Transkription von PKS genen, Sekundärmetoboliten in Flechten

Lichenisierte Ascomyceten produzieren ein breites Spektrum an sekundären Metaboliten. Ihre chemische Diversität ist in den verschiedenen Ebenen der organismischen Phylogenie ungleichmässig verteilt. Bestimmte Verbindungen sind gemeinsam in den großen Flechtengruppen zu finden, andere hingegen treten nur sehr verstreut auf. Darüber hinaus können unter variierenden Kulturbedingungen und in Proben vom natürlichen Standort verschiedene Substanzen ausgebildet werden. Im Zentrum des geplanten Projektes geht es um die Zuordnung dieser Diversität zu den phylogenetischen Strukturen eines essentiellen Enzyms des betreffenden Stoffwechselweges, wie z.B. der Polyketid-Synthase. Exprimierte Polyketid-Synthase (PKS) Gene, welche mittels Umkehrtranskription detektiert werden können, werden mit der Anwesenheit von Sekundärmetaboliten im Phänotyp und mit der Präsenz entsprechender Gene in den Genomen verglichen; das kann auch durch die Klonierung von heterogenen PCR Produkten und dem Einsatz von heterologen Primern erfolgen.

Lichenisierte Ascomyceten produzieren ein breites Spektrum an sekundären Metaboliten. Ihre chemische Diversität ist in den verschiedenen Ebenen der organismischen Phylogenie ungleichmässig verteilt. Bestimmte Verbindungen sind gemeinsam in den großen Flechtengruppen zu finden, andere hingegen treten nur sehr verstreut auf. Darüber hinaus können unter variierenden Kulturbedingungen und in Proben vom natürlichen Standort verschiedene Substanzen ausgebildet werden. Im Zentrum des geplanten Projektes geht es um die Zuordnung dieser Diversität zu den phylogenetischen Strukturen eines essentiellen Enzyms des betreffenden Stoffwechselweges, wie z.B. der Polyketid-Synthase. Exprimierte Polyketid-Synthase (PKS) Gene, welche mittels Umkehrtranskription detektiert werden können, werden mit der Anwesenheit von Sekundärmetaboliten im Phänotyp und mit der Präsenz entsprechender Gene in den Genomen verglichen; das kann auch durch die Klonierung von heterogenen PCR Produkten und dem Einsatz von heterologen Primern erfolgen.