S-Schicht-Glykosylierungsenzyme für die Nanobiotechnologie
S-layer glycosylation enzymes for nanobiotechnology
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (95%); Nanotechnologie (5%)
Keywords
-
S-layer glycoprotein,
Geobacillus stearothermophilus,
Glycosylation modules,
Initiation enzyme,
Oligosaccharyl:protein transferase,
Prokaryotic glycoengineering
Glykoproteine sind ubiquitäre Biomoleküle, die an vielen wichtigen biologischen Prozessen beteiligt sind, wobei die assoziierten Glykane oft der Schlüssel zur biologischen Funktion sind. Demzufolge wird die junge Technologie des "Glykan-Engineering", mit deren Hilfe man massgeschneiderte Glykoproteine generieren kann, die Möglichkeiten, komplexe biologische Prozesse zu beeinflussen oder zu kontrollieren, entscheidend erweitern. Auf Grund der Komplexizität der Glykoprotein-Biosynthese in höheren Organismen, waren Glykoproteine bisher für biotechnologische Anwendungen nicht zugänglich. Der kürzlich erfolgte funktionelle Transfer von Glykoprotein- Biosynthesewegen in das Modell-Bakterium Escherichia coli eröffnet nun neue Perspektiven für das "Glykan- Engineering". In diesem Projekt soll der O-Glykosylierungsweg des S-Schichtglykoproteins des Gram-positiven Bakteriums Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a als Ausgangspunkt für "Glykan-Engineering" in E. coli Zellen herangezogen werden. Die Attraktivität dieses Vorhabens besteht darin, dass hier zum ersten Mal "Glykan- Engineering" an einem selbstassemblierenden S-Schichtglykoprotein durchgeführt wird. Dies kann zur periodischen Präsentation von "intelligenten Glykanmotiven" in dichtester Packung und mit Nanometer-Präzision ausgenützt werden, wodurch sich neue Möglichkeiten in der Nanobiotechnologie und Biomedizin eröffnen, wie beispielsweise die Funktionalisierung von Oberflächen oder das Design neuartiger Glykan-Vakzine. Das geplante Vorhaben basiert auf dem detaillierten Verständnis der Schlüsselmodule des S-Schichtprotein Glykosylierungsprozesses, das sind das Initiationsenzym und die Oligosaccharid: Protein-Transferase. Die O- Glykosylierung des S-Schichtproteins von G. stearothermophilus NRS 2004/3a wird durch einen chromosomalen Gencluster kodiert und verwendet einzelne Module aus dem Assemblierungsweg der Lipopolysaccharide von Gram-negativen Bakterien. Ausgehend von den Ähnlichkeiten dieser beiden Biosynthesewege, und basierend auf der Erforschung der beiden Schlüsselmodule der S-Schichtptrotein Glykosylierung, welche im Rahmen dieses Projekts erfolgen wird, sollte der heterologe Transfer von Glykanen auf die bekannten Glykosylierungsstellen des S-Schichtproteins möglich sein. Zur Charakterisierung der Schlüsselmodule und zur Testung unserer Hypothese, beinhalten unsere Forschungsziele: A) Charakterisierung des Initiationsenzyms der S-Schichtglykan-Biosynthese in G. stearothermophilus NRS 2004/3a. Dies ist umso interessanter, als jüngste Ergebnisse duale Spezifität dieses Enzyms vermuten lassen. B) Heterologe Produktion eines S-Schichtglykoproteins mit authentischen S- Schichtglykanen in E. coli, zur Überprüfung der Funktion der S-Schicht-Glykosylierungsmaschinerie im Wirtsorganismus. C) O-Glykosylierung des S-Schichtproteins mit ausgewählten O-Antigenen. D) Untersuchungen zur Spezifität der Oligosaccharyl: Protein-Transferase, indem dem Enzym verschiedene Lipid-gebundene Oligosaccharide als Substrate angeboten werden.
Auf Grund der Unkompliziertheit von Bakterien erfahren bakterielle Glykosylierungs-Systeme immer mehr Bedeutung, um in ihnen mittels Glykosylierungs-Engineering biologisch-aktive Glykoproteine herzustellen. Voraussetzung dafür ist das Verständnis der komplexen Glykoprotein-Biosynthese; ein Mangel daran hat bisher die biotechnologische Nutzung dieser Systeme verhindert hat. Glykoproteine, und hier vor allem S- Schichtglykoproteine, findet man auf vielen Bakterienzellen. S-Schichtglykoproteine haben die bemerkenswerte Eigenschaft, durch Selbstorganisation 2D-Gitter auszubilden, was sie zu idealen Matrices für die Präsentation von Glykanen mit nanometerskaliger Genauigkeit macht. Derartige Glyko-Biomaterialien haben ein großes Anwendungspotenzial in der (Nano)Biotechnologie und Biomedizin. In diesem Projekt sollte die Möglichkeit des Glykosylierungs-Engineering basierend auf dem S-Schicht O- Glykosylierungsweg des Bakteriums Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a gezeigt werden. Basierend auf dem detaillierten Verständnis von Schlüsselkomponenten dieses Weges und auf Grund der postulierten Ähnlichkeit dieses Weges mit anderen bakteriellen Glykosylierungswegen, sollte durch einen Austausch einzelner Komponenten die Produktion eines S-Schichglykoproteins mit "maßgeschneiderter" Glykosylierung in einer geeigneten bakteriellen Zellfabrik gezeigt werden. Die wesentlichen Erkenntnisse aus diesem Projekt sind: (i) Ein klares Bildes über den enzymatischen Ablauf der S-Schichprotein-Glykosylierung in den Modellorganismen Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3 und Paenibacillus alvei CCM 2051. Mittels Röntgenstrukturanalyse und molekular-dynamischer Simulation konnte erstmals Einblick in die Struktur-Funktionsbeziehung einzelner Glykosylierungsenzyme gewonnen werden. (ii) S- Schichtglykosylierungs-Module können zwischen Glykosylierungssystemen ausgetauscht und somit für Glykosylierungs-Engineering verwendet werden. Das S-Schichtprotein kann durch Protein-Engineering in eine Matrix für beliebige Glykane verwandelt werden. Dies konnte durch die Produktion von S-Schichtproteinen, die entweder mit einem Heptasaccharid von Campylobacter jejuni oder dem E. coli O7 Antigen glykosyliert waren, gezeigt werden. (iii) Ein neuartiger Biokatalysator mit verbesserten Eigenschaften im Vergleich zum löslichen Enzym wurde hergestellt, indem Liposomen mit einem Fusionsprotein aus S-Schicht und einem Kohlenhydrat- aktiven Enzym ummantelt wurden. Derartige nanostrukturierte Biohybride können wegweisend für neue Konzepte in der Biokatalyse sein. (iv) Eine Strategie für in vivo Zelloberflächen-Codisplay von Peptid und Glykan-Epitopen wurde für P. alvei entwickelt. "Maßgeschneiderte" nanostrukturierte und selbst-assemblierende Glykoproteine zeigen Möglichkeiten für neue Konzepte zur Beeinflussung oder Kontrolle komplexer biologischer Phänomene auf. Einflüsse auf das Design von künstlichen Rezeptoren, Glykokonjugat-Vakzinen oder Wirkstoff-Verabreichungsformen sind denkbar. In Zukunft wird es interessant sein, das volle Potenzial von S-Schichtglykosylierungs-Systemen zu erforschen.
- Chris Whitfield, University of Guelph - Kanada
- Christine Szymanski, University of Georgia at Athens - Vereinigte Staaten von Amerika
- Miguel A. Valvano, Queen´s University Belfast - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 791 Zitationen
- 26 Publikationen
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2012
Titel A fusion tag to fold on: the S-layer protein SgsE confers improved folding kinetics to translationally fused enhanced green fluorescent protein. DOI 10.4014/jmb.1202.02023 Typ Journal Article Autor Ristl R Journal Journal of microbiology and biotechnology Seiten 1271-8 Link Publikation -
2012
Titel Description of a Putative Oligosaccharyl:S-Layer Protein Transferase from the Tyrosine O-Glycosylation System of Paenibacillus alvei CCM 2051T DOI 10.4236/aim.2012.24069 Typ Journal Article Autor Ristl R Journal Advances in Microbiology Seiten 537-546 Link Publikation -
2008
Titel Molecular Basis of S-layer Glycoprotein Glycan Biosynthesis in Geobacillus stearothermophilus * DOI 10.1074/jbc.m801833200 Typ Journal Article Autor Steiner K Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 21120-21133 Link Publikation -
2008
Titel Negative Ion Ultraviolet Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Mass Spectrometry and Post Source Decay of Glycosyl Esters of Nucleoside Pyrophosphates DOI 10.1255/ejms.965 Typ Journal Article Autor Heinrich M Journal European Journal of Mass Spectrometry Seiten 401-409 Link Publikation -
2008
Titel Biosynthesis of dTDP-3-acetamido-3,6-dideoxy-a-D-glucose DOI 10.1042/bj20071044 Typ Journal Article Autor Pföstl A Journal Biochemical Journal Seiten 187-194 Link Publikation -
2008
Titel Recombinant Glycans on an S-Layer Self-Assembly Protein: A New Dimension for Nanopatterned Biomaterials DOI 10.1002/smll.200701215 Typ Journal Article Autor Steiner K Journal Small Seiten 1728-1740 Link Publikation -
2008
Titel S-layer nanoglycobiology of bacteria DOI 10.1016/j.carres.2007.12.025 Typ Journal Article Autor Messner P Journal Carbohydrate Research Seiten 1934-1951 Link Publikation -
2012
Titel Glycobiology Aspects of the Periodontal Pathogen Tannerella forsythia DOI 10.3390/biom2040467 Typ Journal Article Autor Posch G Journal Biomolecules Seiten 467-482 Link Publikation -
2010
Titel Protein tyrosine O-glycosylation—A rather unexplored prokaryotic glycosylation system DOI 10.1093/glycob/cwq035 Typ Journal Article Autor Zarschler K Journal Glycobiology Seiten 787-798 Link Publikation -
2009
Titel Construction of a Gene Knockout System for Application in Paenibacillus alvei CCM 2051T, Exemplified by the S-Layer Glycan Biosynthesis Initiation Enzyme WsfP DOI 10.1128/aem.00087-09 Typ Journal Article Autor Zarschler K Journal Applied and Environmental Microbiology Seiten 3077-3085 Link Publikation -
2009
Titel Crystalline Cell Surface Layers (S Layers) DOI 10.1016/b978-012373944-5.00113-9 Typ Book Chapter Autor Sleytr U Verlag Elsevier Seiten 89-98 -
2009
Titel S-Layers, Microbial, Biotechnological Applications DOI 10.1002/9780470054581.eib546 Typ Book Chapter Autor Egelseer E Verlag Wiley Seiten 1-25 -
2013
Titel Chapter 6 Bacterial cell-envelope glycoconjugates DOI 10.1016/b978-0-12-408093-5.00006-x Typ Book Chapter Autor Messner P Verlag Elsevier Seiten 209-272 Link Publikation -
2010
Titel Structural Basis of Substrate Binding in WsaF, a Rhamnosyltransferase from Geobacillus stearothermophilus DOI 10.1016/j.jmb.2010.01.035 Typ Journal Article Autor Steiner K Journal Journal of Molecular Biology Seiten 436-447 Link Publikation -
2010
Titel Cell surface display of chimeric glycoproteins via the S-layer of Paenibacillus alvei DOI 10.1016/j.carres.2010.04.010 Typ Journal Article Autor Zarschler K Journal Carbohydrate Research Seiten 1422-1431 Link Publikation -
2010
Titel Prokaryotic Cell Wall Components: Structure and Biochemistry DOI 10.1007/978-3-642-05062-6_16 Typ Book Chapter Autor Sleytr U Verlag Springer Nature Seiten 459-481 -
2010
Titel Occurrence, Structure, Chemistry, Genetics, Morphogenesis, and Functions of S-Layers DOI 10.1007/978-3-642-05062-6_2 Typ Book Chapter Autor Messner P Verlag Springer Nature Seiten 53-109 -
2010
Titel The S-Layer Glycome—Adding to the Sugar Coat of Bacteria DOI 10.1155/2011/127870 Typ Journal Article Autor Ristl R Journal International Journal of Microbiology Seiten 127870 Link Publikation -
2010
Titel Chapter 7 Bacterial surface layer glycoproteins and “non-classical” secondary cell wall polymers DOI 10.1016/b978-0-12-374546-0.00007-9 Typ Book Chapter Autor Messner P Verlag Elsevier Seiten 109-128 -
2008
Titel A temperature-sensitive expression system based on the Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a sgsE surface-layer gene promoter DOI 10.1042/ba20070083 Typ Journal Article Autor Novotny R Journal Biotechnology and Applied Biochemistry Seiten 35-40 Link Publikation -
2007
Titel The dTDP-4-dehydro-6-deoxyglucose reductase encoding fcd gene is part of the surface layer glycoprotein glycosylation gene cluster of Geobacillus tepidamans GS5-97T DOI 10.1093/glycob/cwl084 Typ Journal Article Autor Zayni S Journal Glycobiology Seiten 433-443 Link Publikation -
2007
Titel Functional Characterization of the Initiation Enzyme of S-Layer Glycoprotein Glycan Biosynthesis in Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a DOI 10.1128/jb.01592-06 Typ Journal Article Autor Steiner K Journal Journal of Bacteriology Seiten 2590-2598 Link Publikation -
2007
Titel Novel Biocatalysts Based on S-Layer Self-Assembly of Geobacillus Stearothermophilus NRS 2004/3a: A Nanobiotechnological Approach DOI 10.1002/smll.200700200 Typ Journal Article Autor Schäffer C Journal Small Seiten 1549-1559 Link Publikation -
2007
Titel Sequencing of O-Glycopeptides Derived from an S-Layer Glycoprotein of Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a Containing up to 51 Monosaccharide Residues at a Single Glycosylation Site by Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Infrared Multipho DOI 10.1021/ac0617363 Typ Journal Article Autor Bindila L Journal Analytical Chemistry Seiten 3271-3279 Link Publikation -
2007
Titel Exploitation of the S-layer self-assembly system for site directed immobilization of enzymes demonstrated for an extremophilic laminarinase from Pyrococcus furiosus DOI 10.1016/j.jbiotec.2007.09.018 Typ Journal Article Autor Tschiggerl H Journal Journal of Biotechnology Seiten 403-411 Link Publikation -
2006
Titel New Insights into the Glycosylation of the Surface Layer Protein SgsE from Geobacillus stearothermophilus NRS 2004/3a DOI 10.1128/jb.00802-06 Typ Journal Article Autor Steiner K Journal Journal of Bacteriology Seiten 7914-7921 Link Publikation