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Born Oppenheimer quantenchemische molekularmechanische Simulationen von Ionen in Lösung

QMMM Chemical Simulations

Bernd-Michael Rode (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P13644
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.11.1999
  • Projektende 31.10.2002
  • Bewilligungssumme 74.036 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Chemie (100%)

Keywords

    SOLVATED IONS, QUANTUM MECHANICAL SIMULATION, ELECTROLYTE SOLUTION, TRANSITION METAL IONS, STATISTICAL SIMULATION

Abstract Endbericht

Eine neuentwickelte Methode der Beschreibung solvatisierter Ionen durch Monte- Carlo - bzw. Molekulardynamik - Simulationen basierend auf einem gemischten Ansatz aus Born-Oppenheimer - Quantenmechanik und Molekularmechanik soll auf Parallelrechnern implementiert werden. Dadurch wird sich der Zeitaufwand. für die Berechnungen von Hartree-Fock-Energien bzw. Kräften so stark reduzieren, daß eine größere Zahl von Metallionen in Wasser, flüssigem Ammoniak und wäßrigen ammoniakalischen Lösungen untersucht werden kann. Bisherige Untersuchungen an Metallkationen in Lösung haben nämlich gezeigt, daß der in dieser Methodik implizierte Einschlung von Mehrkörpereffekten nicht nur die Ergebnisse bei zweiwertigen Metallionen drastisch verbessert, sondern sogar für eine korrekte Beschreibung schwach wechselwirkender einwertiger Ionen erforderlich sein kann, beispielsweise bei der richtigen Wiedergabe von strukturbildenden bzw. strukturbrechenden Eigenschaften dieser Ionen. Auch der wohlbekannte Jahn-Teller-Effekt im Falle von Cu(II) konnte im Rahmen von Simulationen nur mit dieser Methodik reproduziertwerden. Schwerpunkt der geplanten Untersuchungen werden Simulationen von 2- und 3-wertigen Kationen der ersten Übergangsmetailreihe sein, die nicht nur für das Verständnis ihrer vielfältigen Komplexchemie von grundsätzlicher Bedeutung sein, sondern auch eine kritische Diskussion einfacher chemischer Modelle wie Kristallfeld- und Ligandenfeld"theorie" gestatten werden. Durch den Einschluß der quantenmechanischen Effekte für die gesamte erste Solvatationshtille werden die bisher genauesten Beschreibungen dieser Ionen in Lösung erwartet, sowie Daten, die für die Interpretation von Ligandenaustauschvorgängen von großer Bedeutung sind. Damit können auch einfache Modelle zu diesen Vorgängen, die derzeit zur Deutung experimenteller Befunde (z.B. Hochdruck-NMR- Messungen) dienen, überprüft werden. Im Fall der wäßrigen Ammoniaklösungen verschiedener Konzentrationen werden die aus den Simulationen erhaltlichen KoordinationszahIverteilungen. auch Vergleiche mit experimentell bestimmten Komplexbildungskonstanten erlauben und detaillierte Strukturen alter im Gleichgewichtszustand der Lösungen realisierten Mikrospezies liefern.

Für eine große Zahl von Metallionen wurde anhand von Molekulardynamiksimulationen die bisher genaueste Beschreibung ihrer Struktur und Dynamik in wäßriger Lösung erarbeitet. Die hohe Genauigkeit wurde durch eine vollständige quantenmechanische Behandlung der Ionen und ihrer nächsten Umgebung erreicht, der dadurch auftretende enorme Rechenaufwand von mehreren Monaten Rechenzeit pro Ion wurde äußerst kostengünstig durch den Einsatz von parallelrechnenden PC-Clustern bewältigt. Die erhaltenen Daten haben nicht nur große Bedeutung für das Verständnis der Chemie von Elektrolytlösungen, sondern auch für zahlreiche biologische Vorgänge, bei denen die untersuchten Hauptgruppen- und Übergangsmetalle eine zentrale Rolle spielen. Zur Veranschaulichung der Ergebnisse wurde auch ein neues Visualisierungsprogramm entwickelt und eingesetzt, das auch die Erzeugung von Video-Clips zur Darstellung der dynamischen Vorgänge auf der femto- und pico-Sekunden-Zeitskala und somit einen Einblick in den Ablauf wichtiger Reaktionen wie den Austausch von Liganden ermöglichte. Insgesamt führten die Ergebnisse zu 20 Publikationen in internationalen Fachzeitschriften und 2 eingeladenen Übersichtsartikeln, sowie zu 2 Einladungen zu Plenarvorträgen auf internationalen Kongressen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 100%
Nationale Projektbeteiligte
  • Klaus R. Liedl, Universität Innsbruck , assoziierte:r Forschungspartner:in

Research Output

  • 671 Zitationen
  • 18 Publikationen
Publikationen
  • 2004
    Titel Molecular dynamics simulation of the hydration of transition metal ions: the role of non-additive effects in the hydration shells of Fe2+ and Fe3+ ions
    DOI 10.1016/j.cplett.2004.01.016
    Typ Journal Article
    Autor Remsungnen T
    Journal Chemical Physics Letters
    Seiten 491-497
  • 2003
    Titel Dynamics in the hydration shell of Hg2+ ion: classical and ab initio QM/MM molecular dynamics simulations
    DOI 10.1016/s0009-2614(03)00301-4
    Typ Journal Article
    Autor Kritayakornupong C
    Journal Chemical Physics Letters
    Seiten 438-444
  • 2003
    Titel Structure and Dynamics of Metal Ions in Solution: QM/MM Molecular Dynamics Simulations of Mn2+ and V2+
    DOI 10.1021/ja0286831
    Typ Journal Article
    Autor Schwenk C
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 1618-1624
  • 2003
    Titel Influence of heteroligands on structural and dynamical properties of hydrated Cu 2+ : QM/MM MD simulations
    DOI 10.1039/b304898e
    Typ Journal Article
    Autor Schwenk C
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 3418-3427
  • 2003
    Titel Dynamical properties of the water molecules in the hydration shells of Fe(II) and Fe(III) ions: ab initio QM/MM molecular dynamics simulations
    DOI 10.1016/s0009-2614(02)01803-1
    Typ Journal Article
    Autor Remsungnen T
    Journal Chemical Physics Letters
    Seiten 586-592
  • 2003
    Titel MD and MC simulations of hydrated manganous ion including three-body effects
    DOI 10.1016/s0166-1280(02)00472-4
    Typ Journal Article
    Autor Yagüe J
    Journal Journal of Molecular Structure: THEOCHEM
    Seiten 15-20
  • 2003
    Titel The hydration structures of F - and Cl - investigated by ab initio QM/MM molecular dynamics simulations
    DOI 10.1039/b209240a
    Typ Journal Article
    Autor Tongraar A
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 357-362
  • 2002
    Titel Librational, vibrational, and exchange motions of water molecules in aqueous Ni(II) solution: classical and QM/MM molecular dynamics simulations
    DOI 10.1016/s0009-2614(02)00645-0
    Typ Journal Article
    Autor Inada Y
    Journal Chemical Physics Letters
    Seiten 449-458
  • 2002
    Titel Preferential solvation of Ca 2+ in aqueous ammonia solution: Classical and combined ab initio quantum mechanical/molecular mechanical molecular dynamics simulations
    DOI 10.1039/b107786d
    Typ Journal Article
    Autor Tongraar A
    Journal Physical Chemistry Chemical Physics
    Seiten 628-634
  • 2002
    Titel QM/MM–MD simulation of hydrated vanadium(II) ion
    DOI 10.1016/s0009-2614(02)01209-5
    Typ Journal Article
    Autor Loeffler H
    Journal Chemical Physics Letters
    Seiten 367-371
  • 2002
    Titel Many-Body Effects in Combined Quantum Mechanical/Molecular Mechanical Simulations of the Hydrated Manganous Ion
    DOI 10.1021/jp020443k
    Typ Journal Article
    Autor Loeffler H
    Journal The Journal of Physical Chemistry A
    Seiten 9529-9532
  • 2002
    Titel Molecular Dynamics Simulations of the Hydrated Trivalent Transition Metal Ions Ti3+, Cr3+, and Co3+
    DOI 10.1021/jp020997n
    Typ Journal Article
    Autor Kritayakornupong C
    Journal The Journal of Physical Chemistry A
    Seiten 10584-10589
  • 2002
    Titel Hydration Structure and Water Exchange Reaction of Nickel(II) Ion: Classical and QM/MM Simulations
    DOI 10.1021/jp0155314
    Typ Journal Article
    Autor Inada Y
    Journal The Journal of Physical Chemistry A
    Seiten 6783-6791
  • 2001
    Titel Effects of Many-Body Interactions on the Preferential Solvation of Mg2+ in Aqueous Ammonia Solution: A Born-Oppenheimer ab Initio QM/MM Dynamics Study
    DOI 10.1021/jp012103p
    Typ Journal Article
    Autor Tongraar A
    Journal The Journal of Physical Chemistry B
    Seiten 10559-10564
  • 2001
    Titel Classical and Mixed Quantum Mechanical/Molecular Mechanical Simulation of Hydrated Manganous Ion
    DOI 10.1021/jp010436g
    Typ Journal Article
    Autor Yagüe J
    Journal The Journal of Physical Chemistry A
    Seiten 7646-7650
  • 2001
    Titel Preferential Cu2+ solvation in aqueous ammonia solution of various concentrations
    DOI 10.1016/s0301-0104(00)00313-x
    Typ Journal Article
    Autor Pranowo H
    Journal Chemical Physics
    Seiten 1-6
  • 2001
    Titel Dynamics of the solvation process of Ca2+ in water
    DOI 10.1016/s0009-2614(01)01188-5
    Typ Journal Article
    Autor Schwenk C
    Journal Chemical Physics Letters
    Seiten 99-103
  • 2001
    Titel The role of non-additive contributions on the hydration shell structure of Mg2+ studied by Born–Oppenheimer ab initio quantum mechanical/molecular mechanical molecular dynamics simulation
    DOI 10.1016/s0009-2614(01)00923-x
    Typ Journal Article
    Autor Tongraar A
    Journal Chemical Physics Letters
    Seiten 485-491

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