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Thermophile sporenbildende Sulfatreduzierer in der Kälte

Heat-loving sporeforming sulfate reducers in the cold

Alexander Loy (ORCID: 0000-0001-8923-5882)
  • Grant-DOI 10.55776/P20185
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.11.2007
  • Projektende 31.10.2012
  • Bewilligungssumme 224.564 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Sulfate-Reducing Microorganisms, Extremophiles, Biogeography, Spore-Forming, Thermophilic, Marine

Abstract Endbericht

Sulfatreduzierende Mikroorganismen (SRM) sind maßgeblich für den anaeroben Schwefelkreislauf und für die Mineralisierung von Kohlenstoff in den oberen, anoxischen Sedimentschichten der Meere verantwortlich, und somit von zentraler Relevanz für die globalen Stoffkreisläufe. Interessanterweise finden sich in einigen kalten und gemäßigten Meeressedimenten neben den erwarteten psychro- und mesophilen SRM auch Sporen von thermophilen Vertretern dieser einzigartigen Organismengruppe. Bislang ist allerdings nichts über die Herkunft und die Verbreitungsart dieser Sporen bekannt. Eine Hypothese ist, dass diese sporenbildenden und hitzeliebenden SRM in heißen Schichten tief unter dem Meeresboden wachsen und über örtlich begrenzte Ströme zur Sedimentoberfläche transportiert werden. Möglicherweise stellen diese Austrittstellen auch Bereiche dar durch die gelegentlich Öl und Gas aus tiefen Vorkommen nach oben dringen. Die offensichtliche Unfähigkeit der thermophilen SRM in den kalten Sedimenten, in denen man sie entdeckt hat, zu wachsen, bietet eine einzigartige Chance an ihrem Beispiel die Biogeographie und Verbreitung von Mikroorganismen in den Meeren zu studieren. In diesem Projekt wird die Diversität und Verbreitung der thermophilen SRM Sporen in verschiedenen Ozeanen mittels einer Kombination von molekularen, biogeochemischen und kultivierungsbasierten Methoden untersucht und somit neue Einblicke in die Herkunft und Verbreitungsmechanismen dieser ungewöhnlicher Mikroorganismen gewonnen. Praktische molekulare und biogeochemische Verfahren werden für den Nachweis und die Quantifizierung thermophiler, sporenbildender SRM entwickelt. Mit Hilfe dieser Methoden wird zusätzlich getestet, ob diese Sporen Bioindikatoren für Ströme tief aus dem heißen Meeresuntergrund und für potentielle unterseeische Öl- /Gasvorkommen sein könnten.

Die Biogeographie von Mikroorganismen wird maßgeblich durch deren passive Verbreitung und Selektion aufgrund lokaler Umweltbedingungen bestimmt. Eine Unterscheidung dieser beider Prozesse ist nur schwer möglich. Im Rahmen dieses Projektes wurden inaktive Sporen wärmeliebender Bakterien, die in kalten oder gemäßigten Meeressedimenten zu finden sind, als Bioindikatoren für den selektiven Einfluss von passiver Verbreitung auf die Biogeographie mariner Mikroorganismen etabliert. Inkubation von Sedimenten bei hohen Temperaturen führte zum Auskeimen einer genetisch und metabolisch diversen Sporengemeinschaft wärmeliebender Bakterien. Die nächsten Verwandten dieser sporenbildenden Bakterien stammen aus Hydrothermalquellen oder Öl/Gasreservoirs im marinen Untergrund. Dies brachte erste Hinweise zum möglichen Ursprung der Sporen, deren Vielfalt in den Meeren vermutlich durch mehre solcher Quellen gespeist wird. Durch Meeresströmungen und Sedimentation werden Sporen thermophiler Bakterien konstant dem Meeresboden zugeführt, wo sie mitunter sehr lange Zeit überleben können. Durch Untersuchung der globalen Biogeographie der Sporen wärmeliebender Bakterien in Meeressedimenten konnte gezeigt werden, dass die Verbreitung der Sporen von der Anbindung regionaler Wassermassen an die globale Ozeanzirkulation bestimmt wird. Hydrothermale Sedimente im Guaymas Basin (Golf von Kalifornien) beherbergen einen großen Anteil der global verbreiteten Sporen und wurden als typische Quellen der sporenbildenden, wärmeliebenden Bakterien identifiziert. Die beobachteten Einschränkungen in der passiven Verbreitung der Sporen im Meer gelten allgemein für alle mikrobielle Zellen, werden aber je nach der Populationsgröße und dem Maß an Resistenz gegenüber unwirtlichen Umweltbedingungen bei jedem einzelnen mikrobiellen Taxons unterschiedlich stark zum Tragen kommen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Bo Barker Jørgensen, Aarhus University - Dänemark
  • Kai Finster, Aarhus University - Dänemark

Research Output

  • 2853 Zitationen
  • 21 Publikationen
Publikationen
  • 2012
    Titel Sulfate-Reducing Microorganisms in Wetlands – Fameless Actors in Carbon Cycling and Climate Change
    DOI 10.3389/fmicb.2012.00072
    Typ Journal Article
    Autor Pester M
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 72
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Three manganese oxide-rich marine sediments harbor similar communities of acetate-oxidizing manganese-reducing bacteria
    DOI 10.1038/ismej.2012.41
    Typ Journal Article
    Autor Vandieken V
    Journal The ISME Journal
    Seiten 2078-2090
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Dispersal of thermophilic Desulfotomaculum endospores into Baltic Sea sediments over thousands of years
    DOI 10.1038/ismej.2012.83
    Typ Journal Article
    Autor De Rezende J
    Journal The ISME Journal
    Seiten 72-84
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Complete Genome Sequences of Desulfosporosinus orientis DSM765T, Desulfosporosinus youngiae DSM17734T, Desulfosporosinus meridiei DSM13257T, and Desulfosporosinus acidiphilus DSM22704T
    DOI 10.1128/jb.01392-12
    Typ Journal Article
    Autor Pester M
    Journal Journal of Bacteriology
    Seiten 6300-6301
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Modeling Formamide Denaturation of Probe-Target Hybrids for Improved Microarray Probe Design in Microbial Diagnostics
    DOI 10.1371/journal.pone.0043862
    Typ Journal Article
    Autor Yilmaz L
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Identification of acetateoxidizing manganese-reducing bacteria in three manganese oxide-rich marine sediments by stable isotope probing.
    Typ Journal Article
    Autor Thamdrup B
    Journal The ISME Journal
  • 2011
    Titel amoA-based consensus phylogeny of ammonia-oxidizing archaea and deep sequencing of amoA genes from soils of four different geographic regions
    DOI 10.1111/j.1462-2920.2011.02666.x
    Typ Journal Article
    Autor Pester M
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 525-539
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Barcoded Primers Used in Multiplex Amplicon Pyrosequencing Bias Amplification
    DOI 10.1128/aem.05220-11
    Typ Journal Article
    Autor Berry D
    Journal Applied and Environmental Microbiology
    Seiten 7846-7849
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Paracatenula, an ancient symbiosis between thiotrophic Alphaproteobacteria and catenulid flatworms
    DOI 10.1073/pnas.1105347108
    Typ Journal Article
    Autor Gruber-Vodicka H
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Seiten 12078-12083
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Systematic Spatial Bias in DNA Microarray Hybridization Is Caused by Probe Spot Position-Dependent Variability in Lateral Diffusion
    DOI 10.1371/journal.pone.0023727
    Typ Journal Article
    Autor Steger D
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Endospores of thermophilic bacteria as tracers of microbial dispersal by ocean currents
    DOI 10.1038/ismej.2013.225
    Typ Journal Article
    Autor Müller A
    Journal The ISME Journal
    Seiten 1153-1165
    Link Publikation
  • 2013
    Titel NxrB encoding the beta subunit of nitrite oxidoreductase as functional and phylogenetic marker for nitrite-oxidizing Nitrospira
    DOI 10.1111/1462-2920.12300
    Typ Journal Article
    Autor Pester M
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 3055-3071
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Probing Identity and Physiology of Uncultured Microorganisms with Isotope Labeling Techniques
    DOI 10.1007/978-90-481-9204-5_6
    Typ Book Chapter
    Autor Loy A
    Verlag Springer Nature
    Seiten 127-145
  • 2010
    Titel Microorganisms with Novel Dissimilatory (Bi)Sulfite Reductase Genes Are Widespread and Part of the Core Microbiota in Low-Sulfate Peatlands
    DOI 10.1128/aem.01352-10
    Typ Journal Article
    Autor Steger D
    Journal Applied and Environmental Microbiology
    Seiten 1231-1242
    Link Publikation
  • 2010
    Titel A ‘rare biosphere’ microorganism contributes to sulfate reduction in a peatland
    DOI 10.1038/ismej.2010.75
    Typ Journal Article
    Autor Pester M
    Journal The ISME Journal
    Seiten 1591-1602
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Phylogenetic Microarrays for Cultivation-Independent Identification and Metabolic Characterization of Microorganisms in Complex Samples
    DOI 10.1007/978-1-60761-947-5_13
    Typ Book Chapter
    Autor Loy A
    Verlag Springer Nature
    Seiten 187-206
  • 2019
    Titel Historical Factors Associated With Past Environments Influence the Biogeography of Thermophilic Endospores in Arctic Marine Sediments
    DOI 10.3389/fmicb.2019.00245
    Typ Journal Article
    Autor Hanson C
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 245
    Link Publikation
  • 2008
    Titel probeCheck – a central resource for evaluating oligonucleotide probe coverage and specificity
    DOI 10.1111/j.1462-2920.2008.01706.x
    Typ Journal Article
    Autor Loy A
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 2894-2898
    Link Publikation
  • 0
    Titel Geomicrobiology: Molecular and Environmental Perspective.
    Typ Other
    Autor Barton Ll
  • 2010
    Titel Thermophilic anaerobes in Arctic marine sediments induced to mineralize complex organic matter at high temperature
    DOI 10.1111/j.1462-2920.2010.02161.x
    Typ Journal Article
    Autor Hubert C
    Journal Environmental Microbiology
    Seiten 1089-1104
  • 2009
    Titel A Constant Flux of Diverse Thermophilic Bacteria into the Cold Arctic Seabed
    DOI 10.1126/science.1174012
    Typ Journal Article
    Autor Hubert C
    Journal Science
    Seiten 1541-1544
    Link Publikation

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