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Charakterisierung von Vibrio cholerae Biofilmen

Characterization of Genes induced during Biofilm formation of Vibrio cholerae

Stefan Schild (ORCID: 0000-0001-7842-0177)
  • Grant-DOI 10.55776/P27654
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2016
  • Projektende 31.12.2020
  • Bewilligungssumme 328.692 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Biofilm, Vibrio cholerae, Cholera

Abstract Endbericht

Die schwere Durchfallerkrankung Cholera wird durch das fakultativ human-pathogene Bakterium Vibrio cholerae verursacht. Der Lebenszyklus von klinisch relevanten V. cholerae Isolaten ist vom ständigen Wechsel zwischen zwei sehr unterschiedlichen Lebensweisen geprägt: Als natürlicher Bewohner der aquatischen Umwelt und als Krankheitserreger im menschlichen Gastrointestinaltrakt.Ein entscheidender Faktor für das Überleben in der Umwelt ist die Biofilmbildung. Neueste Studien lassen vermuten, dass Biofilme auch einen effizienten Weg darstellen, um hohe Keimzahlen auf den nächsten Wirt zu übertragen. Daher tragen Biofilme von V. cholerae ebenso zur Verbreitung der Krankheit Cholera bei. Unter Verwendung eines Reportergen-Systems haben wir während der vorangegangenen Förderperiode erfolgreich Gene identifiziert, welche während der Biofilmbildung von V. cholerae induziert werden. Im Rahmen dieses Projektantrages sollen nun die zwei interessantesten Kaskaden näher untersucht werden. Dazu zählt zum einen die metabolische Verwertung von extrazellulärer DNA (eDNA) als wichtige Matrixkomponente im Biofilm und abundante Nahrungsquelle entlang des Lebenszyklus von V. cholerae. Dabei konnten wir bislang aufzeigen, dass durch die Aktivität der zwei extrazellulären Nukleasen von V. cholerae eDNA zu Nukleotiden abgebaut und somit als Nahrungsquelle genutzt werden kann. Der vorliegende Antrag soll sich nun mit der in weiterer Folge notwendigen Dephosphorylierung der Nukleotide zu Nukleosiden, sowie dem Transport der Nukleoside in die Zelle beschäftigen.Erste Ergebnisse unseres Labors deuten darauf hin, dass V. cholerae 3 Nukleosidtransporter mit unterschiedlicher Nukleobasenspezifität besitzt. Im Gegensatz zu anderen bakteriellen Nukleosidtransportern sind diese Na+-abhängig und ähneln daher eher den humanen Vertretern, welche wichtige Ziele für Chemotherapeutika sind. Weiterhin wollen wir die transkriptionelle Regulation der beteiligten Enzyme und die physiologische Relevanz der Verstoffwechslung von eDNA entlang des Lebenszyklus untersuchen. Zum anderen identifizierte unser Labor zwei O-Glykosyltransferasen (O-OTasen), welche spezifisch im Biofilm induziert sind. Dies deutet auf eine bislang unbekannte O-Glykosylierung von Proteinen bei V. cholerae hindeutet. In der Tat führt die Mutation der O-OTasen zu einer veränderten Biofilmbildung und Morphologie. Vorläufige Daten aus unserem Labor lassen vermuten, dass insbesondere die extrazellulären Proteine der Biofilmmatrix wichtige Ziele der O-OTasen sind. Ziel der zweiten Aktivität im Antrag ist die Erforschung der genauen Interaktionspartner, des transferierten Glycans, sowie die Regulation der O-OTasen. Weiterhin soll die Rolle der O-Glykosylierung für Fitness von V. cholerae in der Umwelt und in vivo charakterisiert werden. Die Ergebnisse dieser Studie werden das Verständnis der Physiologie und Biofilmbildung von V. cholerae und eventuell auch anderer Bakterien verbessern. Idealerweise wird dies die Entwicklung neuer therapeutischer Ansätze beschleunigen, die auf die Persistenz und übertragbaren Formen von pathogenenBakterienwie V. cholerae abzielen. Zudemkönnendie Resultate der Nukleosidtransporter bei der Entwicklung neuer Chemotherapeutika eingesetzt werden.

Die schwere Durchfallerkrankung Cholera wird durch das fakultativ human-pathogene Bakterium Vibrio cholerae verursacht. Der Lebenszyklus von klinisch relevanten V. cholerae Isolaten ist vom ständigen Wechsel zwischen zwei sehr unterschiedlichen Lebensweisen geprägt: Als natürlicher Bewohner der aquatischen Umwelt und als Krankheitserreger im menschlichen Gastrointestinaltrakt. Ein entscheidender Faktor für das Überleben in der Umwelt ist die Biofilmbildung. Neueste Studien lassen vermuten, dass Biofilme auch einen effizienten Weg darstellen, um hohe Keimzahlen auf den nächsten Wirt zu übertragen. Daher tragen Biofilme von V. cholerae ebenso zur Verbreitung der Krankheit Cholera bei. Unter Verwendung eines Reportergen-Systems haben wir während der vorangegangenen Förderperiode erfolgreich Gene identifiziert, welche während der Biofilmbildung von V. cholerae induziert werden. Im Rahmen dieses Folgeprojektes wurden nun zwei Kaskaden näher untersucht. Dazu zählt zum einen die metabolische Verwertung von extrazellulärer DNA (eDNA) als wichtige Matrixkomponente im Biofilm und abundante Nahrungsquelle entlang des Lebenszyklus von V. cholerae. Zum anderen identifizierte unser Labor zwei O-Glykosyltransferasen (O-OTasen), welche spezifisch im Biofilm induziert sind. In silico-Analysen identifizierten mehrere periplasmatische Kandidaten für die Dephosphorylierung von Nukleotiden zu Nukleosiden, aber experimentelle Beweise fehlten. Basierend auf bioinformatischen Daten haben wir drei ORFs identifiziert, die für Nukleosidtransporter kodieren und bestätigt, dass alle drei funktionsfähig sind. Darüber hinaus haben wir ihre Regulation, Kinetik und Spezifität charakterisiert. Aktivität 1 des Forschungsvorhabens charakterisierte nicht nur umfassend die Nukleotidnutzung in V. cholerae, sondern auch deren Einfluss auf die V. cholerae-Fitness in verschiedenen Phasen des Lebenszyklus. Weiterhin identifizierten wir zwei mutmaßliche O-Oligosaccharyltransferasen (O-OTasen) von V. cholerae, die im Biofilm induziert sind. Wir konnten zeigen, dass die O-Glykosylierung einen Einfluss auf die Biofilmbildung in V. cholerae durch Interferenz mit sezernierten Typ-2-Effektoren hat. Da die O-Glykosylierung in Bakterien ein relativ neues Forschungsgebiet ist, haben wir die physiologische Rolle der O-Glykosylierung für V. cholerae näher untersucht und konnten einen globalen Beitrag zur Sekretion von Typ-2-Effektoren, u.a. des Choleratoxins, aufdecken.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Graz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Andrew Camilli, Tufts University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Mario F. Feldman, Washington University in St. Louis - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 566 Zitationen
  • 15 Publikationen
  • 7 Disseminationen
  • 7 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2019
    Titel Characterization of Vibrio cholerae’s Extracellular Nuclease Xds
    DOI 10.3389/fmicb.2019.02057
    Typ Journal Article
    Autor Pressler K
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 2057
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Regulated Proteolysis in Vibrio cholerae Allowing Rapid Adaptation to Stress Conditions
    DOI 10.3389/fcimb.2019.00214
    Typ Journal Article
    Autor Pennetzdorfer N
    Journal Frontiers in Cellular and Infection Microbiology
    Seiten 214
    Link Publikation
  • 2019
    Titel A Broad Spectrum Protein Glycosylation System Influences Type II Protein Secretion and Associated Phenotypes in Vibrio cholerae
    DOI 10.3389/fmicb.2019.02780
    Typ Journal Article
    Autor Vorkapic D
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 2780
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Outer Membrane Vesiculation Facilitates Surface Exchange and In Vivo Adaptation of Vibrio cholerae
    DOI 10.1016/j.chom.2019.12.002
    Typ Journal Article
    Autor Zingl F
    Journal Cell Host & Microbe
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Vibrio cholerae Released by Protozoa are Hyperinfectious
    DOI 10.1016/j.tim.2019.11.003
    Typ Journal Article
    Autor Mitterer F
    Journal Trends in Microbiology
    Seiten 4-6
  • 2018
    Titel In vivo repressed genes of Vibrio cholerae reveal inverse requirements of an H+/Cl- transporter along the gastrointestinal passage
    DOI 10.1073/pnas.1716973115
    Typ Journal Article
    Autor Cakar F
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Genes Activated by Vibrio cholerae upon Exposure to Caenorhabditis elegans Reveal the Mannose-Sensitive Hemagglutinin To Be Essential for Colonization
    DOI 10.1128/mspheredirect.00238-18
    Typ Journal Article
    Autor List C
    Journal mSphere
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Comparative analyses of biofilm formation among different Cutibacterium acnes isolates
    DOI 10.1016/j.ijmm.2018.09.005
    Typ Journal Article
    Autor Kuehnast T
    Journal International Journal of Medical Microbiology
    Seiten 1027-1035
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Silence is golden: gene silencing of V. cholerae during intestinal colonization delivers new aspects to the acid tolerance response
    DOI 10.1080/19490976.2018.1502538
    Typ Journal Article
    Autor Cakar F
    Journal Gut Microbes
    Seiten 228-234
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Biogenesis of Gram-Negative OMVs
    DOI 10.1007/978-3-030-36331-4_2
    Typ Book Chapter
    Autor Zingl F
    Verlag Springer Nature
    Seiten 23-46
  • 2021
    Titel sE controlled regulation of porin OmpU in Vibrio cholerae
    DOI 10.1111/mmi.14669
    Typ Journal Article
    Autor Pennetzdorfer N
    Journal Molecular Microbiology
    Seiten 1244-1261
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Biofilms by bacterial human pathogens: Clinical relevance – development, composition and regulation – therapeutical strategies
    DOI 10.15698/mic2021.02.741
    Typ Journal Article
    Autor Schulze A
    Journal Microbial Cell
    Seiten 28
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Outer Membrane Vesicles of Vibrio cholerae Protect and Deliver Active Cholera Toxin to Host Cells via Porin-Dependent Uptake
    DOI 10.1128/mbio.00534-21
    Typ Journal Article
    Autor Zingl F
    Journal mBio
    Link Publikation
  • 2016
    Titel AAA+ proteases and their role in distinct stages along the Vibrio cholerae lifecycle
    DOI 10.1016/j.ijmm.2016.05.013
    Typ Journal Article
    Autor Pressler K
    Journal International Journal of Medical Microbiology
    Seiten 452-462
  • 2015
    Titel Nucleoside uptake in Vibrio cholerae and its role in the transition fitness from host to environment
    DOI 10.1111/mmi.13143
    Typ Journal Article
    Autor Gumpenberger T
    Journal Molecular Microbiology
    Seiten 470-483
    Link Publikation
Disseminationen
  • 2019
    Titel Grazer forschen an Therapie gegen Cholera
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
  • 2018
    Titel Research ethic workshop
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2012
    Titel German as foreign language
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2016
    Titel Wie der Cholera-Erreger zu Nahrung kommt
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
  • 2016
    Titel Scientifc writing workshop
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2018
    Titel Grazer Forscher decodierten Schlüsselenzym des Cholera-Erregers
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
  • 2018
    Titel Long night of research
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2023
    Titel Invited Speaker: Symposium on Microbial Extracellular vesicles @ Institut Pasteur, Paris
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel International conference: Extracellular vesicles: friends and foes, Weizmann Institute of Science, Rehovot (Israel)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Invited Speaker: Host Pathogen Interaction Meeting III, Rio de Janeiro (Brazil)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2021
    Titel Invited Speaker: EMBO Workshop | Bacterial Membrane Vesicles (BMVs)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Frontiers in microbiology
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Microbial cell
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Invited Speaker: Gordon Research - Conference: Microbial Toxins and Pathogenicity. Waterville Valley (USA)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2016
    Titel Immunotherapy against P. acnes for treatment of acne vulgaris and implant associated infections
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2016
    Geldgeber Austrian Research Promotion Agency

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