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Pollen, Gene und die Evolution der Fagales

Pollen, genes and the evolution of the Fagales

Guido Grimm (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/M1751
  • Förderprogramm Lise Meitner
  • Status beendet
  • Projektbeginn 19.01.2015
  • Projektende 18.01.2017
  • Bewilligungssumme 157.380 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (60%); Geowissenschaften (40%)

Keywords

    Evolution, Cenozoic, Fagales, Interdisciplinary Research, Phylogenomics, Palynological Record

Abstract Endbericht

Wegen der zunehmenden Spezialisierung in den Wissenschaften, klaffen immer größere Gräben zwischen den einzelnen Wissenschaftsdisziplinen auf. Dies ist insbesondere bei den nahe verwandten und ineinanderfließenden Feldern der Neobotanik und Paläobotanik zu beobachten. Obwohl komplementär, werden in der Überzahl von Publikationen die sich mit der Rekonstruktion von historischer Biogeographie, molekularer Datierung und Evolution beschäftigen, Schlüsselerkenntnisse aus der paläobotanischen Forschung weitgehend ignoriert. Am Beispiel der Fagales soll der Versuch unternommen werden, den Bruch zwischen den Disziplinen zu überwinden. Die Fagales bieten sich dafür wie kaum eine andere Pflanzengruppe an: Sie verfügen nicht nur über einen reichen Makrofossilbefund, sondern auch über einen stetig wachsenden palynologischen. Letzteres ist unmittelbar bedeutsam für die Analyse und Interpretation neobotanischer Daten und Rekonstruktionen. Unter dem Elektronenmikroskop beobachtete Pollenmerkmale sind hoch- diagnostisch für einzelne Gattungen der Fagales und erlauben eine exakte Zuordnung. Dies macht den Pollenbefund zu einer natürlich Quelle um Divergenzen, die an Hand molekular-basierter Phylogenien erkannt wurden, zeitlich und räumlich zu fassen. An Hand des Makrofossilbefundes und insbesondere der Pollenfunde lassen sich alle modernen Gattungen der Fagales bis in das Paläogen zurückverfolgen. Die Ordnung selbst lässt sich bis mindestens in die Oberkreide nachweisen. Demgegenüber steht eine häufig geringe genetische Divergenz innerhalb und zwischen den Gattungen. Dazu gesellen sich interessante, bisher unverstandene Phänomene wie das nahezu simultane und quasi-globale Auftreten der modernen Gattungen. Hauptaufgabe des Projektes und des Antragstellers wird es sein, Lücken sowohl in dem Verständnis des paläobotanischen/palynologischen Befundes, in Kooperation mit laufenden Projekten am Heim- und Gastinstitut, als auch der genetischen Daten zu schließen; letzteres im Rahmen internationaler Kooperation. Ziel ist es, die Evidenzen aus den paläontologischen und neontologischen Daten und Rekonstruktionen zusammenzuführen um die Evolution der Fagales in Raum und Zeit umfassend darzustellen.

Die Idee dieses Lise-Meitner-Mobilitätsstipendiums war es eine Brücke zwischen wissenschaftlichen Teildisziplinen zu schlagen, die bisher wenig Kontakt hatten, aber großes Potential für überdisziplinäre Forschung. Der Stipendiat ist Geologe, der sich bereits während dem Studium der Genetik zugewandt und sich wissenschaftlich der Datenanalyse gewidmet hat; seine Gastgeber an der Universität Wien gehören zu den wenigen Palynologen, die den verstreut-fossilen Pollenbefund studieren. Die moderne Wissenschaft fragmentiert sich zusehends. Während die Urväter der Evolutionsforschung, Charles Darwin, Alfred Wallace und Ernst Haeckel, ihre Ideen noch auf umfassenden Betrachtungen der Natur an sich entwickelten, braucht es heute Spezialisten, um mit den sekündlich größer werdenden Datenmengen und den zunehmend facettenreicher werdenden Analysemethoden fertig zu werden. U.a. (Bio)Informatiker zu Auswertung der Daten, während Biologen sich spezialisieren auf Felder wie das der molekularen Systematik, die Verwandtschaftsbeziehungen von Tieren und Pflanzen aus Bäumen ableiten, die auf genetischen Daten fußen; der Biogeographie, bei der man versucht aus der modernen und (wenn möglich) fossilen Verbreitung einer Tier- oder Pflanzengruppe auf deren Historie zu schließen; der Statistik und Modellierung, wo es darum geht die quantitativen Rahmenparameter zu erfassen; und der immer kleiner werdenden Gruppe der Feldbotaniker und -zoologen (auch Taxonomen), hoch-spezialisierte Wissenschaftler, die als einzige das primäre Material beschaffen und ansprechen können mit dem andere Bereiche arbeiten. Zur letzten Kategorie können auch die Palynologen gezählt werden, die sich der Untersuchung mikroskopisch kleiner biologischer Objekte, wie Pollen und Sporen, verschrieben haben. Die Fragmentierung, in Hand mit dem sogenannten "single- blind peer review" System, bei dem meist anonyme Spezialisten die Arbeiten hinsichtlich Publizierbarkeit evaluieren, hat dazu geführt, daß echte überdisziplinäre Forschung selten geworden ist. In diesem Projekt haben wir versucht diese Lücke zu überbrücken und zu zeigen inwieweit der fossile Pollenbefund informativ sein kann für 'neontologische' biologische Disziplinen wie dem Datieren von molekularen Bäumen und der Erfassung biogeographischer Historien. Wir konnten die Wichtigkeit von Grönland zeigen zum Verständnis der Evolution der Buchen und ihrer Verwandten wie den Eichen und Kastanienähnlichen und als urtümliche Heimat von Pflanzen, die man heute nur noch in den äquatorialen Breiten und der südlichen Hemisphäre findet. Ein Beispiel sind die Loranthaceae (Riemenblumengewächse), eine den Misteln ähnliche Gruppe. Hier konnten unsere kombinierten palynologischen und molekularen Studien zeigen, wie diagnostisch Pollenmerkmale in dieser Pflanzenfamilie sind und dass ihre Evolution 20 Millionen Jahre früher begann als bisher angenommen. Unsere Hoffnung ist das unser Projekt einen Pilotcharakter hat, und andere Forscher dazu inspiriert über ihre Teetassenränder hinauszuschauen und in Kontakt zu treten mit Forschern anderer Disziplinen. Überdisziplinäre Forschung kann beschwerlich sein, aber ihre Ergebnisse machen die Mühen wett.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Susanne Renner, University of Munich - Deutschland
  • Marco Simeone, Universita degli Studi della Tuscia - Italien
  • Thomas Denk, Swedish Museum of Natural History - Schweden
  • Alastair Potts, Nelson Mandela Metropolitan University - Südafrika
  • Andrew Hipp, The Morton Arboretum - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 736 Zitationen
  • 29 Publikationen
  • 4 Datasets & Models
  • 1 Software
Publikationen
  • 2016
    Titel Fables and foibles: A critical analysis of the Palaeoflora database and the Coexistence Approach for palaeoclimate reconstruction
    DOI 10.1016/j.revpalbo.2016.07.001
    Typ Journal Article
    Autor Grimm G
    Journal Review of Palaeobotany and Palynology
    Seiten 216-235
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Species relationships and divergence times in beeches: new insights from the inclusion of 53 young and old fossils in a birth–death clock model
    DOI 10.1098/rstb.2015.0135
    Typ Journal Article
    Autor Renner S
    Journal Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences
    Seiten 20150135
    Link Publikation
  • 2016
    Titel A revised stratigraphy for the Palaeocene Agatdalen flora (Nuussuaq Peninsula, western Greenland): correlating fossiliferous outcrops, macrofossils, and palynological samples from phosphoritic nodules
    DOI 10.1515/acpa-2016-0009
    Typ Journal Article
    Autor Grímsson F
    Journal Acta Palaeobotanica
    Seiten 307-327
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Cretaceous and Paleogene Fagaceae from North America and Greenland: evidence for a Late Cretaceous split between Fagus and the remaining Fagaceae
    DOI 10.1515/acpa-2016-0016
    Typ Journal Article
    Autor Grímsson F
    Journal Acta Palaeobotanica
    Seiten 247-305
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Fallacies and fantasies: the theoretical underpinnings of the Coexistence Approach for palaeoclimate reconstruction
    DOI 10.5194/cp-12-611-2016
    Typ Journal Article
    Autor Grimm G
    Journal Climate of the Past
    Seiten 611-622
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Comparative systematics and phylogeography of Quercus Section Cerris in western Eurasia: inferences from plastid and nuclear DNA variation
    DOI 10.7287/peerj.preprints.26995
    Typ Preprint
    Autor Cardoni S
  • 2018
    Titel Plant fossils reveal major biomes occupied by the late Miocene Old-World Pikermian fauna
    DOI 10.1038/s41559-018-0695-z
    Typ Journal Article
    Autor Denk T
    Journal Nature Ecology & Evolution
    Seiten 1864-1870
  • 2018
    Titel Comparative systematics and phylogeography of Quercus Section Cerris in western Eurasia: inferences from plastid and nuclear DNA variation
    DOI 10.7717/peerj.5793
    Typ Journal Article
    Autor Simeone M
    Journal PeerJ
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Evolution of pollen morphology in Loranthaceae
    DOI 10.1080/00173134.2016.1261939
    Typ Journal Article
    Autor Grímsson F
    Journal Grana
    Seiten 16-116
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Taxonomy and palaeoecology of two widespread western Eurasian Neogene sclerophyllous oak species: Quercus drymeja Unger and Q. mediterranea Unger
    DOI 10.1016/j.revpalbo.2017.01.005
    Typ Journal Article
    Autor Denk T
    Journal Review of Palaeobotany and Palynology
    Seiten 98-128
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Intertwining phylogenetic trees and networks
    DOI 10.1111/2041-210x.12760
    Typ Journal Article
    Autor Schliep K
    Journal Methods in Ecology and Evolution
    Seiten 1212-1220
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 2: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d2.v1
    Typ Other
    Autor Banag C
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 2: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d2
    Typ Other
    Autor Banag C
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 4: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d4
    Typ Other
    Autor Banag C
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 4: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d4.v1
    Typ Other
    Autor Banag C
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 5: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d5
    Typ Other
    Autor Banag C
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 5: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d5.v1
    Typ Other
    Autor Banag C
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.60692/80qtb-m5q38
    Typ Other
    Autor Arnaud Mouly
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.60692/4tehp-fjf45
    Typ Other
    Autor Arnaud Mouly
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 1: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d1
    Typ Other
    Autor Banag C
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Additional file 1: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d1.v1
    Typ Other
    Autor Banag C
    Link Publikation
  • 2017
    Titel A Winteraceae pollen tetrad from the early Paleocene of western Greenland, and the fossil record of Winteraceae in Laurasia and Gondwana
    DOI 10.1111/jbi.13154
    Typ Journal Article
    Autor Grímsson F
    Journal Journal of Biogeography
    Seiten 567-581
  • 2016
    Titel Intertwining phylogenetic trees and networks
    DOI 10.7287/peerj.preprints.2054v1
    Typ Preprint
    Autor Schliep K
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Intertwining phylogenetic trees and networks
    DOI 10.7287/peerj.preprints.2054
    Typ Preprint
    Autor Schliep K
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Eocene Loranthaceae pollen pushes back divergence ages for major splits in the family
    DOI 10.7717/peerj.3373
    Typ Journal Article
    Autor Grímsson F
    Journal PeerJ
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.1186/s12862-017-0974-3
    Typ Journal Article
    Autor Banag C
    Journal BMC Evolutionary Biology
    Seiten 131
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Tiny pollen grains: first evidence of Saururaceae from the Late Cretaceous of western North America
    DOI 10.7717/peerj.3434
    Typ Journal Article
    Autor Grímsson F
    Journal PeerJ
    Link Publikation
  • 2017
    Titel The fossil Osmundales (Royal Ferns)—a phylogenetic network analysis, revised taxonomy, and evolutionary classification of anatomically preserved trunks and rhizomes
    DOI 10.7717/peerj.3433
    Typ Journal Article
    Autor Bomfleur B
    Journal PeerJ
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Combined LM and SEM study of the middle Miocene (Sarmatian) palynoflora from the Lavanttal Basin, Austria: part IV. Magnoliophyta 2 – Fagales to Rosales
    DOI 10.1080/00173134.2015.1096566
    Typ Journal Article
    Autor Grímsson F
    Journal Grana
    Seiten 101-163
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2019 Link
    Titel Evolution of pollen morphology in Loranthaceae
    DOI 10.6084/m9.figshare.4737352
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2018 Link
    Titel Data from: The fossil Osmundales (Royal Ferns)-a phylogenetic network analysis, revised taxonomy, and evolutionary classification of anatomically preserved trunks and rhizomes
    DOI 10.5061/dryad.270gs
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2017 Link
    Titel Additional file 3: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d3
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2017 Link
    Titel Additional file 3: of Ixora (Rubiaceae) on the Philippines - crossroad or cradle?
    DOI 10.6084/m9.figshare.c.3798205_d3.v1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Software
  • 2017 Link
    Titel Major update of Phangorn library for R
    Link Link

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