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Einfluss von Nitrifikanten auf den marinen Kohlenstoffzyklus

The influence of nitrifiers on the oceanic carbon cycle

Barbara Bayer (ORCID: 0000-0003-3968-5804)
  • Grant-DOI 10.55776/J4426
  • Förderprogramm Erwin Schrödinger
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.02.2020
  • Projektende 31.01.2023
  • Bewilligungssumme 171.080 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (30%); Chemie (20%); Geowissenschaften (50%)

Keywords

    Chemolithoautotrophy, Carbon Budget, Carbon Release, Ammonia-Oxidizing Archaea, Nitrite-Oxidizing Bacteria, Nitrification

Abstract Endbericht

Ungefähr ein Viertel des Kohlenstoffdioxids (CO2), welches in die Atmosphäre abgegeben wird, löst sich im Oberflächenwasser des Meeres, wo es sich im Gleichgewicht mit anderen anorganischen Kohlenstoffverbindungen befindet. Phytoplankton, welches im lichtdurfluteten Oberflächenwasser lebt, ist für die Hälfte der Photosynthese auf der Erde verantwortlich und wandelt diesen anorganischen Kohlenstoff in Biomasse um. Wenn Phytoplankton stirbt und folglich durch die Wassersäule sinkt, wird organischer Kohlenstoff in Form von Biomasse in die Tiefen des Meeres transportiert und erhält dadurch das marine Nahrungsnetz. Obwohl der Großteil des organischen Kohlenstoffs durch Mikro- und Makroorganismen schließlich wieder zu CO2 veratmet wird, sinkt ein kleiner Teil zum Meeresboden und kann dort für mehrere Tausend Jahre verweilen. Unser Verständnis darüber wie Kohlenstoff diesen Zyklus durchläuft, um letztendlich am Meeresboden zu gelangen, liefert wichtige Informationen für globale Modelle und Prognosen darüber, welche Rolle der Ozean für die Abschwächung des Klimawandels spielt. Neben Mikroorganismen, die organischen Kohlenstoff konsumieren, gibt es in der Tiefsee auch Mikroorganismen, die chemische Energie nutzen können, um anorganische Kohlenstoffverbindungen in Biomasse umzuwandeln. Diese Organismen in der Lage, zum Beispiel reduzierte Stickstoffverbindungen wie Ammoniak (NH3) oder Nitrit (NO2-) zu oxidieren, um damit Energie für die Kohlenstofffixierung zu gewinnen. Ähnlich wie PhytoplanktonimOberflächenwasser stellen Ammoniak- undNitrit-oxidierende Mikroorganismen in der Tiefsee dadurch organischen Kohlenstoff für andere Mikroorganismen bereit, die diese organischen Verbindungen konsumieren. Neben dem organischen Material, welches aufgrund von Zelltod und Lyse abgegeben wird, können auch lebende Zellen organische Verbindungen in das Umgebungswasser abgeben. Diese könnten eine wichtige zusätzliche Quelle an organischem Kohlenstoff in der Tiefsee darstellen, die bisher noch nicht in Modellen des marinen Kohlenstoffzyklus integriert sind. Unter Verwendung von Laborkulturen und Freilandmessungen beschäftigt sich dieses Forschungsprojekt mit der Quantifizierung und Charakterisierung von organischem Material, welches von Ammoniak- und Nitrit-oxidierenden Mikroorganismen ins Meer abgegeben wird. Das übergeordnete Ziel besteht darin, bislang unbekannte beziehungsweise unerforschte Kohlenstoffquellen in globale Kohlenstoffmodelle zu integrieren, um dadurch zukünftige Klimawandelzenarien besser verstehen zu können.

Unser Verständnis darüber welche Kreisläufe Kohlenstoff durchläuft, um letztendlich am Meeresboden zu gelangen, liefert wichtige Informationen für globale Modelle und Prognosen darüber, welche Rolle der Ozean für die Abschwächung des Klimawandels spielt. Neben Mikroorganismen, die organischen Kohlenstoff konsumieren, gibt es in der Tiefsee auch Mikroorganismen, die chemische Energie nutzen können, um anorganische Kohlenstoffverbindungen in Biomasse umzuwandeln (Chemosynthese). Diese Organismen sind in der Lage, zum Beispiel reduzierte Stickstoffverbindungen wie Ammoniak (NH3) oder Nitrit (NO2-) zu oxidieren, um damit Energie für die Kohlenstofffixierung zu gewinnen. Diese frische Kohlenstoffquelle stellt eine wichtige Nahrungsquelle für heterotrophe Nahrungsnetze in der Tiefsee dar. Neben dem organischen Material, welches aufgrund von Zelltod und Lyse abgegeben wird, können auch lebende Zellen organische Verbindungen in das Umgebungswasser abgeben. Um den marinen Kohlenstoffzyklus besser verstehen zu können, ist die Quantifizierung des anorganischen Kohlenstoffes, den Mikroorganismen fixieren und in Form von organischem Kohlenstoff wieder an das Umgebungswasser abgeben, besonders wichtig. Um diese Wissenslücke zu füllen, haben wir im Zuge dieses Projektes anorganische Kohlenstofffixierungsraten, sowie die Abgabe von gelösten, organischen Kohlenstoffverbindungen in Laborkulturen gemessen. Die Ergebnisse der Studie legen nahe, dass Ammoniak- und Nitrit-oxidierende Mikroorganismen zwischen 5 und 15% des kürzlich fixierten Kohlenstoffes in der Form von gelöstem, organischen Material abgeben. Dies würde im globalen Ozean jährlich zwischen 6000 und 20,000 Kilotonnen Kohlenstoff ausmachen. Die abgegebenen Substanzen könnten daher eine wichtige zusätzliche Quelle an organischem Kohlenstoff in der Tiefsee darstellen, die bisher noch nicht in Modellen des marinen Kohlenstoffkreislaufes integriert sind. Ein wichtiger nächster Schritt besteht darin herauszufinden, wie stabil diese Kohlenstoffverbindungen sind und was damit im Ozean passiert, um die Auswirkungen auf marine Nahrungsnetze und die biologische Einlagerung von Kohlenstoff im Ozean besser zu verstehen. Ein weiteres wichtiges Ergebnis dieses Forschungsprojektes ist die Entdeckung, dass einige marine Nitrit-oxidierende Mikroorganismen Formiat als Energiequelle nutzen können. Die Aktivitäten von Ammoniak- und Nitrit-oxidierenden Mikroorganismen sind typischerweise sehr eng miteinander gekoppelt, da beide Gruppen am Nitrifikationsprozess beteiligt sind. Diese größere Flexibilität von Stoffwechselvorgängen bei Nitrit-oxidierenden Mikroorganismen fordert diese Ansicht heraus. Die Bedeutung dieser alternativen Stoffwechselwege im Ozean wird in einer Folgestudie untersucht werden. Zusammenfassend verdeutlichen die Ergebnisse dieses Forschungsprojektes die vielfältigen Rollen, die nitrifizierende Mikroorganismen im marinen Kohlenstoffkreislauf einnehmen, wie beispielsweise die Abgabe von organischem Material, oder die Verwendung von organischem Kohlenstoff als Energiequelle. Darüber hinaus liefern diese Ergebnisse wichtige Zahlen für biogeochemische Modelle des globalen Kohlenstoffkreislaufes und helfen dabei, die quantitativen Zusammenhänge zwischen Kohlenstoff- und Stickstoffflüssen im Nitrifikationsprozess besser verstehen zu können.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
  • University of California at Santa Barbara - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Katharina Kitzinger, Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Stephen J. Giovannoni, Oregon State University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Xavier Mayali, University of California - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Elizabeth Kujawinski, Woods Hole Oceanographic Institution - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 175 Zitationen
  • 13 Publikationen
  • 4 Datasets & Models
  • 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2024
    Titel Contribution of ammonia oxidizers to inorganic carbon fixation in the dark ocean
    DOI 10.1101/2024.11.16.623942
    Typ Preprint
    Autor Bayer B
  • 2024
    Titel Metabolite release by nitrifiers facilitates metabolic interactions in the ocean.
    DOI 10.1093/ismejo/wrae172
    Typ Journal Article
    Autor Bayer B
    Journal The ISME journal
  • 2024
    Titel Genome sequence of Nitrosopumilus adriaticus CCS1 assembled from an ammonia-oxidizing enrichment culture.
    DOI 10.1128/mra.00692-24
    Typ Journal Article
    Autor Li M
    Journal Microbiology resource announcements
  • 2020
    Titel Metabolic versatility of the nitrite-oxidizing bacterium Nitrospira marina and its proteomic response to oxygen-limited conditions
    DOI 10.1101/2020.07.02.185504
    Typ Preprint
    Autor Bayer B
    Seiten 2020.07.02.185504
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Carbon content, carbon fixation yield and dissolved organic carbon release from diverse marine nitrifiers
    DOI 10.1101/2022.01.04.474793
    Typ Preprint
    Autor Bayer B
    Seiten 2022.01.04.474793
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Complete Genome Sequences of Two Phylogenetically Distinct Nitrospina Strains Isolated from the Atlantic and Pacific Oceans
    DOI 10.1128/mra.00100-22
    Typ Journal Article
    Autor Bayer B
    Journal Microbiology Resource Announcements
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Metabolic versatility of the nitrite-oxidizing bacterium Nitrospira marina and its proteomic response to oxygen-limited conditions
    DOI 10.1038/s41396-020-00828-3
    Typ Journal Article
    Autor Bayer B
    Journal The ISME Journal
    Seiten 1025-1039
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Jellyfish detritus supports niche partitioning and metabolic interactions among pelagic marine bacteria.
    DOI 10.1186/s40168-023-01598-8
    Typ Journal Article
    Autor Tinta T
    Journal Microbiome
    Seiten 156
  • 2022
    Titel Controls on the relative abundances and rates of nitrifying microorganisms in the ocean
    DOI 10.5194/bg-2022-139
    Typ Preprint
    Autor Zakem E
    Seiten 1-28
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Prokaryotic Life in the Deep Ocean's Water Column
    DOI 10.1146/annurev-marine-032122-115655
    Typ Journal Article
    Autor Herndl G
    Journal Annual Review of Marine Science
    Seiten 461-483
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Carbon content, carbon fixation yield and dissolved organic carbon release from diverse marine nitrifiers
    DOI 10.1002/lno.12252
    Typ Journal Article
    Autor Bayer B
    Journal Limnology and Oceanography
    Seiten 84-96
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Jellyfish detritus supports niche partitioning and metabolic interactions among marine bacteria
    DOI 10.21203/rs.3.rs-2377893/v1
    Typ Preprint
    Autor Tinta T
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Controls on the relative abundances and rates of nitrifying microorganisms in the ocean
    DOI 10.5194/bg-19-5401-2022
    Typ Journal Article
    Autor Zakem E
    Journal Biogeosciences
    Seiten 5401-5418
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2022 Link
    Titel Cellular carbon (C) and nitrogen (N) measurements of marine nitrifiers
    DOI 10.26008/1912/bco-dmo.871075.1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2022 Link
    Titel Dissolved inorganic carbon (DIC) fixation and dissolved organic carbon (DOC) release measurements of marine nitrifier cultures grown under different culture conditions
    DOI 10.26008/1912/bco-dmo.870832.1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Global proteome analyses of the nitrite-oxidizing bacterium Nitrospira marina grown under atmospheric and low oxygen concentrations
    DOI 10.26008/1912/bco-dmo.847395.1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Targeted proteome analyses of the nitrite-oxidizing bacterium Nitrospira marina grown under atmospheric and low oxygen concentrations
    DOI 10.26008/1912/bco-dmo.847378.1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2020
    Titel Poster award at ISME Summit Unity in Diversity
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Invited speaker at ISME18
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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