Mathematische Modellierung der Exhalationskinetik von Spurengasen
Mathematical modeling of trace gas exhalation kinetics
Wissenschaftsdisziplinen
Mathematik (100%)
Keywords
-
Mathematical Modeling,
Breath Gas Analysis,
PTR-MS,
VOC,
Blood-Gas Kinetics,
Isoprene,
Acetone
Aufgrund ihrer universellen Anwendbarkeit (z.B. durch nicht-invasive, unkomplizierte Probenabnahme) birgt die Atemgasanalyse ein großes Potential als vielseitiges Instrument für die medizinische Diagnostik sowie für allgemeine Biomonitoring-Anwendungen in Echtzeit. Parallel zur immer schneller fortschreitenden Entwicklung von diesbezüglichen chemischen Analysetechniken ist die Klärung einiger wesentlicher methodischen Fragen entscheidend, um die Atemgasanalyse im Standardrepertoire klinischer Tests zu etablieren. Wesentlich ist hierbei etwa der noch immer unterschätzte Einfluss von Blut-Gas-Kinetiken und systemischen Verteilungen der zu untersuchenden Spurengase (volatile organic compounds (VOCs)) auf die entsprechenden Atemgaskonzentrationen. Letztere werden vor allem beeinflusst durch: Atemfrequenz (bzw. Atemfluss), dem pulmonalen Blutfluss und den Gasaustausch im Alveolarraum Diffusionsmechanismen in den oberen Atemwegen Systemischen Konzentrationen dieser Substanzen, welche durch endogene Produktion, den Stoffwechsel und die Zirkulation bestimmt werden. In zwei kürzlich publizierten Artikeln 1,2 haben wir zwei mathematische Modelle für die Blut-Gas-Kinetik und die systemische Verteilung von zwei spezifischen Spurengasen, Aceton und Isopren, entwickelt. Aufgrund der Tatsache, dass diese beiden Stoffe ein relativ breites Spektrum von unterschiedlichen physikalisch-chemischen Eigenschaften abdecken, sind die bisherigen Ergebnisse ein hervorragender Ausgangspunkt für eine Verallgemeinerung unserer quantitativen Kenntnisse auf weitere experimentelle Szenarien sowie auf andere Klassen von endogenen und exogen verabreichten Spurengasen. Im Rahmen des vorgeschlagenen Projekts beabsichtigen wir zunächst das 3-Kompartiment-Modell für Isopren zu einem detaillierteren pharmakokinetischen Kompartiment-Modell zu erweitern, etwa durch Berücksichtigung von zusätzlichen Gewebe-Kompartimenten wie, Leber, Fett, reich durchblutetes Gewebe, ruhende Muskeln und arbeitende Muskeln. Im Zusammenspiel mit den begleitenden experimentellen Untersuchungen wird erwartet, dass hierdurch weitere Erkenntnisse zur Herkunft und Funktion von Isopren im Körper gewonnen werden können. Unsere durch Vorarbeiten untermauerte Arbeitshypothese besagt, dass eine periphere (Muskel-)Gewebegruppe als explizite extrahepatische Produktionsquelle von Isopren im Körper wirkt. Dies deutet insbesondere auf einen neuen, noch völlig unbekannten Stoffwechselweg für diesen am häufigsten im menschlichen Atem vorkommenden Kohlenwasserstoff hin. Schließlich planen wir das oben genannte Modell mit unserem bestehenden Aceton-Modell zu vereinen, mit dem Ziel ein allgemein gültiges, globales mechanistisches Modell für die quantitative Atemgasanalyse zu erhalten. Letzteres ermöglicht dann die Abschätzung von endogenen Produktions- und Stoffwechselraten oder die Rekonstruktion von Blut- und Gewebe-Konzentrationen aus den beobachtbaren Atemgaskonzentrationen. Als prototypischen Testfall innerhalb eines realistischen klinischen Anwendungsrahmens verwenden wir dieses globale Modell dann für die Echtzeit-Beurteilung des Narkose-Status auf Grundlage der ausgeatmeten Atemgaskonzentrationen des betreffenden Narkotikums. Die Arbeitspakete umfassen mehrere theoretische und experimentelle Untersuchungen zur Erreichung dieser Ziele. Unsere mathematischen Simulationsmodelle beruhen auf kausalen physikalischen Gesetzen, insbesondere Massenbilanz mittels Differentialgleichungen. Weitere in diesem Kontext eingesetzte mathematische Methoden umfassen unter anderem Identifizierbarkeit/Beobachtbarkeit, Hermann-Krener Rang-Kriterium, multiple shooting und Sensitivitätsanalyse. J. King, H. Koc, K. Unterkofler, P. Mochalski, A. Kupferthaler, G. Teschl, S. Teschl, H. Hinterhuber, and A. Amann: Physiological modeling of isoprene dynamics in exhaled breath, J. Theoret. Biol. 267 (2010) 626-637. J. King, K. Unterkofler, G. Teschl, S. Teschl, H. Koc, H. Hinterhuber, and A. Amann, A mathematical model for breath gas analysis of volatile organic compounds with special emphasis on acetone, J. Math. Biol 63 (2011), 959- 999.
Im menschlichen Körper werden verschiedenste flüchtige organische Substanzen (volatile organic compounds (VOCs)) freigesetzt, entweder körpereigen (endogen) erzeugt oder in Folge einer Erkrankung. Diese Substanzen gelangen in den Blutkreislauf, werden verstoffwechselt (metabolisiert) oder über die Atmung, Haut, Urin, etc. ausgeschieden.Die Analyse der Ausatemluft bietet eine einzigartige Möglichkeit auf verletzungsfreie (nichtinvasive) Weise Informationen über diese flüchtigen organischen Substanzen zu bekommen. Von Vorteil ist auch die Tatsache, dass Atemgasanalyse beliebig oft beziehungsweise fortlaufend und sogar in Echtzeit durchgeführt werden kann.All diese Fakten zeigen, dass Atemgasanalyse die ideale Wahl ist, um laufende Informationen über den augenblicklichen metabolischen und physiologischen Zu stand eines Individuums zu erhalten.In diesem Prozess ist die Identifizierung und mengenmäßige Bestimmung (Quantifizierung) von möglichen Krankheitsbiomarkern die treibende Kraft bei der Analyse der Ausatemluft. Weiters sind zukünftige Anwendungen für die medizinische Diagnostik und Therapiekontrolle mit laufender Beurteilung der normalen physiologischen Funktion beabsichtigt. Darüber hinaus können exogene VOCs, Substanzen, die in den Körper als Folge einer Umweltexposition eindringen, benutzt werden um die Körperbelastung zu quantifizieren. Schließlich kann mit Hilfe der Aufnahme von markierten Molekülen, die im Atem markiertes Kohlendioxid ergeben, die individuelle Stoffwechselrate (Metabolismusrate) von Patienten für verschiedene Medikamente (z.B. in der Krebstherapie) ermittelt werden, um die optimale Dosis zu bestimmen.Doch aufgrund einer ganzen Reihe von Störfaktoren, die die Konzentration von flüchtigen Stoffen in der Ausatemluft beeinflussen, ist die Atemgasanalyse derzeit, bis auf wenige Ausnahmen, noch weit von einem standardisierten Verfahren entfernt. Diese Faktoren beziehen sich sowohl auf die Verfahrensregeln der Atemprobenentnahme sowie auf die komplexen physiologischen Mechanismen des Gasaustausches in der Lunge. Selbst unter Ruhebedingungen kann die Ausatemluftkonzentrationen von VOCs stark von spezifischen physiologischen Parametern wie Pulsfrequenz und Atemfrequenz beeinflusst werden und des weiteren auch noch von den physikalisch-chemischen Eigenschaften der jeweiligen Substanz.Den Einfluss all dieser Faktoren auf die ausgeatmete Luft zu verstehen, ist daher fundamental für die genaue Standardisierung der Messung von Atem proben, um die entsprechenden Blutkonzentrationswerte berechnen zu können.Durch diese Standardisierung soll schlussendlich der Weg zur Routineanwendung von Atemgasanalyse in der Praxis geebnet werden.In diesem Projekt erweiterten wir zwei kürzlich von uns entwickelte Modelle, um den Einfluss der Umgebungsluft auf die Ausatemluft zu berücksichtigen. Des weiteren entwickelten wir auch ein vollständig neues Modell, das die Produktion von Methan im menschlichen Darm beschreibt. Diese Modelle wurden durch Ergometerversuche auch experimentell bestätigt. Sie erlauben die Bestimmung von Blutkonzentrationen aus den entsprechenden Ausatemkonzentrationen und ermöglichen auch die Berechnung der Produktionsraten und Stoffwechselraten aus der Ausatemkonzentration.Darüber hinaus wurde das Wissen in einer Reihe von Untersuchungen des menschlichen Volatilomes" (das ist die Summe aller ausgeschiedenen flüchtigen organischen Substanzen) stark erweitert:(i) In einer Untersuchung quantifizierten wir insgesamt 74 flüchtige organische Verbindungen, die sowohl im Blut als auch im Atem der Probanden nachweisbar waren.(ii) In mehreren weiteren Arbeiten wurde eine Datenbank von über die Haut emittierten flüchtigen organischen Substanzen erstellt. Diese Stoffe haben ein hohes Potential als Marker der menschlichen Anwesenheit, und sind hervorragend geeignet, um die Lage von verschütteten Erdbebenopfern zu ermitteln.(iii) Schließlich wurde das Vorhandensein von Biomarkern in der Ausatemluft auf ihre Brauchbarkeit als Marker für Krebserkrankungen evaluiert.Insgesamt wurden 25 Artikel in renommierten Zeitschriften veröffentlicht.
- FH Vorarlberg - 49%
- Universität Innsbruck - 51%
- Karl Unterkofler, FH Vorarlberg , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Wolfram Miekisch, Universität Rostock - Deutschland
- Gunnar Johanson, Karolinska Institutet - Schweden
Research Output
- 2317 Zitationen
- 33 Publikationen
-
2019
Titel PTR-MS studies of the reactions of H3O+ with a number of deuterated volatile organic compounds and the subsequent sequential reactions of the primary product ions with water under normal and humid drift tube conditions: Implications for use of deuter DOI 10.1016/j.ijms.2018.11.007 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal International Journal of Mass Spectrometry Seiten 65-70 Link Publikation -
2018
Titel Ex vivo emission of volatile organic compounds from gastric cancer and non-cancerous tissue DOI 10.1088/1752-7163/aacbfb Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Journal of Breath Research Seiten 046005 Link Publikation -
2016
Titel Prediction of blood:air and fat:air partition coefficients of volatile organic compounds for the interpretation of data in breath gas analysisDedicated to the memory of our friend, colleague, and mentor Anton Amann. DOI 10.1088/1752-7155/10/1/017103 Typ Journal Article Autor Kramer C Journal Journal of Breath Research Seiten 017103 Link Publikation -
2015
Titel Potential of volatile organic compounds as markers of entrapped humans for use in urban search-and-rescue operations DOI 10.1016/j.trac.2015.02.013 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal TrAC Trends in Analytical Chemistry Seiten 88-106 Link Publikation -
2015
Titel Exhaled methane concentration profiles during exercise on an ergometer DOI 10.1088/1752-7155/9/1/016009 Typ Journal Article Autor Szabó A Journal Journal of Breath Research Seiten 016009 Link Publikation -
2015
Titel Modeling-based determination of physiological parameters of systemic VOCs by breath gas analysis: a pilot study DOI 10.1088/1752-7155/9/3/036002 Typ Journal Article Autor Unterkofler K Journal Journal of Breath Research Seiten 036002 Link Publikation -
2019
Titel Non-contact breath sampling for sensor-based breath analysis DOI 10.1088/1752-7163/ab0b8d Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Journal of Breath Research Seiten 036001 Link Publikation -
2014
Titel Assessment, origin, and implementation of breath volatile cancer markers DOI 10.1039/c3cs60329f Typ Journal Article Autor Haick H Journal Chemical Society Reviews Seiten 1423-1449 Link Publikation -
2014
Titel Assessment of the exhalation kinetics of volatile cancer biomarkers based on their physicochemical properties DOI 10.1088/1752-7155/8/1/016003 Typ Journal Article Autor Amann A Journal Journal of Breath Research Seiten 016003 Link Publikation -
2014
Titel Monitoring of Selected Skin-Borne Volatile Markers of Entrapped Humans by Selective Reagent Ionization Time of Flight Mass Spectrometry in NO+ Mode DOI 10.1021/ac404242q Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Analytical Chemistry Seiten 3915-3923 Link Publikation -
2014
Titel Product ion distributions for the reactions of NO+ with some physiologically significant volatile organosulfur and organoselenium compounds obtained using a selective reagent ionization time-of-flight mass spectrometer DOI 10.1002/rcm.6947 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Rapid Communications in Mass Spectrometry Seiten 1683-1690 Link Publikation -
2013
Titel Chapter 3 Physiological Modeling for Analysis of Exhaled Breath DOI 10.1016/b978-0-44-462613-4.00003-9 Typ Book Chapter Autor King J Verlag Elsevier Seiten 26-46 Link Publikation -
2012
Titel Volatile organic compounds in exhaled breath: real-time measurements, modeling, and bio-monitoring applications. Typ Conference Proceeding Abstract Autor King J Konferenz The 1st International Workshop on Innovative Simulation for Health Care, W. Backfrieder et al. (eds), Proceedings of IWISH 2012 -
2014
Titel Emission rates of selected volatile organic compounds from skin of healthy volunteers DOI 10.1016/j.jchromb.2014.04.006 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Journal of Chromatography B Seiten 62-70 Link Publikation -
2014
Titel Product ion distributions for the reactions of NO+ with some physiologically significant aldehydes obtained using a SRI-TOF-MS instrument DOI 10.1016/j.ijms.2014.02.016 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal International Journal of Mass Spectrometry Seiten 23-31 Link Publikation -
2014
Titel Blood and breath profiles of volatile organic compounds in patients with end-stage renal disease DOI 10.1186/1471-2369-15-43 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal BMC Nephrology Seiten 43 Link Publikation -
2012
Titel Breath isoprene: Muscle dystrophy patients support the concept of a pool of isoprene in the periphery of the human body DOI 10.1016/j.bbrc.2012.05.159 Typ Journal Article Autor King J Journal Biochemical and Biophysical Research Communications Seiten 526-530 Link Publikation -
2016
Titel Modeling of breath methane concentration profiles during exercise on an ergometer* DOI 10.1088/1752-7155/10/1/017105 Typ Journal Article Autor Szabó A Journal Journal of Breath Research Seiten 017105 Link Publikation -
2016
Titel Quantification of selected volatile organic compounds in human urine by gas chromatography selective reagent ionization time of flight mass spectrometry (GC-SRI-TOF-MS) coupled with head-space solid-phase microextraction (HS-SPME) DOI 10.1039/c6an00825a Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Analyst Seiten 4796-4803 Link Publikation -
2016
Titel A Compendium of Volatile Organic Compounds (VOCs) Released By Human Cell Lines DOI 10.2174/0929867323666160510122913 Typ Journal Article Autor Filipiak W Journal Current Medicinal Chemistry Seiten 2112-2131 Link Publikation -
2015
Titel Hybrid Volatolomics and Disease Detection DOI 10.1002/anie.201500153 Typ Journal Article Autor Broza Y Journal Angewandte Chemie International Edition Seiten 11036-11048 -
2015
Titel Trace detection of endogenous human volatile organic compounds for search, rescue and emergency applications DOI 10.1016/j.trac.2014.11.018 Typ Journal Article Autor Agapiou A Journal TrAC Trends in Analytical Chemistry Seiten 158-175 -
2015
Titel Hybride Volatolomik und der Nachweis von Krankheiten DOI 10.1002/ange.201500153 Typ Journal Article Autor Broza Y Journal Angewandte Chemie Seiten 11188-11201 -
2013
Titel Stability of selected volatile breath constituents in Tedlar, Kynar and Flexfilm sampling bags DOI 10.1039/c2an36193k Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Analyst Seiten 1405-1418 Link Publikation -
2013
Titel Release and uptake of volatile organic compounds by human hepatocellular carcinoma cells (HepG2) in vitro DOI 10.1186/1475-2867-13-72 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Cancer Cell International Seiten 72 Link Publikation -
2013
Titel ABA-Cloud: support for collaborative breath research DOI 10.1088/1752-7155/7/2/026007 Typ Journal Article Autor Elsayed I Journal Journal of Breath Research Seiten 026007 Link Publikation -
2013
Titel Blood and breath levels of selected volatile organic compounds in healthy volunteers DOI 10.1039/c3an36756h Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Analyst Seiten 2134-2145 Link Publikation -
2015
Titel Product ion distributions for the reactions of NO+ with some N-containing and O-containing heterocyclic compounds obtained using SRI-TOF-MS DOI 10.1016/j.ijms.2015.06.003 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal International Journal of Mass Spectrometry Seiten 42-46 Link Publikation -
2014
Titel Analysis of Volatile Organic Compounds Liberated and Metabolised by Human Umbilical Vein Endothelial Cells (HUVEC) In Vitro DOI 10.1007/s12013-014-0201-4 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Cell Biochemistry and Biophysics Seiten 323-329 Link Publikation -
2014
Titel Quantitative analysis of volatile organic compounds released and consumed by rat L6 skeletal muscle cells in vitro DOI 10.1088/1752-7155/8/4/046003 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Journal of Breath Research Seiten 046003 Link Publikation -
2018
Titel In vitro profiling of volatile organic compounds released by Simpson-Golabi-Behmel syndrome adipocytes DOI 10.1016/j.jchromb.2018.11.028 Typ Journal Article Autor Mochalski P Journal Journal of Chromatography B Seiten 256-261 Link Publikation -
2018
Titel Sniffing Entrapped Humans with Sensor Arrays DOI 10.1021/acs.analchem.8b00237 Typ Journal Article Autor Gu¨Ntner A Journal Analytical Chemistry Seiten 4940-4945 Link Publikation -
2018
Titel Modeling-based determination of physiological parameters of systemic VOCs by breath gas analysis, part 2 DOI 10.1088/1752-7163/aab2b6 Typ Journal Article Autor Ager C Journal Journal of Breath Research Seiten 036011 Link Publikation