Neue Erkenntnisse über mitochondriale Dynamik mittels KRTET
Insights into Mitochondrial Dynamics using CSTET
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (60%); Physik, Astronomie (40%)
Keywords
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Cryo Scanning Transmission Electron Tomography (CS,
Mitochondria,
Cryo Fluoresence Microscopy (cryo FLM),
Mouse embryonic fibroblast
Diese Studie, die vom dem Erwin Schrödinger Stipendium unterstützt und im Labor von Prof. Deborah Fass gemeinsam mit dem Elektronenmikroskopie-Zentrum des Weizmann Instituts der Wissenschaften in Israel durchgeführt wird, zielt darauf ab, treibende Mechanismen mitochondrialer Dynamiken zu erklären. Mitochondrien sind weithin als "Kraftwerke" der Zelle bekannt, aber sie erfüllen auch diverse Funktionen in der Signalweiterleitung und -erkennung. Mitochondrien sind ca. 500 nm dicke, tubuläre Organellen. Sie bilden ein hoch verzweigtes und dynamisches Netzwerk, das permanent durch Fusion (Verschmelzen von zwei Mitochondrien) und Fission (Teilen von einem Mitochondrium in zwei) umgestaltet wird. Der erste Schritt der Fission geschieht durch das Einschnüren des Mitochondriums, eventuell unterstützt durch andere Organellen und dem Cytoskelett. Daraufhin versammeln sich weitere Proteine auf dieser Einschnürung und vollenden den Fissionsschritt. Die meisten im Fissionsprozess involvierten Proteine wurden durch lichtmikroskopische Bildgebung entdeckt, die gestörte, mutierte Zellen in mitochondrialer Dynamik abbildet, die diese Proteine nicht besitzen. Dennoch bleiben viele Fragen in Bezug auf den biophysikalischen Mechanismus der Fission und dem Zusammenspiel mit der zellulären Umgebung unbeantwortet. Lichtmikroskopie ermöglicht aufgrund seiner limitierten Auflösung nur einen begrenzten Einblick in den Fissionsmechanismus. Eine höhere Auflösung, die ausreichend ist, um Details mitochondrialer Ultrastruktur im Bereich von einigen Nanometer zu abzubilden, kann mittels Elektronenmikroskopie (EM) erreicht werden. In diesem Projekt verwende ich eine spezielle EM-Technologie zur Visualisierung von Zwischenstadien der mitochondrialen Fission. Zellen mit spezifischen Defekten von Fissionsfaktoren werden verwendet, um den mehrstufigen Fissionsprozess aufzuhalten und so die Analyse von Übergangsstadien zu ermöglichen. Ich konzentriere mich auf die Beantwortung von zwei essenziellen Fragen zur mitochondrialen Dynamik. Erstens, welche sind die Ultrastrukturen der Fissionsübergangsstadien, die in Zellen ohne zentrale Fissionsfaktoren beobachtet werden, und was sagen diese Ultrastrukturen über den biophysikalischen Mechanismus der Fission aus? Zweitens, wie beeinflussen diese Störungen des Fissionsprozesses die Interaktionen von Mitochondrien mit anderen zellulären Komponenten? Die neue EM-Technik, die ich verwenden werde, ist bekannt als Kryo-Rastertransmissionselektronentomographie (KRTET). KRTET ermöglicht die Ausleuchtung von 3D Volumina, die dick genug sind, um ganze Mitochondrien in intakten Zellen zu erfassen. Dadurch wird ein noch nie dagewesener Einblick in die Struktur der Zellen und deren intrazellulären Umgebung gewonnen. KRTET wurde an dem EM-Zentrum des Weizmann Instituts entwickelt und vor kurzem in einer Kollaborationsstudie mit dem Fass Labor angewendet.
- Institute of Science and Technology Austria - ISTA
- David C. Chan, California Institute of Technology - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 1 Zitationen
- 6 Publikationen
- 2 Methoden & Materialien
- 6 Datasets & Models
- 3 Disseminationen
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2024
Titel Snapshots of Mitochondrial Fission Imaged by Cryo-Scanning Transmission Electron Tomography DOI 10.1101/2024.10.25.620016 Typ Preprint Autor Kirchweger P -
2024
Titel Optimizing Contrast in Automated 4D STEM Cryotomography. DOI 10.1093/mam/ozae050 Typ Journal Article Autor Kirchweger P Journal Microscopy and microanalysis : the official journal of Microscopy Society of America, Microbeam Analysis Society, Microscopical Society of Canada Seiten 476-488 -
2022
Titel Bridging the light-electron resolution gap with correlative cryo-SRRF and dual-axis cryo-STEM tomography DOI 10.1101/2022.11.19.517200 Typ Preprint Autor Kirchweger P Seiten 2022.11.19.517200 Link Publikation -
2023
Titel Unraveling the multifaceted resilience of arsenic resistant bacterium Deinococcus indicus. DOI 10.3389/fmicb.2023.1240798 Typ Journal Article Autor Gouveia Ag Journal Frontiers in microbiology Seiten 1240798 -
2023
Titel Visualization of Organelles <em>In Situ</em> by Cryo-STEM Tomography DOI 10.3791/65052 Typ Journal Article Autor Kirchweger P Journal Journal of Visualized Experiments -
2023
Titel Correlating cryo-super resolution radial fluctuations and dual-axis cryo-scanning transmission electron tomography to bridge the light-electron resolution gap. DOI 10.1016/j.jsb.2023.107982 Typ Journal Article Autor Kirchweger P Journal Journal of structural biology Seiten 107982
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2023
Link
Titel Superresolution correlation with cryo-STET DOI 10.1016/j.jsb.2023.107982 Typ Improvements to research infrastructure Öffentlich zugänglich Link Link -
2023
Link
Titel Automated deconvolved dual axis cryo-STET DOI 10.1016/j.jsb.2023.107982 Typ Improvements to research infrastructure Öffentlich zugänglich Link Link
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2023
Link
Titel Deconvolved dual-axis CSTET tomogram of a WI-38 fibroblast cell at 850 nm thick part Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2023
Link
Titel Dual-axis CSTET tomogram at 850 nm thick region, weighted back projection Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
Link
Titel 4D_STEM cryo tomogram of t4 Phages produced by PCA2 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel 4D_STEM cryo tomogram of t4 Phages produced by PCA3 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
Link
Titel 4D STEM cryo tomogram of t4 Phages produced by iCOM Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel 4D_STEM cryo tomogram of t4 Phages produced by iDPC2 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2021
Titel Presentation at "Ambassadors' Club in Israel" Typ A talk or presentation -
2022
Titel Delegation of the ÖVP Typ A talk or presentation -
2024
Titel Visit Wolfang Sobotka Typ Participation in an activity, workshop or similar