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Biokatalytischer Cobalt-Methyltransfer zur De/Methylierung

Biocatalytic cobalt methyl transfer for de/methylation

Wolfgang Kroutil (ORCID: 0000-0002-2151-6394)
  • Grant-DOI 10.55776/P30920
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2018
  • Projektende 30.04.2021
  • Bewilligungssumme 308.779 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (30%); Chemie (25%); Industrielle Biotechnologie (45%)

Keywords

    Biocatalysis, Biotransformation, Bio-Methylation, Cobalamin-Dependent Methyltransferases, Bio-Demethylation, C-O bond formation

Abstract Endbericht

Obwohl die Methylgruppe nur geringfügig zu Masse und Größe eines organischen Moleküls beiträgt, kann ihre Einführung oder Entfernung bedeutsame Auswirkungen auf dessen physikalische und phar- makologische Eigenschaften haben. Deshalb sind Methylierung und Demethylierung häufig angestreb- te Reaktionen in Bezug auf die Synthese von Arzneistoffen, chemischen Produkten und Intermediaten. Allerdings bedürfen konventionelle chemische Methoden üblicherweise der Verwendung von gefähr- lichen Reagenzien; die Entwicklung von nachhaltigeren Strategien ist demnach wünschenswert. Dies- bezüglich würde der Einsatz cobalaminabhängiger Methyltransferasesysteme eine grüne Alternative bieten. Bisher wurde nur eine beschränkte Anzahl von entsprechenden Systemen für die Demethylie- rung charakterisiert, und ihr Potential für biotechnologische Anwendungen ist kaum erforscht. Wäh- rend die natürliche Methyltransferreaktion vier verschiedene Proteine involviert, fokussiert dieses Projekt einen neuartigen Ansatz basierend auf der Verwendung von nur zwei Enzymen. Sowohl Demethylierung eines Donormoleküls als auch Methylierung eines Akzeptors werden von Methyl- transferase I katalysiert, während das Corrinoidprotein als Transporter der Methylgruppe fungiert. Da der Cobalamincofactor im sauerstoffempfindlichen katalytischem Zyklus regeneriert wird, ist er nur in katalytischen Mengen notwendig. Ziel dieses Projektes ist die Entwicklung und Charakterisierung des reversiblen Methyltransfers, kata- lysiert von vereinfachten cobalaminabhängigen Methyltransferasesystemen stammend von Desulfito- bacterium hafniense (dhaf), Acetobacterium dehalogenans (vdm) sowie Hyphomicrobium chlorome- thanicum (cmu). Neben Expression der entsprechenden Enzyme fokussiert das Projekt auf die Erfor- schung des Substratspektrums bezüglich Methylierung und Demethylierung an unterschiedlichen chemischen Funktionalitäten. Um die Anwendbarkeit des cobalaminabhängigen Methyltransfers für die Synthese von pharmazeutisch wirksamen Stoffen zu belegen, wird die bio-katalytische Bildung des Antiepileptikums Lacosamid und des Antidepressivums O-Desmethylvenlafaxin ebenso verfolgt wie die Monomethylierung von Kaffeesäure. Weiters sind sowohl die Optimierung der Reaktionspa- rameter, die Ermittlung der Enzymselektivität als auch die Anwendbarkeit der Enzymsysteme für in- tramolekularen Methyltransfer von zentralem Interesse. Zusammenfassend ist zu erwarten, dass cobalaminabhängige Methyltransferasesysteme, welche Me- thylierung und Demethylierung auf umweltverträgliche Weise ermöglichen, äußerst vielversprechende Kandidaten für verschiedene biotechnologische und synthetische Anwendungen sind.

Biokatalysatoren, also Eiweißmoleküle, erhalten zunehmen Aufmerksamkeit in der organischen Chemie. Deren Einsatz bringt klare Vorteile gegenüber etablierten chemischen Methoden: zuallererst sind Biokatalysatoren aus Aminosäuren aufgebaut, daher aus erneuerbaren Rohstoffen und sind dann auch biologisch abbaubar. Weiters arbeiten die Biokatalysatoren bei milden Bedingungen (Raumtemperatur bis 35 C, Normaldruck und bei neutralem pH) und zusätzlich in Wasser (Buffer). In diesem Projekt wurde eine neue Methode zur Umsetzung von Molekülen zB aus Lignin aber auch für Moleküle die als Antioxidant zum Einsatz kommen entwickelt. Diem Umsetzung von Antioxidantien ist sehr herausfordernd, da es sich dabei um sensible Moleküle handelt speziell in Gegenwart von Sauerstoff aber auch extremen pHs. Als mögliche Anwendung erlaubt die Methode einen bioaktiven und wichtigen Inhaltsstoff von Olivenöl (3-Hydroxytyrosol) aus billigen Rohstoffen herzustellen. Zusammenfassend kann man festhalten, dass die Entwicklung von biokatalytischen Methoden eine wertvolle Alternative für wichtige Reaktionen darstellt um diese auf nachhaltige, resourcenschonende, einfache und günstige Art durchzuführen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Graz - 100%

Research Output

  • 88 Zitationen
  • 12 Publikationen
  • 1 Disseminationen
Publikationen
  • 2018
    Titel Biocatalytic methylation and demethylation via a shuttle catalysis concept involving corrinoid proteins
    DOI 10.1038/s42004-018-0083-2
    Typ Journal Article
    Autor Farnberger J
    Journal Communications Chemistry
    Seiten 82
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Regioselectivity of Cobalamin-Dependent Methyltransferase Can Be Tuned by Reaction Conditions and Substrate
    DOI 10.1002/cctc.202001296
    Typ Journal Article
    Autor Pompei S
    Journal ChemCatChem
    Seiten 5977-5983
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Oxygen-Free Regioselective Biocatalytic Demethylation of Methyl-phenyl Ethers via Methyltransfer Employing Veratrol-O-demethylase
    DOI 10.1021/acscatal.0c02790
    Typ Journal Article
    Autor Grimm C
    Journal ACS Catalysis
    Seiten 10375-10380
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Thiols Act as Methyl Traps in the Biocatalytic Demethylation of Guaiacol Derivatives
    DOI 10.1002/ange.202104278
    Typ Journal Article
    Autor Pompei S
    Journal Angewandte Chemie
    Seiten 17043-17047
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Thiols Act as Methyl Traps in the Biocatalytic Demethylation of Guaiacol Derivatives
    DOI 10.1002/anie.202104278
    Typ Journal Article
    Autor Pompei S
    Journal Angewandte Chemie International Edition
    Seiten 16906-16910
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Biocatalytic Methyl Ether Cleavage: Characterization of the Corrinoid-Dependent Methyl Transfer System from Desulfitobacterium hafniense
    DOI 10.1002/adsc.201801590
    Typ Journal Article
    Autor Richter N
    Journal Advanced Synthesis & Catalysis
    Seiten 2688-2695
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Cobalamin-Dependent Apparent Intramolecular Methyl Transfer for Biocatalytic Constitutional Isomerization of Catechol Monomethyl Ethers
    DOI 10.1021/acscatal.8b05072
    Typ Journal Article
    Autor Farnberger J
    Journal ACS Catalysis
    Seiten 3900-3905
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Anaerobic demethylation of guaiacyl-derived monolignols enabled by a designed artificial cobalamin methyltransferase fusion enzyme.
    DOI 10.1039/d2ra08005b
    Typ Journal Article
    Autor Grimm C
    Journal RSC advances
    Seiten 5770-5777
  • 2021
    Titel EXPLORING THE COBALAMIN DEPENDENT DHAF-SYSTEM: INVESTIGATION OF THE REGIOSELECTIVITY, MECHANISM AND CONCEPTS TO SHIFT THE EQUILIBRIUM IN THE DEMETHYLATION REACTION
    Typ PhD Thesis
    Autor Simona Pompei
  • 2021
    Titel Cobalamin-Dependent Biocatalytic Methyl Transfer: New Enzymes, Substrate Scopes, Protein Structures and Fusion Proteins
    Typ PhD Thesis
    Autor Christopher Grimm
  • 2021
    Titel Cover Feature: Natural Product Diversification by One-Step Biocatalysis using Human P450 3A4 (ChemCatChem 1/2022)
    DOI 10.1002/cctc.202101843
    Typ Journal Article
    Autor Fessner N
    Journal ChemCatChem
  • 2021
    Titel Natural Product Diversification by One-Step Biocatalysis using Human P450 3A4
    DOI 10.1002/cctc.202101564
    Typ Journal Article
    Autor Fessner N
    Journal ChemCatChem
    Link Publikation
Disseminationen
  • 2019 Link
    Titel Three Minute Thesis Competition
    Typ A talk or presentation
    Link Link

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