Systembiologie der ES Zell Differenzierung

Man kann sich die Entwicklung von höheren eukaryotischen Organismen als ein reguliertes, schrittweises Durchlaufen von Zellidentitäts-Entscheidungen vorstellen. Dies verläuft von pluripotenten Stammzellen in der Blastozyste bis zu terminal ausdifferenzierten Zelltypen unidirektional, sowie, mit der Ausnahme von pathologischen Ereignissen, unumkehrbar ab. Obwohl in den letzten Jahren große Fortschritte im Verständnis von pluripotenten embryonalen Stammzellen erzielt wurden, bleiben die genauen molekularen Mechanismen und deren Wirkungsweise in der Regulation von Zellidentitäts-Entscheidungen unbekannt. In einem interdisziplinärem Ansatz wurden in den Labors von Martin Leeb (MFPL, Wien) und Andreas Beyer (Universitzet Köln) in genetischen screens mit haploiden embryonalen Stammzellen eine Kohorte an Kanidaten-Genen identifiziert, die in der Differenzierung von embryonalen Stammzellen eine wichtige Rolle spielen. Diese Liste an Kandidaten bietet eine vielversprechend Grundlage für die mechanistische Analyse der Funktion augewaelter Signalwege und genetischer Kreisläufe. In diesem kollaborativen Projekt werden wir Knockout embryonale Stammzell (ES)-Linien herstellen. Danach werden Transkriptionsprofile im ES-Zell Stadium, sowie in frühen Phasen der Differenzierung erstellt. Diese bilden die Grundlage für die detaillierte molekulare Aufarbeitung der daraus resultierenden Genexpression-Defekte. Unsere Arbeit wird einerseits zu einem besseren Verstaendnis der Mechanismen, welche fuer die Erhaltung und die Etablierung von Zellidentität verantwortlich sind führen. Andererseits wird die bioinformatische Prozessierung der umfangreichen Gen-Expressionsdaten einen Beitrag zum besseren molekularen Verständnis von Differenzierungsprozessen führen.

Man kann sich die Entwicklung von höheren eukaryotischen Organismen als ein reguliertes, schrittweises Durchlaufen von Zellidentitäts-Entscheidungen vorstellen. Dies verläuft von pluripotenten Stammzellen in der Blastozyste bis zu terminal ausdifferenzierten Zelltypen unidirektional, sowie, mit der Ausnahme von pathologischen Ereignissen, unumkehrbar ab. Obwohl in den letzten Jahren große Fortschritte im Verständnis von pluripotenten embryonalen Stammzellen erzielt wurden, bleiben die genauen molekularen Mechanismen und deren Wirkungsweise in der Regulation von Zellidentitäts-Entscheidungen unbekannt. In einem interdisziplinärem Ansatz wurden in den Labors von Martin Leeb (MFPL, Wien) und Andreas Beyer (Universitzet Köln) in genetischen screens mit haploiden embryonalen Stammzellen eine Kohorte an Kanidaten-Genen identifiziert, die in der Differenzierung von embryonalen Stammzellen eine wichtige Rolle spielen. Diese Liste an Kandidaten bietet eine vielversprechend Grundlage für die mechanistische Analyse der Funktion augewaelter Signalwege und genetischer Kreisläufe. In diesem kollaborativen Projekt werden wir Knockout embryonale Stammzell (ES)-Linien herstellen. Danach werden Transkriptionsprofile im ES-Zell Stadium, sowie in frühen Phasen der Differenzierung erstellt. Diese bilden die Grundlage für die detaillierte molekulare Aufarbeitung der daraus resultierenden Genexpression-Defekte. Unsere Arbeit wird einerseits zu einem besseren Verstaendnis der Mechanismen, welche fuer die Erhaltung und die Etablierung von Zellidentität verantwortlich sind führen. Andererseits wird die bioinformatische Prozessierung der umfangreichen Gen-Expressionsdaten einen Beitrag zum besseren molekularen Verständnis von Differenzierungsprozessen führen.