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Glykosyltransferasen zum Aufbau von S-Schichtglykanen

Glycosyltransferases in S-Layer Glycan Assembly

Paul Messner (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P18013
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.04.2005
  • Projektende 31.03.2008
  • Bewilligungssumme 202.356 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (80%); Nanotechnologie (20%)

Keywords

    S-layer glycoprotein, Glycosyltransferases, Geobacillus Stearothermophilus, Carbohydrate Engineering, Nanobiotechnology, Nanoglycobiology

Abstract Endbericht

Glykosyltransferasen spielen eine bedeutende Rolle beim Assembly-Prozess der Zuckerketten von Glykoproteinen. Generell sind sie am Einbau von nukleotid-aktivierten Zuckern in die wachsenden Glykanketten beteiligt. Ihre Funktionsweise ist bei Eukaryoten sehr gut untersucht, während bei jenen Prokaryoten, die zur Glykoprotein- Biosynthese befähigt sind, bisher nur sehr wenige Daten erhoben wurden. Das vorgeschlagene Forschungsprojekt zielt auf die Expression und funktionelle Analyse von Glykosyltransferasen ab, die am Aufbau und der Ausschleusung von S-Schichtglykanen des S-Schichtproteins SgsE von Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a beteiligt sind. Von diesem Organismus und auch von verwandten Aneurinibacillus thermoaerophilus-Stämmen liegen jetzt erstmals vollständige Sequenzen der slg (surface layer glycosylation) -Gencluster vor. Obwohl die Zuckerketten des S-Schichtproteins SgsE nur aus L-Rhamnoseresten aufgebaut sind, wurden durch Vergleich mit Sequenzen aus Gendatenbanken unterschiedliche Rhamnosyltransferasen im slg-Cluster von G. stearothermophilus NRS 2004/3a identifiziert. Da weder L- Rhamnose noch die für den Aufbau von L-Rhamnanen beteiligten Gene bisher im menschlichen Organismus nachgewiesen werden konnten, sind die Rhamnosyltransferasen in Zukunft lohnende Ziele für die Entwicklung von neuen antibakteriellen Therapien. Bei der Charakterisierung weiterer, im slg-Cluster von G. stearothermophilus NRS 2004/3a vorliegender Gene wurden in den putativen Proteinsequenzen ebenfalls Glykosyltransferase-Domänen festgestellt. Diese sind Teil von Proteinen, die an der Kettenlängenbestimmung und der Ausschleusung der S-Schichtglykane durch die Cytoplasmamembran beteiligt sein könnten. Das Vorkommen eines ATP-abhängigen ABC 2 Transportsystems deutet darauf hin, dass das Wachstum der Zuckerketten an ihrem nicht-reduzierenden Ende stattfindet. Da die untersuchten Gram-positiven Bakterien bisher nicht transformiert werden konnten, wird die Expression und funktionelle Charakterisierung der Glykosyltransferasen in heterologen Systemen wie Escherichia coli oder Lactococcus lactis erfolgen. Weiters sind erste Experimente zur genetischen Modifikation der natürlichen Glykanstrukturen der S-Schichtglykoproteine von G. stearothermophilus NRS 2004/3a vorgesehen. Diese Untersuchungen sollen die entscheidenden Grundlagen für die Herstellung von modifizierten S Schichtneoglykoproteinen durch "carbohydrate engineering" für nanobiotechnologische und biomedizinische Anwendungen liefern.

Glykosyltransferasen spielen eine bedeutende Rolle beim Assembly-Prozess der Zuckerketten von Glykoproteinen. Generell sind sie am Einbau von nukleotid-aktivierten Zuckern in die wachsenden Glykanketten beteiligt. Ihre Funktionsweise ist bei Eukaryoten sehr gut untersucht, während bei jenen Prokaryoten, die zur Glykoprotein- Biosynthese befähigt sind, bisher nur sehr wenige Daten erhoben wurden. Das vorgeschlagene Forschungsprojekt zielt auf die Expression und funktionelle Analyse von Glykosyltransferasen ab, die am Aufbau und der Ausschleusung von S-Schichtglykanen des S-Schichtproteins SgsE von Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a beteiligt sind. Von diesem Organismus und auch von verwandten Aneurinibacillus thermoaerophilus-Stämmen liegen jetzt erstmals vollständige Sequenzen der slg (surface layer glycosylation) -Gencluster vor. Obwohl die Zuckerketten des S-Schichtproteins SgsE nur aus L-Rhamnoseresten aufgebaut sind, wurden durch Vergleich mit Sequenzen aus Gendatenbanken unterschiedliche Rhamnosyltransferasen im slg-Cluster von G. stearothermophilus NRS 2004/3a identifiziert. Da weder L- Rhamnose noch die für den Aufbau von L-Rhamnanen beteiligten Gene bisher im menschlichen Organismus nachgewiesen werden konnten, sind die Rhamnosyltransferasen in Zukunft lohnende Ziele für die Entwicklung von neuen antibakteriellen Therapien. Bei der Charakterisierung weiterer, im slg-Cluster von G. stearothermophilus NRS 2004/3a vorliegender Gene wurden in den putativen Proteinsequenzen ebenfalls Glykosyltransferase- Domänen festgestellt. Diese sind Teil von Proteinen, die an der Kettenlängenbestimmung und der Ausschleusung der S-Schichtglykane durch die Cytoplasmamembran beteiligt sein könnten. Das Vorkommen eines ATP- abhängigen ABC 2 Transportsystems deutet darauf hin, dass das Wachstum der Zuckerketten an ihrem nicht- reduzierenden Ende stattfindet. Da die untersuchten Gram-positiven Bakterien bisher nicht transformiert werden konnten, wird die Expression und funktionelle Charakterisierung der Glykosyltransferasen in heterologen Systemen wie Escherichia coli oder Lactococcus lactis erfolgen. Weiters sind erste Experimente zur genetischen Modifikation der natürlichen Glykanstrukturen der S-Schichtglykoproteine von G. stearothermophilus NRS 2004/3a vorgesehen. Diese Untersuchungen sollen die entscheidenden Grundlagen für die Herstellung von modifizierten S Schichtneoglykoproteinen durch "carbohydrate engineering" für nanobiotechnologische und biomedizinische Anwendungen liefern.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Chris Whitfield, University of Guelph - Kanada
  • Miguel A. Valvano, Queen´s University Belfast - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 761 Zitationen
  • 22 Publikationen
Publikationen
  • 2009
    Titel Crystalline Cell Surface Layers (S Layers)
    DOI 10.1016/b978-012373944-5.00113-9
    Typ Book Chapter
    Autor Sleytr U
    Verlag Elsevier
    Seiten 89-98
  • 2008
    Titel Recombinant Glycans on an S-Layer Self-Assembly Protein: A New Dimension for Nanopatterned Biomaterials
    DOI 10.1002/smll.200701215
    Typ Journal Article
    Autor Steiner K
    Journal Small
    Seiten 1728-1740
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Molecular Basis of S-layer Glycoprotein Glycan Biosynthesis in Geobacillus stearothermophilus *
    DOI 10.1074/jbc.m801833200
    Typ Journal Article
    Autor Steiner K
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 21120-21133
    Link Publikation
  • 2008
    Titel A temperature-sensitive expression system based on the Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a sgsE surface-layer gene promoter
    DOI 10.1042/ba20070083
    Typ Journal Article
    Autor Novotny R
    Journal Biotechnology and Applied Biochemistry
    Seiten 35-40
    Link Publikation
  • 2008
    Titel S-layer nanoglycobiology of bacteria
    DOI 10.1016/j.carres.2007.12.025
    Typ Journal Article
    Autor Messner P
    Journal Carbohydrate Research
    Seiten 1934-1951
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Biosynthesis of dTDP-3-acetamido-3,6-dideoxy-a-D-glucose
    DOI 10.1042/bj20071044
    Typ Journal Article
    Autor Pföstl A
    Journal Biochemical Journal
    Seiten 187-194
    Link Publikation
  • 2007
    Titel Novel Biocatalysts Based on S-Layer Self-Assembly of Geobacillus Stearothermophilus NRS 2004/3a: A Nanobiotechnological Approach
    DOI 10.1002/smll.200700200
    Typ Journal Article
    Autor Schäffer C
    Journal Small
    Seiten 1549-1559
    Link Publikation
  • 2007
    Titel Functional Characterization of the Initiation Enzyme of S-Layer Glycoprotein Glycan Biosynthesis in Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a
    DOI 10.1128/jb.01592-06
    Typ Journal Article
    Autor Steiner K
    Journal Journal of Bacteriology
    Seiten 2590-2598
    Link Publikation
  • 2007
    Titel The dTDP-4-dehydro-6-deoxyglucose reductase encoding fcd gene is part of the surface layer glycoprotein glycosylation gene cluster of Geobacillus tepidamans GS5-97T
    DOI 10.1093/glycob/cwl084
    Typ Journal Article
    Autor Zayni S
    Journal Glycobiology
    Seiten 433-443
    Link Publikation
  • 2007
    Titel Sequencing of O-Glycopeptides Derived from an S-Layer Glycoprotein of Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a Containing up to 51 Monosaccharide Residues at a Single Glycosylation Site by Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Infrared Multipho
    DOI 10.1021/ac0617363
    Typ Journal Article
    Autor Bindila L
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 3271-3279
    Link Publikation
  • 2006
    Titel New Insights into the Glycosylation of the Surface Layer Protein SgsE from Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a
    DOI 10.1128/jb.00802-06
    Typ Journal Article
    Autor Steiner K
    Journal Journal of Bacteriology
    Seiten 7914-7921
    Link Publikation
  • 2006
    Titel Virus-Engineered Colloidal Particles—A Surface Display System
    DOI 10.1002/anie.200502620
    Typ Journal Article
    Autor Fischlechner M
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 784-789
    Link Publikation
  • 2006
    Titel Characterization of outer membrane vesicles released by the psychrotolerant bacterium Pseudoalteromonas antarctica NF3
    DOI 10.1111/j.1462-2920.2006.01043.x
    Typ Journal Article
    Autor Nevot M
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 1523-1533
    Link Publikation
  • 2006
    Titel RmlC, a C3' and C5' Carbohydrate Epimerase, Appears to Operate via an Intermediate with an Unusual Twist Boat Conformation
    DOI 10.1016/j.jmb.2006.09.063
    Typ Journal Article
    Autor Dong C
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 146-159
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Efficient Exciton Diffusion and Resonance-Energy Transfer in Multilayered Organic Epitaxial Nanofibers
    DOI 10.1021/acs.jpcc.5b02405
    Typ Journal Article
    Autor Tavares L
    Journal The Journal of Physical Chemistry C
    Seiten 15689-15697
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Prokaryotic Cell Wall Components: Structure and Biochemistry
    DOI 10.1007/978-3-642-05062-6_16
    Typ Book Chapter
    Autor Sleytr U
    Verlag Springer Nature
    Seiten 459-481
  • 2010
    Titel Chapter 7 Bacterial surface layer glycoproteins and “non-classical” secondary cell wall polymers
    DOI 10.1016/b978-0-12-374546-0.00007-9
    Typ Book Chapter
    Autor Messner P
    Verlag Elsevier
    Seiten 109-128
  • 2010
    Titel Occurrence, Structure, Chemistry, Genetics, Morphogenesis, and Functions of S-Layers
    DOI 10.1007/978-3-642-05062-6_2
    Typ Book Chapter
    Autor Messner P
    Verlag Springer Nature
    Seiten 53-109
  • 2009
    Titel Structural and Functional Studies of QdtC: An N-Acetyltransferase Required for the Biosynthesis of dTDP-3-Acetamido-3,6-dideoxy-a-d-glucose
    DOI 10.1021/bi802313n
    Typ Journal Article
    Autor Thoden J
    Journal Biochemistry
    Seiten 2699-2709
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Structural Analysis of QdtB, an Aminotransferase Required for the Biosynthesis of dTDP-3-acetamido-3,6-dideoxy-a-d-glucose
    DOI 10.1021/bi8022015
    Typ Journal Article
    Autor Thoden J
    Journal Biochemistry
    Seiten 1553-1561
    Link Publikation
  • 2009
    Titel The structural basis for catalytic function of GMD and RMD, two closely related enzymes from the GDP-d-rhamnose biosynthesis pathway
    DOI 10.1111/j.1742-4658.2009.06993.x
    Typ Journal Article
    Autor King J
    Journal The FEBS Journal
    Seiten 2686-2700
    Link Publikation
  • 2009
    Titel S-Layers, Microbial, Biotechnological Applications
    DOI 10.1002/9780470054581.eib546
    Typ Book Chapter
    Autor Egelseer E
    Verlag Wiley
    Seiten 1-25

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