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Molecular and Cellular Control of Tissue Homeostasis in Health and Disease - TissueHome

Molecular and Cellular Control of Tissue Homeostasis in Health and Disease - TissueHome

Karl Kuchler (ORCID: 0000-0003-2719-5955)
  • Grant-DOI 10.55776/DOC32
  • Förderprogramm doc.funds
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2018
  • Projektende 31.03.2023
  • Bewilligungssumme 1.478.840 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (25%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (75%)

Keywords

    RNA Modifications and Immune Response, Innate / Adaptive Immune Signaling, Infections and Inflammation, Epithelial Tolerance, Transcriptomics and Bioinformatics, Epigenetics and Autoimmunity

Abstract Endbericht

Im Rahmen des beantragten doc.funds Projektes wird ein neues interuniversitäres, strukturiertes Programm umgesetzt, das der international konkurrenzfähigen Ausbildung von PhD Studenten in der translationalen Forschung auf dem Gebiet der immunologischen Aufrechterhaltung der Gewebehomöostase (TissueHome) dienen soll. Unser Immunsystem bietet Schutz vor äußeren und inneren Gefahren, kann aber bei Fehlreaktionen auch körpereigene Strukturen angreifen. Daher muss das Immunsystem effizient reguliert werden. Die menschliche Haut oder auch der Verdauungstrakt können als grosse immunologische Organe betrachtet werden, durch die der menschliche Organismus mit der Umgebung in Wechselwirkung steht und einen ersten Schutz vor Keimen bieten. Das erfordert aber die Aufrechterhaltung der Barrierefunktion, der Integrität und auch Regeneration dieser Gewebe durch das Immunsystem. Zur Koordination dieser komplexen Vorgänge zur Erhaltung des physiologischen Gleichgewichtes, sind zahlreiche dynamische Wechselwirkungen und weitreichende Signalübertragungen zwischen Zellen notwendig. Fehlregulationen dieser Prozesse oder angeborene Defekte und Infektionen können zu überschiessenden Entzündungen führen, die wiederum bösartige Veränderungen von Zellen, Autoimmunerkrankungen (z.B. Arthritis, Psoriasis oder entzündliche Darmerkrankungen) oder erhöhte Infektionsanfälligkeit nach sich ziehen. Allerdings sind viele grundlegende Fragen über die molekularen Prinzipien der zellulären Immunkontrolle von Geweben noch offen. Die zentrale wissenschaftliche Hypothese von TissueHome, die untersucht werden soll, lautet, dass eine Fehlsteuerung der Immunüberwachung das physiologische Gleichgewicht und Barrierefunktion von Geweben zerstört und es dadurch zu Infektions- und Autoimmunerkrankungen kommt. TissueHome wird vielfältige, interdisziplinäre und modernste translationale Ansätze und Methoden verwenden, um folgende Hauptfragestellungen zu beantworten: (1) Wie reguliert die Wechselwirkung zwischen Gewebe und Immunzellen die Barrierefunktion von Geweben? Welche Arten von Immunzellen s pielen hier eine wichtige Rolle, und wie erfolgt der Informationsaustausch im gesunden und erkranktem Zustand ? (2) Welche molekularen Kontrollmechanismen sind für die Gewebehomöostase wichtig, und wie werden diese durch physiologische oder pathogene Reize kontrolliert und beeinflusst? (3) Wie beinflussen Krankheitserreger und deren Wechselwirkung mit Immunzellen die Gewebsflora, und wie kann ein mikrobielles Ungleichgewicht die Überempfindlichkeit auf entzündliche Krankheiten oder mikrobielle Infektionen fördern? Wir sind überzeugt, dass für effektive therapeutische Ansätze ein besseres Verständnis der molekularen Prinzipien und zellulären Mechanismen, die die Gewebshomöostase im gesunden Zustand steuern, benötigt wird. Im Rahmen des doc-funds Projekt TissueHome werden zwölf internationale PhD StudentInnen, die über ein kompetitives Auswahlverfahren ermittelt werden, versuchen, die oben genannten Fragestellungen zu beantworten. Dafür werden die PhD StudentInnen interdisziplinäre Ansätze einsetzen und Unterstützung durch interuniversitäre Kooperationen im Rahmen von TissueHome bekommen. Die anleitenden TissueHome Fakultätsmitglieder sind ausgewiesene internationale Experten in zahlreichen, sich ergänzenden wissenschaftlichen Bereichen. Das Ausbildungsprogramm von TissueHome bietet daher den PhD StudentInnen medizinisch hochrelevante Forschungsprojekte an und legt auch Wert auf die Vermittlung zusätzlicher Qualifikationen. Dadurch unterstützt TissueHome die PhD StudentInnen, den Grundstein für eine erfolgreiche wissenschaftliche Karriere zu legen. Wir erwarten, dass die TissueHome PhD StudentInnenausbildung, sowie die translationalen Forschungsansätze, die Entwicklung verbesserter therapeutischer Ansätze zur Behandlung von entzündlichen Immunerkrankungen erleichtern werden.

Das doc.funds "TissueHome" hat ein neues umfassendes interuniversitäres Doktorandenprogramm implementiert, das sich der Ausbildung von Doktorand:innen in der translationalen biomedizinischen Forschung widmet. Die zentrale übergeordnete Hypothese der TissueHome Projekte war, dass eine Fehlregulation komplexer Kommunikationssignale zwischen Immunzellen die normale Immunüberwachung stört und so entzündliche Erkrankungen, Autoimmunerkrankungen, Krebs sowie mikrobielle Infektionen begünstigt. Die TissueHome Projekte befassten sich damit, wie die Zellkommunikation innerhalb von Geweben die immunologische Kompetenz, die für die physiologische Barrierefunktion erforderlich ist, prägt. Darüber hinaus intensivierte TissueHome die Zusammenarbeit zwischen der MeduniWien und der Vetmeduni in der Grundlagen- und translationalen Forschung durch die Bearbeitung medizinisch relevanter Themen. Die Einstellung der Doktoranden erfolgte nach zwei äußerst selektiven Runden persönlicher Vorstellungsgespräche. Insgesamt nahmen elf Doktorand:innen (8 an der Meduni Vienna, 3 an der Vetmeduni) am TissueHome Programm teil, das in die laufenden generischen Doktorand:innen-Ausbildungen an der MeduniWien, den Max Perutz Labs (Vienna Biocenter) und der Vetmeduni eingebettet war. Zur TissueHome Fakultät gehörten Gruppenleiter, die für ihre Arbeit in den Bereichen Immunsignalisierung, zelluläre und molekulare Immunologie, Epigenetik, RNA-Modifikation, Genregulation, Pilzinfektionskrankheiten, Autoimmunerkrankungen, Wirt-Pathogen-Interaktionen, Molekularmedizin, Tiergenetik und Bioinformatik internationales Ansehen genießen. Die einzelnen Projekte befassten sich mit grundlegenden Fragen im Zusammenhang mit molekularen Mechanismen der Immunüberwachung, die für die Aufrechterhaltung der Gewebehomöostase bei Gesundheit und Krankheit, einschließlich Krebs, Autoimmunität und Infektionen, von entscheidender Bedeutung sind. Die Forschungsansätze nutzten modernste Methoden der Infektions- und Entzündungsbiologie, darunter genomische und genetische Technologien, Next-Generation-Sequenzierungen, High-End-Bildgebung, Tiermodelle und Mausgenetik, sowie anspruchsvolle immunologische Methoden, um die Mechanismen zu entschlüsseln, die maßgeblich an der Orchestrierung der Barrierefunktion beteiligt sind. Darüber hinaus nahmen die Doktorand:innen an einem maßgeschneiderten Soft-Skill- und Praxiskursprogramm teil, das von Medien- und Interviewtraining, Ethik, Umgang mit großen Datenmengen bis hin zum Schreiben und Begutachten von Fördermitteln und Forschungsaufenthalten in mehreren TissueHome Gruppen reichte. TissueHome bündelte seine Kräfte mit dem FWF-finanzierten Doktoranden:innenprogramm Inflammation and Immunity durch zweimonatliche gemeinsame Progress Reports und Journal Clubs, die aufgrund der COVID-19-Pandemie in digitaler Form abgehalten wurden. TissueHome begann mit einem Kick-off-Meeting, das in der Nähe von Wien stattfand. Die Doktorand:innen des Programms präsentierten ihre Projektvorhaben und holten Feedback von den SAB-Mitgliedern ein. Außerdem veranstaltete TissueHome im Herbst 2021 einen Retreat im Wienerwald, bei dem alle Doktoranden:innen den Status ihrer Projekte vorstellten. Schließlich schloss TissueHome mit dem internationalen Symposium "Immune Control of Tissue Homeostasis" ab, das ausschließlich von Doktorand:innen organisiert wurde. Insgesamt bot TissueHome ein anregendes und herausforderndes Forschungsumfeld, ergänzt durch eine umfassende Ausbildung übertragbarer Fähigkeiten, um die Doktorand:innen auf eine Karriere in der Wissenschaft, der Industrie oder in wissenschaftsbezogenen Bereichen vorzubereiten.

Konsortium
  • Arndt Von Haeseler, Medizinische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
  • Birgit Strobl, Veterinärmedizinische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
  • Christian Seiser, Medizinische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
  • Karl Kuchler, Medizinische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
  • Michael F. Jantsch, Medizinische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
  • Veronika Sexl, Veterinärmedizinische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
  • Wilfried Ellmeier, Medizinische Universität Wien
    Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien
Internationale Projektbeteiligte
  • Steffen Rupp, Fraunhofer Institut Stuttgart - Deutschland

Research Output

  • 553 Zitationen
  • 27 Publikationen
  • 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 5 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2024
    Titel A lineage-specific STAT5B N642H mouse model to study NK-cell leukemia
    DOI 10.1182/blood.2023022655
    Typ Journal Article
    Autor Klein K
    Journal Blood
    Seiten 2474-2489
    Link Publikation
  • 2024
    Titel The Candida auris Hog1 MAP kinase is essential for the colonization of murine skin and intradermal persistence
    DOI 10.1101/2024.03.18.585572
    Typ Preprint
    Autor Shivarathri R
    Seiten 2024.03.18.585572
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Lack of TYK2 Signaling Enhances Host Resistance to Candida albicans Skin Infection
    DOI 10.21203/rs.3.rs-3909216/v1
    Typ Preprint
    Autor Strobl B
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The ADAR1 editome reveals drivers of editing-specificity for ADAR1-isoforms
    DOI 10.1093/nar/gkad265
    Typ Journal Article
    Autor Kleinova R
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 4191-4207
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Innate lymphoid cells—Underexplored guardians of immunity
    DOI 10.1371/journal.ppat.1011678
    Typ Journal Article
    Autor Tsymala I
    Journal PLOS Pathogens
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The guanine nucleotide exchange factor Rin-like controls Tfh cell differentiation via CD28 signaling
    DOI 10.1084/jem.20221466
    Typ Journal Article
    Autor Sandner L
    Journal Journal of Experimental Medicine
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Learning From an Artificial Neural Network in Phylogenetics
    DOI 10.1109/tcbb.2024.3352268
    Typ Journal Article
    Autor Leuchtenberger A
    Journal IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
    Seiten 278-288
    Link Publikation
  • 2024
    Titel JUN mediates the senescence associated secretory phenotype and immune cell recruitment to prevent prostate cancer progression
    DOI 10.1186/s12943-024-02022-x
    Typ Journal Article
    Autor Redmer T
    Journal Molecular Cancer
    Seiten 114
    Link Publikation
  • 2020
    Titel STAT1 Isoforms Differentially Regulate NK Cell Maturation and Anti-tumor Activity
    DOI 10.3389/fimmu.2020.02189
    Typ Journal Article
    Autor Meissl K
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 2189
    Link Publikation
  • 2020
    Titel TYK2 licenses non-canonical inflammasome activation during endotoxemia
    DOI 10.1038/s41418-020-00621-x
    Typ Journal Article
    Autor Poelzl A
    Journal Cell Death & Differentiation
    Seiten 748-763
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Distinguishing Felsenstein Zone from Farris Zone Using Neural Networks
    DOI 10.1093/molbev/msaa164
    Typ Journal Article
    Autor Leuchtenberger A
    Journal Molecular Biology and Evolution
    Seiten 3632-3641
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Histone deacetylases as targets in autoimmune and autoinflammatory diseases
    DOI 10.1016/bs.ai.2020.06.001
    Typ Book Chapter
    Autor Hamminger P
    Verlag Elsevier
    Seiten 1-59
  • 2020
    Titel NCOR1 Orchestrates Transcriptional Landscapes and Effector Functions of CD4+ T Cells
    DOI 10.3389/fimmu.2020.00579
    Typ Journal Article
    Autor Hainberger D
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 579
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Histone deacetylases 1 and 2 restrain CD4+ cytotoxic T lymphocyte differentiation
    DOI 10.1172/jci.insight.133393
    Typ Journal Article
    Autor Preglej T
    Journal JCI Insight
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Type I Interferon Response Dysregulates Host Iron Homeostasis and Enhances Candida glabrata Infection
    DOI 10.1016/j.chom.2020.01.023
    Typ Journal Article
    Autor Riedelberger M
    Journal Cell Host & Microbe
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Quantification of zinc intoxication of Candida glabrata after phagocytosis by primary macrophages
    DOI 10.1016/j.xpro.2021.100352
    Typ Journal Article
    Autor Penninger P
    Journal STAR Protocols
    Seiten 100352
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Histone deacetylase 1 controls CD4+ T cell trafficking in autoinflammatory diseases
    DOI 10.1016/j.jaut.2021.102610
    Typ Journal Article
    Autor Hamminger P
    Journal Journal of Autoimmunity
    Seiten 102610
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Psoriatic skin inflammation is promoted by c-Jun/AP-1-dependent CCL2 and IL-23 expression in dendritic cells
    DOI 10.15252/emmm.202012409
    Typ Journal Article
    Autor Novoszel P
    Journal EMBO Molecular Medicine
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Transcriptomics and Phenotyping Define Genetic Signatures Associated with Echinocandin Resistance in Candida auris
    DOI 10.1128/mbio.00799-22
    Typ Journal Article
    Autor Jenull S
    Journal mBio
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A Proteomic Approach for the Quantification of Posttranslational Protein Lysine Acetylation in Candida albicans
    DOI 10.1007/978-1-0716-2549-1_3
    Typ Book Chapter
    Autor Shivarathri R
    Verlag Springer Nature
    Seiten 41-54
  • 2019
    Titel Distinguishing Felsenstein zone from Farris zone using neural networks
    DOI 10.1101/822288
    Typ Preprint
    Autor Drucks T
    Seiten 822288
    Link Publikation
  • 2019
    Titel JAK/STAT Cytokine Signaling at the Crossroad of NK Cell Development and Maturation
    DOI 10.3389/fimmu.2019.02590
    Typ Journal Article
    Autor Gotthardt D
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 2590
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Complex Interplay Between MAZR and Runx3 Regulates the Generation of Cytotoxic T Lymphocyte and Memory T Cells
    DOI 10.3389/fimmu.2021.535039
    Typ Journal Article
    Autor Gülich A
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 535039
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The AP-1 transcription factors c-Jun and JunB are essential for CD8a conventional dendritic cell identity
    DOI 10.1038/s41418-021-00765-4
    Typ Journal Article
    Autor Novoszel P
    Journal Cell Death & Differentiation
    Seiten 2404-2420
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Das Immunsystem: Der Kampf um unsere Gesundheit
    Typ Journal Article
    Autor Artner L
    Journal Alexandria
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The Tyrosine Kinase Tec Regulates Effector Th17 Differentiation, Pathogenicity, and Plasticity in T-Cell-Driven Intestinal Inflammation
    DOI 10.3389/fimmu.2021.750466
    Typ Journal Article
    Autor Sandner L
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 750466
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Triple-negative breast cancer cells rely on kinase-independent functions of CDK8 to evade NK-cell-mediated tumor surveillance
    DOI 10.1038/s41419-021-04279-2
    Typ Journal Article
    Autor Knab V
    Journal Cell Death & Disease
    Seiten 991
    Link Publikation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2021
    Titel ImmunoTools special Award 2021
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Oral Presentation Award
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad National (any country)
Weitere Förderungen
  • 2021
    Titel Ernst Mach Grant, ASEA-UNINET to Trinh Phan-Canh
    Typ Fellowship
    Förderbeginn 2021
  • 2020
    Titel ÖAD DOC fellowship to Lena Artner
    Typ Fellowship
    Förderbeginn 2020
  • 2023
    Titel ESCMID Research Grant to Trinh Phan Canh - Rom1 as a fungal sensing factor during skin colonization of the human fungal pathogen Candida auris
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2023
  • 2022
    Titel FEMS travel grant to Hossein Arzani for attending the FEBS Advanced Lecture Course "Molecular Mechanisms of Host-pathogen Interactions and Virulence in Human Fungal Pathogens" 14-20 May 2022, La Colle sur Loup, France
    Typ Travel/small personal
    Förderbeginn 2022
  • 2023
    Titel FEMS Meeting Attendance Grant to Trinh Phan Canh for attending " Candida and Candidiasis 2023", 13 - 17 May 2023, Montral, Canada
    Typ Travel/small personal
    Förderbeginn 2023

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