Cellulose-abhängige Signaltransduktion in Trichoderma reesei
Components signalling the presence of cellulose to cellulase gene expression in Trichoderma reesei
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
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TRICHODERMA (REESEI),
REMI MUTAGENESE,
CELLULOSE,
SIGNALTRANSDUKTION,
TWO HYBRID SYSTEM,
TRANSKRIPTIONELLE REGULATION
Trichoderma reesei (Hypocrea jecorina) ist ein Pilz, der seit dreißig Jahren zur industriellen Produktion von Cellulose-abbauenden Enzymen eingesetzt wird. In jüngeren Jahren werden auch die Promotoren seiner Cellulasegene zur Produktion rekombinanter Proteine (z.B. Antikörper, Chymosin, Plasminogen-Aktivator) verwendet. Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich seit mehr als zehn Jahren mit den biochemischen Grundlagen der Stimulierung der Cellulase-Genexpression durch Cellulose. Unsere gegenwärtigen Kenntnisse, erarbeitet am cbh2 (die Cellobiohydrolase II-kodierenden) Modellgen erlauben die Formulierung eines Modells, in dem zwei Gruppen von DNA-bindenden Proteinen - ein HAP2/HAP3/HAP5-Komplex, sowie ein spezifischer Transkriptionsfaktor - konstitutiv an ein für die Induktion essentielles Dekamer binden, und damit die Kontaktoberfläche für ein die Induktion vermittelndes weiteres Protein bilden. Im Rahmen früherer FWF-Projekte verfügen wir über die Gene für HAP2/HAP3 und HAP5, sowie das zweite DNA-bindende Protein. In Fortführung der bisherigen Strategie planen wir im gegenwärtigen Projektantrag, die an der Cellulose-Signaltransduktion weiteren beteiligten Gene zu klonieren, wobei wir zwei verschiedene Strategien vorschlagen: das Gen des den konstitutiv vorhandenen Transkriptionskomplex kontaktierenden Proteins soll mit Hilfe des Yeast Two Hybrid Systems (unter Ausnützung seiner Bindung an die Protein des Komplexes) kloniert und charakterisiert werden; weitere, unbekannte Komponenten der Signaltransduktion sollen mit Hilfe der jüngst für Pilze entwickelten REMI Mutagenese (eine Methode die primär Mutanten isoliert, aus denen jedoch das defekte Gen leicht kloniert werden kann) kloniert werden. Wir schlagen zu diesem Zweck eine genetische Methode vor, mit der sowohl Cellulase-negative als auch Cellulase-, konstitutive Mutanten erhalten werden können. Durch eine erfolgreiche Bearbeitung des vorgeschlagenen Projekts sollte wir über eine Sammlung von Genen verfügen, deren Charakterisierung uns einen Einblick in den Cellulose-Sidnaltransduktionsweg ermöglichen sollte.
In diesem Projekt wurden molekulare Strategien angewandt, um zu erfahren wie der filamentöse Pilz Hypocrea jecorina (Trichoderma reesei) bei Anwesenheit von Cellulose sein Cellulasegen-System induziert. Zu diesem Zweck wurden zwei Strategien angewandt: mittels des sogenannten One Hybrid System sollten Proteine identifiziert werden, die an die Sequenz GTAATA innerhalb des CAE Motivs im cbh2-Promoter von Hypocrea jecorina binden, für welche bereits früher die Beteiligung an der Cellulase-Genexpression nachgewiesen werden konnte. Die daraus erhaltenen 10 Klone, die die gestellten Bedingungen erfüllten, wurden näher untersucht: einige davon zeigten Homologie zu Transkriptionsfaktoren von oft nahe verwandten Organismen, und zu Genen, die in keinem direkten Zusammenhang mit der Aktivierung der Transkription stehen, aber mit dem an der Genregulation beteiligten Proteinkomplex zusammenwirken. Einer dieser Klone zeigte unterschiedliche Expression zwischen dem Wildtypstamm und einer Cellulase-negativen Mutante und wurde daher weiteren Analysen unterzogen. Die zweite Strategie verwendete die Rapid Subtraction Hybridization (RaSH) zur Identifizierung von Genen deren Expression im Wildtypstamm im Vergleich zum zellulase-negativen Stamm unter induzierenden Bedingungen stark erhöht ist. Dabei wurden 23 Gene gefunden, einige davon mehrmals: die meisten kodieren für bisher noch unbekannte Gene, aber bei manchen wurden auch Ähnlichkeiten zu Transkriptionsfaktoren oder Proteinen, die an der Signaltransduktion beteiligt sind aufweisen, gefunden. Diese unterschiedliche Expression wurde durch Northern blots bestätigt und die chromosomale und die cDNA Sequenz der interessantesten Klone isoliert und untersucht. Die funktionelle Involvierung eines dieser Proteine (envoy) in der Cellulasegenexpression wurde durch Konstruktion von knock-out Mutanten nachgeiwiesen. In diesem Projekt wurden daher zum ersten Mal Komponenten der Signaltransduktion durch Cellulose identifiziert, was weitere Arbeiten zu diesem Thema ermöglicht.
- Technische Universität Wien - 100%
Research Output
- 286 Zitationen
- 6 Publikationen
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2018
Titel CXCL5 Facilitates Melanoma Cell–Neutrophil Interaction and Lymph Node Metastasis DOI 10.1016/j.jid.2018.01.035 Typ Journal Article Autor Soler-Cardona A Journal Journal of Investigative Dermatology Seiten 1627-1635 Link Publikation -
2018
Titel CXCL5 as Regulator of Neutrophil Function in Cutaneous Melanoma DOI 10.1016/j.jid.2018.07.006 Typ Journal Article Autor Forsthuber A Journal Journal of Investigative Dermatology Seiten 186-194 Link Publikation -
2006
Titel Antagonism of Pythium blight of zucchini by Hypocrea jecorina does not require cellulase gene expression but is improved by carbon catabolite derepression DOI 10.1111/j.1574-6968.2006.00157.x Typ Journal Article Autor Seidl V Journal FEMS Microbiology Letters Seiten 145-151 Link Publikation -
2003
Titel The Snf1 kinase of the filamentous fungus Hypocrea jecorina phosphorylates regulation-relevant serine residues in the yeast carbon catabolite repressor Mig1 but not in the filamentous fungal counterpart Cre1 DOI 10.1016/s1087-1845(03)00082-3 Typ Journal Article Autor Cziferszky A Journal Fungal Genetics and Biology Seiten 166-175 -
2010
Titel A novel class of peptide pheromone precursors in ascomycetous fungi DOI 10.1111/j.1365-2958.2010.07295.x Typ Journal Article Autor Schmoll M Journal Molecular Microbiology Seiten 1483-1501 Link Publikation -
2012
Titel Epidermal Growth Factor Facilitates Melanoma Lymph Node Metastasis by Influencing Tumor Lymphangiogenesis DOI 10.1038/jid.2012.272 Typ Journal Article Autor Bracher A Journal Journal of Investigative Dermatology Seiten 230-238 Link Publikation