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Enzymologie der Xyloseverwertung in Hefe

Enzymology of xylose utilization in yeast

Bernd Nidetzky (ORCID: 0000-0002-5030-2643)
  • Grant-DOI 10.55776/P18275
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2005
  • Projektende 30.09.2010
  • Bewilligungssumme 255.250 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (55%); Chemie (45%)

Keywords

    Xylose reductase, Xylulose kinase, Protein and metabolic engineering, Structure-function relationships, Xylose fermentation, Enzyme mechanism

Abstract Endbericht

Eine kürzliche Richtlinie der Europäischen Kommission stellt fest, dass bis zum Jahr 2005 Biotreibstoffe etwa 2% des gesamten Treibstoffverbrauchs ausmachen sollen. Es ist notwendig, bestehende Biotechnologien hinsichtlich ihrer Produktivität und Kosteneffizienz zu verbessern, um dieses Ziel zu erreichen. Ethanol ist der vielversprechendste Biotreibstoff der Zukunft für bestehende Automobiltechnologien. Er wird durch biologische Konversion unter Ausschluss von Sauerstoff, dem Prozess der mikrobiellen Fermentation, gewonnen. Unter den möglichen Rohstoffen für die Herstellung von Ethanol ist Lignocellulose in erneuerbarer pflanzlicher Biomasse von herausragender Bedeutung. Lignocellulose besteht aus den Polysacchariden Zellulose und Hemizellulose sowie Lignin und findet sich in riesigen Mengen in Abfällen aus der Land- und Forstwirtschaft und der Papier- und Zellstoffindustrie. Techno-ökonomische Analysen haben gezeigt, dass die wirtschaftlich sinnvolle Verwertung von Lignocellulose durch biotechnologische Prozesse davon abhängt, dass sowohl Zellulose als auch Hemizellulose in wertgesteigerte Produkte überführt werden. Während Glukose, der Grundbaustein von Zellulose, leicht zu Ethanol umgesetzt werden kann, stellt die Fermentation der Xylose, die Hauptkomponente von Hemizellulose, ein Problem dar, welches an der Grenzfläche von mikrobieller Physiologie und Prozesstechnik angesiedelt ist. Die klassische Bäcker- oder Brauereihefe kann Xylose nicht vewerten, ausser es werden dem Organismus durch molekularbiologische Methoden zusätzliche metabolische Fähigkeiten verliehen. Trotzdem produzieren `Designerstämme` wenig Ethanol und akkumulieren viele Nebenprodukte. Das Hauptproblem der ungenügenden Prozesseffizienz liegt darin, dass Redoxkofaktoren NAD und NADP während der Assimilierung der Xylose nicht rezykliert werden und damit eine Stresssituation für die Zelle erzeugt wird. Für die Entwicklung eines industriellen Produktionsorganismus ist es daher nötig, die inizialen Schritte des Xylosemetabolismus zu optimieren. Vorarbeiten in der Gruppe des Antragstellers bieten nun erstmals die Möglichkeit, die beschriebene Problematik ursächlich zu lösen. Durch Protein Engineering werden Enzyme mit maßgeschneiderten Spezifitäten für die Xyloseassimilierung hergestellt und die veränderten Gene im Hefegenom integriert. Der gezielt veränderte Organismus wird in der Lage sein, Xylose mit höheren Ausbeuten in Etanol umzusetzen und weniger Nebenprodukte zu bilden. Die durch Metabolic Engineering hergestellten Hefestämme werden in Bioreaktoren physiologisch und prozesstechnisch charakterisiert. Das Projekt stellt einen wesentlichen Schritt zur Herstellung industrieller Hefen für die Fermentation von Xylose dar.

Eine kürzliche Richtlinie der Europäischen Kommission stellt fest, dass bis zum Jahr 2020 Biotreibstoffe etwa 10% des gesamten Treibstoffverbrauchs ausmachen sollen. Es ist notwendig, bestehende Biotechnologien hinsichtlich ihrer Produktivität und Kosteneffizienz zu verbessern, um dieses Ziel zu erreichen. Ethanol ist einer der vielversprechendsten Biotreibstoffe der Zukunft für bestehende Automobiltechnologien. Er wird durch biologische Konversion unter Ausschluss von Sauerstoff, dem Prozess der mikrobiellen Fermentation, gewonnen. Unter den möglichen Rohstoffen für die Herstellung von Ethanol ist Lignocellulose in erneuerbarer pflanzlicher Biomasse von herausragender Bedeutung. Lignocellulose besteht aus den Polysacchariden Zellulose und Hemizellulose sowie Lignin und findet sich in riesigen Mengen in Abfällen aus der Land- und Forstwirtschaft und der Papier- und Zellstoffindustrie. Techno-ökonomische Analysen haben gezeigt, dass die wirtschaftlich sinnvolle Verwertung von Lignocellulose durch biotechnologische Prozesse davon abhängt, dass sowohl Zellulose als auch Hemizellulose in wertgesteigerte Produkte überführt werden. Während Glukose, der Grundbaustein von Zellulose, leicht zu Ethanol umgesetzt werden kann, stellt die Fermentation der Xylose, die Hauptkomponente von Hemizellulose, ein Problem dar, welches an der Grenzfläche von mikrobieller Physiologie und Prozesstechnik angesiedelt ist. Die klassische Bäcker- oder Brauereihefe kann Xylose nicht vewerten, außer es werden dem Organismus durch molekularbiologische Methoden zusätzliche metabolische Fähigkeiten verliehen. Trotzdem produzieren `Designerstämme` wenig Ethanol, akkumulieren viele Nebenprodukte und verwerten Xylose sehr langsam. In diesem Projekt wurden durch einen umfassenden biologisch-prozesstechnischen Forschungsansatz an den wesentlichen Schlüsselstellen der Prozesseffizienz signifikante Verbesserungen erhalten. Die Bildung von Nebenprodukten konnte durch den Einsatz von maßgeschneiderten Enzymen stark unterdrückt werden und die Geschwindigkeit der Umsetzung von Xylose durch Prozesstechnik deutlich erhöht werden. Die im Projekt entwickelten Hefestämme eignen sich gut für die Umsetzung von Hydrolysaten von Lignozellulose. Nationale und internationale Kooperationen wurden in diesem Bereich etabliert.

Forschungsstätte(n)
  • Technische Universität Graz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Jochen Förster, Technical University of Denmark - Dänemark
  • David K. Wilson, University of California - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 465 Zitationen
  • 16 Publikationen
Publikationen
  • 2009
    Titel Engineering of a matched pair of xylose reductase and xylitol dehydrogenase for xylose fermentation by Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1002/biot.200800334
    Typ Journal Article
    Autor Krahulec S
    Journal Biotechnology Journal
    Seiten 684-694
  • 2008
    Titel Polyol-specific long-chain dehydrogenases/reductases of mannitol metabolism in Aspergillus fumigatus: Biochemical characterization and pH studies of mannitol 2-dehydrogenase and mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase
    DOI 10.1016/j.cbi.2008.10.001
    Typ Journal Article
    Autor Krahulec S
    Journal Chemico-Biological Interactions
    Seiten 274-282
  • 2008
    Titel Novel Chemo-Enzymatic Mimic of Hydrogen Peroxide-Forming NAD(P)H Oxidase for Efficient Regeneration of NAD+ and NADP+
    DOI 10.1002/adsc.200800357
    Typ Journal Article
    Autor Pival S
    Journal Advanced Synthesis & Catalysis
    Seiten 2305-2312
  • 2008
    Titel Tyr-51 is the proton donor–acceptor for NAD(H)-dependent interconversion of xylose and xylitol by Candida tenuis xylose reductase (AKR2B5)
    DOI 10.1016/j.febslet.2008.11.003
    Typ Journal Article
    Autor Pival S
    Journal FEBS Letters
    Seiten 4095-4099
  • 2008
    Titel Altering the coenzyme preference of xylose reductase to favor utilization of NADH enhances ethanol yield from xylose in a metabolically engineered strain of Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1186/1475-2859-7-9
    Typ Journal Article
    Autor Petschacher B
    Journal Microbial Cell Factories
    Seiten 9
    Link Publikation
  • 2008
    Titel Characterization of recombinant Aspergillus fumigatus mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase and its application for the stereoselective synthesis of protio and deuterio forms of d-mannitol 1-phosphate
    DOI 10.1016/j.carres.2008.04.011
    Typ Journal Article
    Autor Krahulec S
    Journal Carbohydrate Research
    Seiten 1414-1423
  • 2007
    Titel Catalytic mechanism of Zn2+-dependent polyol dehydrogenases: kinetic comparison of sheep liver sorbitol dehydrogenase with wild-type and Glu154?Cys forms of yeast xylitol dehydrogenase
    DOI 10.1042/bj20061384
    Typ Journal Article
    Autor Klimacek M
    Journal Biochemical Journal
    Seiten 421-429
    Link Publikation
  • 2007
    Titel Structure-guided engineering of the coenzyme specificity of Pseudomonas fluorescens mannitol 2-dehydrogenase to enable efficient utilization of NAD(H) and NADP(H)
    DOI 10.1016/j.febslet.2007.12.008
    Typ Journal Article
    Autor Bubner P
    Journal FEBS Letters
    Seiten 233-237
  • 2006
    Titel Structural and Kinetic Studies of Induced Fit in Xylulose Kinase from Escherichia coli
    DOI 10.1016/j.jmb.2006.10.068
    Typ Journal Article
    Autor Di Luccio E
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 783-798
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Comparison of Scheffersomyces stipitis strains CBS 5773 and CBS 6054 with regard to their xylose metabolism: implications for xylose fermentation
    DOI 10.1002/mbo3.5
    Typ Journal Article
    Autor Krahulec S
    Journal MicrobiologyOpen
    Seiten 64-70
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Analysis and prediction of the physiological effects of altered coenzyme specificity in xylose reductase and xylitol dehydrogenase during xylose fermentation by Saccharomyces cerevisiae
    DOI 10.1016/j.jbiotec.2011.08.026
    Typ Journal Article
    Autor Krahulec S
    Journal Journal of Biotechnology
    Seiten 192-202
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Enzymes of mannitol metabolism in the human pathogenic fungus Aspergillus fumigatus – kinetic properties of mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase and mannitol 2-dehydrogenase, and their physiological implications
    DOI 10.1111/j.1742-4658.2011.08047.x
    Typ Journal Article
    Autor Krahulec S
    Journal The FEBS Journal
    Seiten 1264-1276
    Link Publikation
  • 2011
    Titel d-Xylulose kinase from Saccharomyces cerevisiae: Isolation and characterization of the highly unstable enzyme, recombinantly produced in Escherichia coli
    DOI 10.1016/j.pep.2011.05.018
    Typ Journal Article
    Autor Pival S
    Journal Protein Expression and Purification
    Seiten 223-230
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Dynamic Mechanism of Proton Transfer in Mannitol 2-Dehydrogenase from Pseudomonas fluorescens MOBILE GLU292 CONTROLS PROTON RELAY THROUGH A WATER CHANNEL THAT CONNECTS THE ACTIVE SITE WITH BULK SOLVENT*
    DOI 10.1074/jbc.m111.289223
    Typ Journal Article
    Autor Klimacek M
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 6655-6667
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Fermentation of mixed glucose-xylose substrates by engineered strains of Saccharomyces cerevisiae: role of the coenzyme specificity of xylose reductase, and effect of glucose on xylose utilization
    DOI 10.1186/1475-2859-9-16
    Typ Journal Article
    Autor Krahulec S
    Journal Microbial Cell Factories
    Seiten 16
    Link Publikation
  • 2009
    Titel The catalytic mechanism of NADH-dependent reduction of 9,10-phenanthrenequinone by Candida tenuis xylose reductase reveals plasticity in an aldo-keto reductase active site
    DOI 10.1042/bj20090128
    Typ Journal Article
    Autor Pival S
    Journal Biochemical Journal
    Seiten 43-49
    Link Publikation

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