Elektronentransfer zelluloseabbauerender Enzyme
Electron Transfer in Cellulose Degrading Enzymes
Bilaterale Ausschreibung: Tschechien
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (60%); Chemie (30%); Industrielle Biotechnologie (10%)
Keywords
-
Cellobiose Dehydrogenase,
Cellulose Depolymerization,
Lytic Polysaccharide Monooxygenase,
Mass Spectrometry,
Hydrogen/Deuterium Exchange,
Chemical Cross-Linking
Die Zusammenarbeit zweier Enzyme, der lytischen Polysaccharidmomooxygenase (LPMO) und Cellobiosedehydrogenase (CDH), bewirkt eine Effizienzsteigerung bei der enzymatischen Zellulosehydrolyse. Die Rolle der CDH ist es, Elektronen an die LPMO weiterzuleiten und sie dadurch zu reduzieren um sie für die Katalyse zu aktivieren. Der exakte Ablauf dieses Elektronentransferprozesses ist jedoch unbekannt, auch ist seine Relevanz gegenüber kleinen Reduktionsmitteln wie Gallussäure abzuschätzen. Die vorliegende Studie bedient sich verschiedener CDHs und LPMOs aus holzabbauenden Pilzen um den Mechanismus und die Kinetik des Elektronentransferprozesses aufzuklären. Dazu wird die CDH/LPMO Interaktion sowohl in homogener Lösung, wie auch im physiologisch relevantem, an Zellulose gebundenen, heterogenen Zustand untersucht. Zur Untersuchung der Interaktion in Lösung werden schnelle kinetische sowie kalorimetrische Methoden eingesetzt. Zur Untersuchung der Protein-Protein und Protein-Zellulose Interaktionen in gebundenem Zustand werden HPLCund Massenspektrometrie herangezogen. Das Projekt testet die Hypothese, dass die natürliche Funktion der CDH die einer LPMO- Reduktase ist. Drei Fragen sollen dabei im Besonderen beantwortet werden: 1) Gibt die CDH Elektronen schnell an LPMO weiter und wie schnell ist sie im Vergleich zu niedermolekularen Reduktionsmitteln? 2) Interagieren CDH und LPMO über eine spezifischen Proteinschnittstelle (Proteinoberfläche) oder basiert der Elektronentransfer zwischen den Enzymen auf zufälligen Kontakten? 3) Variiert die Interaktion von CDH und LPMO Enzymen mit und ohne Kohlenhydratbindungsstelle? Diese Studie soll die Grundlagen extrazellulärer Redoxprozesse im Bereich des Holzabbaus erarbeiten. Die Ergebnisse sind für die annwendungsnahe Forschung wichtig, um den Abbau von Pflanzenstoffen zur Gewinnung von Biotreibstoffen oder Rohstoffen in Grünen Bioraffinerien zu verbessern.
Die Zusammenarbeit zweier Enzyme, der lytischen Polysaccharidmomooxygenase (LPMO) und Cellobiosedehydrogenase (CDH), bewirkt eine Effizienzsteigerung bei der enzymatischen Zellulosehydrolyse. Die Rolle der CDH ist es, Elektronen an die LPMO weiterzuleiten und sie dadurch zu reduzieren um sie für die Katalyse zu aktivieren. Der exakte Ablauf dieses Elektronentransferprozesses ist jedoch unbekannt, auch ist seine Relevanz gegenüber kleinen Reduktionsmitteln wie Gallussäure abzuschätzen. Die durchgeführten Versuche zeigten, dass CDH nicht nur Elektronen zur Aktivierung des Redoxzentrums der LPMO liefert, sondern auch das Kosubstrat Wasserstoffperoxid zur Verfügung stellt und so die Katalyserate der LPMO dramatisch steigert. Die vorliegende Studie bediente sich verschiedener CDHs und LPMOs aus holzabbauenden Pilzen um den Mechanismus und die Kinetik des Elektronentransferprozesses aufzuklären. Dazu wurdr die CDH-LPMO Interaktion sowohl in homogener Lösung, wie auch im physiologisch relevantem, an Zellulose gebundenen, heterogenen Zustand untersucht. Zur Untersuchung der Interaktion in Lösung werden schnelle kinetische sowie kalorimetrische Methoden eingesetzt. Zur Untersuchung der Protein-Protein und Protein-Zellulose Interaktionen in gebundenem Zustand werden HPLC und Massenspektrometrie herangezogen. Das Projekt zeigte, das die natürliche Funktion der CDH tatsächlich die einer LPMO-Reduktase ist. CDH und LPMO interagieren über eine spezifischen Proteinschnittstelle an der Proteinoberfläche um einen effizienten Elektronentransfer zwischen den Enzymen zu gewährleisten. Ebenso wurde ein Unterschied in der Interaktion beobachtet, wenn eine Kohlenhydratbindungsmodul im Enzym vorhanden war. Diese Studie vertieft die Grundlagen extrazellulärer Redoxprozesse im Bereich des Holzabbaus. Die Ergebnisse sind für die annwendungsnahe Forschung interessant um den Abbau von Pflanzenstoffen zur Gewinnung von Biotreibstoffen oder Rohstoffen in Grünen Bioraffinerien zu verbessern.
- Sarah Cianferani, Université de Strasbourg - Frankreich
- Christina Divne, KTH Royal Institute of Technology - Schweden
- Petr Halada, Academy of Sciences of the Czech Republic - Tschechien
- Petr Man, Academy of Sciences of the Czech Republic - Tschechien
- Carol V. Robinson, The University of Oxford - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 491 Zitationen
- 26 Publikationen
- 1 Methoden & Materialien
- 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 3 Weitere Förderungen
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2020
Titel Additional file 1 of The H2O2-dependent activity of a fungal lytic polysaccharide monooxygenase investigated with a turbidimetric assay DOI 10.6084/m9.figshare.11945853 Typ Other Autor Frantisek Filandr Link Publikation -
2020
Titel Additional file 1 of The H2O2-dependent activity of a fungal lytic polysaccharide monooxygenase investigated with a turbidimetric assay DOI 10.6084/m9.figshare.11945853.v1 Typ Other Autor Frantisek Filandr Link Publikation -
2022
Titel Inhibition of the Peroxygenase Lytic Polysaccharide Monooxygenase by Carboxylic Acids and Amino Acids DOI 10.3390/antiox11061096 Typ Journal Article Autor Breslmayr E Journal Antioxidants Seiten 1096 Link Publikation -
2019
Titel Polysaccharide oxidation by lytic polysaccharide monooxygenase is enhanced by engineered cellobiose dehydrogenase DOI 10.1111/febs.15067 Typ Journal Article Autor Kracher D Journal The FEBS Journal Seiten 897-908 Link Publikation -
2019
Titel MOESM1 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.11330105.v1 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2019
Titel MOESM1 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.11330105 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2019
Titel MOESM2 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.11330108 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2019
Titel MOESM2 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.11330108.v1 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2019
Titel MOESM3 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.11330111 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2019
Titel MOESM3 of Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.11330111.v1 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2019
Titel Improved spectrophotometric assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.1186/s13068-019-1624-3 Typ Journal Article Autor Breslmayr E Journal Biotechnology for Biofuels Seiten 283 Link Publikation -
2017
Titel Wheat bran biodegradation by edible Pleurotus fungi – A sustainable perspective for food and feed DOI 10.1016/j.lwt.2017.07.051 Typ Journal Article Autor Wanzenböck E Journal LWT - Food Science and Technology Seiten 123-131 -
2017
Titel Active-site copper reduction promotes substrate binding of fungal lytic polysaccharide monooxygenase and reduces stability DOI 10.1074/jbc.ra117.000109 Typ Journal Article Autor Kracher D Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 1676-1687 Link Publikation -
2018
Titel MOESM1 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.6024731 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2018
Titel MOESM1 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.6024731.v1 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2018
Titel MOESM2 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.6024752 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2018
Titel MOESM2 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.6024752.v1 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2018
Titel MOESM3 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.6024770 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2018
Titel MOESM3 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.6024770.v1 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2018
Titel MOESM4 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.6024791 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2018
Titel MOESM4 of A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.6084/m9.figshare.6024791.v1 Typ Other Autor Breslmayr E Link Publikation -
2020
Titel Chimeric Cellobiose Dehydrogenases Reveal the Function of Cytochrome Domain Mobility for the Electron Transfer to Lytic Polysaccharide Monooxygenase DOI 10.1021/acscatal.0c05294 Typ Journal Article Autor Felice A Journal ACS Catalysis Seiten 517-532 Link Publikation -
2020
Titel The H2O2-dependent activity of a fungal lytic polysaccharide monooxygenase investigated with a turbidimetric assay DOI 10.1186/s13068-020-01673-4 Typ Journal Article Autor Filandr F Journal Biotechnology for Biofuels Seiten 37 Link Publikation -
2020
Titel Structural Dynamics of Lytic Polysaccharide Monooxygenase during Catalysis DOI 10.3390/biom10020242 Typ Journal Article Autor Filandr F Journal Biomolecules Seiten 242 Link Publikation -
2018
Titel A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase DOI 10.1186/s13068-018-1063-6 Typ Journal Article Autor Breslmayr E Journal Biotechnology for Biofuels Seiten 79 Link Publikation -
2017
Titel Engineering of Cellobiose Dehydrogenases for Improved Glucose Sensitivity and Reduced Maltose Affinity DOI 10.1002/celc.201600781 Typ Journal Article Autor Ortiz R Journal ChemElectroChem Seiten 846-855
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2018
Titel Enymatic activity assay for LPMO Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich
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2019
Titel BioTrans 2019, July 7-11, 2019, Groningen, The Netherlands Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel 43rd FEBS Conference, Jul. 7-12, 2018, Prague, Czech Republic Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel International Symposium on Artificial Cell Reactor Science and Technology, Apr. 5-6, 2018, Tokyo, Japan Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2018
Titel 9th International Congress of Food Technologists, Biotechnologists and Nutritionists, Oct. 3-5, 2018, Zagreb, Croatia Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International
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2018
Titel Electron flow during oxidative cellulose degradation Typ Other Förderbeginn 2018 -
2018
Titel Routing the flow of electrons... Typ Other Förderbeginn 2018 -
2017
Titel (OXIDISE) - Interaction and Kinetics of Oxidative Biomass Degrading Enzymes Resolved by High-Resolution Techniques Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2017