GENOMIT - Globales Register, Genomik, hin zu Therapie
GENOMIT - Global registry, genomics, toward clinical trials
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (70%); Klinische Medizin (30%)
Keywords
-
Oxidative Phosphorylation,
Pathomechanism,
Mitochondria,
Global Registry,
Energy Metabolism,
RNA sequencing
Mitochondriale Erkrankungen sind eine genetisch heterogene Gruppe von jeweils seltenen Defekten, für die es bisher kaum ursächliche Behandlung gibt. Das GENOMIT Konsortium bringt nationale Netzwerke aus Deutschland, Italien, Großbritannien und Japan sowie die Zentren für mitochondriale Erkrankungen aus Österreich und Frankreich zusammen, die gemeinsam mehr als 6000 Patienten betreuen. GENOMIT arbeitet eng mit nationalen Patientenorganisationen zusammen, um Diagnose und Betreuung von Patienten mit mitochondrialen Erkrankungen zu verbessern. GENOMIT wird i) ein globales Patientenregister und krankheitsspezifische Verlaufsparameter entwickeln, um klinische Studien vorzubereiten; ii) Genom-weite Diagnostik vorantreiben durch Verwendung von mehr als 3000 Exom-Daten sowie RNA-Sequenzierung und Proteom-Daten; und iii) funktionelle Tests für neue genetische Varianten, Gene und Stoffwechselwege bei mitochondrialen Krankheiten kreieren. Die GENOMIT Partner sind etablierte nationale Zentren für bestmögliche, moderne Diagnose und Patientenversorgung. Dieses Konsortium ermöglicht die Entwicklung eines globalen Patientenregisters sowie die weltweit größte Sammlung an Genom- Daten für mitochondriale Krankheiten. Jeder Partner hat einzigartige Expertise, deren Zusammenführen im GENOMIT Konsortium einzigartige Synergien schafft. Damit sollte in mehreren Bereichen eine kritische Masse erreicht werden, damit natürliche Krankheitsverläufe besser standen werden können, damit neue krankheitsrelevante Gene gefunden werden könne und damit Krankheitsmechanismen besser verstanden werden und damit eine unschätzbare Ressource für klinische Studien geschaffen wird.
Mitochondrien sind ein zentrales Organell der Energieversorgung der Zelle. Bisher wurden Defekte in mehr als 370 Genen gefunden, die zu Krankheiten führen. Das klinische Bild ist sehr heterogen. Im multizentrischen European Joint Programme on Rare Diseases Projekt GENOMIT konnten wir (1) neun neue Gene entdecken, die Krankheiten beim Menschen verursachen, (2) den Krankheitsverlauf in Patientenkohorten einzelner Gendefekte beschreiben, (3) den Pathomechanismus von verschieden genetischen Defekten ergründen und (4) darauf aufbauend Therapieoptionen untersuchen. Insgesamt konnten 27 Publikationen in Fachzeitschriften verfasst, neue wissenschaftliche Kollaborationen eingegangen und Labormethoden entwickelt werden. Vier Studierende konnten eine akademische Ausbildung abschließen. Bei den neu entdeckten Gendefekten sind z.B. ATP5MC3 und ATP5PO hervorzuheben, die beide zu einer Verminderung der ATP Synthase führen, dem zentralen Enzym der ATP-Bildung in Mitochondrien. Während Varianten in ATP5MC3 in monoallelischer, heterozygoter Form bereits krankheitsrelevant sind, werden biallelische Varianten in ATP5O autosomal rezessiv vererbt. Beim Defekt von PPA1, der Pyrophosphatase außerhalb der Mitochondrien, kommt es zu einer gestörten Metabolisierung von Galaktose, die bereits im Neugeborenen-Screening zu sehen ist. Das klinische Bild der Betroffenen war trotz deutlichem Funktionsverlust mild. Dies war überraschend, da die Funktion von PPA1 im Tiermodell als essentiell für das Leben gezeigt worden war. Die Therapie von genetischen Defekten und insbesondere auch von mitochondrialen Störungen sind häufig sehr limitiert und oft auf Milderung von Symptomen beschränkt. Dennoch gibt es auch Beispiele von sehr einfachen und preiswerten Behandlungsmöglichkeiten, wie etwa beim PPA2 Defekt, bei dem die mitochondriale Pyrophosphatase betroffen ist. Diese Krankheit wurde in einem früheren Projekt von unserer Gruppe erstmals beschrieben und in einer internationalen Übersichtsarbeit konnten wir bei 34 Betroffenen aus 20 Familien den klinischen Phänotyp weiter präzisieren. Eine Gruppe von Betroffenen erkrankte im Säuglings- oder Kleinkindalter im Zuge von fieberhaften Infekten, wobei viele dieser Kinder mit kardialen Symptomen verstarben. Der andere Teil erreichte das Jugendlichenalter, wobei 4 dieser Betroffenen nach dem Konsum von kleinen Mengen an Alkohol durch plötzlichen Herztod verstarben. PPA2 wird für die Metabolisierung von Alkohol benötigt und ein Vermeiden von Alkohol stellt eine einfache und wirksame Therapiemaßnahme dar. Ein Screening auf einen Gendefekt in PPA2 wäre daher sehr sinnvoll und die Therapie wäre sogar kostenlos.
- Holger Prokisch, Helmholtz Zentrum München - Deutschland
- Thomas Klopstock, Ludwig Maximilians-Universität München - Deutschland
- Agnes Rötig, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale - Frankreich
- Costanza Lamperti, National Neurological Institute "C. Besta" - Italien
- Michelangelo Mancuso, University of Pisa - Italien
- Kei Murayama, Chiba Children´s Hospital - Japan
- Robert Mcfarland, University of Newcastle - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 391 Zitationen
- 32 Publikationen
- 11 Methoden & Materialien
- 2 Disseminationen
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2024
Titel Biallelic Cys141Tyr variant of SEL1L is associated with neurodevelopmental disorders, agammaglobulinemia, and premature death. DOI 10.1172/jci170882 Typ Journal Article Autor Lin Ll Journal The Journal of clinical investigation -
2024
Titel Genetic landscape of pediatric acute liver failure of indeterminate origin. DOI 10.1097/hep.0000000000000684 Typ Journal Article Autor Lenz D Journal Hepatology (Baltimore, Md.) Seiten 1075-1087 -
2024
Titel Anaplerotic Therapy Using Triheptanoin in Two Brothers Suffering from Aconitase 2 Deficiency. DOI 10.3390/metabo14040238 Typ Journal Article Autor Mayr Ja Journal Metabolites -
2024
Titel De novo variants in RNF213 are associated with a clinical spectrum ranging from Leigh syndrome to early-onset stroke DOI 10.1016/j.gim.2023.101013 Typ Journal Article Autor Brunet T Journal Genetics in Medicine -
2021
Titel PPA2-associated sudden cardiac death: extending the clinical and allelic spectrum in 20 new families DOI 10.1038/s41436-021-01296-6 Typ Journal Article Autor Guimier A Journal Genetics in Medicine Seiten 2415-2425 Link Publikation -
2021
Titel Impaired complex I repair causes recessive Leber’s hereditary optic neuropathy DOI 10.1172/jci138267 Typ Journal Article Autor Stenton S Journal Journal of Clinical Investigation Link Publikation -
2021
Titel Case Report and Review of the Literature: A New and a Recurrent Variant in the VARS2 Gene Are Associated With Isolated Lethal Hypertrophic Cardiomyopathy, Hyperlactatemia, and Pulmonary Hypertension in Early Infancy DOI 10.3389/fped.2021.660076 Typ Journal Article Autor Kušíková K Journal Frontiers in Pediatrics Seiten 660076 Link Publikation -
2021
Titel Mutations in HID1 Cause Syndromic Infantile Encephalopathy and Hypopituitarism DOI 10.1002/ana.26127 Typ Journal Article Autor Schänzer A Journal Annals of Neurology Seiten 143-158 Link Publikation -
2021
Titel Defective metabolic programming impairs early neuronal morphogenesis in neural cultures and an organoid model of Leigh syndrome DOI 10.1038/s41467-021-22117-z Typ Journal Article Autor Inak G Journal Nature Communications Seiten 1929 Link Publikation -
2022
Titel A recurrent single-amino acid deletion (p.Glu500del) in the head domain of ß-cardiac myosin in two unrelated boys presenting with polyhydramnios, congenital axial stiffness and skeletal myopathy DOI 10.1186/s13023-022-02421-7 Typ Journal Article Autor Bader I Journal Orphanet Journal of Rare Diseases Seiten 279 Link Publikation -
2022
Titel Mutations in HID1 Cause Syndromic Infantile Encephalopathy and Hypopituitarism DOI 10.1530/ey.19.1.5 Typ Journal Article Autor A S Journal Yearbook of Paediatric Endocrinology Link Publikation -
2022
Titel Pathogenic variants in GCSH encoding the moonlighting H-protein cause combined nonketotic hyperglycinemia and lipoate deficiency DOI 10.1093/hmg/ddac246 Typ Journal Article Autor Arribas-Carreira L Journal Human Molecular Genetics Seiten 917-933 Link Publikation -
2022
Titel Ketogenic Diet Treatment of Defects in the Mitochondrial Malate Aspartate Shuttle and Pyruvate Carrier DOI 10.3390/nu14173605 Typ Journal Article Autor Bölsterli B Journal Nutrients Seiten 3605 Link Publikation -
2022
Titel Bi-Allelic COQ4 Variants Cause Adult-Onset Ataxia-Spasticity Spectrum Disease DOI 10.1002/mds.29167 Typ Journal Article Autor Cordts I Journal Movement Disorders Seiten 2147-2153 Link Publikation -
2022
Titel Variants in Mitochondrial ATP Synthase Cause Variable Neurologic Phenotypes DOI 10.1002/ana.26293 Typ Journal Article Autor Zech M Journal Annals of Neurology Seiten 225-237 Link Publikation -
2022
Titel Biallelic BUB1 mutations cause microcephaly, developmental delay, and variable effects on cohesion and chromosome segregation DOI 10.1126/sciadv.abk0114 Typ Journal Article Autor Carvalhal S Journal Science Advances Link Publikation -
2021
Titel Characterising a homozygous two-exon deletion in UQCRH: comparing human and mouse phenotypes DOI 10.15252/emmm.202114397 Typ Journal Article Autor Vidali S Journal EMBO Molecular Medicine Link Publikation -
2022
Titel Genotypic and phenotypic spectrum of infantile liver failure due to pathogenic TRMU variants DOI 10.1016/j.gim.2022.09.015 Typ Journal Article Autor Vogel G Journal Genetics in Medicine Seiten 100314 Link Publikation -
2022
Titel A TSHZ3 Frame-Shift Variant Causes Neurodevelopmental and Renal Disorder Consistent with Previously Described Proximal Chromosome 19q13.11 Deletion Syndrome DOI 10.3390/genes13122191 Typ Journal Article Autor Feichtinger R Journal Genes Seiten 2191 Link Publikation -
2021
Titel A novel cryptic splice site mutation in COL1A2 as a cause of osteogenesis imperfecta DOI 10.1016/j.bonr.2021.101110 Typ Journal Article Autor El-Gazzar A Journal Bone Reports Seiten 101110 Link Publikation -
2021
Titel Pathogenic variants in MRPL44 cause infantile cardiomyopathy due to a mitochondrial translation defect DOI 10.1016/j.ymgme.2021.06.001 Typ Journal Article Autor Friederich M Journal Molecular Genetics and Metabolism Seiten 362-371 Link Publikation -
2023
Titel Case Report-An Inherited Loss-of-Function NRXN3 Variant Potentially Causes a Neurodevelopmental Disorder with Autism Consistent with Previously Described 14q24.3-31.1 Deletions DOI 10.3390/genes14061217 Typ Journal Article Autor Feichtinger R Journal Genes -
2023
Titel Diagnosis, characterization and treatment of rare genetic diseases identified by whole- exome sequencing Typ PhD Thesis Autor Melanie Achleitner -
2022
Titel Ketogenic Diet Treatment of Defects in the Mitochondrial Malate Aspartate Shuttle and Pyruvate Carrier DOI 10.5167/uzh-224047 Typ Other Autor Boltshauser Link Publikation -
2021
Titel Mutations in HID1 Cause Syndromic Infantile Encephalopathy and Hypopituitarism DOI 10.22029/jlupub-9160 Typ Journal Article Autor Achleitner M Link Publikation -
2024
Titel Genetic landscape of pediatric acute liver failure of indeterminate origin. DOI 10.48350/189117 Typ Journal Article Autor Lenz Link Publikation -
2023
Titel PPA1 Deficiency Causes a Deranged Galactose Metabolism Recognizable in Neonatal Screening. DOI 10.3390/metabo13111141 Typ Journal Article Autor Achleitner Mt Journal Metabolites -
2023
Titel Investigating the role of ASCC1 in the causation of bone fragility. DOI 10.3389/fendo.2023.1137573 Typ Journal Article Autor Mayr Ja Journal Frontiers in endocrinology Seiten 1137573 -
2023
Titel PSMC3 proteasome subunit variants are associated with neurodevelopmental delay and type I interferon production. DOI 10.1126/scitranslmed.abo3189 Typ Journal Article Autor Ebstein F Journal Science translational medicine -
2023
Titel Treatment of Mitochondrial Phenylalanyl-tRNa-Synthetase Deficiency (FARS2) with Oral Phenylalanine. DOI 10.1055/a-2008-4230 Typ Journal Article Autor Oswald Sl Journal Neuropediatrics Seiten 351-355 -
2023
Titel Expanding the phenotypic and biochemical spectrum of NDUFAF3-related mitochondrial disease. DOI 10.1016/j.ymgme.2023.107675 Typ Journal Article Autor Cabrera-Orefice A Journal Molecular genetics and metabolism Seiten 107675 -
2022
Titel PPA2-associated sudden cardiac death: extending the clinical and allelic spectrum in 20 new families DOI 10.1016/j.gim.2022.02.002 Typ Journal Article Autor Guimier A Journal Genetics in Medicine Seiten 967 Link Publikation
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2024
Link
Titel Oxford Nanopore Sequencing Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
Link
Titel Nanolive Holotomography Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
Titel Seahorse measurements Typ Biological samples Öffentlich zugänglich -
2015
Titel Cloning-Yeast Typ Model of mechanisms or symptoms - in vitro Öffentlich zugänglich -
2010
Titel Convocal Laser Microscope Typ Cell line Öffentlich zugänglich -
2009
Titel Immunohistochemical staining Typ Biological samples Öffentlich zugänglich -
2006
Titel Western Blot Typ Biological samples Öffentlich zugänglich -
2006
Titel Spectrophotometric measurement of the OXPHOS enzyme activity Typ Biological samples Öffentlich zugänglich -
2006
Titel Sanger sequencing Typ Biological samples Öffentlich zugänglich -
2006
Titel Substrate oxidation Typ Biological samples Öffentlich zugänglich -
2006
Titel qRT-PCR Typ Biological samples Öffentlich zugänglich
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2022
Link
Titel young.hope, Research Centre in Salzburg conducts research into metabolic diseases as well as nutritional and developmental disorders in children. Typ Engagement focused website, blog or social media channel Link Link -
2021
Link
Titel Regular GENOMIT meetings Typ A formal working group, expert panel or dialogue Link Link