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Palmitoylierung in der frühen T-Zell Signaltransduktion

Effect of Palmitoylation on early T-cell signaling

Florian Baumgart (ORCID: 0000-0003-1352-8632)
  • Grant-DOI 10.55776/P27941
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.05.2015
  • Projektende 30.06.2019
  • Bewilligungssumme 264.002 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (50%)

Keywords

    T-Cell Activation, Super-Resolution Microscopy, Protein Palmitoylation, Single molecule Microscopy

Abstract Endbericht

Die Aktivierung von T-Lymphozyten beruht auf der molekularen Erkennung von Peptid-MHC-Komplexen (pMHC) auf einer antigenpräsentierenden Zelle durch den T-Zell-Rezeptor (TCR). Durch die Bindung des TCR an pMHC verändern die Komponenten der T-Zell-Aktivierungsmaschinerie an der Zellmembran ihre räumliche Anordnung und es kommt zur Phosphorylierung mehrerer Tyrosine an TCR-assoziiertem CD3 durch die Kinase Lck. Diese anfänglichen Phosphorylierungen haben zur Folge, dass zunächst weitere Signaltransduktionsproteine binden können, was schlussendlich zur Aktivierung der T-Zelle führt. Lck ist folglich absolut essentiell für das Zustandekommen einer T-Zell-Antwort. Wenngleich die Abfolge der molekularen Prozesse, die zur T-Zell-Aktivierung führen, weitreichend untersucht worden ist, fehlt bis heute immer noch ein detailliertes mechanistisches Verständnis dafür, wie die räumliche Anordnung der verschiedenen Signaltransduktionskomponenten deren Funktion steuert. Lck besitzt einen N-terminalen Membrananker, der es an die Zellmembran bindet und dadurch notwendig für seine Funktion ist. Der Membrananker besteht aus drei Lipidmodifikationen: einer irreversibel gebundenen Myristinsäure- und zwei reversibel gebundenen Palmitinsäureketten. Die Modifikation durch drei Lipide erscheint interessant, da im Prinzip die Myristinsäure in Kombination mit einer einzigen Palmitinsäurekette ausreichen würde, um Lck fest in der Membran zu verankern. Des Weiteren sollten Wechselwirkungen zwischen Lck und den Corezeptoren CD4 und CD8, die beide Transmembranproteine sind, die Acylierung von Lck obsolet machen. Interessanterweise sind CD4 und CD8 sowie andere Moleküle, die die Aktivität von Lck modulieren, ebenfalls palmitoyliert. Einige von ihnen, wie CD4 und CD8, sind Transmembranproteine, in welchen die Funktion der Palmitoylierung nicht offensichtlich ist. Gleichzeitig haben Studien, die sich mit der Palmitoylierung von CD4 und CD8 beschäftigt haben, widersprüchliche Ergebnisse geliefert. Im gegenwärtige Projekt soll ein fundamentales Verständnis darüber gewonnen werden, wie die Palmitoylierung von Signaltransduktionsmolekülen in der T-Zell-Aktivierung deren räumliche Anordnung und Funktionalität moduliert. In der Vergangenheit wurde Palmitoylierung von Proteinen hauptsächlich mit biochemischen Methoden oder klassischer beugungsbegrenzter Lichtmikroskopie untersucht. Im vorliegenden Projekt wird Einzelmolekülmikroskopie in einem murinen primären T-Zell Modellsystem angewendet, um die noch unerforschten molekularen Mechanismen zu klären,durch die die Palmitoylierung von Signaltransduktionskomponenten die T-Zell-Aktivierung reguliert.

Im Laufe einer Infektion erkennen T-Zellen fremdartiges Antigen und reagieren darauf mit einer spezifische Immunantwort, um potentiell schädliche Eindringlinge zu beseitigen. Dieser Erkennungsprozess wird durch die räumliche Organisation der T-Zellmembran beeinflusst. Ziel des vorliegenden Projekts war es zu erforschen, wie die Organisation von bestimmten Membranproteinen von T-Zellen in sogenannten Nanoclustern, d.h. Anhäufungen von Proteinen auf kleinstem Raum (innerhalb weniger nm), reguliert ist und wie diese die Funktionsweise von T-Zellen regulieren. Um Nanocluster zu detektieren und zu charakterisieren, entschieden wir uns für die Verwendung von Einzelmolekül-Lokalisierungs-Mikroskopie (SMLM, aus dem Engl.: single molecule localization microscopy), die es erlaubt zelluläre Strukturen in der Größe von ~20 nm oder weniger Radius optisch aufzulösen. Diese Technik kann jedoch auch durch Artefakte beeinträchtigt werden, die die quantitative Interpretation der Bilddaten beeinträchtigen können, insbesondere in Bezug auf Rückschlüsse auf die lokale räumliche Verteilung von Molekülen, wie zum Beispiel Nanoclustern. Obwohl diese Problematik schon seit Längerem bekannt war, gab es keine idealen Strategien zur Korrektur. Während das ursprüngliche Ziel des vorliegenden Projekts in der Charakterisierung von Nanoclustern in T-Zellen bestand, zeigten die ersten Versuche, dass publizierte Daten aus der Literatur, die die Basis für das Projekt bildeten, möglicherweise die Tragweite der unterschiedlichen Artefaktquellen unterschätzt hatten. Aus diesem Grund änderten wir den Fokus des Projekts und entwickelten eine neuartige experimentelle Strategie, um Nanocluster in SMLM Bildern zu detektieren. Im Weiteren verwendeten wir in weiterer Folge die von uns entwickelte Methode, um wichtige T-Zellproteine zu untersuchen. Unsere Ergebnisse zeigten letztendlich, dass Nanocluster weit weniger häufig vorkommen als ursprünglich angenommen. Aus diesem Grund legt unsere Arbeit den Grundstein dafür, die derzeitigen Modelle zur Aktivierung von T-Zellen und des adaptiven Immunsystems zu revidieren.

Forschungsstätte(n)
  • Technische Universität Wien - 100%

Research Output

  • 490 Zitationen
  • 16 Publikationen
  • 2 Disseminationen
Publikationen
  • 2020
    Titel Verifying molecular clusters by 2-color localization microscopy and significance testing
    DOI 10.1038/s41598-020-60976-6
    Typ Journal Article
    Autor Arnold A
    Journal Scientific Reports
    Seiten 4230
    Link Publikation
  • 2019
    Titel A micropatterning platform for quantifying interaction kinetics between the T cell receptor and an intracellular binding protein
    DOI 10.1038/s41598-019-39865-0
    Typ Journal Article
    Autor Motsch V
    Journal Scientific Reports
    Seiten 3288
    Link Publikation
  • 2019
    Titel How T Cells Do the “Search for the Needle in the Haystack”
    DOI 10.3389/fphy.2019.00011
    Typ Journal Article
    Autor Baumgart F
    Journal Frontiers in Physics
    Seiten 11
    Link Publikation
  • 2016
    Titel An Organelle Sizer Based on Local Image Correlation Spectroscopy Detects Changes in Subcellular Morphology
    DOI 10.1016/j.bpj.2015.11.2592
    Typ Journal Article
    Autor Scipioni L
    Journal Biophysical Journal
  • 2016
    Titel Varying label density allows artifact-free analysis of membrane-protein nanoclusters
    DOI 10.1038/nmeth.3897
    Typ Journal Article
    Autor Baumgart F
    Journal Nature Methods
    Seiten 661-664
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Nanoscale Spatial Organization of Chromatin in its Cellular Context, from Telomeres to Hox
    DOI 10.1016/j.bpj.2015.11.2591
    Typ Journal Article
    Autor Manley S
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Opioid Receptors are Organized into Nanodomains in the Plasma Membrane
    DOI 10.1016/j.bpj.2015.11.2587
    Typ Journal Article
    Autor Golfetto O
    Journal Biophysical Journal
  • 2016
    Titel Improved Photo Physical Properties of mEos3 for Single Molecule Tracking
    DOI 10.1016/j.bpj.2015.11.2596
    Typ Journal Article
    Autor Needham L
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2018
    Titel TCRs are randomly distributed on the plasma membrane of resting antigen-experienced T cells
    DOI 10.1038/s41590-018-0162-7
    Typ Journal Article
    Autor Rossboth B
    Journal Nature Immunology
    Seiten 821-827
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Monomeric TCRs drive T cell antigen recognition
    DOI 10.1038/s41590-018-0092-4
    Typ Journal Article
    Autor Brameshuber M
    Journal Nature Immunology
    Seiten 487-496
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Unscrambling Fluorophore Blinking for Comprehensive Cluster Detection via Photoactivated Localization Microscopy
    DOI 10.1101/545152
    Typ Preprint
    Autor Platzer R
    Seiten 545152
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Verifying molecular clusters by 2-color localization microscopy and significance testing
    DOI 10.1101/847012
    Typ Preprint
    Autor Arnold A
    Seiten 847012
    Link Publikation
  • 2018
    Titel What we talk about when we talk about nanoclusters
    DOI 10.1088/2050-6120/aaed0f
    Typ Journal Article
    Autor Baumgart F
    Journal Methods and Applications in Fluorescence
    Seiten 013001
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Unscrambling fluorophore blinking for comprehensive cluster detection via photoactivated localization microscopy
    DOI 10.1038/s41467-020-18726-9
    Typ Journal Article
    Autor Platzer R
    Journal Nature Communications
    Seiten 4993
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Interleukin-33 stimulates GM-CSF and M-CSF production by human endothelial cells
    DOI 10.1160/th15-12-0917
    Typ Journal Article
    Autor Montanari E
    Journal Thrombosis and Haemostasis
    Seiten 317-327
  • 2014
    Titel Detecting protein association at the T cell plasma membrane
    DOI 10.1016/j.bbamcr.2014.09.026
    Typ Journal Article
    Autor Baumgart F
    Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research
    Seiten 791-801
    Link Publikation
Disseminationen
  • 2016
    Titel Effects of the Project Beyond the Scientific Field
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
  • 2015
    Titel Talks, seminars and presentations
    Typ A talk or presentation

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