Thermophile sporenbildende Sulfatreduzierer in der Kälte
Heat-loving sporeforming sulfate reducers in the cold
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Sulfate-Reducing Microorganisms,
Extremophiles,
Biogeography,
Spore-Forming,
Thermophilic,
Marine
Sulfatreduzierende Mikroorganismen (SRM) sind maßgeblich für den anaeroben Schwefelkreislauf und für die Mineralisierung von Kohlenstoff in den oberen, anoxischen Sedimentschichten der Meere verantwortlich, und somit von zentraler Relevanz für die globalen Stoffkreisläufe. Interessanterweise finden sich in einigen kalten und gemäßigten Meeressedimenten neben den erwarteten psychro- und mesophilen SRM auch Sporen von thermophilen Vertretern dieser einzigartigen Organismengruppe. Bislang ist allerdings nichts über die Herkunft und die Verbreitungsart dieser Sporen bekannt. Eine Hypothese ist, dass diese sporenbildenden und hitzeliebenden SRM in heißen Schichten tief unter dem Meeresboden wachsen und über örtlich begrenzte Ströme zur Sedimentoberfläche transportiert werden. Möglicherweise stellen diese Austrittstellen auch Bereiche dar durch die gelegentlich Öl und Gas aus tiefen Vorkommen nach oben dringen. Die offensichtliche Unfähigkeit der thermophilen SRM in den kalten Sedimenten, in denen man sie entdeckt hat, zu wachsen, bietet eine einzigartige Chance an ihrem Beispiel die Biogeographie und Verbreitung von Mikroorganismen in den Meeren zu studieren. In diesem Projekt wird die Diversität und Verbreitung der thermophilen SRM Sporen in verschiedenen Ozeanen mittels einer Kombination von molekularen, biogeochemischen und kultivierungsbasierten Methoden untersucht und somit neue Einblicke in die Herkunft und Verbreitungsmechanismen dieser ungewöhnlicher Mikroorganismen gewonnen. Praktische molekulare und biogeochemische Verfahren werden für den Nachweis und die Quantifizierung thermophiler, sporenbildender SRM entwickelt. Mit Hilfe dieser Methoden wird zusätzlich getestet, ob diese Sporen Bioindikatoren für Ströme tief aus dem heißen Meeresuntergrund und für potentielle unterseeische Öl- /Gasvorkommen sein könnten.
Die Biogeographie von Mikroorganismen wird maßgeblich durch deren passive Verbreitung und Selektion aufgrund lokaler Umweltbedingungen bestimmt. Eine Unterscheidung dieser beider Prozesse ist nur schwer möglich. Im Rahmen dieses Projektes wurden inaktive Sporen wärmeliebender Bakterien, die in kalten oder gemäßigten Meeressedimenten zu finden sind, als Bioindikatoren für den selektiven Einfluss von passiver Verbreitung auf die Biogeographie mariner Mikroorganismen etabliert. Inkubation von Sedimenten bei hohen Temperaturen führte zum Auskeimen einer genetisch und metabolisch diversen Sporengemeinschaft wärmeliebender Bakterien. Die nächsten Verwandten dieser sporenbildenden Bakterien stammen aus Hydrothermalquellen oder Öl/Gasreservoirs im marinen Untergrund. Dies brachte erste Hinweise zum möglichen Ursprung der Sporen, deren Vielfalt in den Meeren vermutlich durch mehre solcher Quellen gespeist wird. Durch Meeresströmungen und Sedimentation werden Sporen thermophiler Bakterien konstant dem Meeresboden zugeführt, wo sie mitunter sehr lange Zeit überleben können. Durch Untersuchung der globalen Biogeographie der Sporen wärmeliebender Bakterien in Meeressedimenten konnte gezeigt werden, dass die Verbreitung der Sporen von der Anbindung regionaler Wassermassen an die globale Ozeanzirkulation bestimmt wird. Hydrothermale Sedimente im Guaymas Basin (Golf von Kalifornien) beherbergen einen großen Anteil der global verbreiteten Sporen und wurden als typische Quellen der sporenbildenden, wärmeliebenden Bakterien identifiziert. Die beobachteten Einschränkungen in der passiven Verbreitung der Sporen im Meer gelten allgemein für alle mikrobielle Zellen, werden aber je nach der Populationsgröße und dem Maß an Resistenz gegenüber unwirtlichen Umweltbedingungen bei jedem einzelnen mikrobiellen Taxons unterschiedlich stark zum Tragen kommen.
- Universität Wien - 100%
- Bo Barker Jørgensen, Aarhus University - Dänemark
- Kai Finster, Aarhus University - Dänemark
Research Output
- 2853 Zitationen
- 21 Publikationen
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2012
Titel Sulfate-Reducing Microorganisms in Wetlands – Fameless Actors in Carbon Cycling and Climate Change DOI 10.3389/fmicb.2012.00072 Typ Journal Article Autor Pester M Journal Frontiers in Microbiology Seiten 72 Link Publikation -
2012
Titel Three manganese oxide-rich marine sediments harbor similar communities of acetate-oxidizing manganese-reducing bacteria DOI 10.1038/ismej.2012.41 Typ Journal Article Autor Vandieken V Journal The ISME Journal Seiten 2078-2090 Link Publikation -
2012
Titel Dispersal of thermophilic Desulfotomaculum endospores into Baltic Sea sediments over thousands of years DOI 10.1038/ismej.2012.83 Typ Journal Article Autor De Rezende J Journal The ISME Journal Seiten 72-84 Link Publikation -
2012
Titel Complete Genome Sequences of Desulfosporosinus orientis DSM765T, Desulfosporosinus youngiae DSM17734T, Desulfosporosinus meridiei DSM13257T, and Desulfosporosinus acidiphilus DSM22704T DOI 10.1128/jb.01392-12 Typ Journal Article Autor Pester M Journal Journal of Bacteriology Seiten 6300-6301 Link Publikation -
2012
Titel Modeling Formamide Denaturation of Probe-Target Hybrids for Improved Microarray Probe Design in Microbial Diagnostics DOI 10.1371/journal.pone.0043862 Typ Journal Article Autor Yilmaz L Journal PLoS ONE Link Publikation -
2012
Titel Identification of acetateoxidizing manganese-reducing bacteria in three manganese oxide-rich marine sediments by stable isotope probing. Typ Journal Article Autor Thamdrup B Journal The ISME Journal -
2011
Titel amoA-based consensus phylogeny of ammonia-oxidizing archaea and deep sequencing of amoA genes from soils of four different geographic regions DOI 10.1111/j.1462-2920.2011.02666.x Typ Journal Article Autor Pester M Journal Environmental Microbiology Seiten 525-539 Link Publikation -
2011
Titel Barcoded Primers Used in Multiplex Amplicon Pyrosequencing Bias Amplification DOI 10.1128/aem.05220-11 Typ Journal Article Autor Berry D Journal Applied and Environmental Microbiology Seiten 7846-7849 Link Publikation -
2011
Titel Paracatenula, an ancient symbiosis between thiotrophic Alphaproteobacteria and catenulid flatworms DOI 10.1073/pnas.1105347108 Typ Journal Article Autor Gruber-Vodicka H Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 12078-12083 Link Publikation -
2011
Titel Systematic Spatial Bias in DNA Microarray Hybridization Is Caused by Probe Spot Position-Dependent Variability in Lateral Diffusion DOI 10.1371/journal.pone.0023727 Typ Journal Article Autor Steger D Journal PLoS ONE Link Publikation -
2013
Titel Endospores of thermophilic bacteria as tracers of microbial dispersal by ocean currents DOI 10.1038/ismej.2013.225 Typ Journal Article Autor Müller A Journal The ISME Journal Seiten 1153-1165 Link Publikation -
2013
Titel NxrB encoding the beta subunit of nitrite oxidoreductase as functional and phylogenetic marker for nitrite-oxidizing Nitrospira DOI 10.1111/1462-2920.12300 Typ Journal Article Autor Pester M Journal Environmental Microbiology Seiten 3055-3071 Link Publikation -
2010
Titel Probing Identity and Physiology of Uncultured Microorganisms with Isotope Labeling Techniques DOI 10.1007/978-90-481-9204-5_6 Typ Book Chapter Autor Loy A Verlag Springer Nature Seiten 127-145 -
2010
Titel Microorganisms with Novel Dissimilatory (Bi)Sulfite Reductase Genes Are Widespread and Part of the Core Microbiota in Low-Sulfate Peatlands DOI 10.1128/aem.01352-10 Typ Journal Article Autor Steger D Journal Applied and Environmental Microbiology Seiten 1231-1242 Link Publikation -
2010
Titel A ‘rare biosphere’ microorganism contributes to sulfate reduction in a peatland DOI 10.1038/ismej.2010.75 Typ Journal Article Autor Pester M Journal The ISME Journal Seiten 1591-1602 Link Publikation -
2010
Titel Phylogenetic Microarrays for Cultivation-Independent Identification and Metabolic Characterization of Microorganisms in Complex Samples DOI 10.1007/978-1-60761-947-5_13 Typ Book Chapter Autor Loy A Verlag Springer Nature Seiten 187-206 -
2019
Titel Historical Factors Associated With Past Environments Influence the Biogeography of Thermophilic Endospores in Arctic Marine Sediments DOI 10.3389/fmicb.2019.00245 Typ Journal Article Autor Hanson C Journal Frontiers in Microbiology Seiten 245 Link Publikation -
2008
Titel probeCheck – a central resource for evaluating oligonucleotide probe coverage and specificity DOI 10.1111/j.1462-2920.2008.01706.x Typ Journal Article Autor Loy A Journal Environmental Microbiology Seiten 2894-2898 Link Publikation -
0
Titel Geomicrobiology: Molecular and Environmental Perspective. Typ Other Autor Barton Ll -
2010
Titel Thermophilic anaerobes in Arctic marine sediments induced to mineralize complex organic matter at high temperature DOI 10.1111/j.1462-2920.2010.02161.x Typ Journal Article Autor Hubert C Journal Environmental Microbiology Seiten 1089-1104 -
2009
Titel A Constant Flux of Diverse Thermophilic Bacteria into the Cold Arctic Seabed DOI 10.1126/science.1174012 Typ Journal Article Autor Hubert C Journal Science Seiten 1541-1544 Link Publikation