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Entwicklung von c-RAF PROTACs für KRAS mutierte Krebsarten

Development of c-RAF degraders to probe KRAS mutant cancers

Georg Winter (ORCID: 0000-0001-6606-1437)
  • Grant-DOI 10.55776/P32125
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2019
  • Projektende 31.08.2023
  • Bewilligungssumme 557.338 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (10%); Chemie (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (40%)

Keywords

    Cancer, RAF1, Protein Degradation, KRAS, Chemical Biology, PROTAC

Abstract

Krebs ist eine der häufigsten Todesursachen in der westlichen Welt. Es ist eine Krankheit, die durch Mutationen in Genen verursacht wird, die zu einer unbegrenzten und unkontrollierten Proliferation und Zellwachstum führt. Einige dieser Gene sind in vielen verschiedenen Krebsarten mutiert und intensive Forschung hat uns in die Lage gebracht grundliegende Mechanismen der Krebsentwicklung zu verstehen. Eines dieser Gene wird als "Kirsten Rat Sarkoma Virus Onkogen Homolog" oder kurz "KRAS" bezeichnet und ist bei etwa einem Viertel der aggressivsten Krebsarten einschließlich Lungen- und Bauchspeicheldrüsenkrebs mutiert. Trotz intensiver Bemühungen war es jedoch nicht möglich, Medikamente zu entwickeln, die die Funktion des KRAS-Proteins direkt oder indirekt hemmen. Aus diesem Grund haben Krebserkrankungen die durch KRAS-Mutationen verursacht werden eine äußerst schlechte klinische Prognose und sehr hohe Sterblichkeitsraten. Wir haben jedoch kürzlich einen neuartigen Ansatz zur Medikamentenentwicklung entdeckt. Während herkömmliche Arzneimittel defekte Proteine blockieren indem sie möglichst stringent an diese Proteine binden, werden in unserem Ansatz unerwünschte Proteine für den zellulären Abbau gekennzeichnet. Diese Wirkstoffe machen unerwünschte Proteine für ein spezialisiertes zelluläres Entsorgungssystem (das Proteasom) erkennbar, was diese Proteine in weiterer Folge umgehend entsorgt. Daher ist unser Ansatz in der Lage, krankheitsrelevante Proteine vollständig zu eliminieren, anstatt nur einige ihrer Funktionen zu vorübergehend zu blockieren. In diesem Projekt schlagen wir vor, neue Wirkstoffe zu entwickeln, die einen funktionell kritischen Effektor von mutierten KRAS selektiv eliminieren können. Dieses Effektorprotein namens "c-RAF" ist selbst interessanterweise selten mutiert. Es wurde aber gezeigt, dass die genetische Inaktivierung von c-RAF zu einer Regression von KRAS-mutierten Tumoren in Mäusen führt. Hier wollen wir testen, ob wir KRAS-mutierte Krebszellen auf ähnliche Weise abtöten können indem wir den Abbau und die Eliminierung von c-RAF chemisch induzieren. Darüber hinaus wollen wir verstehen warum KRAS- mutierte Krebszellen vom c-RAF-Protein abhängig sind, und ob wir die Wirkung von c-RAF-abbauenden Wirkstoffen durch Kombination mit anderen Krebsmedikamenten weiter verstärken können. Zusammenfassend wollen wir in diesem Projekt neuartige und innovative Wirkstoffe für die Behandlung von unheilbaren Krebserkrankungen entwickeln und testen. Dadurch wollen wir zu einem besseren Verständnis der molekularen Mechanismen und der "Achillesfersen" der Krebsentstehung beitragen.

Forschungsstätte(n)
  • CeMM – Forschungszentrum für Molekulare Medizin GmbH - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Stefan Knapp, Johann Wolfgang Goethe Universität Frankfurt am Main - Deutschland
  • Mariano Barbacid, Centro National de Investigaciones Oncologicas - Spanien

Research Output

  • 389 Zitationen
  • 14 Publikationen
Publikationen
  • 2024
    Titel Targeted protein degradation via intramolecular bivalent glues.
    DOI 10.1038/s41586-024-07089-6
    Typ Journal Article
    Autor Hinterndorfer M
    Journal Nature
    Seiten 204-211
  • 2025
    Titel Inhibition of OSBP blocks retrograde trafficking by inducing partial Golgi degradation.
    DOI 10.1038/s41589-024-01653-x
    Typ Journal Article
    Autor Depta L
    Journal Nature chemical biology
    Seiten 203-214
  • 2025
    Titel Orpinolide disrupts a leukemic dependency on cholesterol transport by inhibiting OSBP.
    DOI 10.1038/s41589-024-01614-4
    Typ Journal Article
    Autor Cigler M
    Journal Nature chemical biology
    Seiten 193-202
  • 2021
    Titel Identification and selectivity profiling of small-molecule degraders via multi-omics approaches
    DOI 10.1016/j.chembiol.2021.03.007
    Typ Journal Article
    Autor Scholes N
    Journal Cell Chemical Biology
    Seiten 1048-1060
    Link Publikation
  • 2022
    Titel E3-specific degrader discovery by dynamic tracing of substrate receptor abundance
    DOI 10.1101/2022.10.10.511612
    Typ Preprint
    Autor Hanzl A
    Seiten 2022.10.10.511612
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Functional E3 ligase hotspots and resistance mechanisms to small-molecule degraders
    DOI 10.1038/s41589-022-01177-2
    Typ Journal Article
    Autor Hanzl A
    Journal Nature Chemical Biology
    Seiten 323-333
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Targeted protein degradation via intramolecular bivalent glues
    DOI 10.1101/2023.02.14.528511
    Typ Preprint
    Autor Hinterndorfer M
  • 2023
    Titel Discovery of a Drug-like, Natural Product-Inspired DCAF11 Ligand Chemotype.
    DOI 10.1038/s41467-023-43657-6
    Typ Journal Article
    Autor Xie J
    Journal Nature communications
    Seiten 7908
  • 2023
    Titel E3-Specific Degrader Discovery by Dynamic Tracing of Substrate Receptor Abundance.
    DOI 10.1021/jacs.2c10784
    Typ Journal Article
    Autor Barone E
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 1176-1184
  • 2023
    Titel Advancing Targeted Protein Degradation via Multiomics Profiling and Artificial Intelligence.
    DOI 10.1021/jacs.2c11098
    Typ Journal Article
    Autor Cigler M
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 2711-2732
  • 2023
    Titel Discovery of Molecular Glue Degraders via Isogenic Morphological Profiling.
    DOI 10.1021/acschembio.3c00598
    Typ Journal Article
    Autor Ng A
    Journal ACS chemical biology
    Seiten 2464-2473
  • 2023
    Titel Discovery of a Drug-like, Natural Product-Inspired DCAF11 Ligand Chemotype
    DOI 10.26434/chemrxiv-2023-zmh4f
    Typ Preprint
    Autor Xie J
  • 2022
    Titel Charting functional E3 ligase hotspots and resistance mechanisms to small-molecule degraders
    DOI 10.1101/2022.04.14.488316
    Typ Preprint
    Autor Hanzl A
    Seiten 2022.04.14.488316
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Rational discovery of molecular glue degraders via scalable chemical profiling
    DOI 10.1038/s41589-020-0594-x
    Typ Journal Article
    Autor Mayor-Ruiz C
    Journal Nature Chemical Biology
    Seiten 1199-1207
    Link Publikation

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