Immun-epithel-Kommunikation in IBD

Die IBDome Datenbank wurde entwickelt um multi-omic Datensätze für entzündliche Darmerkrankungen und klinische Daten zu integrieren und dem TRR241-Konsortium zur Verfügung zu stellen. Unserer Ziel ist es die größte Datenbank für Omics-Daten und klinische Daten zu entwickeln und der Community zur Verfügung zu stellen. Wir verfolgen folgende Ziele: 1) Sammlung und Standardisierung der Patientenproben und klinischen Datenmanagement 2) Generierung von experimentellen und systembiologischen Daten mit den vorhandenen Proben. 3) Entwicklung und Wartung einer web-basierten Datenbank sowie analytische Pipelines für die Integration und Analyse von molekularen, zellulären und klinischen Daten. Aufbauend auf den Ergebnissen aus der ersten Förderperiode, werden wir in der zweiten Förderperiode die IBDome Datenbank weiter entwickeln und die Anzahl der PatientInnen erhöhen. Darüberhinaus werden wir longitudinale Daten generieren sowie komplementäre Datensätze mit neuen Techniken (single-cell sequencing, spatial proteomics) erzeugen. Mit neuen Kohorten von Patienten werden wir den klinische Verlauf der Krankheit und das therapeutischen Ansprechen aufzeichnen. Schließlich werden wir einen Translational Board installieren um die klinisch relevanten Analysen zu planen. Das Board wird aus Gastroenterologen, Grundlagen Wissenschaftler sowie Bionformatiker bestehen.