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Mikroevolution eines planktischen Süßwasserbakteriums

Microevolution of a planktonic freshwater bacterium studied along a latitudinal gradient

Martin W. Hahn (ORCID: 0000-0003-0501-2556)
  • Grant-DOI 10.55776/P27160
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.06.2015
  • Projektende 31.05.2019
  • Bewilligungssumme 295.765 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Freshwater Bacteria, Population Genomics, Population Structure, Microevolution, Latitudinal Gradient, Genome

Abstract

Die Mehrzahl der in Europa vorkommenden Tier- und Pflanzenarten weisen nur eingeschränkte Nord- Süd-Verbreitungen auf. Bei Arten mit breiter Nord-Süd-Verbreitung, aber auch bei Arten mit engeren Verbreitungsgrenzen, wurde festgestellt dass Individuen häufig an die lokalen klimatischen Verhältnisse angepasst sind und sich in ihren spezifischen Anpassungen von Individuen anderer Standorte unterscheiden. Im Gegensatz zu Makroorganismen ist nur wenig über die Biogeographie von Mikroorganismen bekannt, es wird jedoch angenommen, dass die meisten wirtsunabhängigen Mikroorganismen sehr weite Verbreitungen aufweisen. Weiterhin ist weitgehend unbekannt ob Taxa wirtsunabhängige Mikroorganismen Populationen ausbilden, die spezifisch an lokale Standortbedingungen angepasst sind. Wir werden untersuchen ob ein Bakterium, von dem wir wissen, dass es innerhalb Europas eine weite Verbreitung vom Mittelmeergebiet bis Lappland aufweist, Populationen mit Anpassungen an lokale klimatische Bedingungen ausgebildet hat. Die untersuchte Bakterienart lebt in Süßgewässern und repräsentiert eine wichtige Art des Bakterioplanktons. Wir werden Stämme aus Seen isolieren, die entlang eines 3000 km langen Nord-Süd Gradienten quer durch Europa liegen. Die isolierten Stämme werden in standardisierten Laboruntersuchungen auf Unterschiede in ihren physiologischen und biochemischen Anpassungen an die Wachstumstemperatur und UV-Strahlung untersucht. Die Populationsstruktur des Taxons entlang des untersuchten Nord-Süd Gradienten wird durch Genomsequenzierung ausgewählter Vertreter sowie durch Multilokus Sequenz Typisierung (MLST) aller Stämme charakterisiert. Die erhaltenen phänotypischen und genetischen Daten werden die Rekonstruktion mikroevolutionärer Prozesse ermöglichen und werden Einblicke in das Potential dieses Taxons sich an verändernde Umweltbedingungen anzupassen ermöglichen. Insgesamt werden die in diesem Projekt gewonnen Erkenntnisse bessere Vorhersagen der mikoevolutionären Reaktionen aquatischer Bakterien auf den globalen Klimawandel ermöglichen. Weiterhin werden die gewonnenen Erkenntnisse zu einer bedeutenden Erweiterung unseres Verständnisses der mikrobielle Diversität und Biogeographie beitragen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Sami Taipale, University of Jyväskylä - Finnland

Research Output

  • 152 Zitationen
  • 7 Publikationen
  • 2 Methoden & Materialien
Publikationen
  • 2018
    Titel Polynucleobacter meluiroseus sp. nov., a bacterium isolated from a lake located in the mountains of the Mediterranean island of Corsica
    DOI 10.1099/ijsem.0.002777
    Typ Journal Article
    Autor Pitt A
    Journal International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
    Seiten 1975-1985
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Polynucleobacter hirudinilacicola sp. nov. and Polynucleobacter campilacus sp. nov., both isolated from freshwater systems
    DOI 10.1099/ijsem.0.002880
    Typ Journal Article
    Autor Hahn M
    Journal International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
    Seiten 2593-2601
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Isolation and Cultivation of Bacteria
    DOI 10.1007/978-3-030-16775-2_10
    Typ Book Chapter
    Autor Hahn M
    Verlag Springer Nature
    Seiten 313-351
  • 2018
    Titel Polynucleobacter paneuropaeus sp. nov., characterized by six strains isolated from freshwater lakes located along a 3000 km north–south cross-section across Europe
    DOI 10.1099/ijsem.0.003130
    Typ Journal Article
    Autor Hoetzinger M
    Journal International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
    Seiten 203-213
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Fourteen new Polynucleobacter species: P. brandtiae sp. nov., P. kasalickyi sp. nov., P. antarcticus sp. nov., P. arcticus sp. nov., P. tropicus sp. nov., P. bastaniensis sp. nov., P. corsicus sp. nov., P. finlandensis sp. nov., P. ibericus sp. nov.,
    DOI 10.1099/ijsem.0.005408
    Typ Journal Article
    Autor Hahn M
    Journal International journal of systematic and evolutionary microbiology
  • 2021
    Titel Opening a next-generation black box: Ecological trends for hundreds of species-like taxa uncovered within a single bacterial >99% 16S rRNA operational taxonomic unit
    DOI 10.1111/1755-0998.13444
    Typ Journal Article
    Autor Hahn M
    Journal Molecular Ecology Resources
    Seiten 2471-2485
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Continental-Scale Gene Flow Prevents Allopatric Divergence of Pelagic Freshwater Bacteria
    DOI 10.1093/gbe/evab019
    Typ Journal Article
    Autor Hoetzinger M
    Journal Genome Biology and Evolution
    Link Publikation
Methoden & Materialien
  • 2019
    Titel > 200 Polynucleobacter strains cultivated as pure cultures
    Typ Biological samples
    Öffentlich zugänglich
  • 0
    Titel Method for characterization of the composition of Polynucleobacter spp. communities in freshwater systems
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich

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