Genetische Analyse von Adenokarzinomen und Vorläuferläsionen

Molekularzytogenetik und Genexpression von Adenokarzinomen und seiner möglichen Vorläuferläsionen Adenokarzinome machen die Hauptgruppe der Lungenkarzinome aus, sowohl in Österreich als auch weltweit. In den letzten zehn Jahren wurden den möglichen Vorläuferlesionen des AC, besonders der atypischen adenomatösen Hyperplasie erhöhte Aufmerksamkeit gewidmet. Dieses Projekt hat das Ziel, mögliche Onkogene und Tumor- suppressorgene zu erkennen, die für die Progression und Differenzierung der ACs verantwortlich sind. Die Expression dieser Gene wird dann auch auf Proteinebene überprüft. Aus dieser Untersuchung erhoffen wir uns unter anderem, auch neue Biomarker für die Diagnose und Prognose zu finden, die sich einfach mittels Immunhistochemie untersuchen lassen. Wir wollen aber noch einen anderen Aspekt beleuchten. Tumorzellen gehorchen dem evolutionären Prinzip. Der im Tumor vorherrrschende Klon ist der Klon, der am besten an die biochemische Situation im Tumor angepasst ist. Aus diesem Blickwinkel wollen wir untersuchen, wie Zellen auf ausgeprägte chromosomale Aberrationen reagieren. Wir glauben, daß die Zelle zu allererst wieder eine Art Balance herstellen muß, um überhaupt solche ausgeprägten Veränderungen überleben zu können. Zusätzlich wird die Zelle aber auch in vielen Fällen ihre biochemischen Reaktionsketten derart adaptieren müssen, um den Wachstumsvorteil, den eine genetisch Veränderung möglicherweise mit sich bringt, voll auszunutzen. Zum Beispiel wäre eine high copy Amplifikation eines Onkogens sinnlos, wenn es ein Heterodimer mit einem anderen, nicht überzählig vorhandenen, Gen bilden müßte, um seine Wirkung entfalten zu können. Durch diese Analyse erhoffen wir uns neue Erkenntnisse über die Regulation der Transkription. Überdies erwarten wir uns, dadurch interagierende Gene und redundante Reaktionspfade zu erkennen. Basierend auf den zunehmend verfügbaren Sequenzdaten des Humanen Genom Projekts wollen wir die Sequenzabhängigkeit von chromosomalen Bruchpunkten untersuchen. Die Integration von Sequenz- und Genexpressionsdaten von Genen in nächster Nachbarschaft zu den Bruchpunkten soll die Frage klären, warum manche chromosomalen Regionen verletzlicher als andere sind, und warum diese erhöhte Empfindlichkeit in vielen Fällen gewebe- und tumorspezifisch ist. Diese Studie bedient sich der Comparativen Genomischen Hybridisierung (CGH), Microarray-CGH- und Genexpressionsstudien, sowie Immunhistochemie und FISH auf Tissuearrays.