Altersbedingte Treibermutationen in der männlichen Keimbahn
Age-related mutagenesis of driver genes in the male germline
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (45%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (55%)
Keywords
-
Ultra-Sensitive Sequencing,
Mutations,
Germline,
Paternal Age Effect,
Driver Genes,
Duplex Sequencing
Neue Mutationen in den Keimbahnen werden direkt an unsere Kinder weitergegeben und haben daher tiefgreifende Konsequenzen für künftige Generationen. Jedoch wissen wir immer noch überraschend wenig über Mutationsprozesse in unseren Keimbahnen. Jüngste Fortschritte in der individuellen Genomsequenzierung zeigten, dass die Mehrheit der neuen Mutationen aus der männlichen Keimbahn stammt und die Anzahl dieser neuen Mutationen auch mit den väterlichen Alter zunimmt. Aufgrund der Einschränkungen der gegenwärtigen Technologien, haben wir jedoch bisher keinen Einblick auf einzelne mutagene Ereignisse, die notwendig sind, um eine einzigartige Art von Mutagenese zu untersuchen: die Verbreitung von egoistischen oder Treibermutationen die ihr eigenes Wachstum fördern und auch im Kontext von Krebs gut bekannt sind. Bisher sind nur eine Handvoll von Treibermutationen in den männlichen Keimbahnen beschrieben worden, jedoch könnten Treibermutationen, die meistens mit genetische Krankheiten verbunden sind, sich sehr schnell verbreiten, und drastisch mit väterlichem Alter zunehmen, sehr häufig sein. Wir haben eine neue, hochempfindliche Sequenzierungstechnologie mit extrem niedrigen Fehlerraten angepasst, um Treibermutationen in ausgewählten Genen in den männlichen Keimbahnen zu identifizieren. Diese werden dann mit unserer einzelmolekül-, digitale PCR-Methode analysiert und charakterisiert. Mit diesen einzigartigen Know-how in ultrasensitiven Methoden, um seltene Mutationen zu erkennen, ist es Ziel dieses Projektes: 1) Durch die Sequenzierung kleiner Genomabschnitte Treibermutationen in den männlichen Keimbahnen zu entdecken; 2) die Verbreitung dieser Mutationen mit dem Alter in den männlichen Hoden zu untersuchen, und 3) die Zunahme und Transmissionsmuster der Mutationen in männlichenSamenzellenvon unterschiedlichen Altersgruppen zu analysieren. Dieses Projekt ist die erste groß umfassende Analyse von Treibermutationen in den männlichen Keimbahnen und schafft somit eine wichtige Grundlage um diese Art von Mutagenese zu verstehen, um auch das verbundene Risiko des verspäteten Kinderwunsches in unserer Gesellschaft zu bewerten.
Neue Mutationen in den Keimbahnen werden direkt an unsere Kinder weitergegeben und haben daher tiefgreifende Konsequenzen für künftige Generationen. Insbesondere treten Treibermutationen in der männlichen Keimbahn gehäuft auf und führen oft zu angeborenen Störungen. Bislang war das Wissen über diese einzigartige Art von Mutagenese sehr beschränkt, da die Identifizierung dieser Mutationen ist aufgrund ihrer geringen Häufigkeit schwierig ist. In dieser Studie wurde eine hochempfindliche Sequenzierungstechnologie mit niedrigen Fehlerquoten entwickelt, und mit einer digitaler Hochdurchsatz-PCR kombiniert, um diese Treibermutationen und dessen die Ausbreitung in den männlichen Keimbahnen zu charakterisieren. Die Studie ergab einen umfangreichen Datensatz von Mutationen, die in der Spermien-DNA von Spendern unterschiedlichen Alters angereichert sind. Darüber hinaus wurden in dieser Studie neue Substitutionen in den Genen FGFR3, Erbb2 und p53, allesamt bekannte Onkogene, identifiziert, die unterschiedliche Akkumulationsmuster mit dem Alter erkennen lassen. Einige Mutationen nahmen mit dem Alter zu, während andere vor der Geschlechtsreife auftraten und auch mit dem Alter der männlichen Keimbahnen konstant blieben. Ein weiteres bemerkenswertes Ergebnis war die beobachtete Diskordanz zwischen der Mutationshäufigkeit in Hoden und Spermien bei zwei Mutationen mit unterschiedlichem Schweregrad, was das komplexe Zusammenspiel dieser Mutationen in der meiotischer Differenzierung verdeutlicht. Darüber hinaus wurde die Auswirkung der Mutationen auf die Proteinfunktion mit biophysikalischen Methoden analysiert. Diese Studie legt daher wichtige Grunderkenntnisse der molekularen Mechanismen, die der Ausbreitung und Weitergabe pathogener Treibermutationen in der männlichen Keimbahn zugrunde liegen, um auch das verbundene Risiko des verspäteten Kinderwunsches in unserer Gesellschaft zu bewerten.
- Universität Linz - 100%
- Kateryna D. Makova, Penn State University - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 75 Zitationen
- 8 Publikationen
- 3 Datasets & Models
- 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 3 Weitere Förderungen
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2020
Titel Family reunion via error correction: an efficient analysis of duplex sequencing data DOI 10.1186/s12859-020-3419-8 Typ Journal Article Autor Stoler N Journal BMC Bioinformatics Seiten 96 Link Publikation -
2024
Titel Exploring the Micro-Mosaic Landscape of FGFR3 Mutations in the Ageing Male Germline and Its Implications in Meiotic Differentiation DOI 10.20944/preprints202401.0347.v1 Typ Preprint Autor Striedner Y Link Publikation -
2022
Titel Activating mutations in FGFR3 are associated with clonal expansion events and high de novo rates in the male germline DOI 10.1101/2022.07.31.502216 Typ Preprint Autor Moura S Seiten 2022.07.31.502216 Link Publikation -
2020
Titel Pathogenic postzygotic mosaicism in the tyrosine receptor kinase pathway: potential unidentified human disease hidden away in a few cells DOI 10.1111/febs.15528 Typ Journal Article Autor Tiemann-Boege I Journal The FEBS Journal Seiten 3108-3119 Link Publikation -
2022
Titel Measurement of FGFR3 signaling at the cell membrane via total internal reflection fluorescence microscopy to compare the activation of FGFR3 mutants DOI 10.1016/j.jbc.2022.102832 Typ Journal Article Autor Hartl I Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 102832 Link Publikation -
2022
Titel High prevalence of somatic PIK3CA and TP53 pathogenic variants in the normal mammary gland tissue of sporadic breast cancer patients revealed by duplex sequencing DOI 10.1038/s41523-022-00443-9 Typ Journal Article Autor Kostecka A Journal npj Breast Cancer Seiten 76 Link Publikation -
2022
Titel Discovery of an unusually high number of de novo mutations in sperm of older men using duplex sequencing DOI 10.1101/gr.275695.121 Typ Journal Article Autor Salazar R Journal Genome Research Seiten 499-511 Link Publikation -
2021
Titel Increased yields of duplex sequencing data by a series of quality control tools DOI 10.1093/nargab/lqab002 Typ Journal Article Autor Povysil G Journal NAR Genomics and Bioinformatics Link Publikation
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2023
Titel Invited speaker at the Environmental Mutagenesis and Genomics Society (EMGS), Chicago, USA Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International
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2019
Titel REGGEN Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2019 Geldgeber European Commission European Regional Development Fund (ERDF) -
2018
Titel DK NanoCell Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2018 -
2022
Titel SFB Meiosis Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2022