Translation von "leaderless mRNAs" in S. solfataricus
Translation of leaderless mRNAs in the archaeon Sulfolobus solfataricus
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
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TRANSLATION,
ARCHAEA,
LEADERLES MRNA,
INITIATION FACTOR
Der Mechanismus der Translation in Archaea (vormals Archaebakterien) ist weitgehend unverstanden. Der translationale Apparat von Archaea weist Komponenten auf, die Ähnlichkeit mit dem von Eubakterien, als auch dem von Eukaryonten besitzen. Archaea besitzen translationale Initiationsfaktoren, die Homologie zu den in Eubakterien und Eukaryonten vorkommenden aufweisen. In dieser Studie sollen die Funktion der translationalen Initiationsfaktoren aIF1, IF2 und aIF2 des Archaeons Sulfolobus solfataricus untersucht werden. Ein Hauptaugenmerk soll auf die Funktion der betreffenden Initiationsfaktoren in der translationalen Initiation von mRNAs gelegt werden, die direkt mit dem AUG Startkodon beginnen. Solche mRNAs treten in S. solfataricus gehäuft auf. S. solfataricus wurde als "Modellarchaeon" ausgewählt, da dessen DNA fast vollständig durchsequenziert und frei zugänglich ist. Dies sollte ermöglichen die betreffenden Gene für Initiationsfaktoren zu klonieren und die entsprechenden Proteine zu reinigen. Darüberhinaus stehen für S. solfataricus PLasmide zur Verfügung. Damit sollte es wiederum möglich sein die Funktion dieser Faktoren in S. solfataricus zu untersuchen. Dieses Forschungsvorhaben beinhaltet 2 Ziele: Erstens soll ein in vitro System aufgebaut werden, daß es ermöglichen soll die Funktion der Initiationsfaktoren biochemisch zu untersuchen. Zweitens sollen diese Faktoren in S. solfataricus überexprimiert werden. Damit soll untersucht werden, ob IF2 und aIF2 die Genexpression in S. solfataricus differentiell beeinflussen. Falls dies der Fall ist, sollen die betreffenden Gene identifiziert werden.
- Universität Wien - 100%
Research Output
- 437 Zitationen
- 8 Publikationen
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2007
Titel New Insights into the Interactions of the Translation Initiation Factor 2 from Archaea with Guanine Nucleotides and Initiator tRNA DOI 10.1016/j.jmb.2007.07.048 Typ Journal Article Autor Nikonov O Journal Journal of Molecular Biology Seiten 328-336 -
2006
Titel Sulfolobus solfataricus translation initiation factor 1 stimulates translation initiation complex formation DOI 10.1261/rna.2289306 Typ Journal Article Autor Hasenöhrl D Journal RNA Seiten 674-682 Link Publikation -
2013
Titel Translation initiation in the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus: eukaryotic features but bacterial route DOI 10.1042/bst20120300 Typ Journal Article Autor La Teana A Journal Biochemical Society Transactions Seiten 350-355 -
2009
Titel Translation initiation complex formation in the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus DOI 10.1261/rna.1662609 Typ Journal Article Autor Hasenöhrl D Journal RNA Seiten 2288-2298 Link Publikation -
2008
Titel Translation initiation factor a/eIF2(-?) counteracts 5' to 3' mRNA decay in the archaeon Sulfolobus solfataricus DOI 10.1073/pnas.0708894105 Typ Journal Article Autor Hasenöhrl D Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 2146-2150 Link Publikation -
2008
Titel Crystal Structure of the Intact Archaeal Translation Initiation Factor 2 Demonstrates Very High Conformational Flexibility in the a- and ß-Subunits DOI 10.1016/j.jmb.2008.07.039 Typ Journal Article Autor Stolboushkina E Journal Journal of Molecular Biology Seiten 680-691 -
2005
Titel The archaeal eIF2 homologue: functional properties of an ancient translation initiation factor DOI 10.1093/nar/gki321 Typ Journal Article Autor Pedullà N Journal Nucleic Acids Research Seiten 1804-1812 Link Publikation -
2004
Titel Translation initiation with 70S ribosomes: an alternative pathway for leaderless mRNAs DOI 10.1093/nar/gkh663 Typ Journal Article Autor Moll I Journal Nucleic Acids Research Seiten 3354-3363 Link Publikation