Untersuchung mikrobieller Dynamic in marinen Aggregaten
Elucidating microbial dynamics on marine aggregates
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (70%); Geowissenschaften (30%)
Keywords
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Marine Aggregates,
Microbial Degradation,
Carbon Cycle,
Vertical Export,
Marine Snow
Die Sedimentation organischen Materials von der Oberfläche in die tiefen Ozeane entspricht in etwa einem Drittel des anthropogenes Kohlendioxid-Eintrags in die Atmosphäre. Die Sedimentation erfolgt im Wesentlichen über die Bildung von Aggregaten aus Phytoplankton, Kotpillen, und anderen partikulären Stoffen, die infolge der Gravitation zum Meeresboden absinken. Dabei transportieren diese Partikel chemische Energie, Nährstoffe und kolonisierende Mikroorganismen. Letztere spielen eine Schlüsselrolle im Recycling des partikulären organischen Kohlenstoffs in den Aggregaten, da sie mithilfe von hydrolytischen Enzymen organischen Kohlenwasserstoff und Nährstoffe in das Umgebungswasser abgeben. Kürzlich wurde gezeigt, dass die Kolonisierung der Aggregate direkt im Oberflächenozean erfolgt, und dass durch das Absinken der Aggregate eine Vielzahl von Mikroorganismen in die Tiefsee transportiert werden. In Experimenten mit künstlichen Aggregaten wurde gezeigt, dass mikrobielle Gemeinschaften in einer bestimmten Reihenfolge auftreten und dass sich Mikronichen bilden. Zurzeit ist jedoch noch wenig über die mikrobiellen Prozesse in natürlichen marinen Aggregaten der Wassersäule bekannt. In dem hier vorgestellten Projekt sollen die wichtigsten mikrobiellen Abbauprozesse in marinen Aggregaten in den unterschiedlichen Wasserschichten, angefangen mit den Oberflächenschichten bis hinab in den Tiefen Ozean, untersucht werden. Die kürzlich entdeckte Vielfalt von Pilzarten in marinen Aggregaten der Tiefsee werden wir mithilfe neuer Methoden insbesondere auf ihre Rolle innerhalb des Abbaus organischen Materials in Aggregaten untersuchen. Weiterhin werden wir mikrobielle Besiedlungsmuster in Aggregaten mit Hinblick auf die Herkunft sowie Zusammensetzung der Mikroorganismen erforschen und werden testen, ob es ein globales Partikel-Mikrobiom gibt. Die Ergebnisse dieser Studien werden die mikrobiellen Prozesse in marinen Aggregaten erklären und zu einem neuen Verständnis der biogeochemischen Kreisläufe der Ozeane beitragen.
- Universität Wien - 100%
Research Output
- 277 Zitationen
- 14 Publikationen
- 2 Datasets & Models
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2020
Titel Submesoscale dynamics directly shape bacterioplankton community structure in space and time DOI 10.1101/2020.09.02.279232 Typ Preprint Autor Fadeev E Seiten 2020.09.02.279232 Link Publikation -
2021
Titel Seasonal dynamics are the major driver of microbial diversity and composition in intensive freshwater aquaculture DOI 10.1101/2021.02.26.433039 Typ Preprint Autor Marmen S Seiten 2021.02.26.433039 Link Publikation -
2020
Titel Functional Seasonality of Free-Living and Particle-Associated Prokaryotic Communities in the Coastal Adriatic Sea DOI 10.3389/fmicb.2020.584222 Typ Journal Article Autor Steiner P Journal Frontiers in Microbiology Seiten 584222 Link Publikation -
2020
Titel Sea-ice retreat may decrease carbon export and vertical microbial connectivity in the Eurasian Arctic basins DOI 10.21203/rs.3.rs-101878/v1 Typ Preprint Autor Fadeev E Link Publikation -
2024
Titel Recovering high-quality bacterial genomes from cross-contaminated cultures: a case study of marine Vibrio campbellii DOI 10.1186/s12864-024-10062-2 Typ Journal Article Autor Orel N Journal BMC Genomics Seiten 146 Link Publikation -
2023
Titel Comparative whole-genome analysis of novel marine Vibrio campbellii from pure and non-axenic cultures reveals a unique plasmid DOI 10.21203/rs.3.rs-2513960/v1 Typ Preprint Autor Fadeev E -
2022
Titel Characterization of membrane vesicles in Alteromonas macleodii indicates potential roles in their copiotrophic lifestyle DOI 10.1093/femsml/uqac025 Typ Journal Article Autor Fadeev E Journal microLife Link Publikation -
2022
Titel Bacterial Indicators Are Ubiquitous Members of Pelagic Microbiome in Anthropogenically Impacted Coastal Ecosystem DOI 10.3389/fmicb.2021.765091 Typ Journal Article Autor Orel N Journal Frontiers in Microbiology Seiten 765091 Link Publikation -
2020
Titel Spatial distribution of Arctic bacterioplankton abundance is linked to distinct water masses and summertime phytoplankton bloom dynamics (Fram Strait, 79°N) DOI 10.1101/2020.09.02.277574 Typ Preprint Autor Cardozo-Mino M Seiten 2020.09.02.277574 Link Publikation -
2021
Titel Spatial Distribution of Arctic Bacterioplankton Abundance Is Linked to Distinct Water Masses and Summertime Phytoplankton Bloom Dynamics (Fram Strait, 79°N) DOI 10.3389/fmicb.2021.658803 Typ Journal Article Autor Cardozo-Mino M Journal Frontiers in Microbiology Seiten 658803 Link Publikation -
2021
Titel Seasonal Dynamics Are the Major Driver of Microbial Diversity and Composition in Intensive Freshwater Aquaculture DOI 10.3389/fmicb.2021.679743 Typ Journal Article Autor Marmen S Journal Frontiers in Microbiology Seiten 679743 Link Publikation -
2021
Titel Submesoscale physicochemical dynamics directly shape bacterioplankton community structure in space and time DOI 10.1002/lno.11799 Typ Journal Article Autor Fadeev E Journal Limnology and Oceanography Seiten 2901-2913 Link Publikation -
2021
Titel Comparison of Two 16S rRNA Primers (V3–V4 and V4–V5) for Studies of Arctic Microbial Communities DOI 10.3389/fmicb.2021.637526 Typ Journal Article Autor Fadeev E Journal Frontiers in Microbiology Seiten 637526 Link Publikation -
2021
Titel Sea ice presence is linked to higher carbon export and vertical microbial connectivity in the Eurasian Arctic Ocean DOI 10.1038/s42003-021-02776-w Typ Journal Article Autor Fadeev E Journal Communications Biology Seiten 1255 Link Publikation
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2021
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Titel edfadeev/Export_and_vert_conn_FRAM: Published workflow DOI 10.5281/zenodo.5515440 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel CARD-FISH cell counts of taxonomic bacterial and archaeal groups in Fram Strait during PS99.2 DOI 10.1594/pangaea.905212 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link