Mikroevolution eines planktischen Süßwasserbakteriums
Microevolution of a planktonic freshwater bacterium studied along a latitudinal gradient
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Freshwater Bacteria,
Population Genomics,
Population Structure,
Microevolution,
Latitudinal Gradient,
Genome
Die Mehrzahl der in Europa vorkommenden Tier- und Pflanzenarten weisen nur eingeschränkte Nord- Süd-Verbreitungen auf. Bei Arten mit breiter Nord-Süd-Verbreitung, aber auch bei Arten mit engeren Verbreitungsgrenzen, wurde festgestellt dass Individuen häufig an die lokalen klimatischen Verhältnisse angepasst sind und sich in ihren spezifischen Anpassungen von Individuen anderer Standorte unterscheiden. Im Gegensatz zu Makroorganismen ist nur wenig über die Biogeographie von Mikroorganismen bekannt, es wird jedoch angenommen, dass die meisten wirtsunabhängigen Mikroorganismen sehr weite Verbreitungen aufweisen. Weiterhin ist weitgehend unbekannt ob Taxa wirtsunabhängige Mikroorganismen Populationen ausbilden, die spezifisch an lokale Standortbedingungen angepasst sind. Wir werden untersuchen ob ein Bakterium, von dem wir wissen, dass es innerhalb Europas eine weite Verbreitung vom Mittelmeergebiet bis Lappland aufweist, Populationen mit Anpassungen an lokale klimatische Bedingungen ausgebildet hat. Die untersuchte Bakterienart lebt in Süßgewässern und repräsentiert eine wichtige Art des Bakterioplanktons. Wir werden Stämme aus Seen isolieren, die entlang eines 3000 km langen Nord-Süd Gradienten quer durch Europa liegen. Die isolierten Stämme werden in standardisierten Laboruntersuchungen auf Unterschiede in ihren physiologischen und biochemischen Anpassungen an die Wachstumstemperatur und UV-Strahlung untersucht. Die Populationsstruktur des Taxons entlang des untersuchten Nord-Süd Gradienten wird durch Genomsequenzierung ausgewählter Vertreter sowie durch Multilokus Sequenz Typisierung (MLST) aller Stämme charakterisiert. Die erhaltenen phänotypischen und genetischen Daten werden die Rekonstruktion mikroevolutionärer Prozesse ermöglichen und werden Einblicke in das Potential dieses Taxons sich an verändernde Umweltbedingungen anzupassen ermöglichen. Insgesamt werden die in diesem Projekt gewonnen Erkenntnisse bessere Vorhersagen der mikoevolutionären Reaktionen aquatischer Bakterien auf den globalen Klimawandel ermöglichen. Weiterhin werden die gewonnenen Erkenntnisse zu einer bedeutenden Erweiterung unseres Verständnisses der mikrobielle Diversität und Biogeographie beitragen.
- Universität Innsbruck - 100%
- Sami Taipale, University of Jyväskylä - Finnland
Research Output
- 152 Zitationen
- 7 Publikationen
- 2 Methoden & Materialien
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2018
Titel Polynucleobacter meluiroseus sp. nov., a bacterium isolated from a lake located in the mountains of the Mediterranean island of Corsica DOI 10.1099/ijsem.0.002777 Typ Journal Article Autor Pitt A Journal International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Seiten 1975-1985 Link Publikation -
2018
Titel Polynucleobacter hirudinilacicola sp. nov. and Polynucleobacter campilacus sp. nov., both isolated from freshwater systems DOI 10.1099/ijsem.0.002880 Typ Journal Article Autor Hahn M Journal International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Seiten 2593-2601 Link Publikation -
2019
Titel Isolation and Cultivation of Bacteria DOI 10.1007/978-3-030-16775-2_10 Typ Book Chapter Autor Hahn M Verlag Springer Nature Seiten 313-351 -
2018
Titel Polynucleobacter paneuropaeus sp. nov., characterized by six strains isolated from freshwater lakes located along a 3000 km north–south cross-section across Europe DOI 10.1099/ijsem.0.003130 Typ Journal Article Autor Hoetzinger M Journal International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Seiten 203-213 Link Publikation -
2022
Titel Fourteen new Polynucleobacter species: P. brandtiae sp. nov., P. kasalickyi sp. nov., P. antarcticus sp. nov., P. arcticus sp. nov., P. tropicus sp. nov., P. bastaniensis sp. nov., P. corsicus sp. nov., P. finlandensis sp. nov., P. ibericus sp. nov., DOI 10.1099/ijsem.0.005408 Typ Journal Article Autor Hahn M Journal International journal of systematic and evolutionary microbiology -
2021
Titel Opening a next-generation black box: Ecological trends for hundreds of species-like taxa uncovered within a single bacterial >99% 16S rRNA operational taxonomic unit DOI 10.1111/1755-0998.13444 Typ Journal Article Autor Hahn M Journal Molecular Ecology Resources Seiten 2471-2485 Link Publikation -
2021
Titel Continental-Scale Gene Flow Prevents Allopatric Divergence of Pelagic Freshwater Bacteria DOI 10.1093/gbe/evab019 Typ Journal Article Autor Hoetzinger M Journal Genome Biology and Evolution Link Publikation
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2019
Titel > 200 Polynucleobacter strains cultivated as pure cultures Typ Biological samples Öffentlich zugänglich -
0
Titel Method for characterization of the composition of Polynucleobacter spp. communities in freshwater systems Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich