typ Journal Article Autor Moertelmaier M Journal Applied Physics Letters Seiten 263903 -
2012
Titel Determination of Interaction Kinetics between the T Cell Receptor and Peptide-Loaded MHC Class II via Single-Molecule Diffusion Measurements DOI 10.1016/j.bpj.2012.06.019 Typ Journal Article Autor Axmann M Journal Biophysical Journal Link Publikation -
2012
Titel Chapter nine Detection and Quantification of Biomolecular Association in Living Cells using Single-Molecule Microscopy DOI 10.1016/b978-0-12-388448-0.00017-6 Typ Book Chapter Autor Brameshuber M Verlag Elsevier Seiten 159-186 -
2012
Titel Structure, Regulation and Biophysics of ICRAC, STIM/Orai1 DOI 10.1007/978-94-007-2888-2_16 Typ Book Chapter Autor Derler I Verlag Springer Nature Seiten 383-410 -
2011
Titel Membrane-Lipid Therapy in Operation: The HSP Co-Inducer BGP-15 Activates Stress Signal Transduction Pathways by Remodeling Plasma Membrane Rafts DOI 10.1371/journal.pone.0028818 Typ Journal Article Autor Gombos I Journal PLoS ONE Link Publikation -
2011
Titel Cationic amphipathic peptides accumulate sialylated proteins and lipids in the plasma membrane of eukaryotic host cells DOI 10.1016/j.bbamem.2011.06.007 Typ Journal Article Autor Weghuber J Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes Seiten 2581-2590 Link Publikation -
2011
Titel What can we learn from single molecule trajectories? DOI 10.2174/138920311798841753 Typ Journal Article Autor Ruprecht V Journal Current protein & peptide science Seiten 714-24 -
2013
Titel Expression analysis of multiple myeloma CD138 negative progenitor cells using single molecule microarray readout DOI 10.1016/j.jbiotec.2013.01.027 Typ Journal Article Autor Jacak J Journal Journal of Biotechnology Seiten 525-530 Link Publikation -
2010
Titel TCR–peptide–MHC interactions in situ show accelerated kinetics and increased affinity DOI 10.1038/nature08746 Typ Journal Article Autor Huppa J Journal Nature Seiten 963-967 Link Publikation -
2010
Titel Cholesterol Slows down the Lateral Mobility of an Oxidized Phospholipid in a Supported Lipid Bilayer DOI 10.1021/la1026202 Typ Journal Article Autor Plochberger B Journal Langmuir Seiten 17322-17329 Link Publikation -
2010
Titel In-vivo Detection of Protein-protein Interactions on Micro-patterned Surfaces DOI 10.3791/1969 Typ Journal Article Autor Weghuber J Journal Journal of Visualized Experiments : JoVE Seiten 1969 Link Publikation -
2010
Titel Chapter Two Measuring Colocalization by Dual Color Single Molecule Imaging Thresholds, Error Rates, and Sensitivity DOI 10.1016/b978-0-12-381266-7.00002-x Typ Book Chapter Autor Ruprecht V Verlag Elsevier Seiten 21-40 -
2010
Titel Two-color single molecule tracking combined with photobleaching for the detection of rare molecular interactions in fluid biomembranes DOI 10.1039/b916734j Typ Journal Article Autor Ruprecht V Journal Soft Matter Seiten 568-581 -
2010
Titel In-vivo Detection of Protein-protein Interactions on Micro-patterned Surfaces DOI 10.3791/1969-v Typ Journal Article Autor Weghuber J Journal Journal of Visualized Experiments -
2010
Titel Identification of Immobile Single Molecules Using Polarization-Modulated Asynchronous Time Delay and Integration-Mode Scanning DOI 10.1021/ac100302s Typ Journal Article Autor Jacak J Journal Analytical Chemistry Seiten 4288-4292 Link Publikation -
2009
Titel Two-stage focus-hold system for rapid ultra-sensitive read-out of large-area biochips DOI 10.1111/j.1365-2818.2009.03165.x Typ Journal Article Autor Hesch C Journal Journal of Microscopy Seiten 251-254 Link Publikation -
2009
Titel Uncoupling diffusion and binding in FRAP experiments DOI 10.1038/nmeth0309-183a Typ Journal Article Autor Lambert N Journal Nature Methods Seiten 183-183 Link Publikation -
2009
Titel Single-Molecule Analysis of Biomembranes DOI 10.1007/978-0-387-76497-9_2 Typ Book Chapter Autor Schmidt T Verlag Springer Nature Seiten 19-42 -
2013
Titel A critical survey of methods to detect plasma membrane rafts DOI 10.1098/rstb.2012.0033 Typ Journal Article Autor Klotzsch E Journal Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences Seiten 20120033 Link Publikation -
2011
Titel Spot Variation Fluorescence Correlation Spectroscopy Allows for Superresolution Chronoscopy of Confinement Times in Membranes DOI 10.1016/j.bpj.2011.04.035 Typ Journal Article Autor Ruprecht V Journal Biophysical Journal Seiten 2839-2845 Link Publikation -
2010
Titel Temporal resolution of protein–protein interactions in the live-cell plasma membrane DOI 10.1007/s00216-010-3854-x Typ Journal Article Autor Weghuber J Journal Analytical and Bioanalytical Chemistry Seiten 3339-3347 Link Publikation -
2010
Titel Chapter 8 Detection of Protein–Protein Interactions in the Live Cell Plasma Membrane by Quantifying Prey Redistribution upon Bait Micropatterning DOI 10.1016/s0076-6879(10)72012-7 Typ Book Chapter Autor Weghuber J Verlag Elsevier Seiten 133-151 -
2010
Titel Resting State Orai1 Diffuses as Homotetramer in the Plasma Membrane of Live Mammalian Cells* DOI 10.1074/jbc.m110.177881 Typ Journal Article Autor Madl J Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 41135-41142 Link Publikation -
2010
Titel Imaging of Mobile Long-lived Nanoplatforms in the Live Cell Plasma Membrane* DOI 10.1074/jbc.m110.182121 Typ Journal Article Autor Brameshuber M Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 41765-41771 Link Publikation