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Untersuchung mikrobieller Dynamic in marinen Aggregaten

Elucidating microbial dynamics on marine aggregates

Eduard Fadeev (ORCID: 0000-0002-2289-2949)
  • Grant-DOI 10.55776/M2797
  • Förderprogramm Lise Meitner
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.12.2019
  • Projektende 30.11.2021
  • Bewilligungssumme 159.340 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (70%); Geowissenschaften (30%)

Keywords

    Marine Aggregates, Microbial Degradation, Carbon Cycle, Vertical Export, Marine Snow

Abstract

Die Sedimentation organischen Materials von der Oberfläche in die tiefen Ozeane entspricht in etwa einem Drittel des anthropogenes Kohlendioxid-Eintrags in die Atmosphäre. Die Sedimentation erfolgt im Wesentlichen über die Bildung von Aggregaten aus Phytoplankton, Kotpillen, und anderen partikulären Stoffen, die infolge der Gravitation zum Meeresboden absinken. Dabei transportieren diese Partikel chemische Energie, Nährstoffe und kolonisierende Mikroorganismen. Letztere spielen eine Schlüsselrolle im Recycling des partikulären organischen Kohlenstoffs in den Aggregaten, da sie mithilfe von hydrolytischen Enzymen organischen Kohlenwasserstoff und Nährstoffe in das Umgebungswasser abgeben. Kürzlich wurde gezeigt, dass die Kolonisierung der Aggregate direkt im Oberflächenozean erfolgt, und dass durch das Absinken der Aggregate eine Vielzahl von Mikroorganismen in die Tiefsee transportiert werden. In Experimenten mit künstlichen Aggregaten wurde gezeigt, dass mikrobielle Gemeinschaften in einer bestimmten Reihenfolge auftreten und dass sich Mikronichen bilden. Zurzeit ist jedoch noch wenig über die mikrobiellen Prozesse in natürlichen marinen Aggregaten der Wassersäule bekannt. In dem hier vorgestellten Projekt sollen die wichtigsten mikrobiellen Abbauprozesse in marinen Aggregaten in den unterschiedlichen Wasserschichten, angefangen mit den Oberflächenschichten bis hinab in den Tiefen Ozean, untersucht werden. Die kürzlich entdeckte Vielfalt von Pilzarten in marinen Aggregaten der Tiefsee werden wir mithilfe neuer Methoden insbesondere auf ihre Rolle innerhalb des Abbaus organischen Materials in Aggregaten untersuchen. Weiterhin werden wir mikrobielle Besiedlungsmuster in Aggregaten mit Hinblick auf die Herkunft sowie Zusammensetzung der Mikroorganismen erforschen und werden testen, ob es ein globales Partikel-Mikrobiom gibt. Die Ergebnisse dieser Studien werden die mikrobiellen Prozesse in marinen Aggregaten erklären und zu einem neuen Verständnis der biogeochemischen Kreisläufe der Ozeane beitragen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%

Research Output

  • 276 Zitationen
  • 14 Publikationen
  • 2 Datasets & Models
Publikationen
  • 2020
    Titel Submesoscale dynamics directly shape bacterioplankton community structure in space and time
    DOI 10.1101/2020.09.02.279232
    Typ Preprint
    Autor Fadeev E
    Seiten 2020.09.02.279232
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Functional Seasonality of Free-Living and Particle-Associated Prokaryotic Communities in the Coastal Adriatic Sea
    DOI 10.3389/fmicb.2020.584222
    Typ Journal Article
    Autor Steiner P
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 584222
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Sea-ice retreat may decrease carbon export and vertical microbial connectivity in the Eurasian Arctic basins
    DOI 10.21203/rs.3.rs-101878/v1
    Typ Preprint
    Autor Fadeev E
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Recovering high-quality bacterial genomes from cross-contaminated cultures: a case study of marine Vibrio campbellii.
    DOI 10.1186/s12864-024-10062-2
    Typ Journal Article
    Autor Fadeev E
    Journal BMC genomics
    Seiten 146
  • 2021
    Titel Seasonal dynamics are the major driver of microbial diversity and composition in intensive freshwater aquaculture
    DOI 10.1101/2021.02.26.433039
    Typ Preprint
    Autor Marmen S
    Seiten 2021.02.26.433039
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Characterization of membrane vesicles in Alteromonas macleodii indicates potential roles in their copiotrophic lifestyle
    DOI 10.1093/femsml/uqac025
    Typ Journal Article
    Autor Fadeev E
    Journal microLife
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Comparative whole-genome analysis of novel marine Vibrio campbellii from pure and non-axenic cultures reveals a unique plasmid
    DOI 10.21203/rs.3.rs-2513960/v1
    Typ Preprint
    Autor Fadeev E
  • 2021
    Titel Seasonal Dynamics Are the Major Driver of Microbial Diversity and Composition in Intensive Freshwater Aquaculture
    DOI 10.3389/fmicb.2021.679743
    Typ Journal Article
    Autor Marmen S
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 679743
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Spatial Distribution of Arctic Bacterioplankton Abundance Is Linked to Distinct Water Masses and Summertime Phytoplankton Bloom Dynamics (Fram Strait, 79°N)
    DOI 10.3389/fmicb.2021.658803
    Typ Journal Article
    Autor Cardozo-Mino M
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 658803
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Spatial distribution of Arctic bacterioplankton abundance is linked to distinct water masses and summertime phytoplankton bloom dynamics (Fram Strait, 79°N)
    DOI 10.1101/2020.09.02.277574
    Typ Preprint
    Autor Cardozo-Mino M
    Seiten 2020.09.02.277574
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Bacterial Indicators Are Ubiquitous Members of Pelagic Microbiome in Anthropogenically Impacted Coastal Ecosystem
    DOI 10.3389/fmicb.2021.765091
    Typ Journal Article
    Autor Orel N
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 765091
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Sea ice presence is linked to higher carbon export and vertical microbial connectivity in the Eurasian Arctic Ocean
    DOI 10.1038/s42003-021-02776-w
    Typ Journal Article
    Autor Fadeev E
    Journal Communications Biology
    Seiten 1255
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Comparison of Two 16S rRNA Primers (V3–V4 and V4–V5) for Studies of Arctic Microbial Communities
    DOI 10.3389/fmicb.2021.637526
    Typ Journal Article
    Autor Fadeev E
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 637526
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Submesoscale physicochemical dynamics directly shape bacterioplankton community structure in space and time
    DOI 10.1002/lno.11799
    Typ Journal Article
    Autor Fadeev E
    Journal Limnology and Oceanography
    Seiten 2901-2913
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2019 Link
    Titel CARD-FISH cell counts of taxonomic bacterial and archaeal groups in Fram Strait during PS99.2
    DOI 10.1594/pangaea.905212
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel edfadeev/Export_and_vert_conn_FRAM: Published workflow
    DOI 10.5281/zenodo.5515440
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link

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