Ein synthetisches Expressionssystem für das T. reesei Xyr1 Regulon (SYNEX)
A synthetic expression platform for the T. reesei Xyr1 regulon (SYNEX)
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
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Xylanase Regulator 1,
Trichoderma reesei,
Gene Regulation,
Transactivator,
Lignocellulose Degrading Enzymes,
Synthetic Biology
Biotreibstoffe der zweitenGeneration(Lignozelluloseethanol)sind eine vielversprechende Alternative zu klassischen fossilen Energiequellen und konkurrieren im Gegensatz zu diesen dessen nicht mit der Versorgung an Nahrungs- und Futtermitteln, noch benötigen sie zusätzliche landwirtschaftliche Nutzflächen. Dieser Vorteil beruht darauf, dass die verwendeten Rohmaterialien lignozellulosehältige Bioabfälle (LBA) sind. Lignozellulose ist der weltweit am häufigsten vorkommende nachwachsende Rohstoff und häuft sich als Abfallprodukt in der Landwirtschaft (z.B. Getreidestroh, Maisstiele, Sojabohnenreste und Bagassse), der Industrie (z.B. der Papierindustrie), der Forstwirtschaft und Holzverarbeitung an und ist in kommunalem Abfall enthalten. Lignozellulose hat schätzungsweise einen ca. Anteil von 50 % an der weltweit vorhandenen Biomasse (dies entspricht 10 50 Mrd. Tonnen). Diese Menge ist mehr als ausreichend um den Bedarf an diesem Rohstoff für die Chemikalien-, Materialen- und Treibstoffherstellung zu decken. Ein kommerzieller Biotreibstoff/Bioraffinerieprozess ist mehrstufig: i) physikalische und/oder chemische Vorbehandlung der LBA (zur Ligninabtrennung und Erhöhung der Wasserlöslichkeit), ii) enzymatische Hydrolyse der LBA (zur Depolymerisierung der (Hemi)zellulose) und iii) Vergärung der so erhaltenen Monosaccharide zu Ethanol. Die Menge an hydrolytischen Enzymen, die für eine effiziente Hydrolyse von LBA benötigt wird, ist sehr hoch unddaher ein kritischer Faktor für dieRentabilität des Produktionsprozesses. Einer der meistverwendeten Organismen zur industriellen Herstellung dieser Enzyme ist der filamentöse Pilz Trichoderma reesei. Derzeit benötigen entsprechende biotechnologischeVerfahrendenZusatz von induzierendenSubstanzenzum Fermentationsmedium von T. reesei zur Aktivierung der Enzymherstellung im Pilz. Diese Induktorsubstanzen müssen in einem weiteren Prozess erzeugt werden, was eine erhebliche Kostensteigerungbewirkt. Darüber hinaus hemmen Glukoseundhohe D- Xylosekonzentrationen (die dominanten Endprodukte der Hydrolyse von LBA) die Enzymproduktion, sogar in Stämmen bei denen die Cre1-vermittelte Kohlenstoffkatabolit- repression eliminiert wurde. Im vorgeschlagenem Projekt sollen diese Nachteile ausgeräumt werden. Konkret ist geplant einen chimären Transaktivator bzw. eine synthetische Signaltransduktionskaskade auf Basis des Xylanase Regulators 1 aus T. reesei, dem humanen Östrogenrezeptor und dem LexA Operator aus Escherichial coli zu konstruieren. Die rekombinanten Stämme, die diesen Faktor bzw. diese Kaskade beinhalten, erlauben es: i) auf eine billigere Induktorsubstanz (Estradiol) zurückzugreifen, ii) wodurch außerdem der zusätzliche Prozessschritt der Induktorerzeugung entfällt, iii) eine Produktion von LBA- hydrolysierenden Enzymen entkoppelt von Kohlenstoffkatabolitrepression, iv) und damit die Verwendung von billigen Kohlenstoffquellen (z.B. Lignocellulosehydrolysate bestehend aus Glukose, D-Xylose und L-Arabinose) für die Produktion von LBA-hydrolysierenden Enzymen.
Während des Forschungsprojektes SYNEX ist es gelungen, eine neue biotechnologische Methode zu entwickeln, um Proteine auf nachhaltige Weise zu produzieren. Der Mikroorganismus, der dazu verwendet wird, ist Trichoderma reesei. Das ist ein saprotropher Pilz, was bedeutet, dass er in der Natur pflanzliche Biomasse, die vor allem aus Lignozellulose besteht, abbaut und auf diese Weise sein eigenes Wachstum ermöglicht sowie seinen Energiebedarf deckt. Lignozellulose ist der weltweit am häufigsten vorkommende nachwachsende Rohstoff und häuft sich als Nebenprodukt in der Landwirtschaft (z.B. Getreidestroh, Maisstiele, Sojabohnenreste), der Industrie (z.B. der Papierindustrie), der Forstwirtschaft und Holzverarbeitung an und ist in kommunalem Abfall enthalten. Damit ist sie eine günstige, nachwachsende und somit nachhaltige Ressource, die angesichts des steigenden Bedarfes der Menschheit an Energie, Rohstoffen und Gütern nicht ungenutzt bleiben sollte. Der oben genannte Pilz ist daher ein idealer Kandidat, um in der Biotechnologie als Produktionsorganismus zum Einsatz zu kommen. Während des Projektes wurden diesem Pilz bestimmte genetische Schaltmechanismen eingefügt, damit dieser ein gewünschtes Protein in großer Menge herstellt, unabhängig davon auf welcher Nährstoffquelle der Pilz wächst. Angeschaltet wird diese Produktion durch Zugabe geringster Mengen des menschlichen Östrogenhormons. Das Spektrum der Proteine, die hergestellt werden können, ist äußerst breit und reicht von Enzymen, die ihrerseits wesentlich zu ökologisch besser vertretbaren Produktionsprozessen (zB durch Reduktion des Einsatzes von Chemikalien) beitragen können, bis hin zu Proteinen, die in der Medizin Anwendung finden.
- Technische Universität Wien - 100%
Research Output
- 462 Zitationen
- 15 Publikationen
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2022
Titel In Vitro Characterization of a Nuclear Receptor-like Domain of the Xylanase Regulator 1 from Trichoderma reesei DOI 10.3390/jof8121254 Typ Journal Article Autor Mello-De-Sousa T Journal Journal of Fungi Seiten 1254 Link Publikation -
2022
Titel CPExtract, a Software Tool for the Automated Tracer-Based Pathway Specific Screening of Secondary Metabolites in LC-HRMS Data DOI 10.1021/acs.analchem.1c04530 Typ Journal Article Autor Seidl B Journal Analytical Chemistry Seiten 3543-3552 Link Publikation -
2022
Titel Gramiketides, Novel Polyketide Derivatives of Fusarium graminearum, Are Produced during the Infection of Wheat DOI 10.3390/jof8101030 Typ Journal Article Autor Seidl B Journal Journal of Fungi Seiten 1030 Link Publikation -
2017
Titel Influence of cis Element Arrangement on Promoter Strength in Trichoderma reesei DOI 10.1128/aem.01742-17 Typ Journal Article Autor Kiesenhofer D Journal Applied and Environmental Microbiology Link Publikation -
2017
Titel Glucose Oxidase Production from Sustainable Substrates DOI 10.2174/2211550105666160712225517 Typ Journal Article Autor Kiesenhofer D Journal Current Biotechnology -
2018
Titel Checkpoint kinase 1 is essential for establishing fetal haematopoiesis and hematopoietic stem and progenitor cell survival DOI 10.1101/413310 Typ Preprint Autor Schuler F Seiten 413310 Link Publikation -
2017
Titel Transcription factor Xpp1 is a switch between primary and secondary fungal metabolism DOI 10.1073/pnas.1609348114 Typ Journal Article Autor Derntl C Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2017
Titel Erythritol as sweetener—wherefrom and whereto? DOI 10.1007/s00253-017-8654-1 Typ Journal Article Autor Regnat K Journal Applied Microbiology and Biotechnology Seiten 587-595 Link Publikation -
2016
Titel Identification of the Main Regulator Responsible for Synthesis of the Typical Yellow Pigment Produced by Trichoderma reesei DOI 10.1128/aem.01408-16 Typ Journal Article Autor Derntl C Journal Applied and Environmental Microbiology Seiten 6247-6257 Link Publikation -
2017
Titel In Vivo Study of the Sorbicillinoid Gene Cluster in Trichoderma reesei DOI 10.3389/fmicb.2017.02037 Typ Journal Article Autor Derntl C Journal Frontiers in Microbiology Seiten 2037 Link Publikation -
2021
Titel CPExtract, a Software for the Automated Tracer-Based Pathway Specific Screening of Secondary Metabolites in LC-HRMS Data DOI 10.1101/2021.10.20.465085 Typ Preprint Autor Seidl B Seiten 2021.10.20.465085 Link Publikation -
2020
Titel Regulatory systems for gene expression control in cyanobacteria DOI 10.1007/s00253-019-10344-w Typ Journal Article Autor Till P Journal Applied Microbiology and Biotechnology Seiten 1977-1991 Link Publikation -
2020
Titel Application of the human estrogen receptor within a synthetic transcription factor in Trichoderma reesei DOI 10.1186/s40694-020-00102-3 Typ Journal Article Autor Derntl C Journal Fungal Biology and Biotechnology Seiten 12 Link Publikation -
2020
Titel Nanoscale Infrared Spectroscopy and Chemometrics Enable Detection of Intracellular Protein Distribution DOI 10.1021/acs.analchem.0c02228 Typ Journal Article Autor Dos Santos A Journal Analytical Chemistry Seiten 15719-15725 Link Publikation -
2019
Titel Fusion transcription factors for strong, constitutive expression of cellulases and xylanases in Trichoderma reesei DOI 10.1186/s13068-019-1575-8 Typ Journal Article Autor Derntl C Journal Biotechnology for Biofuels Seiten 231 Link Publikation