Ein EST Datenset von einem stibonematiden Nematoden

In den letzten Jahren wurde es klar, dass die Untersuchung biologischer Systeme, in denen Evertebraten und Prokaryoten Beziehungen zu gemeinsamen Nutzen unterhalten, zum Verständnis der Entstehung von pathogenen Infektionen beitragen kann. Unter den wenigen nicht-pathogenen Vergesellschaftungen von Bakterien und Nematoden ist jene der Stilbonematinae (Desmodoridae, Chromadoria) die auffälligste. Die Oberfläche dieser marinen Nematoden ist stets von schwefeloxydierenden, chemoautotrophen Bakterien bedeckt, die in einem gattungs- oder sogar artspezifischen Muster angeordnet sind. In der Nematodengattung Laxus konnte die Assoziation mit den Bakterien spezifisch durch Inkubation in D-Mannose gelöst werden. Weiters wurde eine cDNA der Würmer identifiziert, die ein mannose-bindendes C-typ Lektin (STIL-1)codiert, das große Ähnlichkeit mit Immunorezeptoren von dendritischen Zellen bei Säugetieren hat. Es ist zu erwarten, dass es noch eine große Anzahl von symbiosespezifischen Genen bei diesen Nematoden gibt. Wir möchten nun weitere dieser Gene in einem Stilbonematiden Expressed Sequence Tag (EST) Projekt identifizieren. Das Potential dieses Ansatzes geht über die Aufklärung der molekularen Mechanismen der Assoziation zwischen Bakterien und ihren Symbiosepartnern hinaus. Die Tatsache, dass bereits vollständige Genomsequenzen von drei Caenorhabditis-Arten und von Brugia malayi, weiters EST Datensets von vielen parasitischen Nematoden vorhanden sind, gibt die einmalige Gelegenheit, die Gensequenz und -struktur von freilebenden, parasitischen und symbiontischen Arten zu vergleichen. Nicht zuletzt werden die Sequenzdaten der Silbonematinen dazu beitragen, die phylogenetische Trichotomie an der Basis des Nematodenstammbaums aufzulösen.

In den letzten Jahren wurde es klar, dass die Untersuchung biologischer Systeme, in denen Evertebraten und Prokaryoten Beziehungen zu gemeinsamen Nutzen unterhalten, zum Verständnis der Entstehung von pathogenen Infektionen beitragen kann. Unter den wenigen nicht-pathogenen Vergesellschaftungen von Bakterien und Nematoden ist jene der Stilbonematinae (Desmodoridae, Chromadoria) die auffälligste. Die Oberfläche dieser marinen Nematoden ist stets von schwefeloxydierenden, chemoautotrophen Bakterien bedeckt, die in einem gattungs- oder sogar artspezifischen Muster angeordnet sind. In der Nematodengattung Laxus konnte die Assoziation mit den Bakterien spezifisch durch Inkubation in D-Mannose gelöst werden. Weiters wurde eine cDNA der Würmer identifiziert, die ein mannose-bindendes C-typ Lektin (STIL-1)codiert, das große Ähnlichkeit mit Immunorezeptoren von dendritischen Zellen bei Säugetieren hat. Es ist zu erwarten, dass es noch eine große Anzahl von symbiosespezifischen Genen bei diesen Nematoden gibt. Wir möchten nun weitere dieser Gene in einem Stilbonematiden Expressed Sequence Tag (EST) Projekt identifizieren. Das Potential dieses Ansatzes geht über die Aufklärung der molekularen Mechanismen der Assoziation zwischen Bakterien und ihren Symbiosepartnern hinaus. Die Tatsache, dass bereits vollständige Genomsequenzen von drei Caenorhabditis-Arten und von Brugia malayi, weiters EST Datensets von vielen parasitischen Nematoden vorhanden sind, gibt die einmalige Gelegenheit, die Gensequenz und -struktur von freilebenden, parasitischen und symbiontischen Arten zu vergleichen. Nicht zuletzt werden die Sequenzdaten der Silbonematinen dazu beitragen, die phylogenetische Trichotomie an der Basis des Nematodenstammbaums aufzulösen.