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Multi-Omics Analysis of Primary Antibody Deficiencies (i-PAD)

Multi-Omics Analyse des Antikörpermangelsyndroms (i-PAD)

Christoph Bock (ORCID: 0000-0001-6091-3088)
  • Grant-DOI 10.55776/I4204
  • Förderprogramm International - Multilaterale Initiativen
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.04.2019
  • Projektende 31.03.2023
  • Bewilligungssumme 280.044 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (60%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (40%)

Keywords

    Common variable immunodeficiency (CVID), Primary Antibody Deficiencies (Pad), Epigenomics, Transcriptomics, Proteomics, Bioinformatics

Abstract Endbericht

Das menschliche Immunsystem steuert, wie wir auf Infektionen und andere Krankheiten rea- gieren. Seine Funktionsweise unterscheidet sich jedoch erheblich zwischen einzelnen Perso- nen. Bestimmte Menschen haben leichte oder schwere Immundefekte, die sie anfällig für In- fektionen, Autoimmunität und Krebs machen. Einige dieser Immundefekte werden von ein- zelnen Genen verursacht und sind relativ gut verstanden. Aber in vielen Fällen ist die moleku- lare Ursache völlig unbekannt, weshalb diese seltenen Krankheiten schwer zu diagnostizieren und zu behandeln sind. In diesem Projekt werden wir modernste Multi-Omics- Analysemethoden und eine integrative bioinformatische Analyse verwenden, um die moleku- laren Mechanismen des variable Immundefektsyndrom zu analysieren, einem archetypischen seltenen Antikörpermangelsyndrom (PAD), bei dem eine gestörte B-Zell-Funktion wieder- kehrende Infektionen verursacht. Das Labor von Christoph Bock am Ludwig-Boltzmann- Institut für Seltene und Undiagnostizierte Erkrankungen (http://rarediseases.at/) wird sich im Rahmen des i-PAD-Projekts auf die Hochdurchsatz-Analyse des Chromatins sowie auf eine integrative bioinformatische Analyse aller im Projekt erzeugten Datensätze konzentrieren.

Seltene Erkrankungen sind individual rar, betreffen aber insgesamt mehr als 7% der Bevölkerung. Diese Krankheiten sind oft schwerwiegend und eine korrekte Diagnose ist ein wichtiger Schritt auf dem Weg zu einer angemessenen Behandlung. Patienten mit seltenen Krankheiten werden in der Regel auf der Grundlage genetischer Veränderungen diagnostiziert, die sich negativ auf die Funktion ihrer Zellen auswirken. Dieser Ansatz liefert jedoch nicht immer eine schlüssige Diagnose. Im Rahmen des i-PAD-Projekts, das im Rahmen des ERA-NET E-Rare-3 Programms gefördert wurde, untersucht das Labor von Christoph Bock am Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases die epigenetische Regulation bei Patienten, die keine Antikörper zum Schutz vor Infektionen produzieren können. Diese Studie blickte über genetische Veränderungen in der DNA hinaus und untersuchte die epigenetische Landschaft einer besonderen Form von genetisch bedingten Immunerkrankungen.

Forschungsstätte(n)
  • Ludwig Boltzmann Gesellschaft - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Bodo Grimbacher, Universitätsklinikum Freiburg - Deutschland
  • Lennart Hammarström, Karolinska Institute - Schweden
  • Roger Geiger, Universita della Svizzera italiana - Schweiz
  • Esteban Ballestar, Josep Carreras Leukaemia Research Institute - Spanien

Research Output

  • 12 Zitationen
  • 2 Publikationen
  • 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2022
    Titel Integrated Multi-omics Analyses of NFKB1 patients B cells points towards an up regulation of NF-?B network inhibitors
    DOI 10.1101/2022.11.22.517350
    Typ Preprint
    Autor Camacho-Ordonez N
    Seiten 2022.11.22.517350
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Multi-omics analysis of naïve B cells of patients harboring the C104R mutation in TACI
    DOI 10.3389/fimmu.2022.938240
    Typ Journal Article
    Autor Ramirez N
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 938240
    Link Publikation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2020
    Titel Highly Cited Researcher List 2020 by IS Web of Science (Clarivate Analytics)
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Erwin Schrödinger Prize by the Austrian Academy of Sciences
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad National (any country)
Weitere Förderungen
  • 2021
    Titel ERC Consolidator Grant
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2021
    Geldgeber CeMM Research Center for Molecular Medicine

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