RNA Interferenz und Chromatinmodifikation in Säugern

RNA-Interferenz (RNAi) ist ein post-transkriptioneller Prozess bei welchem doppelsträngige RNA den sequenzspezifischen Abbau einer Ziel-RNA auslöst, wodurch die Bildung des entsprechenden Gen-Produktes unterdrückt wird. Kürzlich wurde gezeigt, dass RNAi auch die Expression auf transkriptioneller Ebene durch die Modifikation der Chromatinstruktur regulieren kann. In der Spalthefe und Drosophila werden bestimmte Komponenten der RNAi Maschinerie auch für die Bildung von Heterochromatin benötigt. So wurde gezeigt, dass die Komponenten der RNAi Maschinerie für die Produktion von "small interfering" RNAs (siRNAs), welche zu bestimmten chromosomalen Regionen homolog sind, benötigt werden. Die siRNAs werden ihrerseits in den "RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing" (RITS) Komplex eingebaut und steuern diesen an di entsprechende homologe chromosomale Region. Es wird angenommen, dass dieser Komplex in weiterer Folge Chromatin-modifizierende Enzype rekrutiert, und so die Bildung von transkriptionell inaktivem Heterochromatin herbeiführt. Ziel dieses Forschungsvorhabens ist es zu untersuchen, ob die Komponenten der RNAi Maschinerie auch im Säugersystem eine vergleichbare Rolle bei der Bildung von Heterochromatin spielen. Durch die gezielte Bindung von Epitop-markierten Komponenten der RNAi Maschinerie an bestimmte chromosomale Regionen, soll deren Einfluss auf benachbarte Reportegene und das umliegende Chromatin getestet werden. Die Angewandte Technik ermöglicht auch die Isolierung und Charakterisierung von RNAi bzw. Chromatin modifizierenden Komplexen.