Evaluierung von Tumorsuppressorgenen am Chromosom 8p

Die Entstehung eines Tumors wird durch die Aktivierung von Onkogenen und den Funktionsverlust von Tumor Suppressor Genen (TSG) gesteuert. In jüngster Zeit konnten wir und andere Gruppen zeigen, daß es bei Ovarialkarzinomen häufig zu einem Verlust von genetischem Material am kurzen Arm des Chromosom 8 kommt. Diese Beobachtung ist ein starker Hinweis darauf, daß diese chromosomale Region potentielle TSG beherbergt, die eine kausale Rolle beim Ovarialkarzinom spielen könnten. In den vergangenen zwei Jahren haben wir diese Region am Chromosom 8 sorgfältig kartiert und haben eine Vielzahl rekombinanter bakterieller Chromosomen (BAC) aus humanen DNA Bibliotheken isoliert, um das genetische Material aus dieser Region für weitere Untersuchungen lückenlos zur Verfügung zu haben. In der Folge haben wir mit molekulargenetischen und bioinformatischen Methoden potentielle kodierende Sequenzen isoliert. Momentan arbeiten wir an im Rahmen des Human Genom Projekts erarbeiteten Sequenzen, an Expressed Sequence Tags (EST), die in die Region mappen, und an durch Exon Trapping aus der Region isolierten Exons. Die Evaluierung von Kandidatengenen ist herausfordernd, da der Nachweis von Mutationen oder anderen Formen der Inaktivierung von Genen, wie z.B. Methylierung arbeitsintensiv ist. Homozygote Deletionen sind für gewöhnlich kleiner als Regionen herterozygoten Verlusts und sind oft eine Vorbedingung für die erfolgreiche Isolierung von TSGs, da die Zahl an Kandidatengenen, die untersucht werden müssen, geringer ist. Während wir einerseits neue Methoden entwickeln, um Regionen homozygoten Verlusts zu identifizieren, konnten wir mit konventionellen Methoden eine solche in einer Pankreaskarzinomzellinie identifizieren. Aus dieser Deletion, die sich über 685 Kilobasen erstreckt, sollte es relativ einfach sein, ein Gen zu isolieren. Neben der Suche nach neuen Genen arbeiten wir darüber hinaus an vielversprechenden Kandidatengenen, die in der weiteren Region liegen. Dies inkludiert Rezeptoren für den TNF- related apoptosis inducing ligand (TRAIL). In Kombination sollten diese unterschiedlichen Annäherungsversuche ein Licht auf die Ursache des häufigen Verlusts verschiedener Regionen am Chromosom 8p21 werfen. Dies wird im Laufe des Projekts zur Identifizierung neuer Gene, die in die Entstehung des Ovarialkarzinoms involviert sind, führen. In Verbindung mit einer Charakterisierung gefundener Genen wird dies zu einem besseren Verständnis der Tumorbiologie und letztendlich zu einer Verbesserung der diagnostischen und therapeutischen Möglichkeiten für Patienten mit Ovarialkarzinomen führen.

Die Entstehung eines Tumors wird durch die Aktivierung von Onkogenen und den Funktionsverlust von Tumor Suppressor Genen (TSG) gesteuert. In jüngster Zeit konnten wir und andere Gruppen zeigen, daß es bei Ovarialkarzinomen häufig zu einem Verlust von genetischem Material am kurzen Arm des Chromosom 8 kommt. Diese Beobachtung ist ein starker Hinweis darauf, daß diese chromosomale Region potentielle TSG beherbergt, die eine kausale Rolle beim Ovarialkarzinom spielen könnten. In den vergangenen zwei Jahren haben wir diese Region am Chromosom 8 sorgfältig kartiert und haben eine Vielzahl rekombinanter bakterieller Chromosomen (BAC) aus humanen DNA Bibliotheken isoliert, um das genetische Material aus dieser Region für weitere Untersuchungen lückenlos zur Verfügung zu haben. In der Folge haben wir mit molekulargenetischen und bioinformatischen Methoden potentielle kodierende Sequenzen isoliert. Momentan arbeiten wir an im Rahmen des Human Genom Projekts erarbeiteten Sequenzen, an Expressed Sequence Tags (EST), die in die Region mappen, und an durch Exon Trapping aus der Region isolierten Exons. Die Evaluierung von Kandidatengenen ist herausfordernd, da der Nachweis von Mutationen oder anderen Formen der Inaktivierung von Genen, wie z.B. Methylierung arbeitsintensiv ist. Homozygote Deletionen sind für gewöhnlich kleiner als Regionen herterozygoten Verlusts und sind oft eine Vorbedingung für die erfolgreiche Isolierung von TSGs, da die Zahl an Kandidatengenen, die untersucht werden müssen, geringer ist. Während wir einerseits neue Methoden entwickeln, um Regionen homozygoten Verlusts zu identifizieren, konnten wir mit konventionellen Methoden eine solche in einer Pankreaskarzinomzellinie identifizieren. Aus dieser Deletion, die sich über 685 Kilobasen erstreckt, sollte es relativ einfach sein, ein Gen zu isolieren. Neben der Suche nach neuen Genen arbeiten wir darüber hinaus an vielversprechenden Kandidatengenen, die in der weiteren Region liegen. Dies inkludiert Rezeptoren für den TNF- related apoptosis inducing ligand (TRAIL). In Kombination sollten diese unterschiedlichen Annäherungsversuche ein Licht auf die Ursache des häufigen Verlusts verschiedener Regionen am Chromosom 8p21 werfen. Dies wird im Laufe des Projekts zur Identifizierung neuer Gene, die in die Entstehung des Ovarialkarzinoms involviert sind, führen. In Verbindung mit einer Charakterisierung gefundener Genen wird dies zu einem besseren Verständnis der Tumorbiologie und letztendlich zu einer Verbesserung der diagnostischen und therapeutischen Möglichkeiten für Patienten mit Ovarialkarzinomen führen.