Überauflösende Mikroskopie für große Präparate
Superresolution microscopy of large specimens
Wissenschaftsdisziplinen
Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (20%); Medizintechnik (30%); Physik, Astronomie (50%)
Keywords
-
Superresolution Microscopy,
Multicolour Fluorescence,
White Light Laser,
Beam Shaping,
Mouse Embryo,
Neuronal Network
Im vorgeschlagenen Projekt sollen die Möglichkeiten der neuen Superkontinuum Laser für die Visualisierung neuronaler Netzwerke genutzt werden. Diese "Weißlichtlaser" erlauben die Verwendung verschiedener Wellenlängen für die mehrfarbige Fluoreszensanregung. Dies ist von großer Bedeutung für biologische Anwendungen, bei denen oft die Kolokalisation verschiedenfarbiger Fluoreszensmarkierungen notwendig ist. Der vorgeschlagene Ansatz basiert auf einem von uns neuentwickelten Mikroskop (Ultramikroskop), das die Aunahme dreidimensionaler Bildstapel von makroskopischen Objekten mit mikroskopischer Auflösung erlaubt. Die Präparate werden hierfür mit einem chemischen Klärverfahren durchsichtig gemacht bei dem die Fluoreszensmarkierung z.B. von Neuronen erhalten bleibt. Weiterhin sollte mit den Supercontinuum Lasern Bildgebung mit stark erhöhter Auflösung durch Anwendung der Prinzipien der STED Mikroskopie möglich sein. Die STED Mikroskopie erlaubt eine bis zu zehnfach höhere Auflösung als die Konfokalmikroskopie. Da die axiale Auflösung im Ultramikroskop nicht der lateralen Auflösung entspricht würde eine Verbesserung der axialen Auflösung durch den STED Mikroskopieansatz die Ultramikroskopie deutlich verbessern. Hierfür sollen spezielle Optiken entwickelt werden, mit denen über Fluoreszensquenching ein besonders dünnes Lichtblatt erzeugt werden kann. Letzendlich sollte überaufgelöste Bildgebung großer biologischer Objekte wie Mäusegehirnen möglich werden.
Wir haben uns damit beschäftigt, eine 3D Mikroskopie mit besonders hoher Auflösung für große Präparate wie ganze Mäusehirne zu entwickeln. Das ist möglich, wenn man die Gehirne vorher einem besonderen Klärverfahren unterzieht, so daß sie ganz durchsichtig werden. Wenn man sie dann von der Seite mit einem besonders dünnen Laserstrahl, der ein Lichtblatts bildet, durchstrahlt, entstehen dünne optische Schnitte, die man von oben mit einem Mikroskop aufnehmen kann. So erhält man tausende von optischen Schnitten aus denen sich im Computer dann die dreidimensionale Struktur rekonstruieren läßt. Für die Auflösung ist es nun entscheidend, daß die optischen Schnitte möglichst dünn sind. Dafür wollten wir das STED Verfahren auf die Lichtblattmikroskopie anwenden. Mit diesem Verfahren ist prinzipiell eine sehr hohe Auflösung zu erreichen, allerdings werden durch die hohe Lichtintensität fluoreszierend markierte Zellen in der Probe schnell gebleicht. Deshalb haben wir schließlich eine neue Optik zur Lichtblatterzeugung entwickelt, die ohne das STED Verfahren auskommt. Damit konnten wir ganze Mäusehirne mit bislang nicht erreichter dreidimensionaler Auflösung aufnehmen.
- Technische Universität Wien - 100%
- Frank Bradke, Helmholtzgesellschaft - Deutschland
- Frank Schnorrer, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
- Mathias Jucker, Universitätsklinikum Tübingen - Deutschland
- Edgar Kramer, University of Plymouth - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 1931 Zitationen
- 20 Publikationen
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2015
Titel Ultramicroscopy: development and outlook DOI 10.1117/1.nph.2.4.041407 Typ Journal Article Autor Dodt H Journal Neurophotonics Seiten 041407-041407 Link Publikation -
2015
Titel The superresolved brain DOI 10.1126/science.aaa5084 Typ Journal Article Autor Dodt H Journal Science Seiten 474-475 -
2015
Titel Cerebral ß-Amyloidosis in Mice Investigated by Ultramicroscopy DOI 10.1371/journal.pone.0125418 Typ Journal Article Autor Jährling N Journal PLOS ONE Link Publikation -
2020
Titel A versatile depigmentation, clearing, and labeling method for exploring nervous system diversity DOI 10.1126/sciadv.aba0365 Typ Journal Article Autor Pende M Journal Science Advances Link Publikation -
2022
Titel FlyClear: A Tissue-Clearing Technique for High-Resolution Microscopy of Drosophila DOI 10.1007/978-1-0716-2541-5_18 Typ Book Chapter Autor Pende M Verlag Springer Nature Seiten 349-359 -
2018
Titel High-resolution ultramicroscopy of the developing and adult nervous system in optically cleared Drosophila melanogaster DOI 10.1038/s41467-018-07192-z Typ Journal Article Autor Pende M Journal Nature Communications Seiten 4731 Link Publikation -
2018
Titel Reshaping a multimode laser beam into a constructed Gaussian beam for generating a thin light sheet DOI 10.1002/jbio.201700213 Typ Journal Article Autor Saghafi S Journal Journal of Biophotonics Link Publikation -
2011
Titel Three-dimensional imaging of the unsectioned adult spinal cord to assess axon regeneration and glial responses after injury DOI 10.1038/nm.2600 Typ Journal Article Autor Ertürk A Journal Nature Medicine Seiten 166-171 -
2016
Titel Outlook on optimizing ultramicroscopy imaging technique through optical characterization DOI 10.1002/jemt.22815 Typ Journal Article Autor Saghafi S Journal Microscopy Research and Technique Seiten 929-935 -
2012
Titel Chemical Clearing and Dehydration of GFP Expressing Mouse Brains DOI 10.1371/journal.pone.0033916 Typ Journal Article Autor Becker K Journal PLoS ONE Link Publikation -
2012
Titel Three-dimensional imaging of solvent-cleared organs using 3DISCO DOI 10.1038/nprot.2012.119 Typ Journal Article Autor Ertürk A Journal Nature Protocols Seiten 1983-1995 -
2014
Titel Reduction of Photo Bleaching and Long Term Archiving of Chemically Cleared GFP-Expressing Mouse Brains DOI 10.1371/journal.pone.0114149 Typ Journal Article Autor Becker K Journal PLoS ONE Link Publikation -
2019
Titel Deconvolution of light sheet microscopy recordings DOI 10.1038/s41598-019-53875-y Typ Journal Article Autor Becker K Journal Scientific Reports Seiten 17625 Link Publikation -
2019
Titel High-resolution imaging of fluorescent whole mouse brains using stabilised organic media (sDISCO) DOI 10.1002/jbio.201800368 Typ Journal Article Autor Hahn C Journal Journal of Biophotonics Link Publikation -
2013
Titel Immunostaining, Dehydration, and Clearing of Mouse Embryos for Ultramicroscopy DOI 10.1101/pdb.prot076521 Typ Journal Article Autor Becker K Journal Cold Spring Harbor Protocols Link Publikation -
2013
Titel Dehydration and clearing of adult Drosophila for ultramicroscopy. DOI 10.1101/pdb.prot075812 Typ Journal Article Autor Becker K Journal Cold Spring Harbor protocols Seiten 681-2 -
2013
Titel Ultramicroscopy: Light-Sheet-Based Microscopy for Imaging Centimeter-Sized Objects with Micrometer Resolution DOI 10.1101/pdb.top076539 Typ Journal Article Autor Becker K Journal Cold Spring Harbor Protocols Link Publikation -
2013
Titel 3D-ultramicroscopy utilizing aspheric optics DOI 10.1002/jbio.201300048 Typ Journal Article Autor Saghafi S Journal Journal of Biophotonics Seiten 117-125 -
2013
Titel Dehydration and Clearing of Whole Mouse Brains and Dissected Hippocampi for Ultramicroscopy DOI 10.1101/pdb.prot075820 Typ Journal Article Autor Becker K Journal Cold Spring Harbor Protocols -
2016
Titel Trichobilharzia regenti (Schistosomatidae): 3D imaging techniques in characterization of larval migration through the CNS of vertebrates DOI 10.1016/j.micron.2016.01.009 Typ Journal Article Autor Bulantová J Journal Micron Seiten 62-71