SCORPION: Stem Cells, Tissues, Organoids – Dissecting Regulators of Potency and Pattern Formation
SCORPION: Stem Cells, Tissues, Organoids – Dissecting Regulators of Potency and Pattern Formation
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
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Stem Cells,
Development,
Regeneration,
Evolution,
Differentiation,
Organoid
Das SCORPION-Kooperationsprogramm ermöglichte Doktoranden-Forschungsprojekte in verschiedenen Bereichen der Stammzellbiologie, die Einsichten in das Wachstum und die Regeneration von Geweben erlaubte. Dazu kamen verschiedene Modellsysteme zur Anwendung: Die Labore von Bücker und Leeb legten einen Schwerpunkt auf frühe Stammzellen in Säugern und ihren Übergang aus einem pluripotenten Zustand in die ersten Schritte der Differenzierung. Das Bücker-Labor identifizierte spezifische Marker, die entscheidend dafür sind, wann und wie sich Zellen auf einen bestimmten Entwicklungspfad festlegen. Darauf aufbauend machte das Leeb-Team Fortschritte beim Verständnis der genetischen Grundlagen, wie Stammzellen diese Entscheidungen treffen, und identifizierte mehrere Gene, die bei der Steuerung der Differenzierung eine Schlüsselrolle spielen. Durch funktionale Manipulation dieser erhielt das Team Einblick in die umfassenderen Mechanismen, die die frühe Festlegung der Abstammungslinie in embryonalen Stammzellen steuern. Bei den wirbellosen Modellen konzentrierte sich das Team von Technau auf die Seeanemone Nematostella vectensis. Das Team untersuchte den Selbstorganisationsprozess und die Regeneration in sogenannten Gastruloiden - Gewebe, das einen frühen Entwicklungsschritt in der Embryonalentwicklung der Seeanemonen abbildet. Dabei stand der Notch-Signal-Weg im Mittelpunkt. Raibles Forschung am Meeresborstenwurm Platynereis dumerilii zeigte, wie die Stammzellen, die dem postlarvalen Wachstum zugrunde liegen, wieder neu gebildet werden können, wenn sie experimentell entfernt werden. Das Team fand heraus, dass differenzierte Zellen in einen eher stammzellähnlichen Zustand zurückkehren, an dem auch das myc-Gen beteiligt ist. In einer weiteren Arbeit mit dem mexikanischen Salamander, dem Axolotl, verfolgte die Tanaka-Gruppe einzelne Zellen in den sich regenerierenden Gliedmaßen. Auch in diesem System kehren die Zellen in einen eher stammzellähnlichen Zustand zurück. Die Team von Urbn untersuchte, wie adulte neuronale Stammzellen durch Ernährung und Stoffwechsel beeinflusst werden. Anhand von Mausmodellen entdeckten das Team, dass bestimmte Stoffwechselbedingungen, wie sie beispielsweise durch Kalorienrestriktion oder fettreiche Ernährung hervorgerufen werden, die Aktivierung dieser Stammzellen entweder fördern oder hemmen können. Eine wichtige Innovation in der Organoid-Forschung kam aus Knoblichs Labor, wo das Team anspruchsvollere Modelle des menschlichen Gehirns entwickelte, indem es biotechnisch hergestellte Gerüste verwendete, die die Entwicklung von zerebralen Organoiden - kleinen, dreidimensionalen Modellen von Hirngewebe - unterstützen, so dass sie die Struktur und Funktion des menschlichen Gehirns genauer nachahmen. Gemeinsam mit der Mendjan-Gruppe untersuchten sie, wie sich verschiedene Arten von Fettgewebe und die dazugehörigen Blutgefäße gemeinsam entwickeln. Durch Ko-Kultivierung menschlicher Stammzellen zu Fett- und Gefäßzellen modellierten sie, wie diese Gewebe während der Entwicklung interagieren. Schließlich zeigte Koos Forschung, wie wichtig die Vielfalt der Stammzellen für die Erhaltung der Magenschleimhaut ist, und identifizierte zwei unterschiedliche Populationen von Stammzellen, die sich in verschiedenen Teilen des Magens befinden. Beide Zelltypen tragen zwar zur normalen Aufrechterhaltung des Gewebes bei, reagieren aber unterschiedlich auf Verletzungen, was zeigt, wie der Körper Gewebereparatur und Homöostase ausbalanciert.
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Konsortiumsmitglied (01.10.2019 - 31.03.2024)
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- Universität Wien
Research Output
- 308 Zitationen
- 29 Publikationen
- 1 Methoden & Materialien
- 1 Disseminationen
- 8 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2024
Titel Updated single cell reference atlas for the starlet anemone Nematostella vectensis. DOI 10.1186/s12983-024-00529-z Typ Journal Article Autor Cole Ag Journal Frontiers in zoology Seiten 8 -
2024
Titel Supplementary materials from Elongation capacity of polyunsaturated fatty acids in the annelid Platynereis dumerilii DOI 10.6084/m9.figshare.25943427 Typ Other Autor Bainour K Link Publikation -
2024
Titel Elongation capacity of polyunsaturated fatty acids in the annelid Platynereis dumerilii DOI 10.1101/2024.03.15.584978 Typ Preprint Autor Bainour K -
2024
Titel Molecular profile, source and lineage restriction of stem cells in an annelid regeneration model DOI 10.1101/2024.07.09.602635 Typ Preprint Autor Adelmann L -
2024
Titel Developmentally guided specification of posterior lateral plate mesoderm Typ PhD Thesis Autor Leitner, Marie-Christin Link Publikation -
2022
Titel Letm1 as a potential bridge between mitochondrial ion homeostasis and diel rhythms in the zebrafish Danio rerio Typ PhD Thesis Autor Dao, Pauline Link Publikation -
2021
Titel Wnt/beta-catenin signalling is dispensable for adult neural stem cell homeostasis and activation DOI 10.1242/dev.199629 Typ Journal Article Autor Austin S Journal Development Link Publikation -
2021
Titel Stem cell quiescence: the challenging path to activation DOI 10.1242/dev.165084 Typ Journal Article Autor Urbán N Journal Development Link Publikation -
2021
Titel Genetic engineering in organoids DOI 10.1007/s00109-020-02029-z Typ Journal Article Autor Teriyapirom I Journal Journal of Molecular Medicine Seiten 555-568 Link Publikation -
2024
Titel Cerebral organoids display dynamic clonal growth and tunable tissue replenishment. DOI 10.1038/s41556-024-01412-z Typ Journal Article Autor Haendeler S Journal Nature cell biology Seiten 710-718 -
2024
Titel Elongation capacity of polyunsaturated fatty acids in the annelid Platynereis dumerilii. DOI 10.1098/rsob.240069 Typ Journal Article Autor Bainour K Journal Open biology Seiten 240069 -
2024
Titel ARID1B controls transcriptional programs of axon projection in an organoid model of the human corpus callosum. DOI 10.1016/j.stem.2024.04.014 Typ Journal Article Autor Martins-Costa C Journal Cell stem cell -
2024
Titel FoxO transcription factors actuate the formative pluripotency specific gene expression programme. DOI 10.1038/s41467-024-51794-9 Typ Journal Article Autor Kowald S Journal Nature communications Seiten 7879 -
2024
Titel Red2Flpe-SCON: a versatile, multicolor strategy for generating mosaic conditional knockout mice. DOI 10.1038/s41467-024-49382-y Typ Journal Article Autor Kim S Journal Nature communications Seiten 4963 -
2023
Titel Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism DOI 10.3929/ethz-b-000632667 Typ Other Autor Fleck Link Publikation -
2023
Titel It takes two to untangle: Combined stimulation of adult neurogenesis reverts AD symptoms. DOI 10.1016/j.stem.2023.03.012 Typ Journal Article Autor Gabarró-Solanas R Journal Cell stem cell Seiten 333-334 -
2023
Titel Acquired epithelial WNT secretion drives niche independence of developing gastric cancer DOI 10.1101/2023.02.24.529854 Typ Preprint Autor Kim J -
2022
Titel The cation exchanger Letm1, circadian rhythms, and NAD(H) levels interconnect in diurnal zebrafish DOI 10.26508/lsa.202101194 Typ Journal Article Autor Dao P Journal Life Science Alliance Link Publikation -
2022
Titel Could a Different View of Quiescence Help Us Understand How Neurogenesis Is Regulated? DOI 10.3389/fnins.2022.878875 Typ Journal Article Autor Urbán N Journal Frontiers in Neuroscience Seiten 878875 Link Publikation -
2022
Titel SHInE - Simultaneous HCR, Immunohistochemistry, Nuclear staining and EdU v1 DOI 10.17504/protocols.io.5qpvobnyzl4o/v1 Typ Preprint Autor Coric A -
2023
Titel A Fast And Versatile Method for Simultaneous HCR, Immunohistochemistry And Edu Labeling (SHInE). DOI 10.1093/icb/icad007 Typ Journal Article Autor Stockinger Aw Journal Integrative and comparative biology Seiten 372-381 -
2023
Titel Morphogenesis and development of human telencephalic organoids in the absence and presence of exogenous extracellular matrix. DOI 10.15252/embj.2022113213 Typ Journal Article Autor Martins-Costa C Journal The EMBO journal -
2023
Titel Adult neural stem cells and neurogenesis are resilient to intermittent fasting. DOI 10.15252/embr.202357268 Typ Journal Article Autor Davaatseren A Journal EMBO reports -
2023
Titel Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism. DOI 10.1038/s41586-023-06473-y Typ Journal Article Autor Fleck Js Journal Nature Seiten 373-380 -
2023
Titel From neuroepithelial morphogenesis to circuit formation: using organoid technologies to understand human brain development. Typ PhD Thesis Autor Da Cunha E Silva Martins Costa, Catarina Link Publikation -
2023
Titel The role of MAPK and WNT in tumorigenesis of gastric and liver cancer Typ PhD Thesis Autor Teriyapirom, Isaree Link Publikation -
2022
Titel Single-cell transcriptomics identifies conserved regulators of neuroglandular lineages DOI 10.1016/j.celrep.2022.111370 Typ Journal Article Autor Steger J Journal Cell Reports Seiten 111370 Link Publikation -
2022
Titel A fast and versatile method for simultaneous HCR, immunohistochemistry and EdU labeling (SHInE) DOI 10.1101/2022.10.13.512152 Typ Preprint Autor Coric A Seiten 2022.10.13.512152 Link Publikation -
2022
Titel NMD is required for timely cell fate transitions by fine-tuning gene expression and regulating translation DOI 10.1101/gad.347690.120 Typ Journal Article Autor Huth M Journal Genes & Development Seiten 348-367 Link Publikation
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2024
Titel Time-resolved single-cell RNA sequencing Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich
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2024
Titel EMBO-Regeneration and tissue repair Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2023
Titel SYSTEM Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2023
Titel Impact Award from the city of Vienna Typ Research prize Bekanntheitsgrad Regional (any country) -
2023
Titel Leonie Adelmann Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2023
Titel ISRB Inaugural Meeting Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2023
Titel VBC PhD Award Typ Research prize Bekanntheitsgrad Regional (any country) -
2021
Titel OEAW Doc fellowship Typ Research prize Bekanntheitsgrad National (any country) -
2019
Titel Matthias Lauwers award Typ Research prize Bekanntheitsgrad Regional (any country)