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Überauflösende Mikroskopie für große Präparate

Superresolution microscopy of large specimens

Hans-Ulrich Dodt (ORCID: 0000-0002-9784-9689)
  • Grant-DOI 10.55776/P23102
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2011
  • Projektende 30.09.2016
  • Bewilligungssumme 298.336 €

Wissenschaftsdisziplinen

Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (20%); Medizintechnik (30%); Physik, Astronomie (50%)

Keywords

    Superresolution Microscopy, Multicolour Fluorescence, White Light Laser, Beam Shaping, Mouse Embryo, Neuronal Network

Abstract Endbericht

Im vorgeschlagenen Projekt sollen die Möglichkeiten der neuen Superkontinuum Laser für die Visualisierung neuronaler Netzwerke genutzt werden. Diese "Weißlichtlaser" erlauben die Verwendung verschiedener Wellenlängen für die mehrfarbige Fluoreszensanregung. Dies ist von großer Bedeutung für biologische Anwendungen, bei denen oft die Kolokalisation verschiedenfarbiger Fluoreszensmarkierungen notwendig ist. Der vorgeschlagene Ansatz basiert auf einem von uns neuentwickelten Mikroskop (Ultramikroskop), das die Aunahme dreidimensionaler Bildstapel von makroskopischen Objekten mit mikroskopischer Auflösung erlaubt. Die Präparate werden hierfür mit einem chemischen Klärverfahren durchsichtig gemacht bei dem die Fluoreszensmarkierung z.B. von Neuronen erhalten bleibt. Weiterhin sollte mit den Supercontinuum Lasern Bildgebung mit stark erhöhter Auflösung durch Anwendung der Prinzipien der STED Mikroskopie möglich sein. Die STED Mikroskopie erlaubt eine bis zu zehnfach höhere Auflösung als die Konfokalmikroskopie. Da die axiale Auflösung im Ultramikroskop nicht der lateralen Auflösung entspricht würde eine Verbesserung der axialen Auflösung durch den STED Mikroskopieansatz die Ultramikroskopie deutlich verbessern. Hierfür sollen spezielle Optiken entwickelt werden, mit denen über Fluoreszensquenching ein besonders dünnes Lichtblatt erzeugt werden kann. Letzendlich sollte überaufgelöste Bildgebung großer biologischer Objekte wie Mäusegehirnen möglich werden.

Wir haben uns damit beschäftigt, eine 3D Mikroskopie mit besonders hoher Auflösung für große Präparate wie ganze Mäusehirne zu entwickeln. Das ist möglich, wenn man die Gehirne vorher einem besonderen Klärverfahren unterzieht, so daß sie ganz durchsichtig werden. Wenn man sie dann von der Seite mit einem besonders dünnen Laserstrahl, der ein Lichtblatts bildet, durchstrahlt, entstehen dünne optische Schnitte, die man von oben mit einem Mikroskop aufnehmen kann. So erhält man tausende von optischen Schnitten aus denen sich im Computer dann die dreidimensionale Struktur rekonstruieren läßt. Für die Auflösung ist es nun entscheidend, daß die optischen Schnitte möglichst dünn sind. Dafür wollten wir das STED Verfahren auf die Lichtblattmikroskopie anwenden. Mit diesem Verfahren ist prinzipiell eine sehr hohe Auflösung zu erreichen, allerdings werden durch die hohe Lichtintensität fluoreszierend markierte Zellen in der Probe schnell gebleicht. Deshalb haben wir schließlich eine neue Optik zur Lichtblatterzeugung entwickelt, die ohne das STED Verfahren auskommt. Damit konnten wir ganze Mäusehirne mit bislang nicht erreichter dreidimensionaler Auflösung aufnehmen.

Forschungsstätte(n)
  • Technische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Frank Bradke, Helmholtzgesellschaft - Deutschland
  • Frank Schnorrer, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
  • Mathias Jucker, Universitätsklinikum Tübingen - Deutschland
  • Edgar Kramer, University of Plymouth - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 1931 Zitationen
  • 20 Publikationen
Publikationen
  • 2018
    Titel High-resolution ultramicroscopy of the developing and adult nervous system in optically cleared Drosophila melanogaster
    DOI 10.1038/s41467-018-07192-z
    Typ Journal Article
    Autor Pende M
    Journal Nature Communications
    Seiten 4731
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Reshaping a multimode laser beam into a constructed Gaussian beam for generating a thin light sheet
    DOI 10.1002/jbio.201700213
    Typ Journal Article
    Autor Saghafi S
    Journal Journal of Biophotonics
    Link Publikation
  • 2019
    Titel High-resolution imaging of fluorescent whole mouse brains using stabilised organic media (sDISCO)
    DOI 10.1002/jbio.201800368
    Typ Journal Article
    Autor Hahn C
    Journal Journal of Biophotonics
    Link Publikation
  • 2022
    Titel FlyClear: A Tissue-Clearing Technique for High-Resolution Microscopy of Drosophila
    DOI 10.1007/978-1-0716-2541-5_18
    Typ Book Chapter
    Autor Pende M
    Verlag Springer Nature
    Seiten 349-359
  • 2020
    Titel A versatile depigmentation, clearing, and labeling method for exploring nervous system diversity
    DOI 10.1126/sciadv.aba0365
    Typ Journal Article
    Autor Pende M
    Journal Science Advances
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Three-dimensional imaging of solvent-cleared organs using 3DISCO
    DOI 10.1038/nprot.2012.119
    Typ Journal Article
    Autor Ertürk A
    Journal Nature Protocols
    Seiten 1983-1995
  • 2015
    Titel Cerebral ß-Amyloidosis in Mice Investigated by Ultramicroscopy
    DOI 10.1371/journal.pone.0125418
    Typ Journal Article
    Autor Jährling N
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Ultramicroscopy: development and outlook
    DOI 10.1117/1.nph.2.4.041407
    Typ Journal Article
    Autor Dodt H
    Journal Neurophotonics
    Seiten 041407-041407
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Reduction of Photo Bleaching and Long Term Archiving of Chemically Cleared GFP-Expressing Mouse Brains
    DOI 10.1371/journal.pone.0114149
    Typ Journal Article
    Autor Becker K
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Dehydration and clearing of adult Drosophila for ultramicroscopy.
    DOI 10.1101/pdb.prot075812
    Typ Journal Article
    Autor Becker K
    Journal Cold Spring Harbor protocols
    Seiten 681-2
  • 2011
    Titel Three-dimensional imaging of the unsectioned adult spinal cord to assess axon regeneration and glial responses after injury
    DOI 10.1038/nm.2600
    Typ Journal Article
    Autor Ertürk A
    Journal Nature Medicine
    Seiten 166-171
  • 2016
    Titel Outlook on optimizing ultramicroscopy imaging technique through optical characterization
    DOI 10.1002/jemt.22815
    Typ Journal Article
    Autor Saghafi S
    Journal Microscopy Research and Technique
    Seiten 929-935
  • 2016
    Titel Trichobilharzia regenti (Schistosomatidae): 3D imaging techniques in characterization of larval migration through the CNS of vertebrates
    DOI 10.1016/j.micron.2016.01.009
    Typ Journal Article
    Autor Bulantová J
    Journal Micron
    Seiten 62-71
  • 2015
    Titel The superresolved brain
    DOI 10.1126/science.aaa5084
    Typ Journal Article
    Autor Dodt H
    Journal Science
    Seiten 474-475
  • 2012
    Titel Chemical Clearing and Dehydration of GFP Expressing Mouse Brains
    DOI 10.1371/journal.pone.0033916
    Typ Journal Article
    Autor Becker K
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Immunostaining, Dehydration, and Clearing of Mouse Embryos for Ultramicroscopy
    DOI 10.1101/pdb.prot076521
    Typ Journal Article
    Autor Becker K
    Journal Cold Spring Harbor Protocols
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Dehydration and Clearing of Whole Mouse Brains and Dissected Hippocampi for Ultramicroscopy
    DOI 10.1101/pdb.prot075820
    Typ Journal Article
    Autor Becker K
    Journal Cold Spring Harbor Protocols
  • 2013
    Titel 3D-ultramicroscopy utilizing aspheric optics
    DOI 10.1002/jbio.201300048
    Typ Journal Article
    Autor Saghafi S
    Journal Journal of Biophotonics
    Seiten 117-125
  • 2013
    Titel Ultramicroscopy: Light-Sheet-Based Microscopy for Imaging Centimeter-Sized Objects with Micrometer Resolution
    DOI 10.1101/pdb.top076539
    Typ Journal Article
    Autor Becker K
    Journal Cold Spring Harbor Protocols
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Deconvolution of light sheet microscopy recordings
    DOI 10.1038/s41598-019-53875-y
    Typ Journal Article
    Autor Becker K
    Journal Scientific Reports
    Seiten 17625
    Link Publikation

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