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Mechanismen der Ligandenselektivität in Monoamintransportern

Exploring ligand selectivity in monoamine transporters

Rong Zhu (ORCID: 0000-0001-7553-7249)
  • Grant-DOI 10.55776/P31599
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2018
  • Projektende 30.09.2022
  • Bewilligungssumme 362.014 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (50%)

Keywords

    Binding Kinetics, Serotonin Transporter, Single Molecular Force Spectroscopy, Dopamine Transporter, Electrophysiology, Ligand Selectivity

Abstract Endbericht

Der Serotonintransporter (SERT), der Dopamintransporter (DAT) und der Noradrenalintransporter (NET) regulieren monoaminerge Neurotransmission. Ihre Aufgabe ist es, ausgeschüttete Monoamine zurück in die Neuronen zu holen. Diese Transporter sind wichtige Angriffspunkte für die Therapie von Depressionen und anderen psychischen Störungen. Um verbesserte Medikamente zu entwickeln, ist es wichtig, den Mechanismus ihrer Bindung an die Monoamintransporter im Detail zu verstehen. Die Selektivität der Bindung spielt in diesen Zusammenhang eine besonders wichtige Rolle. Zum Beispiel sollten Antidepressiva eher auf den SERT wirken und weniger auf den DAT. Umgekehrt sollten Medikamente für die Behandlung von Aufmerksamkeitsdefizit-/Hyperaktivitätsstörung auf DAT und NET wirken und weniger auf SERT. Es ist schon vieles unternommen worden, um die Ligandenselektivität besser zu verstehen. Ursprünglich hat man angenommen, dass diese hauptsächlich durch Unterschiede in den Dissoziationsraten der Medikamente erklärt werden kann. Kürzlich hat jedoch ein Koautor dieses Antrags (Dr Walter Sandtner) herausgefunden, dass auch die Assoziationsrate für die Selektivität wichtig ist. Das lässt sich am besten erklären, wenn man annimmt, dass ein Selektivitätsfilter in Monoamintransportern existiert.Dieser Selektivitätsfilter beinhaltet wahrscheinlich zusätzliche Ligandenbindungsstellen, welche im Eingangsbereich zur Hauptbindungstelle liegen. Der Antragsteller hat eine kraftspektroskopische Methode entwickelt, mit der man einzelmolekulare Bindungsereignisse detektieren kann. Diese Methode erlaubt auch, die Bindungskinetik vonLiganden an Monoamintransportern zu messen. Der Antragsteller hat vor kurzem gezeigt, dass er so die Dissoziationsrate des Antidepressivums Citalopram messen kann und dass die Werte gut mit den ResultatenelektrophysiologischerMessungenübereinstimmen.EineinzigartigerVorteil der kraftspektroskopischen Methode war die Entdeckung und Charakterisierung einer zweiten Bindungstelle, die im Eingangsbereich zur Hauptbindungstelle liegt. Das wäre zur Zeit mit keiner Methode möglich gewesen. In diesen Antrag wird vorgeschlagen, die Assoziationsraten-getriebene Selektivität sowohl mit Einzelmolekül-Kraftspektroskopie als auch mit elektrophysiologischen Methoden zu untersuchen. Es wird außerdem angestrebt, jene Strukturen zu identifizieren, welche für die Bildung des Selektivitätsfilters wichtig sind.

Die Monoamintransporter sind wichtige Angriffspunkte für die Therapie von Depressionen, Aufmerksamkeitsdefizit-Hyperaktivitätsstörung und anderen psychischen Störungen. Um verbesserte Medikamente zu entwickeln, ist es wichtig, den Mechanismus ihrer Bindung an die Monoamintransporter im Detail zu verstehen. Die Selektivität der Bindung spielt in diesen Zusammenhang eine besonders wichtige Rolle. Es ist schon vieles unternommen worden, um die Ligandenselektivität besser zu verstehen. Ursprünglich hat man angenommen, dass diese hauptsächlich durch Unterschiede in den Dissoziationsraten der Medikamente erklärt werden kann. Kürzlich hat jedoch Dr. Walter Sandtner herausgefunden, dass auch die Assoziationsrate für die Selektivität wichtig ist. Das lässt sich am besten erklären, wenn man annimmt, dass ein Selektivitätsfilter in Monoamintransportern existiert. Dieser Selektivitätsfilter beinhaltet wahrscheinlich zusätzliche Liganden-bindungsstellen, welche im Eingangsbereich zur Hauptbindungstelle liegen. Wir untersuchten den Selektivitätsfilter mithilfe der Einzelmolekül-Kraftspektroskopie basierend auf Rasterkraftmikroskopie (AFM) und mithilfe der elektrophysiologischen Messungen. Viele Arzneimittelmoleküle wie Desipramin haben eine sekundäre Amingruppe anstelle einer primären Amingruppe, für die kein veröffentlichtes Verfahren zur Funktionalisierung der AFM-Spitze vorhanden ist. In diesem Projekt haben wir die Chemie zur Verknüpfung von Desipramin an die AFM-Spitze durch die Reaktion zwischen Bromacetat und dem sekundären Amin von Desipramin entwickelt, dadurch einen neuen Weg für die Funktionalisierung von AFM-Spitzen mit Wirkstoffmolekülen ebnete. Aus den Kraftmessungen haben wir herausgefunden, dass die Dissoziationsrate von Desipramin für beide Transporter von Dopamin (DAT) und Serotonin (SERT) ähnlich war. Allerdings war die Assoziationsrate von Desipramin bei SERT etwa sechsmal höher als bei DAT. Daher wird die Selektivität von Desipramin für SERT gegenüber DAT hauptsächlich durch seine Assoziationrate und nicht durch seine Dissoziationsrate bestimmt. Durch die Verwendung von Antikörperfragmenten, die auf die extrazelluläre Schleife 2 (EL2) und 4 (EL4) der Transporter binden, fanden wir heraus, dass die Besetzung von EL2 und EL4 die Assoziationsrate von Desipramin für SERT, aber nicht für DAT reduzierte, mit vernachlässigbarer Wirkung auf die Dissoziationsrate, was darauf hindeutet EL2 und EL4 tragen zum Selektivitätsfilter bei, der den Eintritt von Desipramin in die primäre Bindungsstelle von SERT erleichtert. Mithilfe der elektrophysiologischer Messungen erweiterten wir die Erforschung des Selektivitätsfilters auf Methylphenidat, das ein selektiver Inhibitor von DAT ist. Die Ergebnisse zeigten, dass der EL4-Antikörper und sein Fragment den anfänglichen substratinduzierten Übergang von der nach außen gerichteten zur nach innen gerichteten Konformation, aber nicht den Vorwärtszyklusmodus von SERT behinderten. Im Gegensatz dazu verstärkte die Besetzung von EL2 mit Antikörperfragment die Affinität von SERT für Methylphenidat durch Beschleunigung der Assoziationsrate. Dies wurde durch Untersuchung der Bindung bestimmter radioaktiv markierter Inhibitoren an SERT bestätigt. Basierend auf all diesen Beobachtungen schließen wir, dass EL2 und EL4 den Zugang von Inhibitoren zur Bindung von SERT und DAT kontrollieren und somit als Selektivitätsfilter wirken. Diese Erkenntnisse haben Auswirkungen auf die Medikamentenentwicklung.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Linz - 63%
  • Medizinische Universität Wien - 37%
Nationale Projektbeteiligte
  • Walter Sandtner, Medizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Amy Hauck Newman, National Institute on Drug Abuse - NIH - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 226 Zitationen
  • 19 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
Publikationen
  • 2025
    Titel Revealing the location and dynamics of a concealed binding site in the dopamine transporter
    DOI 10.1038/s41467-025-59511-w
    Typ Journal Article
    Autor Zhu R
    Journal Nature Communications
    Seiten 4197
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Nanomechanical binding mechanism of ligands drives agonistic activity
    DOI 10.1038/s41467-025-61929-1
    Typ Journal Article
    Autor Seferovic H
    Journal Nature Communications
    Seiten 6674
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Stabilization of the Quadruplex-Forming G-Rich Sequences in the Rhinovirus Genome Inhibits Uncoating—Role of Na+ and K+
    DOI 10.3390/v15041003
    Typ Journal Article
    Autor Real-Hohn A
    Journal Viruses
    Seiten 1003
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Catching Common Cold Virus with a Net: Pyridostatin Forms Filaments in Tris Buffer That Trap Viruses—A Novel Antiviral Strategy?
    DOI 10.3390/v12070723
    Typ Journal Article
    Autor Real-Hohn A
    Journal Viruses
    Seiten 723
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A molecularly engineered, broad-spectrum anti-coronavirus lectin inhibits SARS-CoV-2 and MERS-CoV infection in vivo
    DOI 10.1016/j.xcrm.2022.100774
    Typ Journal Article
    Autor Chan J
    Journal Cell Reports Medicine
    Seiten 100774
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Force-tuned avidity of spike variant-ACE2 interactions viewed on the single-molecule level
    DOI 10.1038/s41467-022-35641-3
    Typ Journal Article
    Autor Zhu R
    Journal Nature Communications
    Seiten 7926
    Link Publikation
  • 2019
    Titel A comparison of the transport kinetics of glycine transporter 1 and glycine transporter 2
    DOI 10.1085/jgp.201912318
    Typ Journal Article
    Autor Erdem F
    Journal Journal of General Physiology
    Seiten 1035-1050
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Identification of lectin receptors for conserved SARS-CoV-2 glycosylation sites
    DOI 10.15252/embj.2021108375
    Typ Journal Article
    Autor Hoffmann D
    Journal The EMBO Journal
    Link Publikation
  • 2021
    Titel A molecularly engineered, broad-spectrum anti-coronavirus lectin inhibits SARS-CoV-2 and MERS-CoV infection in vivo
    DOI 10.21203/rs.3.rs-516695/v1
    Typ Preprint
    Autor Markovitz D
  • 2024
    Titel Plant-Derived Anti-Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 Antibody Suppresses Trastuzumab-Resistant Breast Cancer with Enhanced Nanoscale Binding
    DOI 10.1021/acsnano.4c00360
    Typ Journal Article
    Autor Park C
    Journal ACS Nano
    Seiten 16126-16140
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Solving the trade-off by differences in handling of intracellular K+: why substrate translocation by the dopamine transporter but not by the serotonin transporter is voltage-dependent
    DOI 10.1101/2020.07.09.196642
    Typ Preprint
    Autor Bhat S
    Seiten 2020.07.09.196642
  • 2020
    Titel Two Distinct Ligand Binding Sites in Monoamine Transporters Monitored by Nanopharmacological Force Sensing
    DOI 10.1016/j.bpj.2019.11.3337
    Typ Journal Article
    Autor Zhu R
    Journal Biophysical Journal
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Handling of intracellular K+ determines voltage dependence of plasmalemmal monoamine transporter function
    DOI 10.1101/2021.03.11.434931
    Typ Preprint
    Autor Bhat S
    Seiten 2021.03.11.434931
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Handling of intracellular K+ determines voltage dependence of plasmalemmal monoamine transporter function
    DOI 10.7554/elife.67996
    Typ Journal Article
    Autor Bhat S
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Extracellular loops of the serotonin transporter act as a selectivity filter for drug binding
    DOI 10.1016/j.jbc.2021.100863
    Typ Journal Article
    Autor Esendir E
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 100863
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Descriptors of Secondary Active Transporter Function and How They Relate to Partial Reactions in the Transport Cycle
    DOI 10.3390/membranes11030178
    Typ Journal Article
    Autor Schicker K
    Journal Membranes
    Seiten 178
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Identification of lectin receptors for conserved SARS-CoV-2 glycosylation sites
    DOI 10.1101/2021.04.01.438087
    Typ Preprint
    Autor Hoffmann D
    Seiten 2021.04.01.438087
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Molecular Recognition in Confined Space Elucidated with DNA Nanopores and Single-Molecule Force Microscopy
    DOI 10.1021/acs.nanolett.3c00743
    Typ Journal Article
    Autor Suh S
    Journal Nano Letters
    Seiten 4439-4447
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Allosterically Linked Binding Sites in Serotonin Transporter Revealed by Single Molecule Force Spectroscopy
    DOI 10.3389/fmolb.2020.00099
    Typ Journal Article
    Autor Zhu R
    Journal Frontiers in Molecular Biosciences
    Seiten 99
    Link Publikation
Methoden & Materialien
  • 0
    Titel Conjugation of molecule with secondary amine to AFM cantilever tip
    Typ Technology assay or reagent
    Öffentlich zugänglich

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