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3D Lithographiestrukturen zur Zelldifferenzierung

3D Lithographical Scaffolds for Stem Cell Differentiation

Jaroslaw Jacak (ORCID: 0000-0002-4989-1276)
  • Grant-DOI 10.55776/P31827
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.12.2018
  • Projektende 31.05.2024
  • Bewilligungssumme 385.612 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (10%); Medizinische Biotechnologie (15%); Nanotechnologie (75%)

Keywords

    Nanolithography, Multiphoton Lithography, STED-lit

Abstract Endbericht

Der Schlüssel zum besseren Verständnis der maßgeblichen biologisch-funktionalen Prozesse bei der Interaktion von Zellen, die während der Differenzierung (z.B. Osteogenese) stattfinden, ist die Entwicklung von Modellsystemen der extrazellulären Matrix. Derzeit ist die Analyse von Zellinteraktionen auf entweder totes Gewebe und/oder ex-vivo Kokultivierung beschränkt. Damit können interagierende Zellstrukturen nur in zwei Dimensionen untersucht werden. Eine auf zwei Dimensionen begrenzte Kultivierung der Zellen ändert aber nachweislich die Proteinverteilung, das Zellverhalten und die Signalwege. Darüber hinaus sind die Zellen wahllos in die umgebende Matrix eingebettet, wodurch die mikroskopische Analyse der molekularen Interaktionen zwischen den verschiedenen Zellen erschwert wird. Ein dreidimensionales Zellträgersystem, das die molekulare Charakterisierung der Zelldifferenzierung sowohl auf Einzelzellebene als auch im Gewebekontext ermöglicht, ist daher sehr wünschenswert. Das Hauptaugenmerk dieses Projektes wird auf der Entwicklung von dreidimensionalen Zellgerüsten liegen. Die mit Nanolithographie geschriebenen Gerüste imitieren die extrazelluläre Matrix. Dies erst ermöglicht eine gezielte Zelldifferenzierung und eine darauffolgende Charakterisierung von mesenchymalen Stammzellen (Osteogenese) auf nanoskopischer Ebene. Hierfür ist die Anwendung neuer 3D-Lithographiemethoden geplant. Dadurch wird es möglich, die Größe der Polymerstrukturen in drei Dimensionen von 100 Mikro- bis auf einige Nanometer zu variieren. Zusätzlich werden die mechanischen Eigenschaften der Polymerstrukturen sowie die spezifische Funktionalisierung mit Zelladhäsion- und Differenzierung-vermittelnden Biomolekülen kontrolliert werden. Das Projektkonsortium umfasst alle für dieses Projekt relevanten Expertisen, nämlich Multiphotonenlithographie, Einzelmolekülmikroskopie, Lokalisationsmikroskopie und Biophysik (technische Expertise des Departments für Medizintechnik an der FH Linz), sowie am für Angewandte Physik der JKU die STED-Lithographie (einziges Institut in Österreich) sowie die Oberflächen- und Polymerchemie. Eine enge Zusammenarbeit mit dem Ludwig-Boltzmann Institut für Experimentelle und Klinische Traumatologie (LBI) und der Abteilung für Geburtshilfe der Medizinischen Universität Wien - beide verfügen über langjährige Erfahrung in der Stammzellforschung und dem Gewebe- Engineering - wird uns bei der Zellkultivierung behilflich sein.

Dreidimensionale Gerüste sind im Tissue Engineering entscheidend, da sie biomimetische Umgebungen für das Wachstum und die Funktion von Zelltypen schaffen. Eine Herausforderung bleibt, die komplexen geometrischen und mechanischen Eigenschaften von Gewebe in einem Organ-on-a-Chip-Modell nachzubilden. In diesem Projekt entwickelten wir 3D-Gerüste, die die extrazelluläre Matrix (ECM) mithilfe von Multiphotonen- und STimulated Emission Depletion (STED)-Lithographie auf Nanometerebene nachahmen. Diese Gerüste ermöglichen die Co-Kultivierung verschiedener Zelltypen und die Untersuchung von Zell-Zell- und Zell-Gerüst-Interaktionen auf nanoskopischer Ebene. Im Laufe des Projekts erzielten wir Fortschritte bei der Entwicklung von Methoden und Materialien für effizientes Photografting von Oberflächen sowie bei der Herstellung proteinbasierter Polymer-3D-Gerüste, die zur Zell-Differenzierung beitragen. Wir entwickelten Puffer, die die Effizienz photochemisch induzierter Oberflächenmodifikationen auf Molekülebene signifikant verbessern. Puffer mit paramagnetischen Kationen und radikalfördernden Sauerstoffverbindungen steigern die Laser-Assisted Protein Adsorption by Photobleaching (LAPAP) von fluoreszenzmarkierten Oligonukleotiden oder Biotin auf 2D- und 3D-MPL-Gerüsten. Die Effizienz des Photopaintings wurde mithilfe der Einzelmolekülfluoreszenzmikroskopie quantifiziert. Wir entwickelten proteinbasierte Photoresists (Streptavidin-, Rinderserumalbumin - basiert) unter Verwendung von Vernetzern wie Polyethylenglycoldiacrylat und methacryliertem Hyaluronsäure, kombiniert mit einem vitaminbasierten Photoinitiator. Darüber hinaus setzten wir 2D/3D-Direktlaser-Schreibtechniken ein, um wasserlösliche, proteinbasierte Gerüste mit anpassbaren mechanischen Eigenschaften herzustellen. Die resultierenden Gerüste zeigten Young'sche Moduli von 80 MPa für künstliche Polymere bis zu 40 kPa für proteinbasierte Materialien, mit Strukturelementen unter 100 nm. Michler's Ethylketon wurde für STED-inspirierte MPL verwendet, wodurch Strukturen von 40 nm mit geringer Autofluoreszenz im sichtbaren Bereich erzeugt wurden, was es ideal für Protein- oder Zellgerüste macht. Die funktionelle Charakterisierung mittels fluoreszenzmarkiertem Biotin und Antikörpern bestätigte ihre Bioaktivität. Wir nutzten neueste Entwicklungen zur Herstellung hybrider Gerüste, indem wir künstliche polymer- und proteinbasierte Photoresists mithilfe von MPL kombinierten. Die Polymerstrukturen aus BisSR, Carboxyethylacrylaten und methacryliertem Kollagen Typ I ermöglichten eine präzise Kontrolle der Gerüstarchitektur für verbesserte Tissue-Engineering-Anwendungen. Diese 3D-submikron-strukturierten Gerüste (~300 m) wurden erfolgreich zur Kultivierung mesenchymaler Stammzellen (MSCs) eingesetzt. Bildgebung von Aktin und Vinculin bestätigte die Biokompatibilität, und die Differenzierung der MSCs zu Osteoblasten zeigte ihr Potenzial für die Knochengewebszüchtung.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Linz - 40%
  • FH Oberösterreich - 60%
Nationale Projektbeteiligte
  • Thomas A. Klar, Universität Linz , assoziierte:r Forschungspartner:in

Research Output

  • 162 Zitationen
  • 21 Publikationen
  • 1 Künstlerischer Output
  • 2 Disseminationen
  • 2 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 9 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2025
    Titel Hybrid MPL Scaffolds with Nanoscale Mechanobiology for Bone-on-Chip
    DOI 10.1101/2025.08.28.672808
    Typ Preprint
    Autor Naderer C
    Seiten 2025.08.28.672808
    Link Publikation
  • 2025
    Titel 3D Multiphoton Nanolithography with Bioresorbable Amino Acid-Based Resins
    DOI 10.1021/acs.nanolett.5c02804
    Typ Journal Article
    Autor Naderer C
    Journal Nano Letters
    Seiten 11993-12000
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Statistical analysis of 3D localisation microscopy images for quantification of membrane protein distributions in a platelet clot model
    DOI 10.1371/journal.pcbi.1007902
    Typ Journal Article
    Autor Mayr S
    Journal PLOS Computational Biology
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Multiphoton lithography for the mimicking of tissue environment
    Typ PhD Thesis
    Autor Boris Buchroithner
    Link Publikation
  • 2021
    Titel CRISPR/Cas9 Genome Editing vs. Over-Expression for Fluorescent Extracellular Vesicle-Labeling: A Quantitative Analysis
    DOI 10.3390/ijms23010282
    Typ Journal Article
    Autor Strohmeier K
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 282
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Improvements and applications of quantitative single molecule localization microscopy
    Typ PhD Thesis
    Autor Hauser Fabian
    Link Publikation
  • 2024
    Titel New buffer systems for photopainting of single biomolecules
    DOI 10.1039/d3lf00125c
    Typ Journal Article
    Autor Naderer C
    Journal RSC Applied Interfaces
    Seiten 110-121
    Link Publikation
  • 2024
    Titel STED-inspired sub 100 nm cationic photoinhibition lithography
    Typ PhD Thesis
    Autor Sourav Islam
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Multiphoton lithography with protein photoresists
    DOI 10.1016/j.mtbio.2024.100994
    Typ Journal Article
    Autor Sivun D
    Journal Materials Today Bio
    Seiten 100994
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Focal spot optimization through scattering media in multiphoton lithography
    DOI 10.1016/j.optlaseng.2021.106607
    Typ Journal Article
    Autor Buchegger B
    Journal Optics and Lasers in Engineering
    Seiten 106607
    Link Publikation
  • 2022
    Titel 3D Nanoscale-Platforms
    Typ Postdoctoral Thesis
    Autor Jaroslaw Jacak
  • 2021
    Titel Real-time 3D single-molecule localization microscopy analysis using lookup tables
    DOI 10.1364/boe.424016
    Typ Journal Article
    Autor Hauser F
    Journal Biomedical Optics Express
    Seiten 4955-4968
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Stimulated Emission Depletion Inspired Sub-100 nm Structuring of Epoxides Using 2-Chlorothioxanthone as Photosensitizer
    DOI 10.1021/acsomega.4c00031
    Typ Journal Article
    Autor Islam S
    Journal ACS Omega
    Seiten 19203-19208
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Single molecule studies of dynamic platelet interactions with endothelial cells
    DOI 10.3389/fbioe.2024.1372807
    Typ Journal Article
    Autor Hauser F
    Journal Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
    Seiten 1372807
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Low-Fluorescence Starter for Optical 3D Lithography of Sub-40 nm Structures
    DOI 10.1021/acsaom.3c00031
    Typ Journal Article
    Autor Gvindzhiliia G
    Journal ACS Applied Optical Materials
    Seiten 945-951
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Gold Nanoislands Grown on Multiphoton Polymerized Structures as Substrate for Enzymatic Reactions
    DOI 10.1021/acsmaterialslett.9b00182
    Typ Journal Article
    Autor Buchegger B
    Journal ACS Materials Letters
    Seiten 399-403
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Purification Analysis, Intracellular Tracking, and Colocalization of Extracellular Vesicles Using Atomic Force and 3D Single-Molecule Localization Microscopy
    DOI 10.1021/acs.analchem.3c00144
    Typ Journal Article
    Autor Puthukodan S
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 6061-6070
    Link Publikation
  • 2023
    Titel STED-Inspired Cationic Photoinhibition Lithography
    DOI 10.1021/acs.jpcc.3c04394
    Typ Journal Article
    Autor Islam S
    Journal The Journal of Physical Chemistry C
    Seiten 18736-18744
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Dual Channel Microfluidics for Mimicking the Blood–Brain Barrier
    DOI 10.1021/acsnano.0c09263
    Typ Journal Article
    Autor Buchroithner B
    Journal ACS Nano
    Seiten 2984-2993
    Link Publikation
  • 2021
    Titel An Improved Transwell Design for Microelectrode Ion-Flux Measurements
    DOI 10.3390/mi12030273
    Typ Journal Article
    Autor Buchroithner B
    Journal Micromachines
    Seiten 273
    Link Publikation
  • 2020
    Titel 3D multiphoton lithography using biocompatible polymers with specific mechanical properties
    DOI 10.1039/d0na00154f
    Typ Journal Article
    Autor Buchroithner B
    Journal Nanoscale Advances
    Seiten 2422-2428
    Link Publikation
Künstlerischer Output
  • 2021 Link
    Titel Visualization 1
    DOI 10.6084/m9.figshare.14582346
    Typ Film/Video/Animation
    Link Link
Disseminationen
  • 2019 Link
    Titel Open House Day - at the University of Applied Sciences / Johannes Kepler University
    Typ Participation in an open day or visit at my research institution
    Link Link
  • 2019 Link
    Titel Lange Nacht der Forschung - University of Applied Sciences / Johannes Kelper University
    Typ Participation in an activity, workshop or similar
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2023
    Titel Speaker Invitation: RSC Applied Interfaces symposium
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Keynote speaker: Regional Biophysical Society Meeting 2022
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2018
    Titel BioCETA, COIN Programmlinie, 866831
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2018
    Geldgeber Austrian Research Promotion Agency
  • 2018
    Titel Vascular MicroLab, Dissertationsprogramm der Fachhochschule OÖ 2018, 868728
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2018
    Geldgeber Austrian Research Promotion Agency
  • 2021
    Titel Fast3DCast 2.0, Bridge, 891107
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2021
    Geldgeber Austrian Research Promotion Agency
  • 2022
    Titel Nano-Carriers, Bridge, 898921
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2022
    Geldgeber Austrian Research Promotion Agency
  • 2024
    Titel NanoPrecMed, Interreg AtCz, ATCZ00052
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2024
    Geldgeber European Commission
  • 2024
    Titel NanoPrecMed, Interreg AtCz, ATCZ00052
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2024
    Geldgeber European Commission Interreg : European Territorial Co-operation
  • 2020
    Titel Image Headstart, Interreg AtCz, ATCZ215
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2020
    Geldgeber European Commission
  • 2020
    Titel Image Headstart, Interreg AtCz, ATCZ215
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2020
    Geldgeber European Commission Interreg : European Territorial Co-operation
  • 2024
    Titel STED-Inspired Nanolithography beyond (Meth-)Acrylates
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2024
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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