Molecular and Cellular Control of Tissue Homeostasis in Health and Disease - TissueHome
Molecular and Cellular Control of Tissue Homeostasis in Health and Disease - TissueHome
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (25%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (75%)
Keywords
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RNA Modifications and Immune Response,
Innate / Adaptive Immune Signaling,
Infections and Inflammation,
Epithelial Tolerance,
Transcriptomics and Bioinformatics,
Epigenetics and Autoimmunity
Im Rahmen des beantragten doc.funds Projektes wird ein neues interuniversitäres, strukturiertes Programm umgesetzt, das der international konkurrenzfähigen Ausbildung von PhD Studenten in der translationalen Forschung auf dem Gebiet der immunologischen Aufrechterhaltung der Gewebehomöostase (TissueHome) dienen soll. Unser Immunsystem bietet Schutz vor äußeren und inneren Gefahren, kann aber bei Fehlreaktionen auch körpereigene Strukturen angreifen. Daher muss das Immunsystem effizient reguliert werden. Die menschliche Haut oder auch der Verdauungstrakt können als grosse immunologische Organe betrachtet werden, durch die der menschliche Organismus mit der Umgebung in Wechselwirkung steht und einen ersten Schutz vor Keimen bieten. Das erfordert aber die Aufrechterhaltung der Barrierefunktion, der Integrität und auch Regeneration dieser Gewebe durch das Immunsystem. Zur Koordination dieser komplexen Vorgänge zur Erhaltung des physiologischen Gleichgewichtes, sind zahlreiche dynamische Wechselwirkungen und weitreichende Signalübertragungen zwischen Zellen notwendig. Fehlregulationen dieser Prozesse oder angeborene Defekte und Infektionen können zu überschiessenden Entzündungen führen, die wiederum bösartige Veränderungen von Zellen, Autoimmunerkrankungen (z.B. Arthritis, Psoriasis oder entzündliche Darmerkrankungen) oder erhöhte Infektionsanfälligkeit nach sich ziehen. Allerdings sind viele grundlegende Fragen über die molekularen Prinzipien der zellulären Immunkontrolle von Geweben noch offen. Die zentrale wissenschaftliche Hypothese von TissueHome, die untersucht werden soll, lautet, dass eine Fehlsteuerung der Immunüberwachung das physiologische Gleichgewicht und Barrierefunktion von Geweben zerstört und es dadurch zu Infektions- und Autoimmunerkrankungen kommt. TissueHome wird vielfältige, interdisziplinäre und modernste translationale Ansätze und Methoden verwenden, um folgende Hauptfragestellungen zu beantworten: (1) Wie reguliert die Wechselwirkung zwischen Gewebe und Immunzellen die Barrierefunktion von Geweben? Welche Arten von Immunzellen s pielen hier eine wichtige Rolle, und wie erfolgt der Informationsaustausch im gesunden und erkranktem Zustand ? (2) Welche molekularen Kontrollmechanismen sind für die Gewebehomöostase wichtig, und wie werden diese durch physiologische oder pathogene Reize kontrolliert und beeinflusst? (3) Wie beinflussen Krankheitserreger und deren Wechselwirkung mit Immunzellen die Gewebsflora, und wie kann ein mikrobielles Ungleichgewicht die Überempfindlichkeit auf entzündliche Krankheiten oder mikrobielle Infektionen fördern? Wir sind überzeugt, dass für effektive therapeutische Ansätze ein besseres Verständnis der molekularen Prinzipien und zellulären Mechanismen, die die Gewebshomöostase im gesunden Zustand steuern, benötigt wird. Im Rahmen des doc-funds Projekt TissueHome werden zwölf internationale PhD StudentInnen, die über ein kompetitives Auswahlverfahren ermittelt werden, versuchen, die oben genannten Fragestellungen zu beantworten. Dafür werden die PhD StudentInnen interdisziplinäre Ansätze einsetzen und Unterstützung durch interuniversitäre Kooperationen im Rahmen von TissueHome bekommen. Die anleitenden TissueHome Fakultätsmitglieder sind ausgewiesene internationale Experten in zahlreichen, sich ergänzenden wissenschaftlichen Bereichen. Das Ausbildungsprogramm von TissueHome bietet daher den PhD StudentInnen medizinisch hochrelevante Forschungsprojekte an und legt auch Wert auf die Vermittlung zusätzlicher Qualifikationen. Dadurch unterstützt TissueHome die PhD StudentInnen, den Grundstein für eine erfolgreiche wissenschaftliche Karriere zu legen. Wir erwarten, dass die TissueHome PhD StudentInnenausbildung, sowie die translationalen Forschungsansätze, die Entwicklung verbesserter therapeutischer Ansätze zur Behandlung von entzündlichen Immunerkrankungen erleichtern werden.
Das doc.funds "TissueHome" hat ein neues umfassendes interuniversitäres Doktorandenprogramm implementiert, das sich der Ausbildung von Doktorand:innen in der translationalen biomedizinischen Forschung widmet. Die zentrale übergeordnete Hypothese der TissueHome Projekte war, dass eine Fehlregulation komplexer Kommunikationssignale zwischen Immunzellen die normale Immunüberwachung stört und so entzündliche Erkrankungen, Autoimmunerkrankungen, Krebs sowie mikrobielle Infektionen begünstigt. Die TissueHome Projekte befassten sich damit, wie die Zellkommunikation innerhalb von Geweben die immunologische Kompetenz, die für die physiologische Barrierefunktion erforderlich ist, prägt. Darüber hinaus intensivierte TissueHome die Zusammenarbeit zwischen der MeduniWien und der Vetmeduni in der Grundlagen- und translationalen Forschung durch die Bearbeitung medizinisch relevanter Themen. Die Einstellung der Doktoranden erfolgte nach zwei äußerst selektiven Runden persönlicher Vorstellungsgespräche. Insgesamt nahmen elf Doktorand:innen (8 an der Meduni Vienna, 3 an der Vetmeduni) am TissueHome Programm teil, das in die laufenden generischen Doktorand:innen-Ausbildungen an der MeduniWien, den Max Perutz Labs (Vienna Biocenter) und der Vetmeduni eingebettet war. Zur TissueHome Fakultät gehörten Gruppenleiter, die für ihre Arbeit in den Bereichen Immunsignalisierung, zelluläre und molekulare Immunologie, Epigenetik, RNA-Modifikation, Genregulation, Pilzinfektionskrankheiten, Autoimmunerkrankungen, Wirt-Pathogen-Interaktionen, Molekularmedizin, Tiergenetik und Bioinformatik internationales Ansehen genießen. Die einzelnen Projekte befassten sich mit grundlegenden Fragen im Zusammenhang mit molekularen Mechanismen der Immunüberwachung, die für die Aufrechterhaltung der Gewebehomöostase bei Gesundheit und Krankheit, einschließlich Krebs, Autoimmunität und Infektionen, von entscheidender Bedeutung sind. Die Forschungsansätze nutzten modernste Methoden der Infektions- und Entzündungsbiologie, darunter genomische und genetische Technologien, Next-Generation-Sequenzierungen, High-End-Bildgebung, Tiermodelle und Mausgenetik, sowie anspruchsvolle immunologische Methoden, um die Mechanismen zu entschlüsseln, die maßgeblich an der Orchestrierung der Barrierefunktion beteiligt sind. Darüber hinaus nahmen die Doktorand:innen an einem maßgeschneiderten Soft-Skill- und Praxiskursprogramm teil, das von Medien- und Interviewtraining, Ethik, Umgang mit großen Datenmengen bis hin zum Schreiben und Begutachten von Fördermitteln und Forschungsaufenthalten in mehreren TissueHome Gruppen reichte. TissueHome bündelte seine Kräfte mit dem FWF-finanzierten Doktoranden:innenprogramm Inflammation and Immunity durch zweimonatliche gemeinsame Progress Reports und Journal Clubs, die aufgrund der COVID-19-Pandemie in digitaler Form abgehalten wurden. TissueHome begann mit einem Kick-off-Meeting, das in der Nähe von Wien stattfand. Die Doktorand:innen des Programms präsentierten ihre Projektvorhaben und holten Feedback von den SAB-Mitgliedern ein. Außerdem veranstaltete TissueHome im Herbst 2021 einen Retreat im Wienerwald, bei dem alle Doktoranden:innen den Status ihrer Projekte vorstellten. Schließlich schloss TissueHome mit dem internationalen Symposium "Immune Control of Tissue Homeostasis" ab, das ausschließlich von Doktorand:innen organisiert wurde. Insgesamt bot TissueHome ein anregendes und herausforderndes Forschungsumfeld, ergänzt durch eine umfassende Ausbildung übertragbarer Fähigkeiten, um die Doktorand:innen auf eine Karriere in der Wissenschaft, der Industrie oder in wissenschaftsbezogenen Bereichen vorzubereiten.
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Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
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Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
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Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
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Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
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Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
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Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
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Konsortiumsmitglied (01.10.2018 - 31.03.2023)
- Medizinische Universität Wien
- Steffen Rupp, Fraunhofer Institut Stuttgart - Deutschland
Research Output
- 553 Zitationen
- 27 Publikationen
- 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 5 Weitere Förderungen
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2024
Titel A lineage-specific STAT5B N642H mouse model to study NK-cell leukemia DOI 10.1182/blood.2023022655 Typ Journal Article Autor Klein K Journal Blood Seiten 2474-2489 Link Publikation -
2024
Titel The Candida auris Hog1 MAP kinase is essential for the colonization of murine skin and intradermal persistence DOI 10.1101/2024.03.18.585572 Typ Preprint Autor Shivarathri R Seiten 2024.03.18.585572 Link Publikation -
2024
Titel Lack of TYK2 Signaling Enhances Host Resistance to Candida albicans Skin Infection DOI 10.21203/rs.3.rs-3909216/v1 Typ Preprint Autor Strobl B Link Publikation -
2023
Titel The ADAR1 editome reveals drivers of editing-specificity for ADAR1-isoforms DOI 10.1093/nar/gkad265 Typ Journal Article Autor Kleinova R Journal Nucleic Acids Research Seiten 4191-4207 Link Publikation -
2023
Titel Innate lymphoid cells—Underexplored guardians of immunity DOI 10.1371/journal.ppat.1011678 Typ Journal Article Autor Tsymala I Journal PLOS Pathogens Link Publikation -
2023
Titel The guanine nucleotide exchange factor Rin-like controls Tfh cell differentiation via CD28 signaling DOI 10.1084/jem.20221466 Typ Journal Article Autor Sandner L Journal Journal of Experimental Medicine Link Publikation -
2024
Titel Learning From an Artificial Neural Network in Phylogenetics DOI 10.1109/tcbb.2024.3352268 Typ Journal Article Autor Leuchtenberger A Journal IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Seiten 278-288 Link Publikation -
2024
Titel JUN mediates the senescence associated secretory phenotype and immune cell recruitment to prevent prostate cancer progression DOI 10.1186/s12943-024-02022-x Typ Journal Article Autor Redmer T Journal Molecular Cancer Seiten 114 Link Publikation -
2020
Titel STAT1 Isoforms Differentially Regulate NK Cell Maturation and Anti-tumor Activity DOI 10.3389/fimmu.2020.02189 Typ Journal Article Autor Meissl K Journal Frontiers in Immunology Seiten 2189 Link Publikation -
2020
Titel TYK2 licenses non-canonical inflammasome activation during endotoxemia DOI 10.1038/s41418-020-00621-x Typ Journal Article Autor Poelzl A Journal Cell Death & Differentiation Seiten 748-763 Link Publikation -
2020
Titel Distinguishing Felsenstein Zone from Farris Zone Using Neural Networks DOI 10.1093/molbev/msaa164 Typ Journal Article Autor Leuchtenberger A Journal Molecular Biology and Evolution Seiten 3632-3641 Link Publikation -
2020
Titel Histone deacetylases as targets in autoimmune and autoinflammatory diseases DOI 10.1016/bs.ai.2020.06.001 Typ Book Chapter Autor Hamminger P Verlag Elsevier Seiten 1-59 -
2020
Titel NCOR1 Orchestrates Transcriptional Landscapes and Effector Functions of CD4+ T Cells DOI 10.3389/fimmu.2020.00579 Typ Journal Article Autor Hainberger D Journal Frontiers in Immunology Seiten 579 Link Publikation -
2020
Titel Histone deacetylases 1 and 2 restrain CD4+ cytotoxic T lymphocyte differentiation DOI 10.1172/jci.insight.133393 Typ Journal Article Autor Preglej T Journal JCI Insight Link Publikation -
2020
Titel Type I Interferon Response Dysregulates Host Iron Homeostasis and Enhances Candida glabrata Infection DOI 10.1016/j.chom.2020.01.023 Typ Journal Article Autor Riedelberger M Journal Cell Host & Microbe Link Publikation -
2021
Titel Quantification of zinc intoxication of Candida glabrata after phagocytosis by primary macrophages DOI 10.1016/j.xpro.2021.100352 Typ Journal Article Autor Penninger P Journal STAR Protocols Seiten 100352 Link Publikation -
2021
Titel Histone deacetylase 1 controls CD4+ T cell trafficking in autoinflammatory diseases DOI 10.1016/j.jaut.2021.102610 Typ Journal Article Autor Hamminger P Journal Journal of Autoimmunity Seiten 102610 Link Publikation -
2021
Titel Psoriatic skin inflammation is promoted by c-Jun/AP-1-dependent CCL2 and IL-23 expression in dendritic cells DOI 10.15252/emmm.202012409 Typ Journal Article Autor Novoszel P Journal EMBO Molecular Medicine Link Publikation -
2022
Titel Transcriptomics and Phenotyping Define Genetic Signatures Associated with Echinocandin Resistance in Candida auris DOI 10.1128/mbio.00799-22 Typ Journal Article Autor Jenull S Journal mBio Link Publikation -
2022
Titel A Proteomic Approach for the Quantification of Posttranslational Protein Lysine Acetylation in Candida albicans DOI 10.1007/978-1-0716-2549-1_3 Typ Book Chapter Autor Shivarathri R Verlag Springer Nature Seiten 41-54 -
2019
Titel Distinguishing Felsenstein zone from Farris zone using neural networks DOI 10.1101/822288 Typ Preprint Autor Drucks T Seiten 822288 Link Publikation -
2019
Titel JAK/STAT Cytokine Signaling at the Crossroad of NK Cell Development and Maturation DOI 10.3389/fimmu.2019.02590 Typ Journal Article Autor Gotthardt D Journal Frontiers in Immunology Seiten 2590 Link Publikation -
2021
Titel Complex Interplay Between MAZR and Runx3 Regulates the Generation of Cytotoxic T Lymphocyte and Memory T Cells DOI 10.3389/fimmu.2021.535039 Typ Journal Article Autor Gülich A Journal Frontiers in Immunology Seiten 535039 Link Publikation -
2021
Titel The AP-1 transcription factors c-Jun and JunB are essential for CD8a conventional dendritic cell identity DOI 10.1038/s41418-021-00765-4 Typ Journal Article Autor Novoszel P Journal Cell Death & Differentiation Seiten 2404-2420 Link Publikation -
2021
Titel Das Immunsystem: Der Kampf um unsere Gesundheit Typ Journal Article Autor Artner L Journal Alexandria Link Publikation -
2021
Titel The Tyrosine Kinase Tec Regulates Effector Th17 Differentiation, Pathogenicity, and Plasticity in T-Cell-Driven Intestinal Inflammation DOI 10.3389/fimmu.2021.750466 Typ Journal Article Autor Sandner L Journal Frontiers in Immunology Seiten 750466 Link Publikation -
2021
Titel Triple-negative breast cancer cells rely on kinase-independent functions of CDK8 to evade NK-cell-mediated tumor surveillance DOI 10.1038/s41419-021-04279-2 Typ Journal Article Autor Knab V Journal Cell Death & Disease Seiten 991 Link Publikation
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2021
Titel ImmunoTools special Award 2021 Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2023
Titel Oral Presentation Award Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad National (any country)
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2021
Titel Ernst Mach Grant, ASEA-UNINET to Trinh Phan-Canh Typ Fellowship Förderbeginn 2021 -
2020
Titel ÖAD DOC fellowship to Lena Artner Typ Fellowship Förderbeginn 2020 -
2023
Titel ESCMID Research Grant to Trinh Phan Canh - Rom1 as a fungal sensing factor during skin colonization of the human fungal pathogen Candida auris Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2023 -
2022
Titel FEMS travel grant to Hossein Arzani for attending the FEBS Advanced Lecture Course "Molecular Mechanisms of Host-pathogen Interactions and Virulence in Human Fungal Pathogens" 14-20 May 2022, La Colle sur Loup, France Typ Travel/small personal Förderbeginn 2022 -
2023
Titel FEMS Meeting Attendance Grant to Trinh Phan Canh for attending " Candida and Candidiasis 2023", 13 - 17 May 2023, Montral, Canada Typ Travel/small personal Förderbeginn 2023