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Funktionelle RNA-Sequenzelemente im Genom des FSME Virus

Functional RNA sequence elements in the TBE virus genome

Christian Mandl (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P17584
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.11.2004
  • Projektende 31.10.2008
  • Bewilligungssumme 224.374 €

Wissenschaftsdisziplinen

Gesundheitswissenschaften (80%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (10%); Medizinische Biotechnologie (10%)

Keywords

    Tick-Borne Encephalitis Virus, FSME Virus, Flavivirus, RNA Genom, Replikation, Translation

Endbericht

Das Fruehsommer-Meningoenzephalitis (FSME) Virus ist ein bedeutender Krankheitserreger des Menschen, der innerhalb seines Verbreitungsgebietes in Europa und Asien jedes Jahr tausende schwere Erkrankungsfaelle hervorruft. Das FSME Virus zeigt den typischen molekularen Aufbau eines "Flavivirus". Andere bekannte Flaviviren sind das Gelbfieber Virus, der Erreger der Japanischen Enzephalitis, das West Nil Virus und die vier Dengue Viren. Im Unterschied zu all diesen Kranheitserregern, die duch Steckmuecken uebertragen werden, wird das FSME Virus aber durch Zecken uebertragen. Wesentlichstes Ziel dieses Projektes war es, Unterschiede zwischen dem FSME Virus und seinen durch Stechmuecken uebertragenen Verwandten auf einer molekularen Ebene zu erforschen. Die genetische Information eines Virus ist auf dem Genom kodiert, das im Falle der Flaviviren aus einem einzigen, relativ kleinen RNA Molekuel besteht. Der hier gewaehlte Ansatz bestand darin, durch molekuarbiologische Verfahren gezielt Veraenderungen in das Genom des FSME Virus einzufuehren, und die Auswirkungen dieser Mutationen auf die Faehigkeit des Virus sein Genom zu vermehren ("RNA Replikation") und Virusproteine herzustellen ("Translation") zu untersuchen. Dazu wurde erfolgreich ein neues genetisches Werkzeug hergestellt, mit dessen Hilfe diese beiden Funktionen, Replikation und Translation, unabhaengig von einander und ohne Verwendung infektioesen Virusmaterials untersucht werden konnten. Es gelang, eine Reihe FSME-spezifischer genetischer Elemente zu entdecken und zu charakterisieren. Von besonderer Bedeutung war dabei die Erkenntnis, dass ein fuer die Replikation essentieller Prozess ("Zirkularisierung") im Falle des FSME Virus von ganz anderen Elementen gesteuert wird als bei den anderen Flaviviren. Ausserdem konnte ein nur im FSME Genom vorhandenes Element ("interne polyA Sequenz") detailliert untersucht werden. Neben dem eigentlichen Ziel des Projetkes, der Entdeckung und Erforschung funktioneller genetischer Elemente des FSME Virus, wurden durch die Forschungsarbeiten eine Reihe weiterer spannender Erkenntnisse ermoeglicht, die in andere Forschungsrichtungen einmuendeten. So gelang es voellig neuartige Virusmutanten herzustellen, die fuer die Entwicklung neuer Impfstoffe und gentechnischer Vektoren von Bedeutung sind. Ausserdem wurde in Zusammenarbeit mit einer Forschungsgruppe in Triest unser System dazu verwendet, erstmals die virale Replikation direkt in lebenden Zellen zu beobachten. Nicht zuletzt fuehrte diese Arbeit zu einem neuen Ansatz, die Bildung und Evolution von Viren zu untersuchen, der nun im Rahmen eines weiteren FWF Projektes verfolgt wird.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%

Research Output

  • 285 Zitationen
  • 7 Publikationen
Publikationen
  • 2020
    Titel IL-33 reduces tumor growth in models of colorectal cancer with the help of eosinophils
    DOI 10.1080/2162402x.2020.1776059
    Typ Journal Article
    Autor Kienzl M
    Journal OncoImmunology
    Seiten 1776059
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The Immune Endocannabinoid System of the Tumor Microenvironment
    DOI 10.3390/ijms21238929
    Typ Journal Article
    Autor Kienzl M
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 8929
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Spatial and temporal organization of tick-borne encephalitis flavivirus replicated RNA in living cells
    DOI 10.1016/j.virol.2008.06.025
    Typ Journal Article
    Autor Miorin L
    Journal Virology
    Seiten 64-77
  • 2008
    Titel Analysis of the effects of alterations in the tick-borne encephalitis virus 3'-noncoding region on translation and RNA replication using reporter replicons
    DOI 10.1016/j.virol.2008.04.035
    Typ Journal Article
    Autor Hoenninger V
    Journal Virology
    Seiten 419-430
  • 2007
    Titel Selection and Analysis of Mutations in an Encephalomyocarditis Virus Internal Ribosome Entry Site That Improve the Efficiency of a Bicistronic Flavivirus Construct
    DOI 10.1128/jvi.01017-07
    Typ Journal Article
    Autor Orlinger K
    Journal Journal of Virology
    Seiten 12619-12629
    Link Publikation
  • 2006
    Titel Construction and Mutagenesis of an Artificial Bicistronic Tick-Borne Encephalitis Virus Genome Reveals an Essential Function of the Second Transmembrane Region of Protein E in Flavivirus Assembly
    DOI 10.1128/jvi.01540-06
    Typ Journal Article
    Autor Orlinger K
    Journal Journal of Virology
    Seiten 12197-12208
    Link Publikation
  • 2006
    Titel Functional Analysis of the Tick-Borne Encephalitis Virus Cyclization ElementsIndicates Major Differences between Mosquito-Borne and Tick-Borne Flaviviruses
    DOI 10.1128/jvi.80.8.4099-4113.2006
    Typ Journal Article
    Autor Kofler R
    Journal Journal of Virology
    Seiten 4099-4113
    Link Publikation

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