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Translation von "leaderless mRNAs" in S. solfataricus

Translation of leaderless mRNAs in the archaeon Sulfolobus solfataricus

Udo Bläsi (ORCID: 0000-0003-4830-257X)
  • Grant-DOI 10.55776/P15334
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.04.2002
  • Projektende 31.03.2006
  • Bewilligungssumme 227.223 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    TRANSLATION, ARCHAEA, LEADERLES MRNA, INITIATION FACTOR

Abstract

Der Mechanismus der Translation in Archaea (vormals Archaebakterien) ist weitgehend unverstanden. Der translationale Apparat von Archaea weist Komponenten auf, die Ähnlichkeit mit dem von Eubakterien, als auch dem von Eukaryonten besitzen. Archaea besitzen translationale Initiationsfaktoren, die Homologie zu den in Eubakterien und Eukaryonten vorkommenden aufweisen. In dieser Studie sollen die Funktion der translationalen Initiationsfaktoren aIF1, IF2 und aIF2 des Archaeons Sulfolobus solfataricus untersucht werden. Ein Hauptaugenmerk soll auf die Funktion der betreffenden Initiationsfaktoren in der translationalen Initiation von mRNAs gelegt werden, die direkt mit dem AUG Startkodon beginnen. Solche mRNAs treten in S. solfataricus gehäuft auf. S. solfataricus wurde als "Modellarchaeon" ausgewählt, da dessen DNA fast vollständig durchsequenziert und frei zugänglich ist. Dies sollte ermöglichen die betreffenden Gene für Initiationsfaktoren zu klonieren und die entsprechenden Proteine zu reinigen. Darüberhinaus stehen für S. solfataricus PLasmide zur Verfügung. Damit sollte es wiederum möglich sein die Funktion dieser Faktoren in S. solfataricus zu untersuchen. Dieses Forschungsvorhaben beinhaltet 2 Ziele: Erstens soll ein in vitro System aufgebaut werden, daß es ermöglichen soll die Funktion der Initiationsfaktoren biochemisch zu untersuchen. Zweitens sollen diese Faktoren in S. solfataricus überexprimiert werden. Damit soll untersucht werden, ob IF2 und aIF2 die Genexpression in S. solfataricus differentiell beeinflussen. Falls dies der Fall ist, sollen die betreffenden Gene identifiziert werden.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%

Research Output

  • 437 Zitationen
  • 8 Publikationen
Publikationen
  • 2013
    Titel Translation initiation in the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus: eukaryotic features but bacterial route
    DOI 10.1042/bst20120300
    Typ Journal Article
    Autor La Teana A
    Journal Biochemical Society Transactions
    Seiten 350-355
  • 2008
    Titel Translation initiation factor a/eIF2(-?) counteracts 5' to 3' mRNA decay in the archaeon Sulfolobus solfataricus
    DOI 10.1073/pnas.0708894105
    Typ Journal Article
    Autor Hasenöhrl D
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 2146-2150
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Translation initiation complex formation in the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus
    DOI 10.1261/rna.1662609
    Typ Journal Article
    Autor Hasenöhrl D
    Journal RNA
    Seiten 2288-2298
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Crystal Structure of the Intact Archaeal Translation Initiation Factor 2 Demonstrates Very High Conformational Flexibility in the a- and ß-Subunits
    DOI 10.1016/j.jmb.2008.07.039
    Typ Journal Article
    Autor Stolboushkina E
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 680-691
  • 2007
    Titel New Insights into the Interactions of the Translation Initiation Factor 2 from Archaea with Guanine Nucleotides and Initiator tRNA
    DOI 10.1016/j.jmb.2007.07.048
    Typ Journal Article
    Autor Nikonov O
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 328-336
  • 2006
    Titel Sulfolobus solfataricus translation initiation factor 1 stimulates translation initiation complex formation
    DOI 10.1261/rna.2289306
    Typ Journal Article
    Autor Hasenöhrl D
    Journal RNA
    Seiten 674-682
    Link Publikation
  • 2005
    Titel The archaeal eIF2 homologue: functional properties of an ancient translation initiation factor
    DOI 10.1093/nar/gki321
    Typ Journal Article
    Autor Pedullà N
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 1804-1812
    Link Publikation
  • 2004
    Titel Translation initiation with 70S ribosomes: an alternative pathway for leaderless mRNAs
    DOI 10.1093/nar/gkh663
    Typ Journal Article
    Autor Moll I
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 3354-3363
    Link Publikation

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