Onkogene Transkriptionsfaktoren und ihre zellulären Zielgene
Oncogenic transcription factors and their cellular targets
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (75%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (25%)
Keywords
-
Cellular growth control,
Signal transduction,
Carcinogenesis,
Regulation of gene expression,
Oncogenes,
Protein - DNA interactions
Die prinzipiellen wissenschaftlichen Ziele unseres Forschungsprogrammes sind die Definition der Struktur und Funktion von Onkogenen und ihrer Proteinprodukte, und die Erforschung der molekularen Mechanismen der zellulären Proliferationskontrolle und der Tumorentstehung. Für onkogene Transkriptionsfaktoren, wie Myc oder Jun, erfordert dies die Identifikation der direkten und indirekten Zielgene dieser Proteine. Die spezifischen Ziele dieses Projektes sind gerichtet auf die strukturelle und funktionelle Charakterisierung von bereits in diesem Labor isolierten Zielgenen, auf die Identifizierung neuer Zielgene für Myc und Jun unter Verwendung von umfassender Genexpressionsanalyse, und auf strukturelle und dynamische Analysen von Transkriptionsfaktor - DNA Interaktionen. Das Expressionsmuster von WS5, einem neuen Genisolat aus diesem Labor, in konditional oder nicht-konditional myc-transformierten Geflügelfibroblasten weist stark darauf hin, dass es sich um ein direktes transkriptionelles Zielgen des Myc Proteins handelt. Die komplette Struktur des WS5 Gens und die molekularen Mechanismen seiner transkriptionellen Regulation sollen bestimmt werden. WS5 ist eng verwandt zu Genen, die melanosomale Membranproteine kodieren und im humanen malignen Melanom überexpremiert sind, einem Tumor mit häufig beobachteter myc Überexpression. Die Struktur und transkriptionelle Regulation der humanen WS5 Homologe und ihre Deregulation im malignen Melanom sollen analysiert werden. Für die in diesem Labor isolierten Jun Zielgene JAC und TOJ3 haben wir intrinsisches onkogenes Potenzial nachgewiesen. Direkte transkriptionelle Regulation durch Jun wurde für JAC bereits gezeigt, und soll für TOJ3 getestet werden. Die biochemische Funktion der JAC und TOJ3 Proteine und ihre spezifische Rolle in jun-induzierter Karzinogenese soll erforscht werden. Für das von einem in transformierten Zellen supprimierten Zielgen kodierte LIM Protein CRP2 konnten wir nachweisen, dass es mit EB1 interagiert, das auch ein Bindungspartner des Tumorsuppressor-Proteins APC ist. Wir werden den Mechanismus dieser CRP2 - EB1 Interaktion im Detail strukturell und funktionell untersuchen, und die funktionelle Relevanz bei der Zelltransformation erforschen. Weiterhin planen wir die Isolierung neuer Myc und Jun Zielgene unter Verwendung konditionaler Zelltransformationssysteme und Anwendung von "open-system" umfassenden Genexpressionsanalysen. Neue differenziell exprimierte Gene sollen detailliert auf ihre molekulare Verbindung zu den induzierenden Onkogenen und auf ihre biochemische Funktion untersucht werden. Außerdem werden wir die Analysen der Lösungsstruktur und Dynamik der Komplexe onkogener Transkriptionsfaktoren und der Mechanismen ihrer spezifischen Interaktion mit DNA von Zielgenen fortführen und ausbauen.
The principal scientific goals of our research program are the definition of the structure and function of oncogenes and their protein products, and the elucidation of the molecular pathways of cellular proliferation control and carcinogenesis. For oncogenic transcription factors, like Myc or Jun, this requires the identification of the direct and indirect target genes of these proteins. The specific aims of this project will focus on the structural and functional characterization of target genes already isolated in this laboratory, on the identification of novel targets of Myc and Jun proteins using open-system comprehensive gene expression analyses, and on further structural and dynamic analyses of transcripton factor - DNA interactions. The expression pattern of WS5, a novel gene recently isolated in this laboratory, in avian fibroblasts conditionally or non-conditionally transformed by the myc oncogene strongly suggests that it is a direct transcriptional target of the Myc protein. The entire structure of the WS5 gene and the molecular mechanisms of its transcriptional regulation will be determined. Intriguingly, WS5 is closely related to melanosomal membrane protein encoding genes strikingly overexpressed in human malignant melanoma, a tumor frequently associated with myc overexpression. The structure and transcriptional regulation of the human WS5 homologs and their deregulation in malignant melanoma will be analyzed. For the Jun targets JAC and TOJ3, isolated in this laboratory, it was unambiguously demonstrated that they have intrinsic oncogenic potential. Direct transcriptional regulation by Jun has already been proven for JAC and will be probed for TOJ3. The biochemical function of JAC and TOJ3 proteins and their specific role in jun-induced carcinogenesis will be determined. For the LIM domain protein CRP2, encoded by a target gene commonly suppressed in transformed cells, we discovered and will further analyze its specific interaction with EB1, which is also a binding partner of the tumor suppressor protein APC. We will also aim at the isolation of novel Myc and Jun targets using conditional cell transformation and open- system comprehensive gene expression analyses. Genes displaying unambiguously correlated changes in gene expression will be analyzed in detail, both for their molecular connection with the inducing oncogene and for their biochemical function. Furthermore, we will continue the analyses of the solution structure and dynamics of oncogenic transcription factor complexes and of the mechanisms of their interaction with target DNA.
- Universität Innsbruck - 100%
- Ulf R. Rapp, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
- Peter K. Vogt, The Scripps Research Institute - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 399 Zitationen
- 11 Publikationen
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2011
Titel The Metastasis-Associated Extracellular Matrix Protein Osteopontin Forms Transient Structure in Ligand Interaction Sites DOI 10.1021/bi200291e Typ Journal Article Autor Platzer G Journal Biochemistry Seiten 6113-6124 -
2011
Titel Siderocalin Q83 exhibits differential slow dynamics upon ligand binding DOI 10.1007/s10858-011-9543-z Typ Journal Article Autor Coudevylle N Journal Journal of Biomolecular NMR Seiten 83 -
2011
Titel Lipocalin Q83 Reveals a Dual Ligand Binding Mode with Potential Implications for the Functions of Siderocalins DOI 10.1021/bi201115q Typ Journal Article Autor Coudevylle N Journal Biochemistry Seiten 9192-9199 -
2009
Titel Inhibition of Myc-induced cell transformation by brain acid-soluble protein 1 (BASP1) DOI 10.1073/pnas.0812101106 Typ Journal Article Autor Hartl M Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 5604-5609 Link Publikation -
2008
Titel Backbone assignment of osteopontin, a cytokine and cell attachment protein implicated in tumorigenesis DOI 10.1007/s12104-007-9076-2 Typ Journal Article Autor Schedlbauer A Journal Biomolecular NMR Assignments Seiten 29-31 -
2008
Titel TOJ3, a v-jun target with intrinsic oncogenic potential, is directly regulated by Jun via a novel AP-1 binding motif DOI 10.1016/j.virol.2008.06.001 Typ Journal Article Autor Karagiannidis A Journal Virology Seiten 371-376 -
2006
Titel WS5, a direct target of oncogenic transcription factor Myc, is related to human melanoma glycoprotein genes and has oncogenic potential DOI 10.1038/sj.onc.1209975 Typ Journal Article Autor Reiter F Journal Oncogene Seiten 1769-1779 -
2010
Titel Stem cell-specific activation of an ancestral myc protooncogene with conserved basic functions in the early metazoan Hydra DOI 10.1073/pnas.0911060107 Typ Journal Article Autor Hartl M Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 4051-4056 Link Publikation -
2010
Titel Chemical Synthesis of Site-Specifically 2'-Azido-Modified RNA and Potential Applications for Bioconjugation and RNA Interference DOI 10.1002/cbic.201000646 Typ Journal Article Autor Aigner M Journal ChemBioChem Seiten 47-51 Link Publikation -
2006
Titel Cooperative cell transformation by Myc/Mil(Raf) involves induction of AP-1 and activation of genes implicated in cell motility and metastasis DOI 10.1038/sj.onc.1209441 Typ Journal Article Autor Hartl M Journal Oncogene Seiten 4043-4055 -
2004
Titel Letter to the editor: Backbone assignment of the dimerization and DNA-binding domain of the oncogenic transcription factor v-Myc in complex with its authentic binding partner Max DOI 10.1007/s10858-005-1058-z Typ Journal Article Autor Baminger B Journal Journal of Biomolecular NMR Seiten 361-362