Multi-Omics Analysis of Primary Antibody Deficiencies (i-PAD)
Multi-Omics Analyse des Antikörpermangelsyndroms (i-PAD)
ERA-NET: Rare Diseases
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (60%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (40%)
Keywords
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Common variable immunodeficiency (CVID),
Primary Antibody Deficiencies (Pad),
Epigenomics,
Transcriptomics,
Proteomics,
Bioinformatics
Das menschliche Immunsystem steuert, wie wir auf Infektionen und andere Krankheiten rea- gieren. Seine Funktionsweise unterscheidet sich jedoch erheblich zwischen einzelnen Perso- nen. Bestimmte Menschen haben leichte oder schwere Immundefekte, die sie anfällig für In- fektionen, Autoimmunität und Krebs machen. Einige dieser Immundefekte werden von ein- zelnen Genen verursacht und sind relativ gut verstanden. Aber in vielen Fällen ist die moleku- lare Ursache völlig unbekannt, weshalb diese seltenen Krankheiten schwer zu diagnostizieren und zu behandeln sind. In diesem Projekt werden wir modernste Multi-Omics- Analysemethoden und eine integrative bioinformatische Analyse verwenden, um die moleku- laren Mechanismen des variable Immundefektsyndrom zu analysieren, einem archetypischen seltenen Antikörpermangelsyndrom (PAD), bei dem eine gestörte B-Zell-Funktion wieder- kehrende Infektionen verursacht. Das Labor von Christoph Bock am Ludwig-Boltzmann- Institut für Seltene und Undiagnostizierte Erkrankungen (http://rarediseases.at/) wird sich im Rahmen des i-PAD-Projekts auf die Hochdurchsatz-Analyse des Chromatins sowie auf eine integrative bioinformatische Analyse aller im Projekt erzeugten Datensätze konzentrieren.
Seltene Erkrankungen sind individual rar, betreffen aber insgesamt mehr als 7% der Bevölkerung. Diese Krankheiten sind oft schwerwiegend und eine korrekte Diagnose ist ein wichtiger Schritt auf dem Weg zu einer angemessenen Behandlung. Patienten mit seltenen Krankheiten werden in der Regel auf der Grundlage genetischer Veränderungen diagnostiziert, die sich negativ auf die Funktion ihrer Zellen auswirken. Dieser Ansatz liefert jedoch nicht immer eine schlüssige Diagnose. Im Rahmen des i-PAD-Projekts, das im Rahmen des ERA-NET E-Rare-3 Programms gefördert wurde, untersucht das Labor von Christoph Bock am Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases die epigenetische Regulation bei Patienten, die keine Antikörper zum Schutz vor Infektionen produzieren können. Diese Studie blickte über genetische Veränderungen in der DNA hinaus und untersuchte die epigenetische Landschaft einer besonderen Form von genetisch bedingten Immunerkrankungen.
- Bodo Grimbacher, Universitätsklinikum Freiburg - Deutschland
- Lennart Hammarström, Karolinska Institute - Schweden
- Roger Geiger, Universita della Svizzera italiana - Schweiz
- Esteban Ballestar, Josep Carreras Leukaemia Research Institute - Spanien
Research Output
- 12 Zitationen
- 2 Publikationen
- 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 1 Weitere Förderungen
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2022
Titel Integrated Multi-omics Analyses of NFKB1 patients B cells points towards an up regulation of NF-?B network inhibitors DOI 10.1101/2022.11.22.517350 Typ Preprint Autor Camacho-Ordonez N Seiten 2022.11.22.517350 Link Publikation -
2022
Titel Multi-omics analysis of naïve B cells of patients harboring the C104R mutation in TACI DOI 10.3389/fimmu.2022.938240 Typ Journal Article Autor Ramirez N Journal Frontiers in Immunology Seiten 938240 Link Publikation
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2022
Titel Erwin Schrödinger Prize by the Austrian Academy of Sciences Typ Research prize Bekanntheitsgrad National (any country) -
2020
Titel Highly Cited Researcher List 2020 by IS Web of Science (Clarivate Analytics) Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International
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2021
Titel ERC Consolidator Grant Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2021